Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGATCCTTACTATTAAGGTAATTGAAATTACAATTACAATTTATTAATTATCAATAACTACAATCGGCGTGCTTAAAAAAAAAACTATCCAAGTAAAATCCATTTTTAAATATTCCTCAATTGCACAGTAGCAGTCTACTATAATTTGTTGCAGCAATCGCCCTCCTTAAATTAAAGTTTGTGCTTCACTTTTTCTTGTGTGCAACCGATATATGTAATATATACTCCACCATCGACTTTAAAGAATACTACGGTATGAATAAACTTTGTAAGCATGTTCAGCTGAATTGCTTGACCGTGTTAAGCTCAGACTAAGATTATTATCCAAGCTTTTAACAAACTTAGTGCCATAATATCTGCTAAATTTCTAATGATTTTACCAAAAAAGTTTGACATCATTAGTTTCATCCGTGTGAAGGTATCTTCGTATCCAACATGTAGTTTTTGGTGGTTGTAAAATGGGCGATTAGGATGAGGGGATGACTAATTTTGAGTAATATTCTACCTTGTTCTATATGTGCTTGGTGAGCGGTTCAATTGAAAAAGGAATATGGATATATATACAAAAAGTTAGAAGAGAAGTAGGATAATTTTTTGTTGAAATCTATCTTTATCATATTATCTACAATTTAAATCATGCAAGACTCTAATATTATTTATTTATTTTTAATATTAGTTAATTCCGTGTGATGACGTGGAAATCCTATGTGGACGCTCTAAATGTTCTCCAAAAAACTCCCCTTTATATATATATTAGATTAGATTGAGGCCCTCATATATCATTTTTATCTATTTTTCCATTTTTCAGGTGGTAAAAAACAAGTTTTAAATTTTTTTAGGTGGTAAAATATAAGGTTTAATTTTTTTTAAATGATAAAAAATAATTTTTCGATTTTTTTAGGTGATAAAAAAGCAATTTGTCCTTTTATTTTATTTTAATTAATTGAGGCATTAGTTATTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTGAGGCATTAGTTTTCTTTTTTCTTTTTCCTTTTTCCTTTTGAGGCATTATTGGATTTTTTTAGCCCAATAATGATTTATGAACGTATATTTAGCCAACAGCCGCACAACTAACTTTTTCTCTTTCCTCTCTCGTTTCTTCGGTAGGGTTCTTCTTCATCTTGTCAGGTAATGATCCCAACCTCTGTCTCTATCTTTCCTCTCTTTCCCAGATGACGTTGTATCGACCATCTCCTTGAACTCGAGTTATCGATTTTCTTCCATCTGTTTCAAGTTGAAATTCATTGATTTTTTATTTTTTCTATACTATTTTGGCTTTATTTTGTCGAATTATGTTTTATATTGTCGAATTTATGTTTTATATTGTCGAATTTGTGTTTGGATTGTCGAATTTGTGCTATAATTTAGGGTTTAATTTTTTTTCTATTCAATTAATTTGCTATTAGATTGTCGAATTTGTATAAGATATCCAGTGCAATATCTGAATTCCTCAATTAATAGTATCATGTTTTTAGTTTGGATTTTAGTCCTTCTGGTGGTTTAATGGATGCAGGATTGCATCCGGAAATGTTTTGCTGTATAAGTTGCATCATTATTAGCAAGCATAGGATAATAGGATTGTCTGGATGTATTGTGTATTAGCAAGTTTTAACAGGATGTTTGTTGGTTTGTTGTTTTCCTCTGCTAGAATGCAGTGTTTTTGAGTTTTATAATAGTAGCAGCAGCAATAGTATTTTATGATCAGCAACTTTTTTTATAGCCATCAGCAGTAATTTTTTGAGTTAATTTGTACTAGTTTCAATTTGTTATGATTTCTTCTTTTCTATTGTACATGTATGATGTAGAATAGACTACAAAATTTATTCTCTTACCAAACATCAAGTAAGGGAAACGTATATAAGCGATTCTTTTCCTAGGATATACCAAACAACCAATAATGGTATTACTTAATCTTACCCTTTCCCCTTCTTATTTGTTTCCATTTCACTCTCTTTCCAACATTCATACCAAACACCCCTAAGATATTTACTGAAAGATTGAACAGTTTTACAACTTTTTTTTTATCGATAAAGGCTATTAAAATGGAGTTTTTCTTGTTTCATTGTTGTTTTTCCTGCTTGGCTCTAATTTTCTATCGTTTTAATTTTGTTGTATGACATAAAGGTTTCTAAATCCGCTTTGTTTGCTTAGATTAACAACCCTACCCGTTTCTCATAATATATTCAGATATGGAAAATAACGAAGTATAAAGGTTTAATCTTGTTGAAGTGTGATAGTACTTTTCTATGCTTTAAATCTGCTCTCTTTTGATTAAATTCACAACCATAATTTTATTCTTTAGCCTAATATATTCAGATATGAACAATAAAAAAATTAATTTGAAGGGCTTCTCGAGATGTCAAAGTTGTGGCGACAACGAGGTTAACTATGGTGTATTATCCACTCCCTTACTCGAGGTATTCTCAATTAGTGTACATCCCATTCCCGACCTCACAGGCAACTTGTTTAATTGTGAAATCTATGGCTCGGTTAAGGTCACTAATGGATTAGGTCATGTACTTGTTCTTTACAACCGAGATCGTGACAATCCAGAGTTTATCAAGCCCAATGAAACAAGTTACAATCGTTATTTGTCGTTAACTGGACTTAAGGATGGCCGTGTTGTTATACCCTATGATTATGTCATTGTGGATATGTGCTTGAGGGACAGGTCTCGAGATGACATTGTAATTGCCAAAGGGGAGTTGAATTTCAATTACAAAGAATCCTTTTACACAGAACATGGTGCCAAACGTGTTGTAGGTGACGCTGGATTTGCGACTTTGCATTATGCCACTTTCCCTTATGCGGTGGTAGCTACTGTGGATGTGGTATTTTTCAGCAAACATGATGATTATGACACAATAGACTATGATCCGGATGAATATTCTCAAGATTTTGCTGATTATGATAGTAGTGGATATGTAAATGATGACGCCGATGCTGATGTTTATGGGACTGTTGCTGCACATACCAATTTCCCTGGAAGTAGCTCCTACGAAGATAATACTACTATTTCAAGCATACTTTTCAATATGCCACATAATCAATGTGTACGGGTCAAATCTAGGACTTTTATCGAGTTGTCGAGATCTATGGTGGCTGTGCCCTTTTATTCGAATTCTCCCCTTCAAATCCATGTAGATTTCAAGTATAATGATGGAAGCAGGCTAGCTGAGGGTGTCTTAGAATTTCAATATATATATTGTGGCCTGATTAAGAAGGATGTTGTGGGAGAAAATGGGCGTATCCGAGTGCGAGTGAAATGGGTTGATGCATATGAGCAACGTTACAGGGGAAGTGATCTAAAACGGAGTGCAACCTTTGAGAAAGAAGAGAGCGAGATGGAGGGGCTGGTTAAAAGGCAGCGGGTATTTGTTTTTGTTTATTTCTTAATGGGATATTTCGTTTCTTGTTCTCACCTCACTATTAATCTTTGTTTTCTCCTTGTAGAGTCTTGTTGATCCACAACCCTCTTCGGCCTTTAGTGATTGGTAGGTGGCTCTCTCTTTTGTTGGATTCTTTGGTTGCTTTTTATTTTTATGATTTATGTCATATTTGTCTATTGGGTGTTTCAGTTAGGGTATGCCTATGACTAGGACTGTGCACCGGTCCAAATCCGGCCCGTTCCGGATCCGAAATCTAGTTTTTTTCATGTCAGGTCCTGAATTATTCCGGACAAGTTTGGTCCTGTAAATTCCGGACCGGTTCTAGACCCGAGTAAAAGAAGACTAGTTTGTTGCAACTGGGAGTTTTGGTTGGCACAGAATGACTAGGATCTCAAGAAGCCTTTCATTCTACCGAACATGATCTCTGATTAGTATGCTTCCTGTAAATTCTGATTTGATTTTAAACTACTTTTGGCATATGCCAGGATTCACACAGTTTATGTGTTGCACTGTTTTTTATTTTATTTTTTGGGTGGCGGAGTGCTATTATTATGCCAAAAGTACATGTTATGCAGTTAGTTTTTGCTTCAGAACAGTCGTTAATTCACCACTTATTATTTTAGTTTTTCTCAATTCCAAGCATGCTCTATATATCTTTAGGGGCTTGTGTTTGTTTGTTTAGTTTTTTATGCAGTATAAAAGTTGGACTAATGTATGAGGGAATGTCTTTTTTCATTACCAGGTCGAAAGAAGAACAAGAGGACAATGGCTGGTCCGTAGATCCATTGCCGCTAGTGGAGGTGTTTTCAATTAGCATTGGTAGCAGTGACTTGAAACCTCCCTTTAAGCTGTATGGCAATATTAGAGTGGAATGTTGTCCTATATTCAATAGAGATGAGAGTTCCGCTCAGATATGTTTTGACAAGATAGAGTTCAAGTATCGCTATCGTTTTGGTTTTGATGCCTTAGAGGATTTTGGGATTTATTTTTAGCTCAAGGATGTTGAGGGTAATCTATCTATCGAAGGACAATTTTCGTGGGTAACCCGTTTGCTTGACTCGTGGTATGACAAGCGCATATGTTCTGTTGTACGAGGGGATCATGGATATGTAGCTGTGCATTACACAATTATTTATGATGGAATACAGGCAAAAGTAAAGGTGTTGGTCAAAAGGTTTGATAACACTTTGGACTTACCCACCAAGTTTTATGGAAGTCTTGTTGCTCGGTATAGCAACCATGAGTACTCAAAACTCCTATGACAAGAAATACTATCAGAGTACACTTTTTGAGAGAAGTTTAGATGATCCTGTTAACCTTAAAAAGGATAGTTCATTGCCACTGTCAAAATCTCTGGTTTGTGTTCCAAGAATGTCTTCCCTAATAATCCAAGTAGACTTAACAGCTGATGACAACTTACTTCCACAGCCAGGTTTTGGTGTTGAGGTTTTGCAGGGCAGCGTGGAGTTTAATACGGATGGTTCTAAGGAGATTTGGGGACAAAACTACTGGATCGAGATATCGGTTAAGTGGCAAACGGGGTTGTGGTAGTTTGTTTAGTGGTAACCGTTGACTTCTTTGGACCTGTATGCCTATGGAGTTAGACTTTAATTTTATGTTTGTATTTTCTAGTTGATTATCATTTGTATTTAAGTGGATAGTTTCAGACATTCCAAAATACTGATTCAGAGTGATGTTTTCGGAATTGAATTCTGTATTTGGTTGTATCCTTGCTGACAGTCTTTTCAAATTCAAATTCAAATTCAAA ATGGGATCCTTACTATTAAGTGTTTTTGAGTTTTATAATAGTAGCAGCAGCAATAATATGAACAATAAAAAAATTAATTTGAAGGGCTTCTCGAGATGTCAAAGTTGTGGCGACAACGAGGTTAACTATGGTGTATTATCCACTCCCTTACTCGAGGTATTCTCAATTAGTGTACATCCCATTCCCGACCTCACAGGCAACTTGTTTAATTGTGAAATCTATGGCTCGGTTAAGGTCACTAATGGATTAGGTCATGTACTTGTTCTTTACAACCGAGATCGTGACAATCCAGAGTTTATCAAGCCCAATGAAACAAGTTACAATCGTTATTTGTCGTTAACTGGACTTAAGGATGGCCGTGTTGTTATACCCTATGATTATGTCATTGTGGATATGTGCTTGAGGGACAGGTCTCGAGATGACATTGTAATTGCCAAAGGGGAGTTGAATTTCAATTACAAAGAATCCTTTTACACAGAACATGGTGCCAAACGTGTTGTAGGTGACGCTGGATTTGCGACTTTGCATTATGCCACTTTCCCTTATGCGGTGGTAGCTACTGTGGATGTGGTATTTTTCAGCAAACATGATGATTATGACACAATAGACTATGATCCGGATGAATATTCTCAAGATTTTGCTGATTATGATAGTAGTGGATATGTAAATGATGACGCCGATGCTGATGTTTATGGGACTGTTGCTGCACATACCAATTTCCCTGGAAGTAGCTCCTACGAAGATAATACTACTATTTCAAGCATACTTTTCAATATGCCACATAATCAATGTGTACGGGTCAAATCTAGGACTTTTATCGAGTTGTCGAGATCTATGGTGGCTGTGCCCTTTTATTCGAATTCTCCCCTTCAAATCCATGTAGATTTCAAGTATAATGATGGAAGCAGGCTAGCTGAGGGTGTCTTAGAATTTCAATATATATATTGTGGCCTGATTAAGAAGGATGTTGTGGGAGAAAATGGGCGTATCCGAGTGCGAGTGAAATGGGTTGATGCATATGAGCAACGTTACAGGGGAAGTGATCTAAAACGGAGTGCAACCTTTGAGAAAGAAGAGAGCGAGATGGAGGGGCTGGTTAAAAGGCAGCGGAGTCTTGTTGATCCACAACCCTCTTCGGCCTTTAGTGATTGTATAAAAGTTGGACTAATGTCGAAAGAAGAACAAGAGGACAATGGCTGGTCCGTAGATCCATTGCCGCTAGTGGAGGTGTTTTCAATTAGCATTGGTAGCAGTGACTTGAAACCTCCCTTTAAGCTGTATGGCAATATTAGAGTGGAATGTTGTCCTATATTCAATAGAGATGAGAGTTCCGCTCAGATATGTTTTGACAAGATAGAGTTCAAGTATCGCTATCGTTTTGGTTTTGATGCCTTAGAGGATTTTGGGATTTATTTTTAGCTCAAGGATGTTGAGGGTAATCTATCTATCGAAGGACAATTTTCGTGGGTAACCCGTTTGCTTGACTCGTGGTATGACAAGCGCATATGTTCTGTTGTACGAGGGGATCATGGATATGTAGCTGTGCATTACACAATTATTTATGATGGAATACAGGCAAAAGTAAAGGTGTTGGTCAAAAGGTTTGATAACACTTTGGACTTACCCACCAAGTTTTATGGAAGTCTTGTTGCTCGGTATAGCAACCATGAGTACTCAAAACTCCTATGACAAGAAATACTATCAGAGTACACTTTTTGAGAGAAGTTTAGATGATCCTGTTAACCTTAAAAAGGATAGTTCATTGCCACTGTCAAAATCTCTGGTTTGTGTTCCAAGAATGTCTTCCCTAATAATCCAAGTAGACTTAACAGCTGATGACAACTTACTTCCACAGCCAGGTTTTGGTGTTGAGGTTTTGCAGGGCAGCGTGGAGTTTAATACGGATGGTTCTAAGGAGATTTGGGGACAAAACTACTGGATCGAGATATCGGTTAAGTGGCAAACGGGGTTGTGGTAGTTTGTTTAGTGGTAACCGTTGACTTCTTTGGACCTGTATGCCTATGGAGTTAGACTTTAATTTTATGTTTGTATTTTCTAGTTGATTATCATTTGTATTTAAGTGGATAGTTTCAGACATTCCAAAATACTGATTCAGAGTGATGTTTTCGGAATTGAATTCTGTATTTGGTTGTATCCTTGCTGACAGTCTTTTCAAATTCAAATTCAAATTCAAA ATGGGATCCTTACTATTAAGTGTTTTTGAGTTTTATAATAGTAGCAGCAGCAATAATATGAACAATAAAAAAATTAATTTGAAGGGCTTCTCGAGATGTCAAAGTTGTGGCGACAACGAGGTTAACTATGGTGTATTATCCACTCCCTTACTCGAGGTATTCTCAATTAGTGTACATCCCATTCCCGACCTCACAGGCAACTTGTTTAATTGTGAAATCTATGGCTCGGTTAAGGTCACTAATGGATTAGGTCATGTACTTGTTCTTTACAACCGAGATCGTGACAATCCAGAGTTTATCAAGCCCAATGAAACAAGTTACAATCGTTATTTGTCGTTAACTGGACTTAAGGATGGCCGTGTTGTTATACCCTATGATTATGTCATTGTGGATATGTGCTTGAGGGACAGGTCTCGAGATGACATTGTAATTGCCAAAGGGGAGTTGAATTTCAATTACAAAGAATCCTTTTACACAGAACATGGTGCCAAACGTGTTGTAGGTGACGCTGGATTTGCGACTTTGCATTATGCCACTTTCCCTTATGCGGTGGTAGCTACTGTGGATGTGGTATTTTTCAGCAAACATGATGATTATGACACAATAGACTATGATCCGGATGAATATTCTCAAGATTTTGCTGATTATGATAGTAGTGGATATGTAAATGATGACGCCGATGCTGATGTTTATGGGACTGTTGCTGCACATACCAATTTCCCTGGAAGTAGCTCCTACGAAGATAATACTACTATTTCAAGCATACTTTTCAATATGCCACATAATCAATGTGTACGGGTCAAATCTAGGACTTTTATCGAGTTGTCGAGATCTATGGTGGCTGTGCCCTTTTATTCGAATTCTCCCCTTCAAATCCATGTAGATTTCAAGTATAATGATGGAAGCAGGCTAGCTGAGGGTGTCTTAGAATTTCAATATATATATTGTGGCCTGATTAAGAAGGATGTTGTGGGAGAAAATGGGCGTATCCGAGTGCGAGTGAAATGGGTTGATGCATATGAGCAACGTTACAGGGGAAGTGATCTAAAACGGAGTGCAACCTTTGAGAAAGAAGAGAGCGAGATGGAGGGGCTGGTTAAAAGGCAGCGGAGTCTTGTTGATCCACAACCCTCTTCGGCCTTTAGTGATTGTATAAAAGTTGGACTAATGTCGAAAGAAGAACAAGAGGACAATGGCTGGTCCGTAGATCCATTGCCGCTAGTGGAGGTGTTTTCAATTAGCATTGGTAGCAGTGACTTGAAACCTCCCTTTAAGCTGTATGGCAATATTAGAGTGGAATGTTGTCCTATATTCAATAGAGATGAGAGTTCCGCTCAGATATGTTTTGACAAGATAGAGTTCAAGTATCGCTATCGTTTTGGTTTTGATGCCTTAGAGGATTTTGGGATTTATTTTTAG MGSLLLSVFEFYNSSSSNNMNNKKINLKGFSRCQSCGDNEVNYGVLSTPLLEVFSISVHPIPDLTGNLFNCEIYGSVKVTNGLGHVLVLYNRDRDNPEFIKPNETSYNRYLSLTGLKDGRVVIPYDYVIVDMCLRDRSRDDIVIAKGELNFNYKESFYTEHGAKRVVGDAGFATLHYATFPYAVVATVDVVFFSKHDDYDTIDYDPDEYSQDFADYDSSGYVNDDADADVYGTVAAHTNFPGSSSYEDNTTISSILFNMPHNQCVRVKSRTFIELSRSMVAVPFYSNSPLQIHVDFKYNDGSRLAEGVLEFQYIYCGLIKKDVVGENGRIRVRVKWVDAYEQRYRGSDLKRSATFEKEESEMEGLVKRQRSLVDPQPSSAFSDCIKVGLMSKEEQEDNGWSVDPLPLVEVFSISIGSSDLKPPFKLYGNIRVECCPIFNRDESSAQICFDKIEFKYRYRFGFDALEDFGIYF Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo20369.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902221395|gb|KNA18913.1| (hypothetical protein SOVF_066400 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 817.4 bits (2110), Expect = 1.300e-233 Identity = 406/414 (98.07%), Postives = 406/414 (98.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902111500|gb|KNA03759.1| (hypothetical protein SOVF_206030, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 617.1 bits (1590), Expect = 2.600e-173 Identity = 312/364 (85.71%), Postives = 323/364 (88.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902111501|gb|KNA03760.1| (hypothetical protein SOVF_206040 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 3.900e-36 Identity = 74/82 (90.24%), Postives = 78/82 (95.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902227547|gb|KNA20738.1| (hypothetical protein SOVF_049520 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 104.4 bits (259), Expect = 5.700e-19 Identity = 125/424 (29.48%), Postives = 192/424 (45.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1021032280|gb|KZM90064.1| (hypothetical protein DCAR_022571 [Daucus carota subsp. sativus]) HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 2.400e-17 Identity = 88/299 (29.43%), Postives = 138/299 (46.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RHD9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_066400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 817.4 bits (2110), Expect = 9.100e-234 Identity = 406/414 (98.07%), Postives = 406/414 (98.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9Q937_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_206030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 617.1 bits (1590), Expect = 1.800e-173 Identity = 312/364 (85.71%), Postives = 323/364 (88.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9Q909_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_206040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 2.700e-36 Identity = 74/82 (90.24%), Postives = 78/82 (95.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RMM7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_049520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 104.4 bits (259), Expect = 3.900e-19 Identity = 125/424 (29.48%), Postives = 192/424 (45.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo20369.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A164VAW2_DAUCA (Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_022571 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 1.700e-17 Identity = 88/299 (29.43%), Postives = 138/299 (46.15%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo20369.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo20369.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo20369.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo20369.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
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