Spo17822.1 (mRNA) | SpinachBase

Overview


Name	Spo17822.1
Type	mRNA
Organism	Spinacia oleracea (Spinach)
Description	Midasin
Location	Super_scaffold_7 : 2164665 .. 2185393 (+)
Sequence length	489

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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GAAGAAGGGGTTCTGGCATCAAATTGCAATCGCCCGATCCGGATCGGGCGAAATGCGCCTGATCGGGCGCGCGTCAAAACTCAGAAAAGGTTTTTATTTTGCCCGATCGGGCGAAGCTTTTCCCGACCGGGCGATTCACGATTTCACGGGCTATATTACACTGATCTCCCCCTTCCTTCATTCTATTTTCCATTTTCTTTCTCAACTCTCTCTCTCTCTTCCTCCATTAAACCCCAAACTCCAAAATCTTCAAACCTTCATAACTTCTTCATTCCTCCACCAATTCATCACACCTTACATCAAATTCATCCTCTCACCACCCTCTACAACCTCCACCCATTTATTTTCATCTTTCTCCACTCTCCACAAAAACCCCAATTTTCCCAAAAACCCCCAAAACCCCAAAAATTCATATTTTCTCCTCCTACCATGGCAAATCGACCCAAGAGGACATGCACCATCACTTCAAGGAACCAACAAGAGGCTTTCACAAGCCGGGCTCGTGAGCCAACACCACCGCCGCTGCCACCACTGTTCGAATCCGATCCGGACTTTCCGGAAATCATTATCACTATGGAGTGGCAACGGGATCGACTCGCCCACCTCAAATTGAGGGAGGTAATTCCTACGCGCTTTATTTGTCAAAAATCCTTGCATGAAATGGGAATTGAAAGTGATGTCAAAAGGGTAATTTATGGTGTTGGCATGAAAGACATGTATGGCATGATGCGTTTAACTTTTAGGAGATTAACGCTTGAATTTCTGAGTTCTTTGTGGTTAGAAAAGAATGGTTATAGGGATGTCACTAGTGTACACTTTCGACTAATGAATCGTGATGTCCATTTAAGCATTCGAGATTTTAGTAGGATATTTGGTTTGTCGACTGAACATAGTAGGAAGGCTGGGAGTGCCCATGATAATTGTGAGATGTGGGGAAAATTGACCGGGAATAGTTCACCCCCTAGCATGCAACACTTGCATGCTTCCCGGATTCAACACCTCGTCCCCATTATGTTTTACAGGTTCCTGGGATTCACTATTTTCGGGAGGGAGGAGAACCAAAACATTAGGAGCACTGAGTTGGAAATCCTAGGTGGTTTTGTGCTGGAGGGGGAGGGGAGATACAGGATGAATTTGGCCCACCACATGGCTTCTCACCTCTATTCGGTGGCCACTAGTACACATAAGACCCGCATTACCATTGGTGGGTTAATCACCCACATTGCTATGGCCTCGGTGAACTTTGTTGAGGCCAACCAGACACCAGTGTTAGGTAGTAACTTGCTGGACTTGAGTTATTTTGCTGGCCTACGCCGCCTTCAAGGCGAGCATGGGTTATTCCGCCCGGGTGCCATGTACTGGATGTTTGATGGGGATAGGCTTTTTACCTTGCCTGACTCACAGGGCCGCACCCGCTTTAGACCCGGCCAGGCACACCACCTATTTGTGGGAGAGCCCATAGAGCATCACCAGGAACCCGAACCCCCAACCCGAGCCACAGCCAGAGCCTGATCAGTTTGAGCACGTTCCCCGTACCTACTTTCGGAGGGGGCGTCATGAGAGAGAGAGGGGAGGCTACACGGTGGCCCAGCTCCAGAGGGGGAGCAACGCTCTATTGAGGAGCATTTGGACAGGCTCGAGATCATATTTGATCACTTTGAGAGTGATCACCAGCGAGCTATGTTCCCCATCTGTGATCATTACGCCAGGCAGGGCTATGTGCCTCAGGATGCCCAGCACCCTTCCTGGTTTAGCTATCCCGCAGAGGGATATGGAGTTCCTGGTGCCATGGGCACTTTCACACCCACCCACTACTACGGTGGTTATGGAGAGGGCCTCAGCGGTCACGGTGGTCGTGGTGGTGATATGGATGATGATGATGGCCAGGGCCAATAGTGATGATGAGGTTGATGGTGATGGTTCGGTCCCCCTTAAGCCAATGAGGACATTATCTGATTTAGCTTGGGGGGTGTCTCATTTCCCTGTACATATTAGGTATGATTTCTTTTCTTTTCGTATTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTGGTGTGTTTATTTTGGTGTGTTTACTGCTTTATAAGTTAGTTTTACCGCTTTAAAAAAAAGAACAAAAATACATTCCGATGAATGCAAAATCATGCTTCCTTGTGCCCCTTTGATTGAAAATGGTTTTGATTCTTGGTATTTGATGACGAGCAATGTTGATATGTTAGCCATGATTTGATATTTGATTACTTTGATGCTAGACATGAGTCAACTCTGACCAACTATTTGTGGACTTGGTGCTTGGCTAGTTGACTTGGTTAGGAATGTGTGATAGCTTCATGGTGTGTCTTTGATTTTGAGTATTGGTTTGCAACTGTTAGTAATGTTTTATGACTCATATACATGGACATTGAGGAGGACGAAGGCATTTTTTCAATTTAGGTAGCGTTCAGATGAAATTAGATACATTTGTTCCCTTCTTTTCCACCCATGTTGTTGCTTGTGCCCTTTATTCGGTGACTAGCCACATTACAAGCCCGTGAGTGCCCCATTGGTTACTAGTCCCAAGCCTAGCTTGGGGGAGCTAATAGTAGTGAGGTGAGGGAGTTGTAGTGTGCTACATCTTGAGCACAAAGTGAGTGTTGAAAAAAATAAAAGGGAGTTCTTATCTTGTTTGTTGTTTGAAAAAAGAAAAAATTCTAATGAAGAGTGAAAAAGATGAGAAGAGTAGAAAATGTGAAGGTTTCCAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGAAATTGAGCAAAAAAACAAAGAAAATTTTCATTGTTGTCAGAAAAATTCAAAGCATTATGTCATTCAAGTATTACAATTCTTTATCATTATGAGTGATTGATTTTTATAGATGAAAAAGGCAAGGAAGTATGGTGTAGTTCATTTGATTGTTTATCATGTGTTGAGTGGGAGAGTTGTGGTCATCACTTGTGGTTGATCATGGGTTTTGCTAGGATTTATACTCCCCAAAGCCAAGGCTTTAAGCTAATATTTTACCCAAATTTACCACTCCCCTACCTAAGCTTAACATTACAAGCTTTGAAGACCTTCCGACCTTTGTGCATAGAGTCGTATTAATATGAAAATAGTTGTTTATCAATGCAAGTTATGACATGACACATTTCGACTCGACTACTAGGTTGAGTGCATGTTCTTTTAGACACATGAGTGTTGTGAGTTTGGGAGGGCATTTTTCACATATATGTTGGGAGGAGAGCGAACGGGTACATATTTTACCCGCCACATAAATGAGTGACGACTGTGTGAGAACTAGTCTTGAATTCCATTGTGCACTTGTGGTTCGCTTTGCGTGACGATTGTTAGGGAGGATTTGTGGTTGGATAGATTTGATTGGTTGACATTGATGCATGCTCGTTGAATTTTTCCTTGAATTATATCCACTGTTTTGAAATATGTTTTGGGGTGAAGTTGATTTTTGTATTCATCGATGATTTCTTTTCCAAGGGACAAGCAAAGATCTAGCTTGGGAGAGTTTGATATGTGTGTTTTATATAGAGTTTTTACCCCCGTCCCTTAGTACTTTTCTACATCAAATGAGCTCTTAGGATCCGTTTTTAGTACTAATATGTGTTGTAAGTGTGCCTTGAGTTTCAGGATTTGTTCGATGAGAAATTAGCCTTTTTAGGCTCGTTTCGCGATGATATAGGCCACTACACGGACCCCAAGTAGGTTCGGGATGATTACGGTCGACCCTTGGGAGCCTAGGATGCCTATGTTCGAGCCTCAAGAGTTGGACTTGGTGCTTTGAGTGAAGGACGATGTATTCTGCAAATCGCCCTTTGAGTGGAGGGCGGAATGAGAAAACCGGGTGAAGAAAAAGACTTCTGAAAGTTTCAACGCGCGCCAGATCGGGCGGGCCTCGCCCGATCCAGATCGGGCGGCCATCCTGGAAGGCATATGGAGTTTTTCTCATCCGCCCGATCGGGCGGAATTTCGCCCGATCGACCTGCTTGTCGAGCAGAATGCCCGATCGGGCGGTCGTCTGCCCGATCGGGCGATGCCAACCTCTGTGCCTTTTTCGCGAGTTTTATTTCCGGTTTTGAGTTGTATTTTGGGCAAACTATAAATACTAAGCCCTTTTATTTTTAGTGACATCTTATTCCTTAGTTTCAAACACTTAGTTTTATTCTCATACCTTAGTTTATTCTCTCAATTTGTTGCAACACTTAGTTTTTAATTTCAATAAAAAATTCAAGCTTTCATTATTCATTGTTCTTCATTTAGGTATTAATTCTTACTTTGCTTTATTGTTTTGTTTTTAATCATGTTTTCAATAGTATTAATTGTTTTGTTTATTGTTAATATGAGTGAGTAGTCAATTTTCTAGGGTTTTGGGGATCCATGAATCAATATGAAGGGATGATTGAATGTTGTTGATTGTTGGTATTGTGGTTAATTCCTATTGATTGATTTCATTTACTTTGCAATTAGACTTGCGCAGTTTAGTTGTATTAGTCAAGCAATATCAAGCTAAGATTCGAGAGATGCAATTTGATGTTTAGGCTTGTTTCAATAGCTAGAATTGGAATTAATACGTCCTGAGAGCCCGTTAATTCTAAGTCTATGATTAGTATCGATTCGAGAGAGCATGGTAGTCTAATTAACTGCTTTATTGACTATTATTGATTGTTTATCATCCTGGATTGTTGTTCATCAGTGAACCTATGCCAATAGACCTTTTTATATCTGAATCATCCCTATTTTATTATTGTCGTAGTTTTATTATTAAAACCAACCAATTCCTGGATCGCAATAGTCTAGACTTTAGTTTTAGTAATAGAAAGAACGACTGTTTCCCTGTGGATACGATCCCTACTTCCTTGTTATCTTGTTAGTGGACTTAGGTTATCTTTGATAGGAGTGCGATTTAGCCTGTCAGCTATCAAGGATCCTAAATTTCAGGTTTGTTCCTCTTTCTCTCTCCTAAATCTTATTCCATTTTCAGATCGTCTTTCCCCCAATTCGTTATTTTTGTTTTGAATAAAATTGAAATAAATTCATAAAAAATATCCAGAATTTCCAATTAATTGCTGTTTTCGTTTTTTATATATTTGTTAATTTATTCAGTATGTTATTTTGTTTGTTTGGTTGATTAGTTAATTTATTTAGTATGTTGATTTAGTTTTCTTTGTTTGATCTGTGAATTGATTTACTGTTCTTCATATGATTCGTTAATTTGAAGTATATTTGGACGGTTTTGTTGATTGTGAGACTGATTCGGGTCATTTCAGGGTTTTTTTTGTATTTAGGTCGGTTTTGTTAAACTTCTGAATTGATTTATTGTTCTTAGTTTTATTTGTTAATTTGAAGTAATTTTGGAAGGTTTTGTTGATTGTTTGACTGATTCGGGTCATTTTGGGGTTTGATTTGTTGTTTTTTAATTGTATTTAGGTCGATTTTGTTAAACTTGTGGCCAAATTGGTCGATTCTTTTGACAAGGGTGGATTCTGGTGGTGTGATAGGTTGCGTGTTGGGTTGCCGAACCCACTACCCAACATTGGAGATGCACTTCAAGACTGGAAGGATAGAGTTAAAGTGTCTGCTGATATTCCACAAAGGGATATGGAGGATCAAGAAGAAGGTGAATTTGGGTTGACATCTGAACTTGATCAGGGAACAGCTCAGGCGTTAGGATCTGCAATGCCTTATCAGACGGAGCATAATATTGTCCATGACAAGCCTGATGGGGATGGAGCATAA

mRNA sequence

ATGACTGAAAATGCCTCATCTGGAGGATCATATATAACTCTTGAGGATAGAGTTCTGTCTCGAATTTCTTATGTCACTCTTGCTTTCAAAAAAGGAGAAGGCTTTGTCTCAGCACTGGAGAAGAGCGTGACGGTTCCGAGGCGTGATTTCGGTATTCTAGCACTTCTCTCGTTGGTCGAGGTCGATTTTGTTAAACTTGTGGCCAAATTGGTCGATTCTTTTGACAAGGGTGGATTCTGGTGGTGTGATAGGTTGCGTGTTGGGTTGCCGAACCCACTACCCAACATTGGAGATGCACTTCAAGACTGGAAGGATAGAGTTAAAGTGTCTGCTGATATTCCACAAAGGGATATGGAGGATCAAGAAGAAGGTGAATTTGGGTTGACATCTGAACTTGATCAGGGAACAGCTCAGGCGTTAGGATCTGCAATGCCTTATCAGACGGAGCATAATATTGTCCATGACAAGCCTGATGGGGATGGAGCATAA

Coding sequence (CDS)

ATGACTGAAAATGCCTCATCTGGAGGATCATATATAACTCTTGAGGATAGAGTTCTGTCTCGAATTTCTTATGTCACTCTTGCTTTCAAAAAAGGAGAAGGCTTTGTCTCAGCACTGGAGAAGAGCGTGACGGTTCCGAGGCGTGATTTCGGTATTCTAGCACTTCTCTCGTTGGTCGAGGTCGATTTTGTTAAACTTGTGGCCAAATTGGTCGATTCTTTTGACAAGGGTGGATTCTGGTGGTGTGATAGGTTGCGTGTTGGGTTGCCGAACCCACTACCCAACATTGGAGATGCACTTCAAGACTGGAAGGATAGAGTTAAAGTGTCTGCTGATATTCCACAAAGGGATATGGAGGATCAAGAAGAAGGTGAATTTGGGTTGACATCTGAACTTGATCAGGGAACAGCTCAGGCGTTAGGATCTGCAATGCCTTATCAGACGGAGCATAATATTGTCCATGACAAGCCTGATGGGGATGGAGCATAA

Protein sequence

MTENASSGGSYITLEDRVLSRISYVTLAFKKGEGFVSALEKSVTVPRRDFGILALLSLVEVDFVKLVAKLVDSFDKGGFWWCDRLRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRDMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDGA

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
Spo17822	Spo17822	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo17822.1	Spo17822.1-protein	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo17822.1.exon.1	Spo17822.1.exon.1	exon
Spo17822.1.exon.2	Spo17822.1.exon.2	exon
Spo17822.1.exon.3	Spo17822.1.exon.3	exon
Spo17822.1.exon.4	Spo17822.1.exon.4	exon
Spo17822.1.exon.5	Spo17822.1.exon.5	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo17822.1.CDS.1	Spo17822.1.CDS.1	CDS
Spo17822.1.CDS.2	Spo17822.1.CDS.2	CDS
Spo17822.1.CDS.3	Spo17822.1.CDS.3	CDS
Spo17822.1.CDS.4	Spo17822.1.CDS.4	CDS
Spo17822.1.CDS.5	Spo17822.1.CDS.5	CDS

Homology

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902185707|gb|KNA10543.1| (hypothetical protein SOVF_143350 isoform A [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 7.900e-29
Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1

		  
Query: 85   LRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQR------DMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQ 144
            L+   PNPL NIGDALQDWK+RVKVSADIPQR      DMEDQEEGEFG TSE DQGTAQ
Sbjct: 4931 LQKNQPNPLRNIGDALQDWKERVKVSADIPQRDDETVDDMEDQEEGEFGFTSEFDQGTAQ 4990

Query: 145  ALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            ALGSAMP QTEHNIVHDKPDGDG
Sbjct: 4991 ALGSAMPDQTEHNIVHDKPDGDG 5013

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902185708|gb|KNA10544.1| (hypothetical protein SOVF_143350 isoform B [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 7.900e-29
Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1

		  
Query: 85   LRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQR------DMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQ 144
            L+   PNPL NIGDALQDWK+RVKVSADIPQR      DMEDQEEGEFG TSE DQGTAQ
Sbjct: 4931 LQKNQPNPLRNIGDALQDWKERVKVSADIPQRDDETVDDMEDQEEGEFGFTSEFDQGTAQ 4990

Query: 145  ALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            ALGSAMP QTEHNIVHDKPDGDG
Sbjct: 4991 ALGSAMPDQTEHNIVHDKPDGDG 5013

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731348138|ref|XP_010685342.1| (PREDICTED: midasin isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris])

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 8.700e-20
Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1

		  
Query: 91   NPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRD------MEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAM 150
            NPL NIGDALQ+WK+RVKVSADIPQRD      MED+E  EFG TSE DQG  QALGSAM
Sbjct: 4968 NPLRNIGDALQEWKERVKVSADIPQRDEETVDNMEDEEADEFGFTSEFDQG-PQALGSAM 5027

Query: 151  PYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            P Q EHNI  D PDGDG
Sbjct: 5028 PDQVEHNIGRDMPDGDG 5043

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731348140|ref|XP_010685343.1| (PREDICTED: midasin isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris])

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 8.700e-20
Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1

		  
Query: 91   NPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRD------MEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAM 150
            NPL NIGDALQ+WK+RVKVSADIPQRD      MED+E  EFG TSE DQG  QALGSAM
Sbjct: 4967 NPLRNIGDALQEWKERVKVSADIPQRDEETVDNMEDEEADEFGFTSEFDQG-PQALGSAM 5026

Query: 151  PYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            P Q EHNI  D PDGDG
Sbjct: 5027 PDQVEHNIGRDMPDGDG 5042

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009111803|ref|XP_015902684.1| (PREDICTED: midasin-like [Ziziphus jujuba])

HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 1.300e-10
Identity = 38/84 (45.24%), Postives = 52/84 (61.90%), Query Frame = 1

		  
Query: 85   LRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRDME-------DQEEGEFGLTSELDQGTA 144
            +R   PNP  ++GDAL++WK+RV VS DI   DM+       D+   EFG  SE ++GTA
Sbjct: 4942 VRKSQPNPYRSVGDALKEWKERVNVSVDIQADDMDTQQVEIDDENANEFGYVSEFEKGTA 5001

Query: 145  QALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            QALG AM  Q + N+  +KP+  G
Sbjct: 5002 QALGPAMSEQVDKNVSDNKPNEAG 5025

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QTF5_SPIOL (Midasin OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_143350 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 5.500e-29
Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1

		  
Query: 85   LRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQR------DMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQ 144
            L+   PNPL NIGDALQDWK+RVKVSADIPQR      DMEDQEEGEFG TSE DQGTAQ
Sbjct: 4931 LQKNQPNPLRNIGDALQDWKERVKVSADIPQRDDETVDDMEDQEEGEFGFTSEFDQGTAQ 4990

Query: 145  ALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            ALGSAMP QTEHNIVHDKPDGDG
Sbjct: 4991 ALGSAMPDQTEHNIVHDKPDGDG 5013

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QV03_SPIOL (Midasin OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_143350 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 5.500e-29
Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1

		  
Query: 85   LRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQR------DMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQ 144
            L+   PNPL NIGDALQDWK+RVKVSADIPQR      DMEDQEEGEFG TSE DQGTAQ
Sbjct: 4931 LQKNQPNPLRNIGDALQDWKERVKVSADIPQRDDETVDDMEDQEEGEFGFTSEFDQGTAQ 4990

Query: 145  ALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            ALGSAMP QTEHNIVHDKPDGDG
Sbjct: 4991 ALGSAMPDQTEHNIVHDKPDGDG 5013

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BXX6_BETVU (Midasin OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g170240 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 6.100e-20
Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1

		  
Query: 91   NPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRD------MEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAM 150
            NPL NIGDALQ+WK+RVKVSADIPQRD      MED+E  EFG TSE DQG  QALGSAM
Sbjct: 4968 NPLRNIGDALQEWKERVKVSADIPQRDEETVDNMEDEEADEFGFTSEFDQG-PQALGSAM 5027

Query: 151  PYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            P Q EHNI  D PDGDG
Sbjct: 5028 PDQVEHNIGRDMPDGDG 5043

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BTH2_BETVU (Midasin OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g170240 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 6.100e-20
Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1

		  
Query: 91   NPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRD------MEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAM 150
            NPL NIGDALQ+WK+RVKVSADIPQRD      MED+E  EFG TSE DQG  QALGSAM
Sbjct: 4967 NPLRNIGDALQEWKERVKVSADIPQRDEETVDNMEDEEADEFGFTSEFDQG-PQALGSAM 5026

Query: 151  PYQTEHNIVHDKPDGDG 162
            P Q EHNI  D PDGDG
Sbjct: 5027 PDQVEHNIGRDMPDGDG 5042

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: R0I690_9BRAS (Midasin OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10019643mg PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 9.700e-10
Identity = 32/73 (43.84%), Postives = 50/73 (68.49%), Query Frame = 1

		  
Query: 91   NPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQR-----DMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAMP 150
            NP  N+GDAL++WK+RV++S+D+ ++     +MED E  E+G  S+ D GT+QALG A+P
Sbjct: 4863 NPYRNVGDALKEWKERVRISSDLGEKQEAENEMEDPEASEYGYASQFDAGTSQALGPALP 4922

Query: 151  YQTEHNIVHDKPD 159
             Q   N+   +P+
Sbjct: 4923 EQVNANMREGEPE 4935

[Close]

BLAST of Spo17822.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G67120.1 (ATPases;nucleotide binding;ATP binding;nucleoside-triphosphatases;transcription factor binding)

HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.600e-11
Identity = 29/62 (46.77%), Postives = 45/62 (72.58%), Query Frame = 1

		  
Query: 91   NPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQR-----DMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAMP 148
            NP  N+GDAL++WK+RV++S+D+ ++     +MED +  E+G  S+ D GT+QALG A+P
Sbjct: 4922 NPYRNVGDALKEWKERVRISSDLGEKQEAENEMEDPDASEYGFASQFDAGTSQALGPALP 4981

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
BLAST of Spo17822.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
BLAST of Spo17822.1 vs. TAIR (Arabidopsis)

BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 5

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|902185707\|gb\|KNA10543.1\|	7.9e-29	81.9	hypothetical protein SOVF_1433...	[more]
gi\|902185708\|gb\|KNA10544.1\|	7.9e-29	81.9	hypothetical protein SOVF_1433...	[more]
gi\|731348138\|ref\|XP_010685342.1\|	8.7e-20	72.7	PREDICTED: midasin isoform X1 ...	[more]
gi\|731348140\|ref\|XP_010685343.1\|	8.7e-20	72.7	PREDICTED: midasin isoform X2 ...	[more]
gi\|1009111803\|ref\|XP_015902684.1\|	1.3e-10	45.2	PREDICTED: midasin-like [Zizip...	[more]

BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 5

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0K9QTF5_SPIOL	5.5e-29	81.9	Midasin OS=Spinacia oleracea G...	[more]
A0A0K9QV03_SPIOL	5.5e-29	81.9	Midasin OS=Spinacia oleracea G...	[more]
A0A0J8BXX6_BETVU	6.1e-20	72.7	Midasin OS=Beta vulgaris subsp...	[more]
A0A0J8BTH2_BETVU	6.1e-20	72.7	Midasin OS=Beta vulgaris subsp...	[more]
R0I690_9BRAS	9.7e-10	43.8	Midasin OS=Capsella rubella GN...	[more]

BLAST of Spo17822.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo17822.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 1

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G67120.1	1.6e-11	46.7	ATPases;nucleotide binding;ATP...	[more]