Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCACTTTTCATAATAGGGTTCAGCCTTATCTTCTTGTTGTGGGATGCATGGGAATTGGACTTTTCCAAAGGTATGTTACACTCTGTGAGACTTCATAGTTTTATTCTCCAATGTTGTTCTTTTATCTTGGTTTTCTCTTTTGTTCTAAAATATGGGGTACATTATATGTCGGGTCTTTTCTTAGATTTATGGAAAGAAACATTCACTACTTTACGTCTGAATTTTATTGTTGAGAATCCGTTTTTCATTTTCTCTCATAGATGAAAATCTAGATCATAATTATTTCCTTCTGCATACCCACCTGCCCAAGTCACCATTTTCAGAAACTGCCTACTTTTCATGCCTTGATTACTAGTTGCACTGCCCTCATTCACTGTTGAGCCAGAGCCAGTAACCACTAAAAGTCTAAAACCATCAATCTTTACCAGATAGATATAGCACAACTTGTTGCAAGTGTCCATTCTTAGGTTACATTAGCATCAAATCACACAGATTCTAAGAGAGGTTGGCTCTGATATGTGGGAAGGTTTGCCAATATAGAGAAGGGTCAAATATATCTTCTTTAGAAGTTCCCTTCCTGAACTCAATGTGATAAACTGATAATGATCAGCCTTAAGAAAGCTTTATGAAGCCCATGTGAGTCAGACAAGTTTTCTGGAATCTCTATAAGTTTGTATATTGCAGACATGCAAGTCATTGGGGGGAGACGGGGAGATCATGCAGTGATGTGTTGGGATCGGAGACAGGGTAGACTGAGAAGGGGGTGAGTTTCAGTCTTTCCCGGCTTTCAAAGTTGCAGTAACTTTGAATGTTGAGGTCCCCTTGCCTGTAAGTTCCCGTAGAATTAGATAGTTTGATCCTGGTGGGAACATAGGGTTTTCGTCATTTGTAATGTAACTCTACTCTGAATTAATCACTGAAAATAAGAGGTTCTTATTTTAGTTTTCTAGCTTCTTTCTTTGAATGGTTGTTGCTGTGATCAAGAATTTTACTATTTATTGTCTTAAAAAAGTTTTCATCAGTCAATGACTATCGCTTTTAGTTATATTCTACTGTGCAGTTTGTTCGACTTATTTCTTGACAATGCTAAGTGCTAATTATCAATAAGGTCGCAGCAGCAATAAGGTCAACCCCTTCTTTGATGTTTTAATTCGACCTTGGCTTAGTTACATAGGCACAGTAGGCATTTGAATTTTGAGGTCTTTTTTCGGGTGAGAATCATAGTAGGGAGTTTATTTGTGATTCGTAGACAAGCTTTTGGAAAATGAAAAAAATGATCAACATTTATTAACATAATGTACTCTAGGTGTGAATATCAGACACCAGACATGGGACTTGGGACTAGCTTTAGCTGGGTAATTGGTGATAAATAGTGCTTTTGCATACCATTACTGTCCCTCGTGGTGCCTTCTTAGGTAGATTGTTCCTTACATCAAGTTATGTGTATCCTACTGTTTAGTTACTTCGACTCTTTAATGTTGCCTGAATAGATACGAATGCTGAACCGCAAGGATGTCATAGCAAAACATTACCTTATCTGTGTTCAATATCATAGCAAAGATCTCGAAATGAATGAGCACCTAAGTGTTCTTATTACTCATGTAATTTATTTTGATTATCACATGTCAAGTGTCTGGTGTGACGTTCGTGCACTAGTTATTACTTGGATCTATGGTGGTACCTAAGTATATGGCTATACTGATTACTGCATCCGTCTTGATGTTTTTCTGAATTTCTTATCCCTAGTTTTGCACCAGTGCACTGAGATTCCTTTTCATACCTTGTTCTATATCTTCTGTCAAGGTTAAATGGTAGATATGTCTGCATTCGAGGTAATGGTGGTAGTTTTTTTTTGTAATGCTATTTTGAGTTTATGCTGAACAGGTTTGGTTTTCTTCAGGTGGTGTGCACAGAAGGGCCAGAGAGAATTAGAGAATTGATTACAATGGGTGCATCCTTTGATCTTCATTATTTTACTTTTGGTCTGAATTGTGTACTTAATATAAATTATTAGAAATACAATGATTGTTTCCCATATTGTAAGATTTATAATGGTTATTGTCCTTATGTTTAAGCCTTATCTAGTAAAATGGAATCAAGGTTGGATTTGTTAGATGATCTTCTGGAGGCTATCATTGACAAGGTACCTCTGCTTAAAAGTAGATCAAAAATGTGTTTTTTGCTTCTGTATCCCACAAAAATCTAAGAAAATTTGAATTTTCAAGTTCAATAGATTTTGTTCTCCCAACCAACTGAAGCACACCCAGGATTTTTTTTATATTCTTGTTTAGCTATTTATTATATTAGTGATGAATCTGACAATGCTTGCTTCAGACTTTTGCTAATGACGATGCTGGAAAAGATGGTAAAATTTAAGGAAGAGTGGAAGGCTTATATCCGTCGTAATCCCAACCAACATGAATATTCCTTATCTCAAGTATGTCACTTCACCTTTCACTCTTTTAGTTATTTGTTTTTAATCAAGAACCTGTCTCTTTCTTTGGGTTTATCATCCTGAAGGTAACATCCTTATGATAACTGGGATTTTATAGTATGGTCCTCCTATCATGTCTGTGGCTAACTGTGATTTTATCAAGTTGTATTTTGCCGGCAATACCATATAACAAGTCGCATAAACCTTGCACTTAGGTTGATTATGGCACACAGGTTACCGCTTCCTGTCTAAAAATGCCCTTCTGCTTCACTTTTGTATATGACGGTCTTCTTTTTTTGGTGAAAACGGAAACATTTCATAAACTAAAATTCAGCCTATTACAATCCGTCAAATGTAAGTTTAAACAATAACTAGGGAGAATGAAGTCAATGTAAATGTGACTGTCTTCTGCTGTCCTCAATTTACAGTTATTACTTATTAGTGGAATATAATGCATGGTGGAAATGTTCTAGTTTTGTTGGTTGATCAGTCATGTTCTCTGATTCTGTCAGACTATCCAACACTGTTGTGCTCTACACTGTTTTGGGGTAGGAGCTAATTAGTAATTTCTTTAGTGCTTGAGTTATATCACAAGCACACACACGCGCACATAAATAGATTTGGTTGGGACTAAGAACAGAGTTGGAGAATCCAAGGCAGATTGGAGTAGGATTGTGTAAATCGGAGTCAGGTTGAAATTTTAACTACTAGTTGGATCAGAGTCTGATCAGAGTCTGCGAGCCTTAATGTACTGGATAAGCTTGAGTTTGTCTATGTTGTTCTGTCTTCCAATTCGCAGACCCTCAACGAATTATCTGGTCCAGCAAATGCTTCCAGGTTTTCCTTTTGATCTCAACAATCTGTCCTGCACAGAATCAAGAATCATTAGCACAAAATTCTTAATAAATTTGTGAAAGAAACAAACAAATTCAATCAGCTGTAGTCCAACTTGTCTTTAAAAATTGGGAATACAGAATGTAGTGGGTCAGATGGGTTTGCGTCCCGTAAGCATAAGTAGTTTAGCCCAAATGAACATTCATGTAGGGAGAATGATAATATGTATATACAGAAGCTCTCAGAATATATGGTGCCAAAACTCAAAGGTAGTAAAAATAAGCTTCCTGGTCTAATATGTATAAGGCATTGTGGAGGAATGAGCACCACATCAGAGAGAAATAGTGAAAGCAATGGAATGTTTAACTCAGATTCAAAGACAGAACAACAACTAGCTAGTGTTCAATTTCTTAAGCGCTAACCAGCAGTTGCAACTATTTTAAACTACTAGTGTTTGGCAAGCTAGGTGAAGGTGATAAGGTGAATCAAATTGGTAGTTGATATCTTAAAGTTAGTCGATAGTGTGTGTTGCTAAATAAATGGTGAAATGAGCAAAAATTGATATGTTAGCTCAAATGATAGTCTAGTTGAAGTTCTTATTTAATTAAGTTAAAATAATAAGCTAAATAAAATGCTTGGTTGAACGGAAAAATTAGCTAGCTTAAGTGTTGGAAACATGACTTAATTTGATATGTTAGCTTAGCTACTTTGTTTGGCAAACACTTATCATTTCACTTAGTGGTCTAAATACCAATTCAACAAAATTATCAATTTAATCCTGTTCCTGAAGAATTTGGGCTAGCTTATTTTCAGTTAACTCGGCAGTTCAAGTTATTTCTCCCCTTTTCAACTACGTACATCTTAGGTTGTGATTATAAAATAACATTTTATAAATTCTAGCTATAGCCACCTATTTTACTCTTCAACTACCTTATATTTTAGGTGGAGACACAAACAAACACTATTGCACAAACAAAGTGTTATAATGCTTTTTACATTTCACATATATGACATAATTTTTATTTTGTGTGTGTAGATTAATGATGATTCAGGTGGCAAAGGTAACAATTAGATCAAGATATTTAAGATTCGATCTCAATCACGGGGATTTATGAACGAACATTGTTTTTATGTTAAAGGAACAAAATAAGTTATTTTTATTTCTAGTGTGATTTGATAAGACAAAAATTTGATGTATGGATATATAATACCTATCCTAAGTCATTTTGGTATGTTCTTAACTAGTTTGATTATTGGACAGTGCAAATATGCACGTGGATGTTTTTTTTTTATTAAAATCAAGTATGTGATTACAAGTAAGTTTGATTATTGGACAATGCAAATATGCACATGATGAGTGTTTGCGGATGTTTGTTCTGTTGTTGCAGTCAGTTGTTTCTGTTGTGGTTGGTTGCTGTGCTCTTTGCAGGTTTTATAGTATTGTTGCTATCGCTTCTGGTGTTGCGGTTTGTACACCCATTGATGTGGTTTTTGTTTCTTCGTTTTAACTTTTCTTGTAATACTTCATTTTGGTAATAAAGTTTCCCTATTTAGAAAAAATATAAAAGAACATGATTGGTAGGTAAATTGTGACGCTTTTTCGCATCAAAGGTGTTTTGGTGGGAAATAATGGGGAGGCAAATTGTGACGCTTTTTTGCATCATAATTGTTTTGGTAGGAAATATGGGGAGGTAAATTGTGACGCTTTGTTGCATCACAATCG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This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo08411.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902176481|gb|KNA08772.1| (hypothetical protein SOVF_159580 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 8.500e-22 Identity = 55/66 (83.33%), Postives = 59/66 (89.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731349334|ref|XP_010685940.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104900256 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 6.100e-20 Identity = 51/67 (76.12%), Postives = 57/67 (85.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870853536|gb|KMT05417.1| (hypothetical protein BVRB_7g175440 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 6.100e-20 Identity = 51/67 (76.12%), Postives = 57/67 (85.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. NCBI nr
Match: gi|743897345|ref|XP_011041961.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105137785 [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 4.000e-19 Identity = 52/96 (54.17%), Postives = 66/96 (68.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. NCBI nr
Match: gi|357454019|ref|XP_003597290.1| (transferring glycosyl group transferase [Medicago truncatula]) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 4.000e-19 Identity = 48/67 (71.64%), Postives = 57/67 (85.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QNE9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_159580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 5.900e-22 Identity = 55/66 (83.33%), Postives = 59/66 (89.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BWA0_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g175440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 4.300e-20 Identity = 51/67 (76.12%), Postives = 57/67 (85.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: G7IU85_MEDTR (Transferring glycosyl group transferase OS=Medicago truncatula GN=MTR_2g095970 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 2.800e-19 Identity = 48/67 (71.64%), Postives = 57/67 (85.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9HPP1_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0009s03140g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.600e-19 Identity = 51/96 (53.12%), Postives = 66/96 (68.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067L6V0_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_05614 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 1.800e-18 Identity = 50/96 (52.08%), Postives = 64/96 (66.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G07850.1 (Protein of unknown function (DUF604)) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 7.200e-19 Identity = 48/96 (50.00%), Postives = 59/96 (61.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G41460.1 (Protein of unknown function (DUF604)) HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.300e-15 Identity = 38/66 (57.58%), Postives = 47/66 (71.21%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G23490.1 (Protein of unknown function (DUF604)) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 2.800e-15 Identity = 36/66 (54.55%), Postives = 50/66 (75.76%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G11350.1 (Protein of unknown function (DUF604)) HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 1.800e-14 Identity = 36/66 (54.55%), Postives = 50/66 (75.76%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08411.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G12460.1 (Protein of unknown function (DUF604)) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.000e-13 Identity = 28/63 (44.44%), Postives = 46/63 (73.02%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo08411.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo08411.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo08411.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo08411.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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