Spo08740.1 (mRNA)

Overview
NameSpo08740.1
TypemRNA
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 113150488 .. 113154565 (+)
Sequence length726
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTATTTTGCCGCCTTTTTCCGCTGGTTTCATTTTCAAGTTCCCTCCAAAGTGATTTTTTTCATTTTTGAAAACCCGCCATGGAATTGTTGTGAAGCGAGGAAGACGGTAAATTGAGGTGAGTTTTGTTGTTTTGAGTATTAAGAAGTAACAGGGGGGTGTTCGACGAAATTTTTGTACATGAAGTATAACTTTCTTAGTGATCGAGTCAAAATTTTATCTAGCTTTTTATTCACCAATAATAAATAATTTTTTTTTTCATTTTTTATTTGCAATACAAACGTGCTTGTCAAAGTTGAAATAAGTTGAACAATTAGTATCTTTAATTATCGATAATTAAAGTTATAACGGAAAATATACGTTAAAACGAACAAGATTTACATGAATATGTTTTTGGTTAAGTAAAAATAAACAAATGTATAGTATGTAAATAATGCAAAAAAGTAAATGTGCATCCTCTTGCGTAGGAGAGTGAGAGCTTTATATTTTCACCGGAGAACCGGGAAGTTTCAGAGGTGTGATTTTCAAAAAAAATCCGCTTACTAGCCTACTCCAGTTTTGGGGGAAAAAAAGAAATTTAATAATGATTAGTTACCGATAATAATGATTATTTACCAGTATCTCATTAAAATTCAAGAATTAATTAGTTTTAAAATATACAAAATAGTATTCTTAAATATCACTAATATATTTTTTTTAAAAATACTCCATATATCAGTAGTGTTATCATTAAAAAAAATCAATATCAGCAGTAATTAATTTTTAATAATATGGACTTTTTTTAGGTCAAGGATAATACGGAGTTTTACTACATTAGATAAACCTAGGGCTGCAAACGAGCTGAGTCGATTCGAGTTTTACCTTGTTCGAGCTAAACTTGATAAGGATTTTCACTGTCCGAGCTTGTCTCGAGCTTAACCTAGCTTTGAAAATTGTTGTTTGAGATTTGTTCGCTAAGCATCAAGATGCATGTCTCAAGCTCGGCTCGAGCTTGCCCGTTTAGAGCTACACGAGCTTTATTCGTGCTTAATAAACGAGCTTTAACTGAGCTTGTTCGCGAGTTGTTAGCGAACGTATCCCCTCATTTTAGCCCAAGATAAACCTTGAGGTTTTCAACTCAATTTTTTTTATTATAAATCAGAAAACTCATAATATGAAACGTATTAACATGAAATATTATATTAATATTAAATTAACAAAAAAACTGGATAAAAAGATAAAAAATTTACCAACTTTTTACCAGTCTAACGAGAGGTCCAACATCCATTAAATTAACAAATATGTTTGTTAATGCATGTTCTACGCACATTCCGTCCAAATTGGATGTGAACTTGACAAATCGGTTATGTTCTTAACGTGCTTTGGACAATTTTGTTATGATCTAAACGTGATGTGGATACTTAAGTTTTTGATCTGGACGTGATATGGACATATGAGTCCTATTATGGACATAATCTGGATAAATTGGTTTAACTTGGACATATCGGTTATGATCTTGACATGATATGGACATGCCGATTTTGATCAAGGCAAGATCTCGACATATTAGTTATGATATATAGATATTGGTCTAATCTGGACATATATGGATAGATCATTCCTAATATGGAAATATTGGTTTTCATATAGACATGATATGCTAGTAGTTTTTTATCAGGATATGATGTCGCCATGTCGGTTTCAATTTGGACATTAGGTAAACAGATCAGATCAACAAGATCCAAACATTGATATGATACGGATACAATCCAAACAAAGTTTTTTTGATTTGGACATGATCTAAGCAGCTCAGAACTTATCTAGACATCATATGAGAAGACTAGAAAGATCGGTTCTGATTTATACGGAGTGCGTGATTTGGACATATCGGTTATGATTTGGAGAGATAGGTTATGATCTGGAGAAATCGGATATGATTTAGACATATTGGTTATGATATGGACATACTGGCTCTGATCTGGACATACACGATTTGGGTAGATCGATTCTAAATTCGATAGATCGTTTATGATCTGGACATGATTTTATCAGATCGATAGACATGATATGTACATATCAGTTCTTATATGGACATGATCTGGACATGATTTGGACATATCAATTGTTATCTAGGCATGATTTGGACATATCGGTTCTAATTTGTACATGATTTGTATTTTTTTCTTGATTTATACATGAGCTGTACAATATAAGTTATGATTTTTACATGATCTGCACAGATCCGATTCACATATGTATAGACGGGTTTACATTTGATTTAAACTTATTATTTATTACCTGATTTGACCTAATCTGAAATAAGTAATAAGGTGAACTAAATAGTGTCATATACTCTTGTATCACTATTATATGTTATAATCATATATTATTATATTCTTATAGTCTTATACGATTATAAATACATACAATCCTAACTAATACCTAAATAATTTAATATAGTACAATGAAATTATTAATAAAATACGATTGATTTTAAAAATTGAACCACTTAATAAAATACGGAGAGATTAATCCATAATTTGAAGAATAAAATTACCCACCCATATTTTGCCTAACCCATATTCATCATCAAGCCCTCAAGAAAATTTGAGGGATGTTTTATTTTTTCATTTGCATTTGAAAAAAAACATGCTCATCCTCTAATATTTAGAGCCGCCTATGTCAAAAAGTAGAGCCCGTACTTATCTAGTTCTCTCTGGTTCTCCATGACGCCTCGCGCACCACAACCTACGCCAACTCCACCACCGCTGCCCTCCATTGCTTTCGCCTGAGTTTCTCGCCGACGTCTCTCCTCTCCTTCGGTTGTTGTGACGCCCCTTTCTCTCCTCTCCTTTCCTCTCCTCTCCTTCGCTGCTGGTTCCGCTGCTCTTTTCTCTCATCTAGAACTGATCGTTCTCAGCAATAGTGGGTACTTTTACTCCTCAAATTTATTAATTTCTCAAAATTTCTTGTTTTGAGCTTCAATGATTTTAAATTATTAAAACTTTAGGGTTTTGTTTTGTTGTTCCGGTTAAATTTACTTCGGTTAATTTTGATTTTCTGGTTTGTATGCATAAACTCTAATTTCGTCCAAGGTCATTTAATTCCATGAAAATTGACGATTGTTTCCCAATTTTCCATTGTTCTCTATAATTTGTGCTTAAACTTGATTCACGTCGTTTCTTCGTTGGGTACGGTACTTTTTTTCCCAACTAAGTCTATTAAGGAATTTCTTTTGGAAATTCGTTGTGTATGTTTGATTGATTTTGTTCCTAGGTTGCGGAGTCATGAAGATGCGTCATTGGAGCTAAGTTTGGCTGAAGATTCATCAATTACTTTGAATTGACAGCCAGGGAATGTTCCTCTTAATTTGGTATTATCATTTCATTTATTATGCTCTTATGTTGATTTAGCAGTTAATTGGGATTTTGTTATCTGAAATCTAAGGTTATATGATTCTCTTTTATTTTATTATTAGTTACAATCTTTTTCATTGGTATTGGATTTGATAGTTGATGGACATAATGCGGAATTATAGACTCTATCTTTGTAAGAACATCAGGATGTCTACATCTTACCATCCAAAAGAATGCTCTAATACCACCCTCACCTCGTAGCCTGACCTGTAGCTTGTTTGGCAAATGCAAACTCATTTTTAAAAAAATAACACTTTGGCATATGTGAGGGGAGCTCCCCTCCCTAATTTCTGTAATTAGCATTATATTGAAGTGATATACTCAGTACATAAACTATAAGATACAAAACTGACCTCCACTACTCTGCTTTTGTTCAGCATCGTATACTTCCGCTTATCTGAACAAGAGGCAGTGAATGGGTTGGTTTAGGGATCGTGGTGTACTTGATTGAGTATATGATGGTTGGTTTTTCTTCCTTGTGAGTAATTATGGATGATTGATGTACGTTGGTTGGGGTTGATTGCGCCACGAAGATAGAAGCATATCTGAAACCGGATTGGTATTCTTTTCCCTCAATTGCTAACCTTACTGTCATTCCTTCTGATTCGTGAATCTCCTCTCCTTCCCTCTCTTTTGCACTTCAAAATTTTAAGAATTATGTGTTTCTCTTTACAGTGTACGAC

mRNA sequence

ATGTATTTTGCCGCCTTTTTCCGCTGGTTTCATTTTCAAGTTCCCTCCAAAGTGATTTTTTTCATTTTTGAAAACCCGCCATGGAATTGTTGTGAAGCGAGGAAGACGTTCTCTCTGGTTCTCCATGACGCCTCGCGCACCACAACCTACGCCAACTCCACCACCGCTGCCCTCCATTGCTTTCGCCTGAGTTTCTCGCCGACGTCTCTCCTCTCCTTCGGTTGTTGTGACGCCCCTTTCTCTCCTCTCCTTTCCTCTCCTCTCCTTCGCTGCTGGTTCCGCTGCTCTTTTCTCTCATCTAGAACTGATCGTTCTCAGCAATAGTTGCGGAGTCATGAAGATGCGTCATTGGAGCTAAGTTTGGCTGAAGATTCATCAATTACTTTGAATTGACAGCCAGGGAATGTTCCTCTTAATTTGCATCGTATACTTCCGCTTATCTGAACAAGAGGCAGTGAATGGGTTGGTTTAGGGATCGTGGTGTACTTGATTGAGTATATGATGGTTGGTTTTTCTTCCTTGTGAGTAATTATGGATGATTGATGTACGTTGGTTGGGGTTGATTGCGCCACGAAGATAGAAGCATATCTGAAACCGGATTGGTATTCTTTTCCCTCAATTGCTAACCTTACTGTCATTCCTTCTGATTCGTGAATCTCCTCTCCTTCCCTCTCTTTTGCACTTCAAAATTTTAAGAATTATGTGTTTCTCTTTACAGTGTACGAC

Coding sequence (CDS)

ATGTATTTTGCCGCCTTTTTCCGCTGGTTTCATTTTCAAGTTCCCTCCAAAGTGATTTTTTTCATTTTTGAAAACCCGCCATGGAATTGTTGTGAAGCGAGGAAGACGTTCTCTCTGGTTCTCCATGACGCCTCGCGCACCACAACCTACGCCAACTCCACCACCGCTGCCCTCCATTGCTTTCGCCTGAGTTTCTCGCCGACGTCTCTCCTCTCCTTCGGTTGTTGTGACGCCCCTTTCTCTCCTCTCCTTTCCTCTCCTCTCCTTCGCTGCTGGTTCCGCTGCTCTTTTCTCTCATCTAGAACTGATCGTTCTCAGCAATAG

Protein sequence

MYFAAFFRWFHFQVPSKVIFFIFENPPWNCCEARKTFSLVLHDASRTTTYANSTTAALHCFRLSFSPTSLLSFGCCDAPFSPLLSSPLLRCWFRCSFLSSRTDRSQQ
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spo08740Spo08740gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo08740.1Spo08740.1-proteinpolypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo08740.1.exon.1Spo08740.1.exon.1exon
Spo08740.1.exon.2Spo08740.1.exon.2exon
Spo08740.1.exon.3Spo08740.1.exon.3exon
Spo08740.1.exon.4Spo08740.1.exon.4exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo08740.1.CDS.1Spo08740.1.CDS.1CDS
Spo08740.1.CDS.2Spo08740.1.CDS.2CDS
Spo08740.1.CDS.3Spo08740.1.CDS.3CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo08740.1.utr3p.1Spo08740.1.utr3p.1three_prime_UTR
Spo08740.1.utr3p.2Spo08740.1.utr3p.2three_prime_UTR


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo08740.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo08740.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo08740.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo08740.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top