Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGTTGCCAAGTGGAGATTTATGTTCTCATCGTCGAACCTTCCCTTTCGGGAATGGGGACAAAAGTAGGTGTCTACACTCCGGTGGAAGATGACGAGTGTGAAGTGGTTACTACTCAGATTTTATTTGGCACCATTCTAACTTCAGTTGTCACCACCATTCCAATTCGAGGAAAGGTTGAAGAGAGTAGGGAGAATGCAGATGGGGATGTTGGTCTGCAGGAGGAAAAATTAAGGTGGTGTACTCCGACTTAGATGTGTAATACTCCCTCCGCCCCTTAATACTTGCACCGCTTTCCTTTTCGGGCCGTCCCTTAATACTTGCACCGTTTCTATAAATGGAAATTTATACCAATATTATATTATTTCTCACACTTACTTACTAACCCCACCTACACCCCTATTTCCTACAAAAAATCATTTAAAAATTCACACCCCCACTCACCACTCCCCACCTTTTACACATTTTCCGCTAACTATATTAAAAAAATACCTCACTATCAACTAACACCCATTAAATTAATAAGTAAATTCAAATGTCTTAAACTCCGCATCGGTCAAACCGGAGGGAGTATGAGGACACGACAATTAGCAGCTTGGAGTATTTTGGTGGTTTTTGTAAAGTTTTTGGTGTTTTTAGTAGGTCGGTTGCGTAAAAGAGAAGTTCTGGTTGCAAGTTTTTGGGTTTTGCCGGATGTTATACTGAAACCTACTTATTAATACTTCTTCCGTTCCACAAATATCGCACCATGTTGTCTTTTACACTATTCACGTGTGCCTTTGACCATCTTTTGTAAAATATACGTAAAAAATGTAATCATGTAAGATCTTATTAGATTCGTATAGATATATATTTTCTGAATATCAATTTTTAATAATTTTTACAAATATATAATTCGAAAGATAACCTGTCAAAGTCAAGTATTGAAAATGGTAAAGTTAACATTTTGTAATATTTTCAGAAAAAGAGTGCAATATTTCCAGAAAAGAGAAGTATAATATTCACGTTAAAACAAAAAAAAACATTCATCCGAGTCTTTTCTCAAATCCCTAATTAACATTGAATATCATTTTCGCACTTGATTTTCCCTCAATTCTGATTGAATTCAATACTTTCTCATCATCTTTTTGCTCGATCAAATCCAGTGTGAGATTGTATTTTTTAATTACTCAAAATTTGAAAATTTCTGGTTTGGTTTTCCCTAATTCTTAGATTTTTTGATCTTGTTCTGTAATTTCTTTTGGATGATTCACTTCACTGAGAAAAGATCAAGACTTTCTGGTTAATTTCATGTCAATTCTTCAGTTGGTAGGATGAGTGTCCACTCAATTGGAGGAGCAAGTACTCCAAAGACCTTTGATGCTTACCCCCGAGTCGAAATCGATATCGAGTCATTAGGTTTTAGAAACCCTAGAAGAGCTAGAAATTCTAAATTTAATCTCATAAAAATGTTTAAATCAGCTGCAAACCGTTTCAAGTGTTATTTCAAGTTACATCCTGTATTGGTCTTTTTATCAATTTTGTCATTTGGGGTGGCAATTCTAACCATTCTTTCATTTTATGAAAACCGTGTTCGATTAGTGTATACTTATAGGAAAATTGATTCGAAACCGGAAATTTATCCCCTTCCGAAGCTTAAAAACCTTGTGATGGTTGCTGGGCATTCAGTTTATACTAGTAATGATTATGGGAAAGTTGACAATGAGAAATCTTGGTTTTTGGAGTCTTATCAAATGCACCCTGGCCAAGCTGCCACTTTTTTGGCCCATATAAAACAGGGTGTTGAGGTTGCAGCGAAGGATGATCAGGCTTTGTTGTTATTTAGTGGGGGAGAAACTCGAAAGGATGCCGGTCCCCGTAGTGAAGCCCAGAGTTATTGGCTTGTTGCTGAATCGAAAGCGTGGTTTGGTGAGTTCTTATTATTGTGTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCACTTCCTCATTTGTTTGATTAATGTGTACAATATTCTTTCACTGAGCATTGGTTAGTGCTTTATTTTCTGTGGCTCAAGTTTTTGTTGTATGCATAATAATTGTTATTCGAAAAAAAATGATCATCCCTACAATGGTAAAAATGAACATGTTAAGTAGTTAAAATGTTGTTAGGTGTTCCTTAGAAGTTTGAAGAATTGCTTAGTATTTTAACTTTTCTGAAACCACATGAAGCGAAGTCCTATTTTTTGAGTGATGCTGTGGATACCAGCTTTTCTTGCTGGAACAAATAGAGATTTGTGTGGAGAGAGTTGAGCTTGTTTGAGCAAAAGCGAGTTAAAAAATGATCAAGGTCTCCAAAATTATGAATAATTTTTTTTGGCAAGCAAGTTAAGGTATTACTAATCAACCAAAACCAAGTTACACCAAGGGAGGGAAGAGAAACAGCCTTCTCCTACAGCCCAAACCAAACAAAGGGCTAAGAACACTTAGCCTAAAAAATGGAAAGCAAAAGCCAGCTTACAACTTATATAACCAATCTATATCTCTACTAGACACTTTCTTGCCAATCAGATTCTGCACTCTACATTTAACATCACTCTGGACCTCCTTGAGAATTCTCTGTGTACAGTAGGGACTTGAAGGTTCCAGATAACAGAATTCCTAGCTTTCCACAGATGGTACACCATAGCTGTTGCAGTGGTAAGCCACTGTCCTTCTGAACTCACTAGATGCAGTTCTCTGGAGACATTTGAGAAGAGCACTAAGACCAGTCTTGCAGTGAGAAAACCCTAGCCATCTCATGACTTCAAAGCCACATTCAGAACATCCAAAGAACAAATGATCTACAGTTTCTGGAGAGACCCCACATATTGGGCATACACAATCATCAGCTATCCCCATCCTTGGTAATCTGGTTCTGGTTTTCAGCTTGTCTAAGGTAGCTAGCCACAAGATGAACCTGTGTTTAGGAACAGACAATCTGTTGCACACATACCTGGGCCATTGCACATTCTCCTCTTGAGTGATATTATTTAGATACATTTCTTTGATAGAGTATCTAGGGGCATCAAGCCATTGGGAAGAAAGAAACATTTTGGATAAACTGATTTTTGACTTGATATAAGAACTTCACCACCCAACTTGCAGAAGAAGAGGGAGTGAACTAGACCCAGGACTTATCCTTGATGTATAGGGTGTGAACCCATCTCACCCACAAGTTCTCTTTCTTTGGAGCAATAGCCCAAGCCAGCTTTCCCACAACAACTTGGTTCCGTAACATGAGGTCAGCACCAGGTCTGCAGTCATCATAATTGCTATGCCACAGAAAAGCCCTACAAAAGTACAAATGGCATTGATCTTTGTAAGACAACTTTGGGGAAAATGAAGATCTGAGCCCAATACACAATACACACAGATGCTCATCAATACAAAATTAACCAGTTGCATCCTACCAGCAAAGTCGTTGTTCTTGGAACTCCAAATTTTGATTCTGAGAATCATTTTTTCCACAAGAGCTTCACAGTGAGACTGTTTCAACTTGCAGGTACTGATGGGAGCACCTAGATACCTGAATGGGGAAGCGTGTGTTCTCTGCAGTAGTGTCCACTTCAGACCTACTGAGACCACAACAGTAGATGGATGATTTAGAAGCATAAAACACCTGAAAACCTTCCATCATTAGCTGAATAACACCATTTCCCCCTTTACTGAACATCAATTAATTATCCGCAAAACATAGATGATTAAGAGCTAATCTTCTACACCTTGGATGGAACTTGAAAAGAGGGTGCTCATCGACTGTGATCATAGCTCTGGAGAAATACTCCATACAGCCAAGTTAAATTAAATAAAAACCAAGATAGCTTGTCAAGCTAAAAAAGCAAAGAAATTACAGCCCAAGCACTAGAACAACAAAACCGAAGTTAGCAACTACTGCTAACTACACATTTACACTAATATCAAGTCCTTCAGCTCATTAGAGCATCTACAATAAATCCTAAAAGAGATTTCTTTTACAATATTGTCTACAGTCTTAGAATTCTGTGTAAAGATGACAGCGTCCCTATGCAGCCAAATTTCGCAAATAGCTTCAGTGAAGCAAATAACATAATGCTTTGCCTTGGGCCTGTTCTTCTTAATCATTTCGTACGGCCACTGCCAAACCTGCATCAAAACATGCACTGTTTTTCATGATTCCAGCATGCTCAAGATTCTCTTCCAAATATCGGCAGTAAATGGAACTTAAAAAACAAATGTTGGACAGATAACTCACAACTGTTACAAAGCACGCACACAGAACAGTTAACACCCTATTTGCTGAGCTCAGTGTTACCTGGTTCGCCCCTAACCCCCGCGAACCGCGAACCGGTTCGCCTGTACCGATTCGCGATTCGCCGGCGATCCAATTCGCTATTTTTCACGAACCAAACCAAAACCCTAATTTTAACGATTGAAGGTCCGGGAAGGCGATAGAATGATAAAATATGTTGGGGCTTTTGTTTGAGAAGGACATACACGTTGATTGCGATCGTCAATTGTTGTTTTTGTTGTTCTTTCTTCTTGCTGAATCTAAGCACCATGGGAGAGACTGGAACTCTAGATGTCGATGGTGAAGAATGAAGATGATGAATTGTACTTTTTGTTTTTATTTTTTTACTTTGTTTTGCACTTTTTGTTTTATTATAATACTTTTTGTCTTATTATTATACCTTTTCTCTGTACTATTGTTGTGCATTGCACATAGGTCATGGGTGTGATGTCCCATTATTTTATTATGTTTCTTTTTGCCAATTAACTTCTGCCTTTTTAGTTTTCACGTGACTTTGCTAAGGATTGTGTAATTAGCCAGAATGAATTTTCCTTATCAACTTACTATTATTATTATTTTTATTGCATATTACACTCCGTACTTTAAAATGTAACTACACAAAAAAAATTCCATACTTCTCTCGCGAACGTAAAATCAGCTACCTACGAACCGCGAACCCGAACCCGAACCCGTACCCCGTACCGAAACGAACCACGAACCAGGTAACTCTGGC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MRCQVEIYVLIVEPSLSGMGTKVGVYTPVEDDECEVVTTQILFGTILTSVVTTIPIRGKVEESRENADGDVVGRMSVHSIGGASTPKTFDAYPRVEIDIESLGFRNPRRARNSKFNLIKMFKSAANRFKCYFKLHPVLVFLSILSFGVAILTILSFYENRVRLVYTYRKIDSKPEIYPLPKLKNLVMVAGHSVYTSNDYGKVDNEKSWFLESYQMHPGQAATFLAHIKQGVEVAAKDDQALLLFSGGETRKDAGPRSEAQSYWLVAESKAWFGGGNIRERALTEEHARDSFENLLFSVCRFRELTGTYPQNITVVSYDFKEERFAQLHRLAIGFPASRFSYVGTPASATSEAAAKKGESLVRSQFENDPYGCLSSLRHKKLRRDPFHRSIPYPSGCPEIEGLFKYCGMSLYGGPLPWG Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo04263.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902208385|gb|KNA15935.1| (hypothetical protein SOVF_093820 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 613.2 bits (1580), Expect = 3.300e-172 Identity = 299/299 (100.00%), Postives = 299/299 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731356381|ref|XP_010689647.1| (PREDICTED: uncharacterized protein C57A10.07 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 605.5 bits (1560), Expect = 6.900e-170 Identity = 293/336 (87.20%), Postives = 310/336 (92.26%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009138079|ref|XP_015886394.1| (PREDICTED: uncharacterized protein C57A10.07 isoform X1 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 483.8 bits (1244), Expect = 3.000e-133 Identity = 236/343 (68.80%), Postives = 271/343 (79.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. NCBI nr
Match: gi|595790955|ref|XP_007199226.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa021931mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 482.3 bits (1240), Expect = 8.800e-133 Identity = 231/333 (69.37%), Postives = 270/333 (81.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645264359|ref|XP_008237639.1| (PREDICTED: uncharacterized protein C57A10.07 [Prunus mume]) HSP 1 Score: 481.9 bits (1239), Expect = 1.200e-132 Identity = 231/335 (68.96%), Postives = 270/335 (80.60%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R8W8_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_093820 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 613.2 bits (1580), Expect = 2.300e-172 Identity = 299/299 (100.00%), Postives = 299/299 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BPX9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_9g208430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 605.5 bits (1560), Expect = 4.800e-170 Identity = 293/336 (87.20%), Postives = 310/336 (92.26%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: G5DWY3_SILLA (Putative uncharacterized protein (Fragment) OS=Silene latifolia PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 6.500e-151 Identity = 258/336 (76.79%), Postives = 290/336 (86.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: G5DWY4_SILLA (Putative uncharacterized protein (Fragment) OS=Silene latifolia PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 538.1 bits (1385), Expect = 9.400e-150 Identity = 256/336 (76.19%), Postives = 290/336 (86.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5W0V5_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa021931mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 482.3 bits (1240), Expect = 6.200e-133 Identity = 231/333 (69.37%), Postives = 270/333 (81.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: YDJ7_SCHPO (Uncharacterized protein C57A10.07 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=SPAC57A10.07 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 191.4 bits (485), Expect = 1.900e-47 Identity = 106/245 (43.27%), Postives = 141/245 (57.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: YO238_YEAST (Uncharacterized protein YOR238W OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) GN=YOR238W PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 1.500e-15 Identity = 54/147 (36.73%), Postives = 77/147 (52.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04263.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G21370.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 450.3 bits (1157), Expect = 1.300e-126 Identity = 230/347 (66.28%), Postives = 267/347 (76.95%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04263.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo04263.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo04263.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 2
BLAST of Spo04263.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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