Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCCAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAACTTAAAAAAGCATGGAAAATATTGAAGCTAGAGAAGTGGTTAACTTTGGGAAATCTCTTATAGTGCCAAGCGTACAAGAGCTAGCTAAGGAGTCCATCACTCAAATCCCTTCAAGGTATGTCAGAGATAACAGCGACGGAAGCTTGCCGGACCGTCCGGTTGGTGAATCGTCGGCGTTATCAGTACCCGTGATTAATCTTCAAAGACTTCTTGATGTCCATGGTGATTCTAAGGACTCCGAGCTACACAAACTTCACTTTGCTTGCAAGGAGTGGGGTTTTTTCCAGGTACTAGTTGTACCTTTTATTACTAGATACCATGTACTTAATTTTATGAAAACCTTTGTATTCTCCACTTTTAACGAATTTAATCCGATTTTTCGTCCAGGTGAGCGTCACTTAACCAACGTTTTTAATTTTAAAATTAAATTAAAGACGTATTATTAGATTTCTATGTAAAGAAGTTAGATAAATAGGGTTAATATGGATCAAAAGTTGGATGAAAATCATTAAAAGATGGTGAATTTTGCATATTTCAAAAAATTAAGATTGTAAATCTGAATTTATATTTTATAAGTGATTAATACAAAAATTTGAAATTTAAAAGGTGGTTAAATCAAAATTTTGATTAAAGCATTATTTATATAAGCCAACTTGTGAAAAGTTAAACGTCTATCTAAAATATAATTAATTTGTGGGATAATTTTGATAGGTAATAAACCATGGGGTTAGCACTTCATTGTTGGAAACATTCAAGACAGAGGTAGTTGAGTTTTTCAAGCTTCCAATGGAGGATAAAAAAAAACTATGGCAACAAGAAGACAACCATGAGGGATTTGGGCAATTGTTTGTTGTATCAGAAGACCAGAAACTTGATTGGTGTGATATGTTCTACTTGACTACCCTTCCTCTTAAATTGAGAAGGCTTGATCTTTTCAATAAGCTACCACGAAACTTAAGGTTCTTCTCTTTCTTTCTCTGTTTTTCTTTTACAAAATAATTAATATTTTGTTTTACGCGTTGTTTGGTTAACAATAAAATATGGAGGAATTGAAAATTCATGGAAATTTATAAATAGGGTAGTTATTTAGTTGAAATAAAAAAGTAAAAATAAAGAAAGTTGAAATGAATGGGAAGTTAGAATTTCTACAAAACATGAGAAATAAATTACCTAGCCCCCCTTGGTGAATCAAAATTCTCCGGATTTTCTAAAATTTGTATGGCCTGTTTCATTTGAAATTCTGGAATTTGGACAAATAACTTGTTTGGATAGTCCAAGAATTTGGATTTACATTTGGCCCAAATCAAAGCTTTCCAAAAATAAGAACAAAATAAATCATTCGAAATTTAATTTCTCTCTCCTCTGCTTCACACTGGTCCATCTTTTCATCTCTCCGCTTTCTCTCTCTTGGCCGTCATTTCTAACCTCACAACATTCTCTCCTTAAGTTCTCTCTACTCGTTATCCTTAGTTCTCTCTCCTTTTTCATGCACACGAACAGTGATTTCTATCTCCTTCCCTTGTAATGTCTTTGTTGTTTCACAACTCCTTTGTCGCCCGCCATCGTTGTTGTCATCGCCGTCGACTAGTGTTTCAAGATATCCGGCTTGACACTTATGTGCACCTCGAGATGATTCACGTGGAGCTGTAATGAGAGGGCAATGAACGTAACAAGATTATTAGAAGAGTTAGGGTTTGATTTCCCCCCAAATTTGAATCTTGTTTACAATATGATTTTGATTTTCATTGTTGATTAATAAAATAAACTAGCCTATTTAATTGTGAATTAACAAAAAAAAATAATTTTAATTCAAATTATGTGTTGATCTGACTAGGATTAGAGTGTTTAAATTATTGAAAAGTTAAAAAAAACAAGCATGCAAAAATACGCATCAACAAATTTATTTTCTTTGATTAACATGGTAGGGATAATTAATAAAATAAGATTTGAAGAGTAATTTATTTTGGATTTTCTAATTTCATGAAATAATTTGTGTATTTAGAAAGCAGGGTTGTGGAACTAAAATTCTAGAGTTCACTTTAAATCCCGTTGATTCCCGAACAACATATTAGCATTTAAAATTGTGGAATTGATATTCTCATGTTTCCCAAACATAAAATTAGGAATTGAATTTCAACATTTCAATTCCAGAAATTGATCGAATTCCATGATTTGAAATAAGGGTGATGGTAAAGGTCGCAAGTTGCAACAAAATCTAGTTGTATCCTACGTGTCAGATTCTAAATGGTACATATGGGCGCCACGTAAGTCATGCGTCATCAAAATATTTTTACTATCAATGCAATACTTTTATTATGAAAATATGTAAATAAAGTAATCGATACAAAGAAGAAAATAAATGTTTCCTATACAAATCATAAATATTTTTTTGAAATAAAATTACATTATTCAATTTGTAAACTAAAATATTAAGATTTTCGTGTCTTTTTTGTAACATGTATAATAGGTTATATAAGTTAAATATTTTAGTTTCCAATTTAAATCATGATACATACCATGTCATGTCATCATTGTGACACGCTTTAAAGTTCGCAAGTTGCGGCCTTTATCATTTTTGTTAAAATTAATTCCATGTTTTTAAACACAACCTAACGAAATTCCCATGAATTTAACAAGGGAAGTAATTTTCTTTGAATTACAACTTCCTATGAGATTTAATTAAATGTCAATCAAGCAAACACTTAGTTTTGAATGACGGTTAATTCTTATAAAAGATGGCATAATTGAAAGATTTCGCATCGACAAAATTTAGCTAAATTATTTATTGGTACCTGTTTTGGACAAATTCTGCTTAGAGCCGAGCTTGTCTTTGTTAGGTTATGATACATATGACAAAACATAAATCATGTGGAAAAACCATAAAGCCAGGAAACATATTATTCACACATAACGATTTAGCATAATTCAGATGCATACACTTTGTTGCGTGCCCTCCCTAGCTGCGCCCGAACCGAANTAATCCGATTTTTCGTCCAGGTGAGCGTCACTTAACCAACGTTTTTAATTTTAAAATTAAATTAAAGACGTATTATTAGATTTCTATGTAAAGAAGTTAGATAAATAGGGTTAATATGGATCAAAAGTTGGATGAAAATCATTAAAAGATGGTGAATTTTGCATATTTCAAAAAATTAAGATTGTAAATCTGAATTTATATTTTATAAGTGATTAATACAAAAATTTGAAATTTAAAAGGTGGTTAAATCAAAATTTTGATTAAAGCATTATTTATATAAGCCAACTTGTGAAAAGTTAAACGTCTATCTAAAATATAATTAATTTGTGGGATAATTTTGATAGGTAATAAACCATGGGGTTAGCACTTCATTGTTGGAAACATTCAAGACAGAGGTAGTTGAGTTTTTCAAGCTTCCAATGGAGGATAAAAAAAAACTATGGCAACAAGAAGACAACCATGAGGGATTTGGGCAATTGTTTGTTGTATCAGAAGACCAGAAACTTGATTGGTGTGATATGTTCTACTTGACTACCCTTCCTCTTAAATTGAGAAGGCTTGATCTTTTCAATAAGCTACCACGAAACTTAAGGTTCTTCTCTTTCTTTCTCTGTTTTTCTTTTACAAAATAATTAATATTTTGTTTTACGCGTTGTTTGGTTAACAATAAAATATGGAGGAATTGAAAATTCATGGAAATTTATAAATAGGGTAGTTATTTAGTTGAAATAAAAAAGTAAAAATAAAGAAAGTTGAAATGAATGGGAAGTTAGAATTTCTACAAAACATGAGAAATAAATTACCTAGCCCCCCTTGGTGAATCAAAATTCTCCGGATTTTCTAAAATTTGTATGGCCTGTTTCATTTGAAATTCTGGAATTTGGACAAATAACTTGTTTGGATAGTCCAAGAATTTGGATTTACATTTGGCCCAAATCAAAGCTTTCCAAAAATAAGAACAAAATAAATCATTCGAAATTTAATTTCTCTCTCCTCTGCTTCACACTGGTCCATCTTTTCATCTCTCCGCTTTCTCTCTCTTGGCCGTCATTTCTAACCTCACAACATTCTCTCCTTAAGTTCTCTCTACTCGTTATCCTTAGTTCTCTCTCCTTTTTCATGCACACGAACAGTGATTTCTATCTCCTTCCCTTGTAATGTCTTTGTTGTTTCACAACTCCTTTGTCGTCCGCCATCGTTGTTGTCATCGCCGTCGACTAGTGTTTCAAGATATCCGGCTTGACACTTATGTGCACCTCGAGATGATTCACGTGGAGCTGTAATGAGAGGGCAATGAACGTAACAAGATTATTAGAAGAGTTAGGGTTTGATTTCCCCCCAAATTTGAATCTTGTTTACAATATGATTTTGATTTTCATTGTTGATTAATAAAATAAACTAGCCTATTTAATTGTGAATTAACAAAAAAAAAATAATTTTAATTCAAATTATGTGTTGATCTGACTAGGATTAGAGTGTTTAAATTATTGAAAAGTTAAAAAAAACAAGCATGCAAAAATACGCATCAACAAATTTATTTTCTTTGATTAACATGGTAGGGATAATTAATAAAATAAGATTTGAAGAGTAATTTATTTTGGATTTTCTAATTTCATGAAATAATTTGTGTATTTAGAAAGCAGGGTTGTGGAACTAAAATTCTAGAGTTCACTTTAAATCCCGTTGATTCCCGAACAACATATTAGCATTTAAAATTGTGGAATTGATATTCTCATGTTTCCCAAACATAAAATTAGGAATTGAATTTCAACATTTCAATTCCAGAAATTGATCGAATTCCATGATTTGAAATAAGGGTGATGGTAAAGGTCGCAAGTTGCAACAAAATCTAGTTGTATCCTACGTGTCAGATTCTAAATGGTACATATGGGCGCCACGTAAGTCATGCGTCATCAAAATATTTTTACTATCAATGCAATACTTTTATTATGAAAATATGTAAATAAAGTAATCGATACAAAGAAGAA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This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
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Match: gi|255557477|ref|XP_002519769.1| (PREDICTED: protein SRG1 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 493.0 bits (1268), Expect = 4.400e-136 Identity = 244/361 (67.59%), Postives = 290/361 (80.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. NCBI nr
Match: gi|460374405|ref|XP_004233001.1| (PREDICTED: protein SRG1-like [Solanum lycopersicum]) HSP 1 Score: 491.9 bits (1265), Expect = 9.900e-136 Identity = 238/353 (67.42%), Postives = 290/353 (82.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. NCBI nr
Match: gi|970009219|ref|XP_015065479.1| (PREDICTED: protein SRG1-like [Solanum pennellii]) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 3.800e-135 Identity = 238/353 (67.42%), Postives = 289/353 (81.87%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B9I8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g200840 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 556.2 bits (1432), Expect = 3.000e-155 Identity = 275/367 (74.93%), Postives = 318/367 (86.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9S1A0_RICCO (Flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0635750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 493.0 bits (1268), Expect = 3.100e-136 Identity = 244/361 (67.59%), Postives = 290/361 (80.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: K4B8C6_SOLLC (Uncharacterized protein OS=Solanum lycopersicum PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 491.9 bits (1265), Expect = 6.900e-136 Identity = 238/353 (67.42%), Postives = 290/353 (82.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061GL78_THECC (2-oxoglutarate and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_029579 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.400e-133 Identity = 238/369 (64.50%), Postives = 290/369 (78.59%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061GEK4_THECC (2-oxoglutarate and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_029579 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 482.6 bits (1241), Expect = 4.200e-133 Identity = 236/362 (65.19%), Postives = 287/362 (79.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SRG1_ARATH (Protein SRG1 OS=Arabidopsis thaliana GN=SRG1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 2.100e-101 Identity = 179/352 (50.85%), Postives = 250/352 (71.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DIOX2_PAPSO (Probable 2-oxoglutarate/Fe(II)-dependent dioxygenase OS=Papaver somniferum GN=DIOX2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 359.0 bits (920), Expect = 6.300e-98 Identity = 178/364 (48.90%), Postives = 253/364 (69.51%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DIOX3_PAPSO (Codeine O-demethylase OS=Papaver somniferum GN=CODM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 350.9 bits (899), Expect = 1.700e-95 Identity = 175/363 (48.21%), Postives = 246/363 (67.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DIOX1_PAPSO (Thebaine 6-O-demethylase OS=Papaver somniferum GN=T6ODM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 349.0 bits (894), Expect = 6.500e-95 Identity = 175/364 (48.08%), Postives = 248/364 (68.13%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NCS1_COPJA (S-norcoclaurine synthase 1 OS=Coptis japonica GN=NCS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 251.1 bits (640), Expect = 1.800e-65 Identity = 140/361 (38.78%), Postives = 209/361 (57.89%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G17020.1 (senescence-related gene 1) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 1.200e-102 Identity = 179/352 (50.85%), Postives = 250/352 (71.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G25310.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 1.700e-101 Identity = 186/352 (52.84%), Postives = 246/352 (69.89%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G25300.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein) HSP 1 Score: 365.2 bits (936), Expect = 4.900e-101 Identity = 185/351 (52.71%), Postives = 243/351 (69.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G17010.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 8.400e-101 Identity = 185/366 (50.55%), Postives = 256/366 (69.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02765.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G78550.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein) HSP 1 Score: 362.5 bits (929), Expect = 3.200e-100 Identity = 184/351 (52.42%), Postives = 248/351 (70.66%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo02765.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo02765.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo02765.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo02765.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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