Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGTAGTATGCAGCTACTGCCCACCTGAACTCAAACCTTCGCTATTTCTTGGTCGAACTCCTCCTTTCCTCGTAAGTTCTACTCCACTTTTTGTTGCTGATCGAATTGTCATTTAATTTTCGATATATTTTGTAATTTTCGATTTATATGGCTGAGCTACTTGTCAAATTTGATAGGAAAGTTTGCAAGTTTGTGTATGATATTTTAACTATATGTCCATTTGAAGTAATGTTACCAAGCACATTGAAGTGAGTCGTATGACTATCTGCAAGTTTGGATAAAATTACAGAAAGTATTTTAGTTTTCTTAAAATCGCGCTATTATAAATGTCAAATATGGTTTATACTCTTGTAAGGAGGGTCTAGTGTACTAGGGAGTAACTTGGGGTTTTCAGTTCGACCAATTGACGACTGAGCAAGCTAAGGAGTTCCATTTGAGAATTCCAGTTGTTTCTATTCTTTATTTGATGGTAACGTCTCTATGTCAGTTTAGTTGAGTTTTCGAAAAGGGAGGAGACAGAAAGTGAAGGATTTGACAAACATAATCATCTTTCCGATGTTGGAAATGTTTGGAAGAAATTCGAGTAGTTCAGAGTTAGGAGAATGGTATGTAGTTCTATAAAACTGTCTTTGGTTTACATTTGTTGAGGGTAAGGGAAAAAGAGGGAAGAGAAAGGGAGGTGAGGCGAGGAAAGGAGCGAGCTTTCATTTTCCTTCCAAACCTGTCTAATAATGGAAGGGTTTAATTTATTAAAAGGGGAAGGACAATGGATCCCTCAAGTTCCCTCCCCCCTTCCCCTGTGTCTTATCCAAAGGGAAAATGTATCCCTCACTTTCCCTTCCATCCAAAACTTCCTATCCAAACATATGTAAGCTTTTTATATGTGGATATTCATTTTGTCGGTCCTTCTCTCAAACAACTTATTTGTTCGTAGGCCACGAGCAATTGTATTATATTGTACATCATGATAAGGGGTAACCCCTGTGGAATTTCTGTTCCTAATTGGTATATAGAAAATGTGGAAATTCCTACACTGGTATAAACAAAGCTTTTAAACTTTGTTTGGATAGCAAGATAGAAGGGAAAGGAAGGGGAGGGAAAGATGAGGAAGGGGAGGGGAAAGAAAGGGAGGGAAGGTGGAGCTCCATTTTCCCTCACTCCTCCCCTACCTCCTTCCCCCAACCTTTTATTAACAAGAGAACTTGTCCCTCTCCATTTCTCTTCCCTCCCTCTCTCCGTTTCCTCTTATCCAAACTGTCTTAGTGAGGTAAATAGCTATTTGGAAGACCATAGTTATATTGTGGGATCTAGAATGAGACTGTTATTATTTAGTGATATAGTGCATTGTTATTGTTTCTTCTAGCGCATAACAAGGAGTAACAGTTGGCAATTTGCCAAATCAGAAACGGGAGTATTGGTCTCCTTGATATTGTTGTGTCGCATCTCCTCTGTTCTATTATTTCTGTAACATTATCAGCATACATACTAAGCAGTTTGATTGTGATCTTGAATGAAAATGTAGGGAAAAGTACAATTTCAGCTCATGGCACTGAACTATAGATGCACGTCAAGAATTAATGCCCTTTTTTGGGGACCCAAGAAGGCAGTCGAGCGATATGATGCTTCTCTTTCACTGGGAGAATTCTCTTTGACAGGGTCAGGCTCAGAGGTGTTTCGTGTTTTTGTCTTCAATGGTCAGAAATAGAATAATATGATCACTTAAAAGCTCTTGAGACTTTGACATCTGATTCTGTTTCTATCTCATTTCTGACAGAGGGCTCCAGCTGATTCATTTTTACCCAAGAAGGTTTTTCTTTCAGTTATTTCTTCTATCTCCGAGGTTTCATCAGAAGAATGGGATGCATGTGCCGTAGATATGGACGGACCTGAAAAGTTAAATCCATTTCTTTCTCATGGCTTTCTTTCAAGCTTAGAGGAGTCTGGTTGTTCTGTGAAGGTCTGGCAATCTCTTGAGTACTATTATTTATATTCTTTAGTCAACACACTATTTACATGGAAAATATAATGTTACTTCTTCCATACTATAAACGTTCTGATGATTGCTTGTAGGAGTAATTATCTTAAAACGAATTCTTATGAAAGAAGCACTACTGCACGAGTGCTCTTTTCATTAGCCAATATCTCGATTTTGTCGTGTCTAATTTGGGATGAGATTGTGATCCTCCTCCTTAGTAGTGCAACTTCTAGTTCATGCCCGAGGTTTCCTGAAGGATTGATTATGTGTATCCTAATGGAATTTGATACATATATGACCAGTTTTTAGTAAATGAAATTTTTTAAGTCGTAATTTTGGAAAGAGAAATGGGACGAAGATTATGTCTAATGAAAATATGTGTATACTCTGGGTAACATATATATATATCTGAAGGACTGATTATGTGTATCCTTAGTCTTCCCGGCTAATGATATATGAAGTATGGAAGAAAGCTCCTAAAGCATGGTTTGTTTGCACAATTGCACGTACAGATGCGAAAGTGAATATTTGAACTAATTATGTCCGTACGATTTTCCTTGCATTCTCCTGTAGTTTGTGTCTTTAGAGGAAGAGTCTGCCAAATGCCAATCATCCTTTACTCTTTTGTCCATGAGGACCATGACTGTTTGACACTTACCATTATCCCACTCGGATGCAACCTTCGTCTGTGAAAAATGTTCTTATTGATTTGGATAAAAAGTTTACCTTCCTGAAGTGTGGAAGATGGTTTTGTTGGCAATATAGTGGTCCACTTGGAAGGAATGAACCGACTGATTTTGGGTGGTAGAGCTTGGTCGAGACTTTTGTTTTTTTGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGNGGGTGTGTTAGTTGGTTCTTGATAGGTTGAGGACTTGTGAATTTTTTCCTTAGCCCTGTTTTTGTACATGGGTGACACCTCTTATATGAAATCTTTGTTACAAAACTCAAACTTCCCAATCATTTTTCTCGAGACTCTCAGGCTCTCAGCAATATTAGACTTATCACCTGGTGTCCTAGTGCATTTGGCTTTCATGCTTTCAGTTAATTAGGTAGTCTGTTCTCATCTGAATACTTATTCAGTTAATCTCATTCTTACTTGTTCTTACTGAAATTGCTTCAGGAAACAGGATGGGCACCAAAACACATTATTGCGAAGGATGAAGTTGACAATGTCATTGGCGTGGTTCCACTATATCTTAAAAGGTAGTACAGATGCAAAGCTGCTCATTGAGAACTATTGTCATAGTTCCTCCATTCCAAATTAGTTGGTAAGGTCTTTTTGGCACACATATTGAGGTGAAGTGAGAGAGAAAGGCAATAGACAAAAGTACCACACTGTCGTCTACGTGGCTACTCCTCAGCCAACTATACCGAACCATTTCTCTCTCCTCCACAGTCCCATCAGCCATCACCACTACTACCTCCCTCCCTCACAACTCCCCAGCCCCGATACCGAAAAGATCCTTCACTTTCTCCTCCTCCCCCAATTTCCACTGCTGATACCCTGTTTACTGCGACGGCTCCCAATAATCACCACCACACACCTCATCACTCTATCTCTCTCCAAGATCTTGAAACACACCACTATCACCTCCACCTCCACTTTCTCCAAGAACCCGTTGAGAAAATCTCGACTCCTTCCTCACTTGCTTTTTGCCGCGTCAAATTATTTTATGGATACTGAAGAAATCATACCAAATTACTCGTTTCTGGCCCGATCATCCACAAATTCGAATTTGATTTTCACCATTTCCATTGTTGTTGTCGCTACAGATGTGAACATTGCCTTTAGAGGGTGGTGGTGGAGTAGGACTTGAGTTACGGTTTTGAGGATGGTTTTTCTCTCTCCTCCTTCAGTTGAGGTTTGTGAGGGCTGAAACTTGAGGTACGGTTTTGAGGGAGGAGGATTAGAGCAGCGACTGCGAGTTTTGTGATGGTGTGGTCTTGTCGTCACGTCCGGCATGATTCCGAGTTGTTGTGCCTTCTTGTTGTGGTGTGATTAAGATGGGGTGAGGGTGGTGGATAAGTTCAGATTTGGAAGGTGGTGGTGGAGTTGGTGGTCAGGGTTCGCGGCAGTTATGGGTAAGGGGAGGCCCGTAAGGGAGTAGAGAGAAGAGGAGTTAGGGCATTCACGGGAAGGAAGGGAGGAGAGATGAGAAACTGGGGGGGGGGAGGGGGTAAAAGTGACATTTTGACATATAAAACTTACCTGAAATAGAAACATGTCAACTAAAAAGAAACTTCCCAAAAAGGAATATGTGTCAACTAATTTGGAACGAAGGAACTATGTGTCAAATGATTTCTATGCAGATGTATTCACTCTGGTTTGTGTTCCTTAAATGAACATGCAGTCATTCCTATGGAGAATATGTCTTTGATCATTCATGGGCCAATGCTTACTATAGTTATGGTTCGAGGTATTATCCCAAGTTACAAAGTTGTGTGCCATTTACTCCAGTTACTGGTCCAAGAATCTTACTTCGTAATACTGCCTGCAAAGATGAAGTTTTCGATATAATGGTATCTGCACTTAAAGATCTAACGGTTAAGGTACTTTCTCTATGATGTAATCTATGCAGCTACTTTTGCAGTTATTTTTACTGTGCTTCCGCGCTTTTACTGTAATCTGACTTAACTGAGTATATACTGACTTTACTAACAAGCATATATTGGCCTTAAAATACAATTTGCCACACCGAGTTTGTACTCTTTGTAACAAAAAAAGCATTTAGGAATTTTTTTTTGAGGGAAATTTAGGAAAATAAATTAATTTGTTTCCCTTATTAGTATTTCTTGTTTCTCTTTCAAAAGATTATGTGTATTAAATGTATTAAATACTACCGTTGAAGTTTATTTTTCCTGTTCTTGATATAATGCAAGGAATTGGCTAATTCCTCGCCCAACCACTATCCTGCTAGACACAAAAACAGAACAGTAGAAAAGAAAAGAAAAGAATAGAGAAAGGTTGATGATGTGTATTACTGATAAAGTGTAGTGT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ATGGCAGTAGTATGCAGCTACTGCCCACCTGAACTCAAACCTTCGCTATTTCTTGGTCGAACTCCTCCTTTCCTCGGAAAAGTACAATTTCAGCTCATGGCACTGAACTATAGATGCACGTCAAGAATTAATGCCCTTTTTTGGGGACCCAAGAAGGCAGTCGAGCGATATGATGCTTCTCTTTCACTGGGAGAATTCTCTTTGACAGGGTCAGGCTCAGAGAGGGCTCCAGCTGATTCATTTTTACCCAAGAAGGTTTTTCTTTCAGTTATTTCTTCTATCTCCGAGGTTTCATCAGAAGAATGGGATGCATGTGCCGTAGATATGGACGGACCTGAAAAGTTAAATCCATTTCTTTCTCATGGCTTTCTTTCAAGCTTAGAGGAGTCTGGTTGTTCTGTGAAGGAAACAGGATGGGCACCAAAACACATTATTGCGAAGGATGAAGTTGACAATGTCATTGGCGTGGTTCCACTATATCTTAAAAGTCATTCCTATGGAGAATATGTCTTTGATCATTCATGGGCCAATGCTTACTATAGTTATGGTTCGAGGTATTATCCCAAGTTACAAAGTTGTGTGCCATTTACTCCAGTTACTGGTCCAAGAATCTTACTTCGTAATACTGCCTGCAAAGATGAAGTTTTCGATATAATGGTATCTGCACTTAAAGATCTAACGGTTAAGTTCCAGGTGTCGTCGATGCATGTTACGTTTGCAAATGAACGTCAGTGTCATGGAATGAAAGACAAGGGCTTCCTTCAAAGAATAGGCATGCAATACCACTGGAAAAATCGGAATTACAAGAATTTTGATGAGTTTCTGATGGATTTGAAACAAAGCAAGAGAAAAAATATTCGCCAGGAACGTAAAAAGATTTTTGCTCAAAACTTGACTATGAAGCGTCTACGAGGATATGAGATTAAGGCAAAACACTGGGACACCTTCTATCAATTCTACAAGAATACTACTGACAACAAGTGGGGTACTCCTTACTTGACGAGGGATTTCTTCCATAATATGGCATCAAAGATGGGAGATCAAGTGCTGCTAGTTATTGCTGAAGAACAGGATGAACTTGTTGCTGGGTCCCTTAATCTAATAGGTGGTGATACCCTATATGGACGCCTGTGGGGTTGTCTCCCAGAATCTTACTATCCAAGTTTGCATTTTGAATCATGTTACTATCAGGCAATAGAAGCTGCTATTGAATTCAATTTGGACAAGGTGGAAGCAGGAGCTCAGGGTGAGCACAAAATCCAGCGGGGATACCTACCTGTAACAACTTATAGCTCCCATTACATTGTTGATGAAGATTTTCGGAAAGCTATAGAAGATTTTCTAGTGCGAGAAACTGAGCAGATGATGCTTGTAATGAAGGTATTGCGTGAATCTGGGCCCTTCAAAGATGATATAAAATGGGATATTCAAGAATAG 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This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo08993.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731341941|ref|XP_010682144.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104897033 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 832.8 bits (2150), Expect = 3.000e-238 Identity = 409/478 (85.56%), Postives = 431/478 (90.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802563139|ref|XP_012066733.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105629709 isoform X1 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 727.2 bits (1876), Expect = 1.800e-206 Identity = 348/475 (73.26%), Postives = 399/475 (84.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. NCBI nr
Match: gi|359486271|ref|XP_002268159.2| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100262534 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 723.0 bits (1865), Expect = 3.400e-205 Identity = 350/473 (74.00%), Postives = 395/473 (83.51%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720060867|ref|XP_010274992.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104610180 isoform X1 [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 722.6 bits (1864), Expect = 4.400e-205 Identity = 347/481 (72.14%), Postives = 410/481 (85.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1000949078|ref|XP_015580053.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC8262588 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 714.5 bits (1843), Expect = 1.200e-202 Identity = 340/472 (72.03%), Postives = 396/472 (83.90%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8C6R1_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_6g146050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 832.8 bits (2150), Expect = 2.100e-238 Identity = 409/478 (85.56%), Postives = 431/478 (90.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067L1Y5_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_00288 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 727.2 bits (1876), Expect = 1.300e-206 Identity = 348/475 (73.26%), Postives = 399/475 (84.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7TGM3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_12s0035g01750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 723.0 bits (1865), Expect = 2.400e-205 Identity = 350/473 (74.00%), Postives = 395/473 (83.51%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: U5GKJ3_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0004s23700g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 702.2 bits (1811), Expect = 4.300e-199 Identity = 339/474 (71.52%), Postives = 394/474 (83.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061GEK5_THECC (Acyl-CoA N-acyltransferase isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_026893 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 700.7 bits (1807), Expect = 1.300e-198 Identity = 338/472 (71.61%), Postives = 393/472 (83.26%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08993.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G23390.1 (Protein of unknown function DUF482 (InterPro:IPR007434), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181)) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 6.000e-184 Identity = 308/473 (65.12%), Postives = 377/473 (79.70%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo08993.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo08993.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo08993.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo08993.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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