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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTGCGTCTGCAACCACCACCAGACTTGCTGCCGCCACATCTGCACTTTCCGCCTCTCGTTGTTGCCACTATCAACCATCATGGTCCTTCTCCTTTCATGGCGGAGAAATCAGGAATAAGAGGGAATATTCCATTGTTGAAAGGAAGATGGGTTTGGGAAAGAGATGGAGAGGTGTGTGATTTTAGGGGCGACTTCAATTGTCGAGAGTAAGAGAGAGAAAAAAGGACTGGAATTGGGGAAGATGGGATTGAAAATGAAGTGCAGGTTTTCTCTGATGATGAGCTTAAATTGAGAATAATCTGGATAATTTCTTGCTTAATTACTTCATTAGCTCGGCATAATCTGGTGAAGAAGATGGTGAATCAATGTCTGAAGTTAATAGAAGATATAATTCGACACAATTAAACTGTAATGAGAGCAGGGGCATATGGGGAAAGAATCGGAAAACATTGGGGCATATGCTGAAAGCCTCAGAAATCAGTGGGGCATGTGGTGAAATAAAAATTTTATGAAATACAGGGGTATATGGTGAAAAAAGTTTCTAACGGTCACTTAACGGCAGGGTAAGTTATGCAAGAAAATGAAACCTCAGGGGTATATGGTGAATAACTGAAACTGCGAGGGTATTTGTTCAATAAAATCAAACATCGGGGGTATTTCATGAAAAATCCGTAATTATTAAACTCTTGATTAGGTCCTTATTCATTTAAGGTTAATAACTTGATTAGAAGTAATTAATAAGGTCAAATAATTTGTAGATTCTTAAGCCTTGATTAGTTGTTGCAAATATTTATGTGATGCATATTTTTCTGCTAACTTGCTAAGTGGGCCATTCTTTAAAAATGAATGAGTGAATGGCATATTGCAAATATATTGTTTTACAGGTTGTGGAAAGTGACTAGTATGGCGCAAATAGGATAGTAAATATGGTATGCGTACCATTAATTTGAATGCAAAATATGGTCTAATGCACCATGGTTTTATTTAAATATGGTCTACGTACCATCAATTTGTTGTAATTAGTTTTAATTATTGCAAATCCTATTTGATGAAAATGGCGCCTCCCTTGGTGAAATTCAAGAACGGAGTTTCCAATCCATTTTCAAGACGAAGTTTGAAGTTGAAGCTTCAAGATAAAGTTGGGCCATACTAGATCACATTTAAATCTTATGCATGTTTTAAGATATTTATTGCTTTAAATATGTCTTGATATTCTGCATGAGATTGTGGCTTGATTATGTTGCATGATTAAGGATTTTAATTAGTTCACTTAAAATTTAACCAACATAGTAAGAGCCTTAAGTTCCAAACTTTAAAATTGAGTTAAAAGGTGTCATTCAAGAATAACACTTATTTCTCACCTTTTCCGCCAAAGCGAGGTGTTACTTATTGATTTTAAAGGGGTAAGGTACACATTAGTTGTGAGCACATGTTGATTTTGGTTGAACTCAACGATATAAGTAAGGGGCCCTTTTATGTCGTGGCAAATGGGATAGGTATACCTAATAAGTTCTTAGACATATCTGTCAACCAAGAGTAGTTTCTAGACTATTAGCAAAGGATTTTCTTACCTAAAATATTTTAGAATTAAGACAAGCCAAAGCATGCTTAGTCCTTTAATGATTTTGAGGATCTTGGATTTATTTTATTCACACCTGCCAAAACACAAAAGCTCGAATAAAATGCTTAATAAAATTTGAATTATGCATGTTTTCTAGAATTTAAGTTAAGATCATGAATGAATGGTTATTTATTTGTTTATTCTTTTCAGTTGTAGTTTTGATTATGGCAAACAACAATTCATTCAACATTCGATCAATTCTCGAAAAGGAGAAGTTGAACGGGAAAAACTTCCTTGACTGGCAAAGGAACTTGCAAATAGTTCTTATGCATGCAGGAAGCAAAAGAGTATGTCCTAGAAGAGGCGATGCCCGAAATCGCTGGCAACGGGGTCACCCGGCCAGCCCTCAATCGTTGGTTTGATACCAAAAAGGATGTCAAATGTTTAATGCTTGCATCCACGATTGCAGATCTACAGAAAACGTTTATCAACTCAGATGCTTTCACGATCATCAGTGAGTTGAAGAACATGTTCCAAGATCTGGCTCGAGTCGAAAGATTCAAGACTCATAGGCAAATTCTTGACACCAAGCTCAGGAAAGTCGAGCCCGTAAGTCCACATGTTCGCAAGATGATTGGATTAATTGAGAATATTAGTAGGATGGATCAACAGTTCTGTCAAGAAATGGTTGTAGACACCATCCTCTACTCTCTTCATAGCGGGTTTGATAAGTTTAAACTGAATTACAACATGAATAGTATGGACAAAACACTCACTGAGCTTTACGGTATGTTGAAGACCACTGAAAAGACGCTCAAAAGTGATAAGCAATATGTGCTTATGATGCGTGGGGGAAAGTTCAAGAAATCTGGTAAGAAGAGGAATGTTAAGAAAGGTGGCAAGAAAGCCAGCCCATCTAAGCAAACTGGAAACGCTAATTATGAAAAGAAGAAGGTAAGACAACCACTTCTGAATCTGAATGCTTATACTGTGAGAAGAAGGGGCATTGGAAGAGAGATTTCTTGAAGCTAAAGGAAGATTAGAAGAATGAAACTGTCGTTCCAGCTTTAGGTATTTTCGTTATAGACTGTAAACTTTCTATTTCAACTTCTTGGGTATTAAATACAGGTTTTGGCTCACACTTATTTTCCAATCCACAGGGACTAAGAAGAAGTAGAAGATTAAGCAAGGGTGAAGTCGACCTACGAGTGGGAAATGGAGCAAGGATTGTTGCATTAGCTGTAGGGACTTATTATTTTGAAGGAAATATGTCCTTCACCCAAGGTGCATTAGTCTAATAGCAAGGTTCAGATTAATTATGAATAACTAATTCAGTGAGATCAAGTGATCGGAACAACTAGGTGGAGCAATGCTTCCGATCAGTGAGTTCTAATCCTTCTTAGGCTCACAACTTACTCGTTACTGAACCTACAAGGTCACACCAATGACAGGAAACACATCACCAGATTAAATGAATCGAAAATTCATTTAATGGAATTTCAGGAAATTAGTTTGGAAAATATAATTATACGATTAAACATTGGATTGTGAAATAGTATATCGTATTGCTATATTCGTAAGCTAGGCAAGATGAATAATCGTATCGTACGACATTGGATCGTCAAGTAAGGAACGATAAATAAATTATCGTAAGATAATTAAATCACAACACGAAAGTGAAGGAAATATGTCCTTCATCCAAGGTGCATTAGTCCAATACCAAGGTTCAGATTAATTACGAACAATAATTTAGTGAGATCAAGTGATCAGAAAAGCTGGCTGGAGCAATTCTTCTGATCAGTGAGTTCTAATTTATATTAGGCTCACAACTTACTCTTGACTGAACCTATAAGGTTACACCATTGGCATGTAATAGATCACCAGATTAAATGAATCGGAAATTAATTTAATAGCTTTTCGGGAAATTAGTTCGGAAAACATAATTATACGATTAAACATTGGATCGTGAAATCGTATATCGTATTACGTATATTCGTAAGCTAGGCAAGATGAATAATCGTATCGTACGATATTGGATCGTCAAGTACGAAACGATAAATAAATTGTCGAAGGATAGTTTAATCGCAATACGAAAACAACCCACAAGCCGGAGGGCACAAGCGCAAGGCCCATGGGCGCAGCGTGCATGGCCATGCAGCGCTGGCCCATAGGCCTCGCTGCGGTGTGGCGCACGCGGACAAAAGCACAAGGCAAGCAACAGCAGCTAGCGGCCCGCGGCCTAGCTAGCTGTGTGCGTGTGTAATGTCATGGGCTTGCTGGCCGGCCAATGGCCTTAGGCCTTGGTTGGTTGGCCTGCTTATTGTCTAGTTTATTTTAATAACCTAAGTACATGTTTTTTCCAACACACAATTCAGATTGTACACACAATCCTAGGAGAAAAGAGAAACCCTAATTCTCTCTTTGCCTCCATGAAGGTGTTCTTCCCAAAAGAAAAAATATCTTGACTGACTTCTAAGCCATTGATCTCAAGACGGATCCGAACGTGTTGGTGAACCAAGTAGAGGAACGACATCTAGAGTTCTTGTTCGTGTTTGTGGTACGTTGAATCTAGGGAAAACACGCTACAAATGTAAGTCTGCTTGATCTGTACTTTATACTTGGTTCCTGGCTTTGGGGATTTTTCCGCTGCGTTAATATATTTTTAACTGTATTCCCCAACAGAAAGAAACCCACGAGCCGGAGCGCACAAGCGCAAGGCCCATGGGAGCAATGCGCATGGCATACAACGCTGGTCCATAGACCTCGCTGTTGTGTGGCGCGCGCGGTCAAAGCACAAGGAAGCACAGCAAGCACGCGGCCCGTGACCCAGCTTGTTGTGTGCGTGCCTATGCCCTTCGTGGGATTTCGGGCCGACCAATGGCCTTAGGCCTTGGTCGGTTGGCTTGCTTAATGTTTAGATTATTTTAATAACCTAAACACATGTTTTTCATACACACAATTCAGATTGTACACACAACCGTAGAAGAAAATTGAAACCCTAATTCTACTTTGCCTTCCAAGTGTGTTCTTCCCAAAAACCAAAAGAACCTTGATCGAGATCTAAGCTATCAACAATCAAGGCGGATCTGCACTGTAGGTGAACCAAGTAGAGGAACTACAATTGGAGTTCTTGTTCGTGTTCGTTGACAAAGAGGAAAACACGCTTCAAACGTATTTATTGCTTAATCTGTATACATGATTCCTGGTTTTGGGGTTATTCCGCTATCATGTTATGTATTTAACTTCAAACCCCTTCATATTTTTCGTTGCCCTATGGGCTAGTTTTGGAACTAGAAGAGTATTTCCATGTTCCAAGTATTACTAAAAACATCATTTATGTTTCTTGCTTAGATGCTAAGGGATTTAACTTTCAAATAAAAGACAATAGCTGTTTGTTTTATTTTAAAGAGATGTTTTATGGATCTGCAA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This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
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Match: gi|902191985|gb|KNA11953.1| (hypothetical protein SOVF_130320 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 5.200e-16 Identity = 50/67 (74.63%), Postives = 55/67 (82.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731336183|ref|XP_010679118.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104894555 isoform X3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 4.400e-15 Identity = 43/53 (81.13%), Postives = 46/53 (86.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870858746|gb|KMT10234.1| (hypothetical protein BVRB_5g119940 isoform A [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 4.400e-15 Identity = 43/53 (81.13%), Postives = 46/53 (86.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731336178|ref|XP_010679116.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104894555 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 4.400e-15 Identity = 43/53 (81.13%), Postives = 46/53 (86.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QE32_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_189470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 105.1 bits (261), Expect = 1.200e-19 Identity = 60/101 (59.41%), Postives = 67/101 (66.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QZ29_SPIOL (Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_130320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 3.600e-16 Identity = 50/67 (74.63%), Postives = 55/67 (82.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8C948_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g119940 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 3.000e-15 Identity = 43/53 (81.13%), Postives = 46/53 (86.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CDC6_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g119940 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 3.000e-15 Identity = 43/53 (81.13%), Postives = 46/53 (86.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QLS8_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_164830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 5.200e-15 Identity = 44/44 (100.00%), Postives = 44/44 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: KPYC1_ORYSJ (Pyruvate kinase 1, cytosolic OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=Os11g0148500 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 3.500e-12 Identity = 33/44 (75.00%), Postives = 40/44 (90.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: KPYC1_ORYSI (Pyruvate kinase 1, cytosolic OS=Oryza sativa subsp. indica GN=OsI_35105 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 3.500e-12 Identity = 33/44 (75.00%), Postives = 40/44 (90.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: KPYC2_ORYSI (Pyruvate kinase 2, cytosolic OS=Oryza sativa subsp. indica GN=OsI_37456 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 2.200e-11 Identity = 30/44 (68.18%), Postives = 40/44 (90.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: KPYC2_ORYSJ (Pyruvate kinase 2, cytosolic OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=Os12g0145700 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 2.200e-11 Identity = 30/44 (68.18%), Postives = 40/44 (90.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P2C51_ARATH (Probable protein phosphatase 2C 51 OS=Arabidopsis thaliana GN=At3g63340 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 5.000e-11 Identity = 32/57 (56.14%), Postives = 42/57 (73.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G52990.1 (Pyruvate kinase family protein) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 4.300e-13 Identity = 34/44 (77.27%), Postives = 39/44 (88.64%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G36580.1 (Pyruvate kinase family protein) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.700e-13 Identity = 34/44 (77.27%), Postives = 37/44 (84.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G63340.2 (Protein phosphatase 2C family protein) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 2.800e-12 Identity = 32/57 (56.14%), Postives = 42/57 (73.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G63320.1 (Protein phosphatase 2C family protein) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 5.300e-11 Identity = 30/57 (52.63%), Postives = 40/57 (70.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G15610.1 (Proteasome component (PCI) domain protein) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 2.600e-10 Identity = 28/45 (62.22%), Postives = 38/45 (84.44%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo14238.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo14238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo14238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo14238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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