Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCTCGCGCTCAACGCCCTTCTTCTTCCCTTACCTTTCCCTGCGTCGTCCCCTAAAGAAAAAACCTAAGCCGCATCTCAAATTTTCAGTTCTGTTGTTCGCGTCCCGTTCTCCTCTCCTCACTTTGAACACTCTTTCTCTTCGTTCCTCTGCATCGCCGGCCACCACCTCCTTCATGCCGACGCTGCTGGTGCGGTGGTTGCGATGGTTATTGCGTTGTTGTGGTTGATGGTGTTGTCCTGCCTCCGTACTCGGCTTTCCTCTGTTTGTCGCCGCCAATAATGGTGGCCACCAACACAACATCATTTGAAATCCATCACTAATTGGTAAATTGATTTCAATTTCTCCCTCAATTGATTTAATAAGTTCTTGATTTAAAATTTTAAAACCCTAACTAATCGATTCAATGTTCTTTTCCCCCTTTCTTACACCGCCCGTTCTGGTTGTTGGGTGCGACGGCGCTCTGTCGTCTCCGCCGCCTCCTTGTTCGTTGGTGTCAAAGCTAATTATGGACTTGCTCTCCCCTTCCCTCTCCTCCATTGTTGCTGCTCGTTTCTAGCCCATGGTACGACACTCCATTCTTCTTCCTCTCTCTCCTGATACTTTTTTGCTACCTATGTTAGTTGTTGTTAATTTTGAGTGATTTTTAAGTTGACAAATTAGTTTATGAGTTTAATTGGAAAACTACTGCAATCAAGTTTTCATAATGATGCACAATTGATGGTTTTAATTTGAAATTTAAGCTTAAAGTGGTATTTCTGCTTCTGGAAGTTTCATTGTCTCCTTCTCAAACAATCCTCCTGATCCAGAAAAGGATAGTGCCGCAGTTCAGACATTCTTTGCCAATATGGAAGTTTGCTAATGCTATGGGGGATTGGGGGCCATGGGTAGGATTGGTGTCCTAACTGGTGATGAAGGGGAAATCCGAATAAATTGTAGGACAAATGAGTAGTGTACAATAATCTGAAGTGAATTAAGCATGTCACTTAAAGTTTTCTTGGCAATTTTTAAACTCACGGTTGTAGTTGCAAGTAAAGTTAACTGTAGATCACTTGAAAAGAAGCAATCACTTCAAAATGCACTCTCTGTAGTTTATGTATTCAACCTGGGATAACATTCTCGTTGTTTGGTCTTAAAATTTGAAGTTTGGTGAGCTTGCTTCTTTTGTAGTCAAGAAATATTTGTTCTTTTTTCAGTCTTATGATTAGTTTGCTACCTTCAAAATTTACTCACTGTAGTTTATTTGTTCAGCAAGGATACCATTCTCATTGTTTGGTCTCCCAGAGTCCTAATTAAAGTGCAACTCTTGACATTTGAAATTTCGTGAGCTTTCTTCTTGCTCTTTAGGCGTAAGAAATTGGTGGTATGTTTAGTCTTTCTTCTTGCTCACAATAAACTAGTTGGGTTTTTGTTGATAATTTAGCGGTATCCCTATATACTAAGAGAAAGAAAGAAAATAAGTTCATATGAGAGCAAGTACATGATTGAGTTGTACCCTGCATGGCTGTATCAGAGTTTTATTTTGAACTTTATGTTGATTCAGAAGATCTTTGCGTCTACCCTTGAACATTGACAAAGTAGAGTTCTCTAGCACCAGTTATTGTAACAGTCTTGGACGTCAGGGTAACTCTGAGCTTTATTATGTAATATTCCCTCTGTCTCACTTTGATAGGTCACATTAGGTTCGAGCTCATTCATAAAATTTCGAAATATCATAATTTCTCTTGATAATTTGTATGCAGTACAGTTTTTGAGATTAAAAATCTTATTGTGATACTCATAATCCTTAAATTAGTAAGAGACATATGGGGATATTCACAATTTAACATACTAAATATGAAGAGGGGCCTATTATTTTGGGACATCCCAAAAAGAAATGTGACCTATTAAGCGGGATGGACAGAGTATTGGTTTCTGTTGAGAATTTAACAAGTAAAAACTGATCAGATTTATCAGTCTTTGACATTTACATGGAAAATTTATCATCACATCAGCTTGTTTAGACTGTCAAACCAAATAGATTTGGAAAAGTGAGAGTTCATCCCCCATCATGAGTGTGTGTTCACTCTTCGCCTCATATAAATCTTTTTTAGGCTTGTACTTTATTTTGCCTAGATCTTGAATGAATTTAGGGTAACTGGCTTCCATAGTGCTGTTCAGGGTCTATGGTGTTTTGATGGGGATTGAAGATCAATGCGGTGCAATGGAGTAGTGGGTTTTTAATGAATGAGAAGTATCACTCCTATTTCAAACGCTGTTGATGTTGTGGAATTCTGTCTTCCTCCCAAGAATTTTGATAAAGATCAGAGCTGTGGAATGAAAATATTTGATATCATCATGATATATGTGAAGCTATGTTGCTGGATGATGGTAAACACATAGATTGCTTGTCTTTCATTGTGAATTTGAGTTGAGTAACAACTTCTTTGTCGTAGCCTGTTTCTTAACATTAAGCTTCCGTATTTGTACAGATTTGGAATTAAGTTTACTTTGTAGTGGCAGCGAGAAGCTACGGAAACAGACACTCATCTGAGTAGTAGTGATACTCTGAAGTCTGAACTGTTGCACCTTTCTCCTTCATTAGTCAATTATCATCAGGTTAGCTTATTTCTTCTACAGTTTACGTGTAACTTTTCTGGTTAAGAGTAGTACAAGGCATTCGTTGAATTATGATATATTTCAATGATTTGCAAAGTAGCTTAAGACGAACTGAAGAACTTTGGACTGAATAGTAGTGTTTTGCCATAATTCTAAGAATAATCAATAGGGTTTAATTCCACACCATGCGGTTTGTGGTGTTTGAACCTTTGAAAAGTGTTTTCGGCTACTGTAAATATTTAAGCATGTAGAATGCTGCCAGTGGACAACGGTGAATGAGTTTAATCTTGATGTACATAATTGGTACATATAATTGCTTTCCATGCAACGGCTCTGGAGCTCGTAAGTCTCCCTCCCTCTCTCCCTCCATCACTATTATTTTTGATATTTGTACAAACTCTAGTTTCATATTGCAGCCTGTAATGCAAGATCAGGTACTTTTGTTTGGTGGTTTGAATCGTAATAGCACCATTCTGCGTATACTTTTTTGTTCTTGTTTTGTGCTGCATGGAAACGTGCCGTTGAACACCTTTTCTTTTTGCAGGTTACAGATTTTAAAAAGAGTAAAAAGAGTTTGAATACTCTAAATTCTACATGTGATGAGGTACATCACCTTTGCACTGATGGGCCTGTACACTGTTCTCGTGCATATTCTTATCTATACGCTGATACTTTATTTTTTATTGTCTAGGTGCGAAATTCTGGGAACTTGAAAGAGATCGTGCAGTTAATCCTTAATCTAGGCCAAAGGTACTCATCATATTCGTCATCTATGGGGCTATGGGCTGTAACATGTGGAAGATATAGATCTCACTTTTCTAAATGTTGCAGGTTTCTGTTGCTGGTTCTTCGTTACAGAAACCATTCACAGTGAGGTACTTGGAATAAGTTCCACTAGCTCTAGATTGTTCTTGCTTTGTTTCAGATTATATTTGGGTCAAGAGCATCATGATGCATCAAGCACTATTCTCTAGGTTCTTTTTCTTATTACCAAATGTGCTTTGCACTATTTTAAGAACATAATAGCCATTTAATCTTACTTTGTAGATTCCTGTAATGCTATATTAACTTCATGATCACACGAAATGCAGATAATAATTTTATGGACGAATATTGATTATTTTGCAGATTCATAACCACTAAGTTCACTGTTTTATGTCACACGAAAAGCAGATAATAATTTTATGGACGAATTGGAGCTAGACACTGCAGAAATCCTTAGAAAAGCCAGAAGAAGAAAGAGAAAACAAAATTGTAAAAGAGCATTCCTAACTCAAAGAAAGTGAAGGTATGATCTATCTACTTTCTGACCATCCTTGAAAATTTCACACTGCTCTCTCTGTTTGTGTTTATTGTCATTACAAACTAAAGAGAAATATCATGCTATTCTTCATCATCTTGATGGAATTACTATACAACTTTCATAGTGGATGTGAGCTGCTTTCTGCTGATTGTTAGAAACCAAAAATAGGAAAAGGTTTATTAAAAATTGATAGATCATGAAAGGATTTGACGATTCGTGTATCTGGATATAGTAACCTTGTCATGCATTCTAGATCTTGTGTCTGACTACTTATTCAAGTTTCTGAGAACTAGGCACTTCATTTTGTTAGAAGTTAAAAATGTCGAATTTGTGCTGATAACGCAAATAATTACCAGCATGGGACAGATCATAAATCGAATTAAAGAATTCAAATTAGGCACAGGCAATCTTGCAGCTAAAAGTTTCTTCCTAAAAATCTAATAGTATTGCCAAACTCTATCATTCTAGATTCTGTAATTGATCATATCAGAGTGGTGGACTTCTTTTAGTTATTCTATCATGGCAATATGACATGCAGCAATTGTAAATTCCGGGAAGCTATTTCGTCACTCATTCCATTACCTTCGAGAAATAACTCATCATACTTAACCACAACCTCGTTGATAAATGTACTTCTTTCAAGTGTGTTTGGATTTGATAGTCATGATCATTTTCAAGTTGGGACTTTTTCGATTTGTGTAAAAATAGAGTCATGTAATTCCGGATTGAGTCGGGTAATTTAGCTTGGGTAATATAATGGGGGTTAGTTTTTCCCGTGTGTTGTGATTTCTCACTTCTTTTCCTAAGCATGAAGCATTTTAGGCTAAAATGACATTTTCGCTCCCAACTTTAAACTAAAGAACCTAAGGACTCATTTTATACTTATTACATGTTTAATATGCATATTTTAACTTTCTAAGACTCATTCCAATCTATTTATGCTCATTTAAGGTTCATTAGGTCGTTATAGGTTTTATTTAGGCTAAAATGACATTTTCGCTCCCAAATTTTAGCTACAGAACCTAAGGATTAATTTTTTAAACCTTTTACATGATTAATATGCTAAAATTTATCTTTCCAAAACTCATTCCAATCTACTTATGCACATTTAATGCTCATTGGGTCGTTATAGGTCATATTTAGGCTAAAATCACCGTTTCGCGCCCAACTTTGAACTAAATAACATAAGGACTCATTTTATACTTATTACATGTTTAATACGCATAGTTTTAACTAACTAAGACTCATTCCAATCTATGTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTCATATTTAGGCTAAAATGACATTTTCGCTCACAACTTTGAACTAAAGAACTTAAGGACTCATTTTAAACCTTTTACATGATTAATATGCTTAGTTTTAAGTTTTCAAGACTTATTCCAATCTATTTATGTACATTTAAGGCTCATTAGGTCGTTGTAGGTCATATTTAGGCTAAAATGACATTTTCGCTCCCAGTTATGAACTAAAGAACATAAGAACTCATTTTATAGTTATTACATATTTAATATGCATAGTTTTAACTTTCTAAGACTCATCCCAATCTATTTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTTTTATTTAGGTTAAAATGATAATTTCGCTCCCAAATTTGAGCTACAGAACCTAAGAATTCATTTAAAACCTTTTAAATGATTAATATCCTTAGCTTTAAGTTTCCAAGACTCGTTCCAATCTATTTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTCTTATTTAGGCCAAAATGACATTTTCGCTCCCAACTTTGAACTAAAGAACCTAAGGACTCATTTTATACTTATTACATGTTTAATATGCATAGTTTTAACTTTCTAAGACTCATTCCAATGTATTTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTTTTATTTAGGCTAAAATGACATTTTCGATCTCAAATTTGAGCTACAGAACCTAAGAATTCATTTAAAACCTTTTAAATGATTAATATGCTTAGCTTTAAGTTTCCAAGACTCGTTCCAATCTATTTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTCTTATTTAGGCCAAAATGACATTTTCGCTCCCAACTTTGAACTAAAGAACCTAAGGACTCATTTTATACTTATTACATGTTTAATATGCATAGTTTTAACTTTCTAAGACTCATTCCAATGTATTTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTTTTATTTAGGCTAAAATGACATTTTCGCTCCCAACTTTGAACTAAAGAACCTAATGACTCATTTTACACTTATTACATGTTTAATATGCATAGTTTTAACTTTCTAAGACTCATTCCAATGTATTTATGCACATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTTTTATTTAGGCTAAAATGACATTTTCGATCTCAAATTTGAGCTACATAACCTAAGAGTTCATTTAAAACCTTTTACATGATTATTATGCTTAGCTTTAAGTTTCCAAGACTATTATGACGTTGTCATTAGTTGCTTGAATGTTAAAATGTGATATTTAATTTGCATTTAATCTAATCCTTAGTTGAAATTTCTGTTTTTGTAAAGGTCTACACTCCGAGGAATGCGCCTATGCTAGTGAGGAAATTGATGTGGTTCGTGCGCAATGGGCTAAGTTTTTACCCGCAAGTATTTATTATTGGCGTGAGCGCGCTTGATCGAGTTGGTTTAGTTGTTATATAACAATCTTTTACATTAAAATGTATGCGTACTTTGAAATTCGAACGTACATATATTTAAATGTAGTACGTGCACTTTGGTTTTGGGACATATAGTATACAGAACACCATTTGTTTTTATATTTGTTATACAAGTTGCGATATTCTATTATTGTTATGACAGGTTTCTATATTTG TCTCGCGCTCAACGCCCTTCTTCTTCCCTTACCTTTCCCTGCGTCGTCCCCTAAAGAAAAAACCTAAGCCGCATCTCAAATTTTCAGTTCTGTTGTTCGCGTCCCGTTCTCCTCTCCTCACTTTGAACACTCTTTCTCTTCGTTCCTCTGCATCGCCGGCCACCACCTCCTTCATGCCGACGCTGCTGGTGCGGTGGTTGCGATGGTTATTGCGTTGTTGTGGTTGATGGTGTTGTCCTGCCTCCGTACTCGGCTTTCCTCTGTTTGTCGCCGCCAATAATGGTGGCCACCAACACAACATCATTTGAAATCCATCACTAATTGGTAAATTGATTTCAATTTCTCCCTCAATTGATTTAATAAGTTCTTGATTTAAAATTTTAAAACCCTAACTAATCGATTCAATGTTCTTTTCCCCCTTTCTTACACCGCCCGTTCTGGTTGTTGGGTGCGACGGCGCTCTGTCGTCTCCGCCGCCTCCTTGTTCGTTGGTGTCAAAGCTAATTATGGACTTGCTCTCCCCTTCCCTCTCCTCCATTGTTGCTGCTCGTTTCTAGCCCATGTGCTGTTCAGGGTCTATGGTGTTTTGATGGGGATTGAAGATCAATGCGGTGCAATGGAGTAGTGGGTTTTTAATGAATGAGAAGTATCACTCCTATTTCAAACGCTGTTGATGTTGTGGAATTCTGTCTTCCTCCCAAGAATTTTGATAAAGATCAGAGCTGTGGAATGAAAATATTTGATATCATCATGATATATGTGAAGCTATGTTGCTGGATGATGTGGCAGCGAGAAGCTACGGAAACAGACACTCATCTGAGTAGTAGTGATACTCTGAAGTCTGAACTGTTGCACCTTTCTCCTTCATTAGTCAATTATCATCAGGTTACAGATTTTAAAAAGAGTAAAAAGAGTTTGAATACTCTAAATTCTACATGTGATGAGGTGCGAAATTCTGGGAACTTGAAAGAGATCGTGCAGTTAATCCTTAATCTAGGCCAAAGGTTTCTGTTGCTGGTTCTTCGTTACAGAAACCATTCACAGTGAGATAATAATTTTATGGACGAATATTGATTATTTTGCAGATTCATAACCACTAAGTTCACTGTTTTATGTCACACGAAAAGCAGATAATAATTTTATGGACGAATTGGAGCTAGACACTGCAGAAATCCTTAGAAAAGCCAGAAGAAGAAAGAGAAAACAAAATTGTAAAAGAGCATTCCTAACTCAAAGAAAGTGAAGGTCTACACTCCGAGGAATGCGCCTATGCTAGTGAGGAAATTGATGTGGTTCGTGCGCAATGGGCTAAGTTTTTACCCGCAAGTATTTATTATTGGCGTGAGCGCGCTTGATCGAGTTGGTTTAGTTGTTATATAACAATCTTTTACATTAAAATGTATGCGTACTTTGAAATTCGAACGTACATATATTTAAATGTAGTACGTGCACTTTGGTTTTGGGACATATAGTATACAGAACACCATTTGTTTTTATATTTGTTATACAAGTTGCGATATTCTATTATTGTTATGACAGGTTTCTATATTTG ATGAGAAGTATCACTCCTATTTCAAACGCTGTTGATGTTGTGGAATTCTGTCTTCCTCCCAAGAATTTTGATAAAGATCAGAGCTGTGGAATGAAAATATTTGATATCATCATGATATATGTGAAGCTATGTTGCTGGATGATGTGGCAGCGAGAAGCTACGGAAACAGACACTCATCTGAGTAGTAGTGATACTCTGAAGTCTGAACTGTTGCACCTTTCTCCTTCATTAGTCAATTATCATCAGGTTACAGATTTTAAAAAGAGTAAAAAGAGTTTGAATACTCTAAATTCTACATGTGATGAGGTGCGAAATTCTGGGAACTTGAAAGAGATCGTGCAGTTAATCCTTAATCTAGGCCAAAGGTTTCTGTTGCTGGTTCTTCGTTACAGAAACCATTCACAGTGA MRSITPISNAVDVVEFCLPPKNFDKDQSCGMKIFDIIMIYVKLCCWMMWQREATETDTHLSSSDTLKSELLHLSPSLVNYHQVTDFKKSKKSLNTLNSTCDEVRNSGNLKEIVQLILNLGQRFLLLVLRYRNHSQ Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo12530.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902206129|gb|KNA15387.1| (hypothetical protein SOVF_098670 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 4.100e-7 Identity = 33/39 (84.62%), Postives = 35/39 (89.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12530.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902239702|gb|KNA25680.1| (hypothetical protein SOVF_004340 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 1.600e-6 Identity = 39/66 (59.09%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12530.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R9C4_SPIOL (Formin-like protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_098670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 2.900e-7 Identity = 33/39 (84.62%), Postives = 35/39 (89.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12530.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9S1Q6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_004340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 1.100e-6 Identity = 39/66 (59.09%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo12530.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 2
BLAST of Spo12530.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 2
BLAST of Spo12530.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo12530.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
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