Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAAGGACGAGGGGTGGGTTGGATTGAGATTGAGAAAAGAGACATGAGCCAAACCGAGTCAAACATCACGAGTGGCGAAGCGGAAACATTAGTAGAAGCAGCATTGCGAGTGTTGAACACAGCAGACCCCTTTGAGAAGGCTAAACTTGGTGACGCTGTTGCTTGCAAATGGCTTCAAGGCATCATTTCTCAACCTTACCATTCTTCTACCGACCTTCAAATCCCTGATCGCCCAGCACGTCCCGCCAATGTAATCATCTTCTTCTGCAAGTTGTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGGTTTTGCAATTGCATTTTACCTATTTGATAAAATGCCTAAGAGAGTGAGTTTTTTTTATTTTTGTTTTTAAATTTTTTATTCATGTGCAGGTCAAGTTGTTGTCCCCAAGTCTTATGCCCAAGTTGGGTAAAGCTGGCAGCCTTCATAGCCGTCAAGCAATTATACACAGTCTTGTGCATACTGAGAGTTGGGCCATTGACTTATCATGGGTAATAATCTTGTCATATCTACATTTTGTTTGGTATTACTGCTGTTGTTCATCACATTTGAAGTAGTTATAAGTTTTTACACATACACAAGCGGCAGTGTGAGACCAAAGAGATATGGAATGAAATGGTATGGAATCTCATACCATAGGCGTATGGGTTCAAATTCCCATACCAGTCTGAAGTTGTTTGGTTTGCTTTTGGAATGGATTCTATATCCTATTCATAATGTTTGATTTATTTTTGGAGTGGAATACTAAACATCTGAACATAAAAAAATTTAATTTGTACATTATGCATCAAAATTAATAAAATACTTCTTCCGATTTTTAATACTCGCAACGTTTGTGATTTCTACACTATTCACATATTATACTTTGACTATTGTTGATGATTTATAGGTAAGTTAAAACATAGTCATGTGGGATCTTGTTAGATTCGTCTTAATATGTATCTTCAAAATAATAATTTTTTATAATTTTTGCTTAAAGAGAATTAAAATATAAATGATTAAAGTTGTGCATTGGCATGCGTGAAAGTGACAAACGTTACGAGTAAAAATGAACTGAGGAAGTATAATTTATATGTTTTTGCACCTCCAAGTCTCCAACCATCTCTGTCCTCAATCCTCATCATATCCCCCATTAATGTACTACTAAGTCCTTCACTCCATCACTGAGAATACATCGTCAATGGTCATCATCAATTCGACTTCCATTAAAACACCACTTCCTCTATCACCTTATTCCATCTGAAATGCCATATGACTTCATCACTGTGAGTTTTCGCCCATGTAACTTCATCGCCAACATTTTTATGAACAAGATTGATCAATACACCTTCATCATTTGCATTCTCTTTGTATCTTAGTGTTTTAATTTACAAATTGAGTTTTTGAATACTCAATTGCCGACATTAAGATGGAGGATACATTCCATCGATCTAAAATAACAGTCATCACCCACGTCCTCGGTCAAGTCGCCGGAGAAAGAGTAAAGTCTGGCCGGTGACGGTGGTTAGATCAAAAGTGGTGATGTGCTGTCAACCTATTGTGTTGGTTTTTTTTAGTTAGGGTTTGTATCTTGGGTGGAATGGATTGTGAATCTTAGGGGGTAAGGTGGGTATGAGATTCTAGGGGGATGGGATGGAGTTAGAAACCCCTAGGTATGAAGTTCCATACCAAAATGTCTCAACCAAACAATAATATGGATGGAATGGATTCTAACTCCATTCCAACCAATTCCAAAAAGCTCAACCAAACACCAGTCCTTTTTATACAATTTAAAATGTATAGATTCTTATCCAAGACCAAATACATCACAAAAGAGGCCTAGAAGTAACTTTTGAGTTAGATTTCGTCAAAACACCAAAATTCATAGTCTATTTCGTGGCTGTAATGCTTATAATGTTATGTTGATGATGCTATGCATGCATGTTTCTTCTCTTGCGTGTACTTTATATTTGATAGTTTGGGCGGCATAACAACGAATCTAGATGGCAAGTTTGATTACTTTGGCGACGGGGAATAAATCTGGTTCTTACTAGTTTCTACTTTGTGTAGGATTTTACTTAGTTTCTTAGCTAGAGTAGTATTTGTGTTAAAGTTGGCTTACACGTTTTTACTATCTTACTAGGGAGAGGTTGTACTTTAAGTTGTTACTAGGATGCTTCATTTACCTCAAATTACCCGTGTTGGATGATTGGATCGTCGACAAATCATGGAATTTTTTCATAATTTAGCCGAGTCAAACACTTGGACATGTATCCGTTCCCGACACTAGTACCTGTCTCCAAATAACATATCCTTTAAGCATATTAGATTTGCTTCTTATTTTCAGATTTGCCATCCTTGCCGAGTTAGTTTTCTACTTGGAATTTATTTATGTTTTCTTAGTCTTCATATGCCTTTGGCTTTTAGGAATCCCAAGCTAGGTATGATTAGTTTTTCTGTTTTGTGTATCCTGTTTAGAGGCCCGATTGACTTATGCTATTAAAATCAGTTTTGGAGTTTATGATGAGCTTATGCTTTCTAGGTTTAGGAAGTTAAACCAAACATACAAACAAGACTTATTACTCACTATTAATTCAAAGGAACACATAAAAATCAGAAAACTCTCTATAATTATGCATCATTAACAGTTCACTTCATCTCGTGTGTGTTGGATTGTGTCAGAAACTTGGTGCTCCAATGATCATATGGAATCCTTAAATGGCACTTAAATTTTCTTCCAGACACCTCAATTGTTTCAAATAACGTATTCATAAAGAATATAGGTAAAAGAGAAGCAAGAGAAGAGAAAACCATGTGATATATCATATGTGCTCAAAACGACCTATGCTCTTGGTATCATACTTTAACAAGGAAAGAAAAAGAGTCAACACAATGTTTAAAAAAGCTCAAGGTGCATTGAGGCGATGAGGATCCTTCTACTCCCCGGTGCACTCTTAATAAAAGTTGAAATATTTGGTGTAAAAGAAACAGTTGTGTGGCTTTTGGTGCGCTGCACCTACCCCTCGTGGAAACTGCAGGCACTTAACCCTTAAAGCCTTATGCGCGCCGTGCCTTTTCTACACTGAGTCAACCCTGAAATATGCATATATATTTGCAACATGAAAATCATATACAAAATTCTTTAAAATCATGAATGTTGTGTCGCTGCACTCCATTCCAATTTTAGACAGTCCCATTTTGATGCATCAGGCGCGTGGATATGTACGTGTAGTCTCATACTTGTGTCTGAGTAACGTATAAGCTCATAAAGCTATATTGTTTTTGGCTTCCCAAAAGCTGAAAAAATAGTTCAAGAATACGTTATGTAAGCTTTACTGTTGAATATTGGTTATGAATTGAGCTTTCTGGATGAGTTTTTGCTCACAAATTACTCTCTGTATACTTCCTCTGTTTTATTTCTGATTTTTTTTTTATAATTGCACCGTTTGATGTTTCACACTTGCCTTCAAAAGAAGTTATGGTTACACTTCGGCTCGCTCATATCATAAAATCACTTTCTTGACCTGGCCGGGGCCGGGAGAAAGCATTAGCAAAAGGAATAGGAATGCCCCCAGCAGAAATTACTTATTTTCGAGATCCCGTGATAAATTCTTCTGATCGCCAATTCATACTAGATCTTACTTGCCAATGGTGATGAACCTAACAAGATCCCACATGACTATTACTTAAGTGTAAATTACAAAAAATTGATAAAAGAGAGTGTGTGAATAGTGTAAAATTATAAATGGTGCGATTATAAAAATAAAAATAAAAATAAAAACAAAGTATCCTTTTGCTGTGGTGCTTCTGTTCTATGATTGATTTGGTTACATTCTAATTCGTATTATTCAACTCATTTTTTTATACTATTGTGTTGGTCTCAATAGCTTCTATATTCCCAATTAACTTTTAAATGTTTTTCAGGATATTATTGCTCGTTTTGGCAAACAAGAAGCAATGCCAAGGGAATTCTTCACAGATTTTGTTAAAGTTGCACAGGATGAAGGTAGACACTTCAGCCTTCTTGCTATCCGCCTTGGGGAACTGGGCTCTTCTTATGGAGCTTTGCCGGCCCACGATGGTCTATGGGACTCAGCGATTGCAACATCAAATGATCTTTTGGCACGGTTAGCAATTGAACATTGTGTCCATGAGGTAACTCCATTTAGTCCCACACACTGATATTACTGTTTGATTTCCCTGCATTGTCCAAAAGTTTACCAAATTTCCACTTTCTAATGTTAAAAGGTTTTATTAGGTGATGCCTTCTGTACAGTGTAGAGCTTTTATCATATTTCTTACCTAGATTGTCATATTAGGTAGTAGGTATATAAAACTATGCTTATTCTGGTACATTTCAGAATCCAAGTACCAAGAACACAATACATCAGGGACTCAGAAACAGAAAGATCGGTAATTTAGAGCATGAATAAAGTGTGTGCTGACATGTTCTCTTTCTTTTTTTGCATAGTAATTTGATGGGAGTTTTGGAACTGTTTTTCTACCTTCTCTCTTATTCTATTACCCTGAGGAAAGGCGAGCAAGAATATGTTTAGTTAGAAGTTATATATGGCTTTAAATCACCCTAAATTTAAACAAAAACAATAGGATACAACTTGACTTTATTAACCAAAGCAGGAGTATTTGTTTTGCACTTCACTCGTGCACAACATTGGAAAACCCATTCAAGAAAAATAGAAATTGAAATAAATCTTATGACTATTTACTCGCAAGCGGGATGAAAAAATCACTGGACTCGATAGCCGGGTCAACGATTTTGAAGACCACTGGACTAGCACAAGGCTTCCCTTGCCTTCCCCATGCAACACCATGATAATGATTCTGTTAGTTGTGACCTTTCAATAGTGTGAATGAGGAAAAACATGGTAGTTTTAGGTTTTCTACATTTTTATGACCCATAAATTAGTGGCATTTGGGTTGCTGATTATATCCCTGTGGCGTTGATTATGTCTTGTTGCTTATGTGCTGTGCAACATGT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MSQTESNITSGEAETLVEAALRVLNTADPFEKAKLGDAVACKWLQGIISQPYHSSTDLQIPDRPARPANVKLLSPSLMPKLGKAGSLHSRQAIIHSLVHTESWAIDLSWDIIARFGKQEAMPREFFTDFVKVAQDEGRHFSLLAIRLGELGSSYGALPAHDGLWDSAIATSNDLLARLAIEHCVHEARGLDVIPTTIARFRNGGDDKTADLLETVIYPEEITHCAAGVRWFKYLCLRCTNRSPNEESGIKQVEDDDAVIQKFHTTVRTFFRGPLKPPFNVEARRAAGFVPEWYEPLAVKELEASP Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo07549.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902218114|gb|KNA17961.1| (hypothetical protein SOVF_075190 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 625.9 bits (1613), Expect = 3.600e-176 Identity = 305/305 (100.00%), Postives = 305/305 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731365418|ref|XP_010694515.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104907298 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 2.300e-146 Identity = 256/305 (83.93%), Postives = 272/305 (89.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870845618|gb|KMS98307.1| (hypothetical protein BVRB_4g093750 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 2.300e-146 Identity = 256/305 (83.93%), Postives = 272/305 (89.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. NCBI nr
Match: gi|224113181|ref|XP_002316417.1| (hypothetical protein POPTR_0010s23920g [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 485.3 bits (1248), Expect = 7.600e-134 Identity = 238/304 (78.29%), Postives = 262/304 (86.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. NCBI nr
Match: gi|565389509|ref|XP_006360496.1| (PREDICTED: uncharacterized protein HI_0077 [Solanum tuberosum]) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.700e-133 Identity = 230/287 (80.14%), Postives = 259/287 (90.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9REN9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_075190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 625.9 bits (1613), Expect = 2.500e-176 Identity = 305/305 (100.00%), Postives = 305/305 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BEB8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_4g093750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 1.600e-146 Identity = 256/305 (83.93%), Postives = 272/305 (89.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9HUX7_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0010s23920g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 485.3 bits (1248), Expect = 5.300e-134 Identity = 238/304 (78.29%), Postives = 262/304 (86.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M1CLW6_SOLTU (Uncharacterized protein OS=Solanum tuberosum GN=PGSC0003DMG400027322 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.200e-133 Identity = 230/287 (80.14%), Postives = 259/287 (90.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067EVT4_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g022031mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 481.5 bits (1238), Expect = 7.700e-133 Identity = 231/299 (77.26%), Postives = 260/299 (86.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Y077_HAEIN (Uncharacterized protein HI_0077 OS=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) GN=HI_0077 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 4.600e-22 Identity = 85/277 (30.69%), Postives = 133/277 (48.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G04520.1 (Protein of unknown function DUF455) HSP 1 Score: 459.5 bits (1181), Expect = 1.600e-129 Identity = 219/295 (74.24%), Postives = 252/295 (85.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07549.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G06240.1 (Protein of unknown function DUF455) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 4.900e-38 Identity = 100/291 (34.36%), Postives = 147/291 (50.52%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo07549.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo07549.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo07549.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 1
BLAST of Spo07549.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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