Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAAGAGTAATGAAAGAAGCTTTTGAAAACAATCAAAAGATCCTAGCCCCATATCATCAGATGTAAGTTTATTTTCTTATCTTGGTTAGAACAATACTAGTTGTTTAGTTTGTTCTATGTTCGACACTTTTCCCATTTATCTGTATTCTTGCATGTCATATAGTCGCATATCCGACAATCATACAATATCTGTATTTGAGAAACCCTCTTCATATAGTTTCCTATTATTATTTTTAATTATTTTTTGCCGATAAAGTAATTTTATTATTGTTAAGCATATTTCATTTTCATAGTTTTGCCGATCCTTACGTGTCATATTTCAAAAAAAAAGTAGCCGTTTTCGCTCCCAACTCTTAACTCATGAACCAAAATAGGAATTATTAACCCTTTACATGTTTAATATACTTAGTATTAGTTTTCCAATCATTATTCTCATCTACTTTGGTCAATTTATGCACATTTAAGGCTCGTTCGATCCTTACATGTCATATTTTGACTAAAATAGCCGTTTTCGCTCCCAACTCTCAAGTAATGAACCAAAATAGGAATTCTTTACCCTTTACATGTTTAAAATACTTAGTATTAGGTTGCCAATCCTCATTCTCATTTACTTTGGTCAATTTTTGCACATTTAAGGCTCGTTTGATCGCTATATGTCATATTTTGACTAAAATAGTCGTTTTCGCTCCTAACTCTCAACTAATGAACCAAAATAGGAACTCATTTCAACTAATAATATGAATCATGAAAAAGGTTTAGAATTTGAATATAAGTTTTTTTGTTGATAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTAAATGACCTATATCGACCTAAATGAACCATAGACGTGCATAAAGATCTTAGAGACAAAATAATTTAAAAACTTTGGGACCAGTATTGTGTCTTGCTGGTTTAGTCTGACGTGCAGCCTGGGAAACATCTTGAGTTTAATTTAATGTCGAGGGACTTATGGCAGCCTGGCAGCAGCAGATCAGCTGCTGAACACATCAGTTTATGATCTGTTCAACTGCTGATCCGTTGCTGCTGATCTGCAACTGAACAGATCAGAAACTGATGTGTTCAGCTGCAGATCAGTAGCAGCAGATCAGCAAACTGATCTGTTCAACAGCAGATCAGCAGCAGCAGATCAGCTGCTGAACACATCAGTTTCTGATCTGTTCAGCTGCAGATCAGCAGCAACAGATCAGCAGTTGAACAGATCAGAAACTGATGTGTTTAGCAGCTGATCTGCTGCTGCTGATCTGCAGCTGAACAGATCAGTTTCTGATCTGTTCAACAGTAGATCAGCAAAAGCAGATCAGCTGCTGAACACATCAAAAACTGATATGTTCAGCTGCTGATCATTACAGTTACTACACTTCAACCGTTCATCAGGACTATTTCTATGCTTGTGTAATTTTGAACCAGCCATGTTACTACTAGATGCAGACAAAGGGAATACATTATTACCTCTGTAGATCAAAATATGAATGTGTGAAACCCTTTCTTGTATTTTTCTTTCATGTCTGATTGCTTTAAATCAGTATTTAGCTTGGTAGATGTATATGATTTCCAGTTTCCCTGATGAAGCTTTTGAGGTATTAGGAAAAGGCTATGTTGCCTCAATAGGATGCAAACTTTCTAGGATGTTACCTCTTGAATAATACATTTGTCAGTTCAAGTAGAGATTATTAATCTTAGTAACCTCTAACTAATCATATCAAACATAAAAAAGATTTAGAAAGTGTCCTTAGGTTCATTTGTTGATATTTGAAATTGAAAATGCCATTTTTGGCCAAATATGACCTATATCGAGCCAAATGATCCTTAGATTTGCATAAAGAACTTGAAATGAGTTTAATAAATATATAACTAATCATATAATTCATGAAAAACGTTTAGAATATGGAAATAGGTTCGTTTGTTGGTAGTTGCGTTCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCCATAGGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATATAACTAATCATATGAATCATAAAAAATGTTTAGAATATGGAAATAGGTTTGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGAACCATAGCCATGCATAACGAACTTGAAATAAGTCTTATAAACATATAACTAATCATCTAAATCATGAAAAAGGTTTAGAATGTGGATATAAGTTCGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCAATAGGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATCTGACTAATCATATAAATCATGAAAAAAGGTTAGAATGTGGAAAGAGGTTCGTTTGTTGGTAGTTGGGTTCAAAAATGCCATTTTTGCCAATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCTATATGCGTGAATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATGAACATATAATTAATCATATGAATCATGAAAAAGATTTAGAATATGGAAATAGGTTTGTTTGTTGGTAATTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTTTATCGACCCAAATGACCCATAGGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATATAACTAATCATATGAATCATAAAAAACGTTTAGAATATGGAAATAGGTTTGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTTTATCGACCCAAATGACCCATAGGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATATAACTAATCATATGAATCATAAAAAACGTTTAGAATATGGAAATAGGTTTGTTTGTTGGTAGTTGGCATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCCATAGGAATGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAAACATATAACTAATCATCTAAATCATGAAAAAGGTTTAGAATGTGGATATAAGTTCGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCACTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACTCAAATGACCCATAGGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATATAACTAATCATATGAATCATAAAAAACGTTTAGAATATGGAAATAGGTTTGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCCATAGGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATATAACTAATCATATGAATCATAAAAAACGTTTAGAATATGGAAATAGGTTTGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGTCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCCATAGGCATGCATAACGAATTTGAAATGAGTCTTATAAACATATAACTAATCATCTAAATCATGAAAAAGGTTTAGAATGTGGATNAACATATAACTAATCATCTAAATCATGAAAAAGGTTTAGAATGTGGATATAAGTTCGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACCTATATCGACCCAAATGACCCTTAGGCGTGCATACGAACTTGAAATGAGTTTCATAAACATTTAACTAATCATATTAATCATTAAAAGGGTTTATAATTTGAATATAAGTTCGTTTGTGTTAGGTTATGATACATATGACAATTCATAAATCATGCGGAAAAAACCATAAACCCAGGAAAACATATTATTTACACATAATCATTTAGCATAGATTAGATGCATACTCTTTGTTGCGTGCCTTCCCTAGCTGCGCCCGAACCGAACAAGAACAAGTCTTTAGGACTCCAAGTGTCGTCCCTCCGTAGATAGTCCACAGCACGTCCGGATCCGCCTTAAGATTGACCAACTAGAATCGCCCTTAAGGTACTATTATTTTCGGCACTTTATAGGCAAATGTGTGACTGAATTTTTCTCTCAAAAACTCACTTTGAATACTTTGAAACTTGTGTTATAAATTGTGAGCCCTAGCCTCATATTTATAGCGGTATGGAAAGGGAATCGAAATCCTATTCAGATACAAATTAATTAAACCTAGAATTCTACAAGAACTCTAATTTAATTAATTTATCAAATAGAATTAGGAATTTAATCATTAACCGAACTCTGCATGTTTTAGGAAACGTGCACGAACACAAACACTTGCACACACACGCACGGCAGCCACGATGGGCCCCATGCGTGCGCGCTAGCAGCAGCCCACTCAGCGCCCGCGCGCGCTGCGCGCTGCGCGTGCTGTGCGCAGCCTGCTGGGCCTGGCCTTGCGCTGGGCCTGGCGTTGCTGTTTGTGCGGCGCGCTTGGCTTGCTGGGCGATGGCCTGGCTTCGTGCTGGGCCTCGTCCGGCAGGCCTCGTCCGATGCTTATTCGTACGATGCGCTTCCGATTAAATTTCCGATTCCGGAATTCATTTCCGATACGAACAATATTTAATATTTCCGATTCCGGAATTAATTTCCGTTTCGAACAAATATTTAATATTTCCGTTTCCGGAATTATTTTCCGATTCCGGTAATATTTCCGATTCTGACAACCGCATTTATTAGACTTAACATAGAATGCATACTTGGACCAAGGGCATTATTTCCTTCAGTTTGTTGGTAGTTGGGATCGAAAATGCCATAAATTACCTATATCGACCCAAATGACCTATATGCGTGCATAACGAACTTGAAATGAGTCTTATAATCATATAACTAATCGTATGAATCATGAAAAACGTTTAGAATATGGAAATAGGTTCGTTTGTTGGTAGTTGTGATCGAAAATGCCATTTTTGGCCATAAATGACTTATATCGACCCAAATGACCCTTAGGTGTGCATAACGAACTTGAAAAGAGATTCATAAACACTTAACTAATCATATTAATCA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ATGGCAAGAGTAATGAAAGAAGCTTTTGAAAACAATCAAAAGATCCTAGCCCCATATCATCAGATCACAAATTCTATGTCTGTGTCAGTCCCTCTATGGAGAGTCAGCAAGCTTACTACTACATCGATTTCAGTTTGTAATTCCAGAACTCCTGTTTCTAATGGAAGTCCCATGAGATGCAGCTGCTTGGGAACTATGATAAATTTTGAGAGCGCTGCTGCATCTAATTGGGTTCCTGTCATTGACCAAGTGCTTCTGACTGCTAGTGTAGTCTTTGCTTATATGGCTGGAGTCATTCCTTCCGGAGGATCCTATGTAAAATCCCAAAAGAAAAAGTTAAATGACCCACTGCTTCCTGAAAGTCCCATGTTTTCCGGTAGTACAACAAAAAAGGAAGATCAGCTTGTGTATCAATGTCCCTGGGATGTAGTGAAAGGGAAAATAACAAAGTCTCTTCTTGCTATTGAAAATGGTGTTATTGTGGAAGAAAGTTCCATAGAATATGAATTAGATCGTGCAAAGAGGCCTCTTAATTTGTATGCTGTTGCTAATGGTTCCAGATTCAGGCTGCTTTTGTCTTCAATTGAGCAACTTGAGAAAGAGGTTAATGAAATCCCAGACACATCAATGGCTATGGAAAGGGAGGAATGGCTAGGATTATTTTCCTCTACTTTAAAGAAGGCTTGTCAATCAGCTTTGTTTTCTTGGATGGAAATGGAGTTCTGCACTGAAAACTGTAAGCCTGACAAGGAGCTTTTGTTCTCTATGTCAGAGAAGTTGAGAGGAGATGATATTATCTTAGGGAACATTAGAAAATTCGGCAAGATGGATCTATTTGCAGATTTGATTGGCTTTCTCAGATATGATTACATTAGGGAATGTAGCTACTATGACCACAATGTTTATCCCTTACACGGGTGTGCTATATTGGAAGATCTGATCATTACTCTAGCTGATGCAATTTCAAGCATATATTTGGAGGTTATATCTGTTGACAGTGATATTTCTGAAAAGATTAGCAACTTTGGGTTGTCCTTGTGTACTTTGTCAACAAGAGATCTGCAGAAATTAAGAAATGAGTCTTTGCACAATCTGTATTTCAAAAGAGGAGAAACAAAAACCTACTATTGTGGTTATCAGCCGTCATTAAAGAAGGGACCACCTGTTACCTTCTTGTGCTCCAGCTCTATACATTGGGATTATTGTACACGTGTCATTTCCCTTCTTCGAGATCCTGGGACGTCAGCCGAGGCTTTCATTCCTCACTCGTCACTCAACCGTCTGGCCACCCCTCCTTCAAATAACAATAGAATACTCAGCTATCTTCGGATAGCTATGCGCGAGTGGATTCACCAGAACTTTGGACAAATTGTATTGATGTATGAGGATCGATTTGACCTTCGGGTACTAAAGATTGAACCTTATCGTGATCCAGCAGAAAAGCTCAAGGAAAGTCGTAAGTGGTGGAAAAGACTTACTCTGAAGAAATCTGTAACAGTGCAGTCCTCACTACGCTATTCAGTAGTTGGTCCCTTCTCTTTGACCTTAAAGCGCACAAGGGAACTGAGGGCCCTCAAAGGATGGTATGCTCCTCCTCCTCCCTGGAAGTACTACTTCAGCCTCATACTTGAGTTGTCTGACATAGCAGTGCCAATGGTCAAAGTAGTTGTTTCTCAGTTTACCAATCAACATGATTATAATAGGTATGACTATTTTATAGTTTGA MARVMKEAFENNQKILAPYHQITNSMSVSVPLWRVSKLTTTSISVCNSRTPVSNGSPMRCSCLGTMINFESAAASNWVPVIDQVLLTASVVFAYMAGVIPSGGSYVKSQKKKLNDPLLPESPMFSGSTTKKEDQLVYQCPWDVVKGKITKSLLAIENGVIVEESSIEYELDRAKRPLNLYAVANGSRFRLLLSSIEQLEKEVNEIPDTSMAMEREEWLGLFSSTLKKACQSALFSWMEMEFCTENCKPDKELLFSMSEKLRGDDIILGNIRKFGKMDLFADLIGFLRYDYIRECSYYDHNVYPLHGCAILEDLIITLADAISSIYLEVISVDSDISEKISNFGLSLCTLSTRDLQKLRNESLHNLYFKRGETKTYYCGYQPSLKKGPPVTFLCSSSIHWDYCTRVISLLRDPGTSAEAFIPHSSLNRLATPPSNNNRILSYLRIAMREWIHQNFGQIVLMYEDRFDLRVLKIEPYRDPAEKLKESRKWWKRLTLKKSVTVQSSLRYSVVGPFSLTLKRTRELRALKGWYAPPPPWKYYFSLILELSDIAVPMVKVVVSQFTNQHDYNRYDYFIV Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo17532.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902207941|gb|KNA15805.1| (hypothetical protein SOVF_094860 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 664.8 bits (1714), Expect = 1.300e-187 Identity = 338/338 (100.00%), Postives = 338/338 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902207942|gb|KNA15806.1| (hypothetical protein SOVF_094860 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 659.1 bits (1699), Expect = 7.200e-186 Identity = 335/335 (100.00%), Postives = 335/335 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731347322|ref|XP_010684928.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104899430 isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 516.2 bits (1328), Expect = 7.600e-143 Identity = 268/339 (79.06%), Postives = 295/339 (87.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731347316|ref|XP_010684925.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104899430 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 516.2 bits (1328), Expect = 7.600e-143 Identity = 268/339 (79.06%), Postives = 295/339 (87.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731396410|ref|XP_010652493.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100244728 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 6.100e-76 Identity = 168/337 (49.85%), Postives = 220/337 (65.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R8I8_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_094860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 664.8 bits (1714), Expect = 9.200e-188 Identity = 338/338 (100.00%), Postives = 338/338 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R8J2_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_094860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 659.1 bits (1699), Expect = 5.000e-186 Identity = 335/335 (100.00%), Postives = 335/335 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8C059_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g166970 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 516.2 bits (1328), Expect = 5.300e-143 Identity = 268/339 (79.06%), Postives = 295/339 (87.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7U3I2_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_07s0005g06150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 4.300e-76 Identity = 168/337 (49.85%), Postives = 220/337 (65.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4VUE4_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019729mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 267.7 bits (683), Expect = 3.300e-68 Identity = 159/384 (41.41%), Postives = 226/384 (58.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17532.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G48830.2 (unknown protein) HSP 1 Score: 201.8 bits (512), Expect = 1.100e-51 Identity = 124/314 (39.49%), Postives = 181/314 (57.64%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo17532.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo17532.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo17532.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo17532.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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