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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCCCCATAGAGCTACAGAAACTCAGACCAGTAGAAATCGAAGCGAAGCAATTTAAGGCTTTAAGCAACTGAAAATCCAACACAAGGAAGAAGAAGACACAAAAAAAACTAAAATGGAGGAATCACTGCGAATTAAAGAATTCGATGAAGTTACTTCCGCTGAAGAATTCGAGTCTCAAATTGAACCCCTAAACGTTCCCGCGGTATAATTTCGCAAATTCATGAACACTCTATTTATCTCTCTTCATTTTTTAATTATGTTTTTTTGTTGTTTTTTTTGTTTAATTTTAATTATTGTTTCCGATTTTGATGTGGAATCAAGGTTTTTAGAGGATGTGTGAAGGATTGGAAAGCTTTCCAGAGCTGGAATCCTACAAATGGCGGTCTCGATTATTTGCAGGTTTTGCTTCTGATTTTTTAAAAATAATTTCACAAGTTTACATAATTGCATTGAATATTTGGATTCTTTCATGTCGATGTATATTGTATGTTAATTGAAAGTAAAATGTTAGTTGGATTTTGTTAATTGAAAATCCGGGCAACAAAGATTAAATAGTCGGATTAACTTCACCATTCTTACAGTGTCTTAATTCTTAATCAAAGTAAAATGTTAAGCATAAACAACATGGAGGAGAAAACGACTTGCCTTTTACCTTTAACTATTAACACATATGTAACATTACATACATCCTAGTTGGCGTAAGTTTAGGAGTTTTGCAAGTTATTATCGGCGTTATTGAGGCATTATTATTGCACCTATTGTAGGCATTGTTGTACTAAATATGTGTTAATAGTGAAAGATATAAGGCAAGCCAATTTCTCCTACATATTGTTTATGTTTATCATGGTATCAGAGCCAACGGTCTTGACCCCTTGTCTGTCCTGAGAAAGGAGGGTCCATTGAAGAATTTGTAAAGAAGAGTAGAAGATGTGTTCGGAGCAAGTAGTGCAATAGAAGTGAATGCCCCAAGTAGGGTCTGAACCTCAAGTTAAGAGAGTCCAGTAAGGACATTGTGTAACCCATCCACACTGCATAAAGGTGCATAAAGGTGTCTGACATGCGCCTGGAGTGTTAAGAGTATAATCCATATGTGAATATTGGACTAGTTATCTCATATTGAAGGAATAGAGGGAGATTGCCTAACATATAAGATTGGTGGACTACTCCACATATTACCAATCGATTTTAGGATAAAACCCTATCAGGCTTGTATGTGGTGAGACTCTTCTCTTGTCTGGGCTCGTGTTAGGCCCAATGAGTTTATCATAAAACAAGGAAATTTAGGTATGCATAATTAGTTAGTAGTGATAAACTCATAATGAGCCTAACTTGTTTGCGAGTTACACTATTTTGCCTCGGTCAATGTTAGGTTGATTTAGTTTTAATGAGAGCTCGGGGCTTTAACAAGTTAAGTCGAGCTCAATAGATTTGAAAAATGAGTAAGTGGTTGTGACTTGAAAAGCTTGTGAGTATTTTCACAATCATAGTATATGAATTGGATTAAGTAAATAAAATGACATGTGAGGACTATAATAGATTTAACAAAACGGCTGTGGGATCTTATAATAATGGAAAAGTTAGAAATAGGAATGTTAGAGCTTGACAAAGTATTCACTAGAATGTTACTTGAGCTCCATTCACACTCTGAGTAGAGTATCAACATGAGGCTAAAATATTTGAGTTTGACAAGCTTGAGTTAGGGTCTAGATTGCCTGAATCAACCAAGCTATCCCATACTTGAATGCATCTCGACTTTTTATCATCCTTATTCAACAACCAACGAAAGCACATGATTGTGGAATCGTGGAATAATTGTTACATGCTGAAATTTAGTAAAGTTTATCTTTCTTGCATCATGTTTGTTTCAATTCTTTCTTCTTGTCATGTAAATTATTGTATAGTTTCGTTTCCTTTTTTAATAATAAATGATACATCCAACATTCCACGGGAAGATGTTAAGTATATACTACGTGTATGATCAACTGATTAAAATTTCAGGAGCGAGTACAATCAGCTATTGTGGAGGTTATGCTATCAAGATCAGCACCGGTTTTCTATGGTGATATCAGAAGCCATGAGAGGGTACTCTGCAATTTCTTTGAGCATTTACTATTTCTACTGAACATATAGTTTTGGACTTTCATTTAGGTTCTCAAGTAGCCATGACCCTTGTTGATGGTGTAGGTTCCGCTGCCGTTTTCTTCATTCATTGAGTTTTGTAAGAGGGGTTCAGACAAAGATGGAATCCATGATGCCTGCAGTGAGTCAGAGATACTTGAGAGTGTGGCATCCGATGCTGATTTGTGCAATTCGTTAACAAATGCTCGTGATCAGATTTATTTAGCACAGGTTGAAGCTCATAGTCCTGAACTCCTAGTAGACGATTTATAAGTAGTTGAACTAGAAGTTCAGTTTAGCTATAGTAGTACAATAACATAAGGATACATGGAATACTTTGAAAATTTTGGATACACCAATCAGACAAGATAAGAAATAAATAAAAGATGTGATCAGACCAGGCCAAATCTTCAATTTTGGACTACATCACCGTATCTGAGTTAAATGGATAATATTCTCAGTCTCAAATCCACCTCTGTGAGTATTCTTCTTTCTTTTGGGAAATATACTGTGCAGATTTACCAGAATTACACCTATTACTGAAGGCTGAACCCTAATGCCTTGCGAGGATTGGTAATGCTAGACTGCTGGTTAGGGCTTAAAGCCAAACCCTTTTTCAAGAAAAGCAGGGGTGTCATTATATTGCTCCTACCTGTACTGTACTGTACTGTCTCTTGTATCATGTTTTCAGCAGGATTTGAATTACCCTCTTTATCTTTTGAGCAGTGAAGTGATGGCCTCATCTTGTTTATACTTTCTGAAAATAAACAAATGTGACTGCAGGTCCCGATCTTGAACAGGGAGAATGAAGAAAGGGTGCAATTAGAAAGTTTACAGGAAGACATTAAAATAGTATGTTTATGAATCATCGACTTGTTTGTTTTGATTTGCAGCTCTATTATCTGTTCTGATTCTGAATGTATCCTCAGACTTACTGCTTGCTTCTTTTTTCAGCCTTCTTTCTTGGGACCAAATAAATTATCTTCTATCAATTTGTGGATGAATAATGCAGAGTCTAGATCGAGCACCCACTATGATCCTCACCATAACCTTTTATGTGTAGTCGCTGGTTGCAAGCGAGGTAGGTATTTTTTCCTTTGGTTTTCTTCATCTTATGTTTCATTATTGTTGCTTACTGAGAAACTTGCTGTTTTTGTGGACGGATTCACCAGCTATGTGCAAATTTACGAACACTCTTGAAATCTGCAACTTTAATAAATGATCTTATGCATTGCTAGTAAGAGTGTGGTTAATAGGCAGGCCTTCTATTTGTATTGACTGATTGATCTCTTCGGGTAACAAATCCCTATCATGATTGAATTTTGACCATGGTGTAAAAACTAGCCCGAGTTAACTCGTATCGCCCGAGTTAACAAGGTTTTGGAGGCTGGCGATACGAGATATCCCGAGTTGTAAAGGTGTTTTTAAAAACGGCGAGATCTCGGCCGGTTCAACCGATACGAACGAATTTTGTCCGCATTAAACGTTATAAACCTCACATCTACTCGATTTTCAGCCAAATTTCCCATGTTTTCGACAAAAAGAAAGCGAAAAAGGAAAGAAATGGAGAAACTTTATTGAAATAGAGTAGAGAACTCCATTTTCAAATCTAAAACCAGTGAGGAGAGAGAAGGTAGACAAAGGAATTCATTTTAATTATGTCACGTATACGGTTTAGGGGAGGGGGACTACGGTAGGTAGTGAATGGGGATGACATGGGGCTTCTTTTTCAAATTTCAAATTCCTACGCGACAACCGCGACATGGTCCGCGACTAACGCAACATTTCCGTTACCGAGACTCCGCGACCGATCCCGCGACCGTGACCGATACCGCATTTTTTATCTATGATTTTGACACTGTGACAGATCATCCCTCTTGCATTCCTTTATATATTCTTTTAATAATAGAATTCCAATATTATTCATATTAGGAATTAAAGGAGACTTTGGAATAATCTTGTGCTGTTTATCACTAGTTTTTTTTTATCTTCCCATCCTTCTGGCTGGCATTTTTGTGAAAGGAAGTCTGAATAATGACATGGATTGAGATTGGTGGATATTGGAGATGGGAAGAAATGCTGCACTATTGTGGGCTTGTGGCTTAAGACTAATGACATTTCGCCAGCTTCCTTTTCGTATGCCTAAAACTTTTTTAGGTCAAATATCTCGTAGCAAAATTGTTCGTCACATGGACAGTATTTTGAACTTCTATCTTTCTGTTTGTGTATTGGTTTTTAGATAGGAATGACCAATTTTAGATTCTCATGTTAGTTGTGCTTCTTTGTGTGTATCAAAGCCTTATGCACTAGAAAACAGTTCAATTGGCTACATTCAACAACCACTGGAGGTGAAGGTGTTTTTTTATTTTAATTAATTTTTAGGAAAGAAGGAATTTTGTCCCTTCAAACTCAGATGCCAATTATTGTAGCTTTTCCACTTTTTCTTGCAGCATCTGATCTTTCTAGAAAATAACATATGCTGTTATGTTTGTCTATTTGTATTAATTCACTTCTGGAAATTCTACTTTTGGCAGTTGTTCTATGGCCGCCATCTGCTGGCCCGCTCTTGTATCCTATGCCATTATACGGAGAGGCCTCTAATCATAGGTATGCGGACTATACGACAACTTAAGGGGTGTTGAGTAAATTGGAATTGGAGTTTGGGGATTAATCAGTAAGAGTGAGAGTTGGTGATTAGCAATATGGTAATTTCAATCCTTTATTTGGGACTTAGGGTTAATAAATTGAGAATAAAGTGACTATTTACTAAAATATTCCTTGTTAATTTTTCGTATACCCTAGTCATTATTGGAATACGGGTACTTTTCTTTTGCTATTGAATTGCCCTCCCCAACTTCCATCTTCCCCTGGTCGTA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ATGGAGGAATCACTGCGAATTAAAGAATTCGATGAAGTTACTTCCGCTGAAGAATTCGAGTCTCAAATTGAACCCCTAAACGTTCCCGCGGTTTTTAGAGGATGTGTGAAGGATTGGAAAGCTTTCCAGAGCTGGAATCCTACAAATGGCGGTCTCGATTATTTGCAGGAGCGAGTACAATCAGCTATTGTGGAGGTTATGCTATCAAGATCAGCACCGGTTTTCTATGGTGATATCAGAAGCCATGAGAGGGTTCCGCTGCCGTTTTCTTCATTCATTGAGTTTTGTAAGAGGGGTTCAGACAAAGATGGAATCCATGATGCCTGCAGTGAGTCAGAGATACTTGAGAGTGTGGCATCCGATGCTGATTTGTGCAATTCGTTAACAAATGCTCGTGATCAGATTTATTTAGCACAGGTCCCGATCTTGAACAGGGAGAATGAAGAAAGGGTGCAATTAGAAAGTTTACAGGAAGACATTAAAATACCTTCTTTCTTGGGACCAAATAAATTATCTTCTATCAATTTGTGGATGAATAATGCAGAGTCTAGATCGAGCACCCACTATGATCCTCACCATAACCTTTTATGTGTAGTCGCTGGTTGCAAGCGAGTTGTTCTATGGCCGCCATCTGCTGGCCCGCTCTTGTATCCTATGCCATTATACGGAGAGGCCTCTAATCATAGCTCTGTCACTCTTGATTCTCCTGATTTTTCGCTTCATCCACGATTTGAACGCGCGCATGAGTCTTCCCAGAAAGTCACTCTTCAAGCAGGAGATGGGCTTTTTATTCCCGAAGGCTGGTTCCATCAAGTTGATAGTGATCAGTTGACTATTGCTGTTAACTTTTGGTGGAAATCTAACATGATGTCTAGCATGTTGGAACATATGGATGTATATTACTTGCGTTTAATATTGAGAAGTTTCTGCAACATTACAACATTTTATGGTGACAATTTTTTCATGCTGCTTCTTCTTTCCTTTCCAATAGGGCAGAATCAGATGTTGCCGAAAATTTCTGGTGCGGGTTCTGGTAAAGTGAGAGACTGCAGAAGTGAGGCATCTGACAATGAAAAACCAGGTATTCAAGAAAATGTCAAGTTTAATGTGAATGTCAAACTTCATGATCTTTGCCCCCCAACATTTGAAGCTCTTCACAAACTTGTTTCTCTCGTCCATGACGGGGTCAATGCTGTCAGTCAACCATGCCCTTCAACAACTGATTCTAGAGTGATTCCTGATAGTGATGGAAAAAACACGATGATTACTACTAAGTCACTCAATTCGGCCTCTCAACAAGATCAATGCACTTCAAAATGTGATTCAGGAGTTATTCCAGATAAGGACTCCAAGAACATGGTGGTATCTAACTTGTACAGCCTGGAAGATGATTCCATTGCCAATATCCTCTTGAATCTTGAACCAATTGATCTTATGACTGTCTGTCTGGCAATGGTGAACAGTTTCCCCAGAACCTTAGAGGCTTTGATATTACACATGCTTTCGCCAGTAGGGGCTGAAGTTCTTACACGAAAATTTGAGGAGTTAGATCAGCAGATGACTGAAGAAGATCGGAGCGCATTCTACCAGAGGTTTTACAGTGTGTTTGATGATCAGTTTGCTATCATGGATGTGATCTTGAAAGGAAAAGAGTCATTTGCACTTCAGGCTTTCAAGAATGTTTTGCAACTATACATGGGAGTCAGAGAGTGA MEESLRIKEFDEVTSAEEFESQIEPLNVPAVFRGCVKDWKAFQSWNPTNGGLDYLQERVQSAIVEVMLSRSAPVFYGDIRSHERVPLPFSSFIEFCKRGSDKDGIHDACSESEILESVASDADLCNSLTNARDQIYLAQVPILNRENEERVQLESLQEDIKIPSFLGPNKLSSINLWMNNAESRSSTHYDPHHNLLCVVAGCKRVVLWPPSAGPLLYPMPLYGEASNHSSVTLDSPDFSLHPRFERAHESSQKVTLQAGDGLFIPEGWFHQVDSDQLTIAVNFWWKSNMMSSMLEHMDVYYLRLILRSFCNITTFYGDNFFMLLLLSFPIGQNQMLPKISGAGSGKVRDCRSEASDNEKPGIQENVKFNVNVKLHDLCPPTFEALHKLVSLVHDGVNAVSQPCPSTTDSRVIPDSDGKNTMITTKSLNSASQQDQCTSKCDSGVIPDKDSKNMVVSNLYSLEDDSIANILLNLEPIDLMTVCLAMVNSFPRTLEALILHMLSPVGAEVLTRKFEELDQQMTEEDRSAFYQRFYSVFDDQFAIMDVILKGKESFALQAFKNVLQLYMGVRE Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo02359.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902224637|gb|KNA19841.1| (hypothetical protein SOVF_057890 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1077.8 bits (2786), Expect = 0.000e+0 Identity = 544/570 (95.44%), Postives = 546/570 (95.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731336200|ref|XP_010679127.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104894562 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 824.7 bits (2129), Expect = 9.900e-236 Identity = 423/578 (73.18%), Postives = 473/578 (81.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731438006|ref|XP_010646130.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100247818 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 588.2 bits (1515), Expect = 1.600e-164 Identity = 326/583 (55.92%), Postives = 395/583 (67.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. NCBI nr
Match: gi|743867040|ref|XP_011032633.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105131385 isoform X1 [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 581.6 bits (1498), Expect = 1.500e-162 Identity = 320/583 (54.89%), Postives = 389/583 (66.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720075207|ref|XP_010279250.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104613224 isoform X1 [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 574.7 bits (1480), Expect = 1.800e-160 Identity = 315/577 (54.59%), Postives = 395/577 (68.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RJZ5_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_057890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1077.8 bits (2786), Expect = 0.000e+0 Identity = 544/570 (95.44%), Postives = 546/570 (95.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CE11_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g120010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 824.7 bits (2129), Expect = 6.900e-236 Identity = 423/578 (73.18%), Postives = 473/578 (81.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5VGT5_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa004409mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 4.400e-158 Identity = 326/575 (56.70%), Postives = 385/575 (66.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0D2MV41_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_004G076600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 4.400e-158 Identity = 309/572 (54.02%), Postives = 399/572 (69.76%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0B0MHG4_GOSAR (tRNA wybutosine-synthesizing 5 OS=Gossypium arboreum GN=F383_22897 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 564.7 bits (1454), Expect = 1.300e-157 Identity = 306/572 (53.50%), Postives = 394/572 (68.88%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: JMJ30_ARATH (Lysine-specific demethylase JMJ30 OS=Arabidopsis thaliana GN=JMJ30 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 1.200e-18 Identity = 80/269 (29.74%), Postives = 118/269 (43.87%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TYW5_CHICK (tRNA wybutosine-synthesizing protein 5 OS=Gallus gallus GN=TYW5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 1.700e-17 Identity = 88/306 (28.76%), Postives = 130/306 (42.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TYW5_HUMAN (tRNA wybutosine-synthesizing protein 5 OS=Homo sapiens GN=TYW5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 7.100e-16 Identity = 54/151 (35.76%), Postives = 76/151 (50.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TYW5_DANRE (tRNA wybutosine-synthesizing protein 5 OS=Danio rerio GN=tyw5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 84.0 bits (206), Expect = 6.000e-15 Identity = 85/306 (27.78%), Postives = 123/306 (40.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TYW5_MOUSE (tRNA wybutosine-synthesizing protein 5 OS=Mus musculus GN=Tyw5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 3.900e-14 Identity = 52/151 (34.44%), Postives = 72/151 (47.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G19840.2 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein) HSP 1 Score: 479.6 bits (1233), Expect = 2.800e-135 Identity = 279/570 (48.95%), Postives = 347/570 (60.88%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02359.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G20810.2 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 6.600e-20 Identity = 80/269 (29.74%), Postives = 118/269 (43.87%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo02359.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo02359.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo02359.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo02359.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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