Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGTGTTTTGCATCAACTCCAAAGGAGGCTGGTGGAAATAGAAGGCGGCCGAGCAATATTGGGGATGTCTCAGTCTTCGTTCCCGGGCTACGAATTCCTAAACCTGTAGATTTCTCTCAGTGCCTTGGCGATCATGTATCAAAAACTGTTGTAGATCGTTTGTCTGCTCTCAGAACACAAATTGTTGTAATGGTTGGCCATGAAGCCCTTACGGTCACGAGATCAAGAAGAAAATCTGCTACCCAACATGGTTAGTTGATCTCAAGAACAAAGAATCAATATTCAGTAACGATATGGTAGATGTTAGTTGCTTAATTGCTTGCAAGTTAAGGTAATCTCAAAACAAAATATTTACTTTATGCAGGAGGTTCAACGTTAGCCGATCTTCAGCAAGCCCTTGAAGATTACTTGCCAGTTCTGCTGGGATTAGTTAAAGATGGTATACTTCATGTCCTTTTGTTTGAATATTTCTGCTGATTGCTGACCTCAAGTAGATTCATGTTCTGTAAATTTACTGTACTTTTTTCAGGAAGCCCTTTACAACACAAGATACAATTTTCCTGGGTTAATCAGGAGGATGGTGCAGAGGTTGGGTCTCATAATTCATTTATGTTGCTGCTTGATGATTTGCTGGTTGGCTTATGGTATGCTTATATTAGGAAGTTTAACAATTGATTCCTGTCTTACATCTTTCAGGAAACTGCCATGTCCAATGCTTGGTATGAGATATTGTCTGTCCTGCATTTGATGGCAATGCTATCATTATCACAAGCCAACCTGTTACTGCTCCCCAGAATATCTGCTGATGGTTATCAGCCAAAGGTTTCAGACGGTAGGCCTAGATTCCATATTATTTCAATTATTTGTGTACTTCTATGTTTCAAGATACCGGGATGGGGATGCTCTATTTATCAATGTCTTTGACCTACCCTTGAGAATTTAAGTTGTTGCTGCTTTGATTCTAAGTGTTGATTTTGGAAACTGAGGTGATAAGATTCTGATAGACTGGCCGAAAATGTTCAGGTCATTATTTGGTTTAGGTACTGTAATGCTGATATATATGTGTGTAATATGTATATATTACCCAAAGGTAAAAAAATCCGTTTTGATGGGGATATGGTTGGTCAATTAGGCAATCCCAAACCAAAAAAAGAACACGACGGAGTCATCGACTATAAGACACATTACAGGGGCAGATCAGAAGCCTTGGATTCTTATAGTAGTCCTACCTTGGGTATTTGTCTATAGCTTTCTAGGTCAATTGCCGTTAAAGATATAAACTGAGTGCCATTTGACGAGTAACTGAGAAAAAGGGAGAAGTTTGTAACCCAAGCTTACTTTTTCTATGAATAAAGGCTGCTCAAGTAAGAAGTTCATGAGGTGCCACCTCCTTTAGAATAAACAGTTCCTAGCAGGTTGCATAACACATAAAAGCAGCGAGCAAGAACAAAACTATGGAAATCAAATCACAAGTTTATAGCGGTAGGGGTGAGGATGTTTCATAGGATTTATATCCTCCAAAGGGTCAAGAATGAAGTTACTAGAGAAAAGGTGGACTTGACCTCCCTTGATGGTAAGATGTGTGAAACAAGACCTAGATGGTTTCTTTGTAAGAAGAGGTATCCCGATACTACAGCTTGAGATATGAAGATCGTTTTGAGAAATTATGACAGAAGAAAAAGAAAAACCAATAAATCTTGTGCAGGGGTTTTGGGCCACCCGTAATGAGCATGTCCCTAAATAGGAAACTCCTGATATTCGGTGATACATTTAGATTTCAACCCCTTGCTTGTCTCATTTTTTTCCCATCCTTAATTCTTTTACTATTTACTAGTGTGACTGTGCACATCCTTCTATCTGTTCTATTTGGCCAACTATGCCTAGTTTGTGGTCTTTACAGTATAATTTCGACCATCAGTTGTTGACCGACTTACTGTATGCTACTTCTCCGTTTCCAATAAGTTTCTGAAATGGGATTACTGGCGCCTGGGAACATTTACTTGCATCTGTGATCTTAAACTGCTGACACCGTCGGTGATTTTAAGTGCTGACACCGTCAGTGATTTTAAGTGCTGACACTATCAGTGATTTTAAAGTGCGCACACCGCCAGTGATTTTAAAGTGCTGACACCGTAATAATTGGCAACTGTTCATGAACAAATAGCTGCGGCTATGAACTAGGGATGTCAATGGGGCGGGGCGGATGCGGATGTATGCCCCTCCATCCCCATCCCCACCTAAAATTTTCATCCCCATCCCCGCCCCATCACCCATGGCGGGTACAAAATTCATCCCCATCCCCACCCCAACGGGTATAAACTAAAATTCATCCCCGCCCCACCACCCAACTGGGTATCCATCCCCATCTTATCCCCGCGACCCCGCCCCATACCCGCGCCAATATCCGCCTAATTTTTCTTATTTAGCAAACATTTTTCATATGTACGAAGTAATGAAAGTTAACTTTACAAAAAAAAAACCTTACGACTAAAGAGACATATATAATCGAAAAAATACCCGTAATAACAAAAAACTTAAAATTCTCACCTAAATATGCACATTAATACAAACTCACCCCATCACCCATGGCGGGTATGAAGCGGGGCGAGTGGGGATGGGGCGGGGCGGGCGGGGATGGGGCGGGTTCAACACAAAATCCACACCCGCCCTATCACCCATGGCGGGTGCGATTTCTATACCCATCCCCGCCCCATCACCCGCCAAACCTACCTCCATCCCCGCCTACTTGGGGCGGATGCGGGGCGGGTCTCCCACGAAACCCGCCCCACTGACATCCCTACTATGAACCAAAGATTTTATTTTTTACTTCCGGCTAGGTTTCAGATTATCTTTCGTGAACCAAAGGTTTGTTTTTGTTGAAGTGTTTATGATTTTTGAACTAGTCATTTCGTTTTACTTAAAGTAAATTTTTTAGAATATATTCTTTGTACCAGAGGTTGATTTTATTTTTTTCAAGCGGAAGGTTCATATTTATGAACCAAAGTTTCATCTATTTTGAAACATAAGTTCAACGTTTTGGAACCACATGCTCAACGTTTTTTTAATTGAAGTTTACAGAGTAATATTTTAAGTTCAAATATTTTTTTACAGAAGGTTCATTGTTTTTCAACCATAGGTTAATCTTTTCTTAATTCAGGTTTATTTTTTAAGTGAAGAATAATTTTGTAAGTTCATTTTTTGAACGGCAGTCGGCAGGTTAATTTTTCAATTTATGAAGGTTCCAATACACACACATACGAACACCAAAAAGCTAGTCGTCAAACAAGCCCTGAATTTTTCTACTGCACAAGTTATTGGACACATTAGCTTGTCTTGGAATTTCTTTGCTACGAATCCAATTTATTTCTCAGCCAAAACCTCACAAGTAAACATCATTGATAAGAAACTACGACACAAATAAGGGAAAGCAAGTTATATGTGGCTGTTATTGTTGAATATTAGGGTGATTACCAATTTTAGCCTACCCACTTTCAGGAGGTGGGAGTGCTCCCTAGAATTGTTTCTCTCTCTACTTTTTTTTTTGAATTAATCTAACAATAAGCTTCTTTCCCCTTGTATTACATCAGACTTCCCGAGTTATTTATCACACCATTCTTAACTATGGAGTATTAAGTGATTTTCCATCCACACCTTCTAACTGAATTTCCTACAAACTCTAAGGGATGTTTTCATTGTTATCCTTTCTGTTCCTATGATCATAATTGAACAGCAGCGGAAGCTTAGAGGACGATTCACTGCATATGCATTGGTATGTGCACGAATTCATAAAAATTCTGAAGTGCAAAATCTTACGACTTAACTCACGATATGCACAATCATATTTCTTGCATCTCAAATACTCATCCACGCTTTTCTCTGCCATCTTGGACACATATATCTTTTACTTAAGAATTTTGAAATGTGATTTTCTTTACCCTTAACCAACTTTTTTTCTCTTGGCCCTTACAGGCCTACAGTGCATTCAAGTCAGATAAACAAAAATTGTAAAGCTTAGAATGTATACACGCCCTTTTTCATTGTTTTGGATGTGAAACACTGCTTTCTAGTGCGGAAAGGACTTCCATAGATAAATGAATTAATGAATCGAAGGGGAAAGTGTGTAAACAATTGACATAACTGCTTATTTGGCGAGTTTGGAAGGTATACCATAAGAATGGCAGCCTCTGTCTAAGAGTTTCTGATTGGAGTGTCCGAAGCAGGAAATACCTTTTCTATTGGGGGTAGTCGTGGAAGCCTTTAGAAAACCGCTCTTAACTTCATGAAGTGCTTGAAGCCCTGTTCATTCAATTATATTGTAGACAAAATGAGGATATGAATGTCTAGGCAAGTGTGCAAGAATAGAAGTCAAAGAAGTAATTTTGTCAAATTTGAGTGTCTCTCTCAGTAGTGACTATTATGTGAGTTTGCTTCCCCGAGCTTCAACTGCGTAAAAGAGGTTTATGTTTTTTAAAATTCACTTCAACGTTTTCTGCTTGCTGTTATTAGGACTAAACAGTCCATCTCGTATCTCTGAAGATTTTAATTTTAAAATTTAGATGGTGGTTAATTTGCGTTAAAAATAACCAGTACGTCTTCTGTATCTTACAATATCGTTTCAAACTTGTTGGTTAGTTTGTGTTGCATAAGCCTTCATAGAGGCATAACTTGACAATTTCTTTTTATATTGGATGATTGGTGAGACCTGCTCCCTCCTTCCCATATCTGTCATATCTAGAAAATGAATTTTTTAAAACAAAAATCATCTGTTTTCTTTTGTAGCATATAAATGCTTTTGTTTACGCTTTAATTTATTATTTTGGGAAACTTGGTTACTATTTCACGATCTAAAAAAAAAAGTTGACTATGAAATTAGGACGGAGAGTTATTACTCTAGCTCCTCTATATTCAGTTAATTTGCTGTGAGCAGCAATATAAATTCCCTGTCTTCATAATTTGTTTTCCATTAAGTGGACATTATTGAATATATTAGA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MGCFASTPKEAGGNRRRPSNIGDVSVFVPGLRIPKPVDFSQCLGDHVSKTVVDRLSALRTQIVVMVGHEALTVTRSRRKSATQHGGSTLADLQQALEDYLPVLLGLVKDGSPLQHKIQFSWVNQEDGAEETAMSNAWYEILSVLHLMAMLSLSQANLLLLPRISADGYQPKVSDESRRASVDVFLKAAGYLDCAVRHVFPQFSAEMRRNLPVDLAEGVIRALSLQALGQGVDIQLGMAIDSAKATLAVKRRLACEMVKYWQQAQDNIMNLPLSNGWGEKHQLFVKWKYVEAKAAAYYYHGLILDEGNTEKSHGMAIAALQAADEYLKESKKACEAFNMAPPQSRNTLSWGTMKYLSEKIPKDTASKVRINRDLYTHEKIIETAPTLPDFALALKPDEYQLPAVHSCWSGESINAV Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo17078.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902175839|gb|KNA08673.1| (hypothetical protein SOVF_160520 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 2.200e-237 Identity = 415/415 (100.00%), Postives = 415/415 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731363353|ref|XP_010693389.1| (PREDICTED: BRO1 domain-containing protein BROX-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 4.100e-223 Identity = 388/415 (93.49%), Postives = 398/415 (95.90%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. NCBI nr
Match: gi|359489921|ref|XP_002264045.2| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100266486 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 8.900e-202 Identity = 345/413 (83.54%), Postives = 382/413 (92.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568848707|ref|XP_006478139.1| (PREDICTED: BRO1 domain-containing protein BROX [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 709.5 bits (1830), Expect = 3.400e-201 Identity = 349/413 (84.50%), Postives = 378/413 (91.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1021569616|ref|XP_016176019.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107618451 isoform X2 [Arachis ipaensis]) HSP 1 Score: 709.1 bits (1829), Expect = 4.400e-201 Identity = 346/415 (83.37%), Postives = 378/415 (91.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QPQ6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_160520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 1.600e-237 Identity = 415/415 (100.00%), Postives = 415/415 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8E7M3_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g047580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 2.900e-223 Identity = 388/415 (93.49%), Postives = 398/415 (95.90%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7T7E0_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_16s0039g00390 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 6.200e-202 Identity = 345/413 (83.54%), Postives = 382/413 (92.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0A0LTW5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G043250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 708.8 bits (1828), Expect = 4.000e-201 Identity = 346/412 (83.98%), Postives = 377/412 (91.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5W9E5_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa006106mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 708.0 bits (1826), Expect = 6.800e-201 Identity = 344/413 (83.29%), Postives = 378/413 (91.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G73390.1 (Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein) HSP 1 Score: 666.8 bits (1719), Expect = 8.900e-192 Identity = 327/412 (79.37%), Postives = 368/412 (89.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G17940.1 (Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein) HSP 1 Score: 642.5 bits (1656), Expect = 1.800e-184 Identity = 319/402 (79.35%), Postives = 360/402 (89.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17078.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G14020.1 (Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein) HSP 1 Score: 283.1 bits (723), Expect = 2.800e-76 Identity = 167/411 (40.63%), Postives = 245/411 (59.61%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo17078.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo17078.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo17078.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo17078.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 3
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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