Spo21936.1 (mRNA)

Overview
NameSpo21936.1
TypemRNA
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_00709 : 32505 .. 39891 (-)
Sequence length1264
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCATCTATTGTGCAGGGAAGTCAAACTGAGCGAGTATACAGAGGATTGTTTGAAGAATTAGTCATAGTCAAATACGGTGATATGTTGAAGAGGTTACTAGACAGCTTAATAGTTTTGTAAAAGTGAGTAGTACTCTTCAAGTCTTCAGTTTCAATATCTTCTGATGTATCTGTTTGCGGAAAGATTACATATTAGTTTTTCTTCTTGCTTTCATCATATTATTCGTGTATTCTTTACATCTGGAATTTTTCTTGATTCTAGCAATCTCATTGCTCTGATAACTTGGCTATCATTTCTAGCTTTAAAGGTTGTTCTTGTTGATGTTTTCGACTTAATGAAACTCTCTCTTTGGATATCCATATGTTCCTTGTTTGCATGCTATCTTCTTGATTCCTCTTTCAACCTTTATTGTGATATTCTGTATGCAAACCTAGATAAGAGTGTTCTGTACACCTCTGGTTTCTTCCTTTAAGATTGTTGTTAGTCAGAAGATTTGTGAAAATGTGCTTCATCCATTAAATAATCAATTGCTTAGTAGAGGCCTTCCTAGATAACATTGGACCTGATTAAGCTGTACTTTTGGTGGCAGCATCTGTTTGGAGGTCTATGGTATTGTTGAAAGCATTAATACTACACCCTTTAAAAAGCAAGGAATGGTGTTTTACTATTCATCAAATAGTGAAGTGACGGATCCACCCTCACATTCCTTCACGTTTTCATTTTGTCGTTATTCTTACAGACAGTGTAATCACCTCTTTGCCCTCATTCCCAGATTTCCCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCTCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCCCCTACTGATCCGCTGCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTTCCTCCCCTTCCGTTTGCGAACGCTACCTCTCATCTCTCCTCCGCCCCCTTAACTTTTCTCTCTCCTTTTCAATAACCTCGGATCATCAGCAAAACGTCGCCGACCACCTGGATCTCTCGCTTGGTACTCTCTAGTCTCTCCTTTTCTGTTTCGCTTTCATAGCAGTGAGAAGGAAATTGATTTCATCAAGGTAATTCCTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATAATTCAGCCTGTAATTAGTAATGATGGTCTGAAGTTGATTGGTTGCTATTACTTGATTGATTGTCTGTAATTACGACGCTTTTCAAATTCAGGATCTTGTTGCTGTTTTATGGAAATAAATTGGTAGTTTGACGCGTTGAGGAGGCGATTTCCCCCAAAAGTCAGGTAATTGTTTTCTTTTATTCATTCCCCAGAAGTAAGTATTTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTACTTGAGAAATGTATTATTTGGAAGTGTATTGCATTGTATGTTGGAAAGGGGAAACAGATTTCATCATGTAAAACCCAATGAAGAAGCAAGTTATGGCAATGTAAACGCTTGCAGAAATTCCTAATTTTCTCCTACAGCCTGCAGTGTATGACCACCCATGTGCCCTTCTATGTCATATCTGGAATAGATCATCAGATTACAGGAAAACAAGAAACATGATAAGAAACTTTAGTTGGATGGAATTTTAATTAGTTAGGAATGTTGTAAGGAACTTAGCAAAAGTTTGGATATGATACCTTCTGGTTTTTGCTGGTGATTGATGTAAGATGATGATGTTTAAATTAATTTTTTAGCAATATATTTGGGAAATAATATGTTCAAGCGTTCTTTATGTGCTTAAATTCTTTTGCTGATTGTTGCCAAAAAAAAAAAAATCTTTTGCTGATTATTGTGGGTTGCAATTGAATTTTTTTGTGGGGCAATTCCAACAGGTGATTTTAGAGAAGTGGCTATTAATCCACTGGGTTGCATTTCAGTGCCGATTATGGGTTCATCCTTCAGGTAACTGTACTATATTTTGGTTACCACAAAATTTGTTTCCTCAATGTTAATGTAAGAACTGAGTGTTGCTGGAGTGTGATTACATCTGGTCTTGAAGAGGCGTGTGAAACCAATAGAGACGAGATAAGCAAAAAATGCAATCTTTTTCTTATCTTGCTGTTCAATAATTTCTCTGAATAATTGGGGACTTGAAATTCGATTATTTGACATTGATGTGGAAAAATTGAAGCTTTTTTATGCTTCTTTTATATAGTAGGTTGGGAATTGGAATTCTGCACGGGTTAGGTAATTATATGGTTTAGGAAAAGATCAAACTGATTCGTCATTGTCTAGAACCGCAGCCACCCGTATTAACAATTGTCATTAAGAACAACACTGATAAATACAATTAAGTTACGGATAAGTTTTTCGATTTTGTTGACCGAGTACTGGCTAGGGGTAATGATCTCAACTGCTCACCTTCACACCAACACTACCTATAAGAAGAGGGTACTGCTTTTACTACCAGCCAGAGGTGGCGAGCAGATAGGTTACTTGGCTATGTTTTTACCAATTTTAAGGTTCATGAATTGCTGTTGGAGCTAAATTTCATGTCCAAATATGAGTTACCAAAGAAAGTAATCCAGCATTCTCATTCTCTCTGGTCTTTAACTCTTTAACTCTCAGTTGTTTGAAACTAGACCAGAATTAGCAAGATCACTAATGCGCGAGGATGAGGGCGACTATCCATTTGGAAGTAGTCATAACCTGCCGTTTGAGATTATAAACGCACACTCTCTTGAGTCTTTCCGTTACATTGGTATTGATCCTGATGTTTATGAATTATGAATTTATGATCACTTGACTAGGAAGGTTCATAAAGAGATTAGTGGTGCTTCCTTATATAAACTCCACTATATACCTTTATCAGGACTTCTTCAGAGATTAATCTTTTCTTATATAGATTCCCTTGGATATTTGTTACACTCAACTAAGAAATTTTGACGCCTAGGCCCTAGGCTTCTTGGAAGTTAGAACTATTGAACTGTTGCACGTTCTTATCTCATAAAGTAGCGTACTGAGTACTGACTGACAGTGGAAGCAGGAAAAGCCTAACTGTCAGTGTGATGTGTGCAATCTTGCAGAGAGAAAGAATTACGCTTATTATTTTCTGTGTATAATGGTAAATCATTTGGAAATTCACTCTTTTTTGGGAAACTAATCATATGCAATATCCAATGTCCTAGCAGTAGTTGCTAAGATTGATGTCTGCAGTTTGGAGTGGTTGTGGCGGACGGGAAAATAGGAAGGTAAATTTGCACGCATTGAAGCCTAACTAAGTTGGGGCAACTTTCTGTAATATATGAATTCTCTTTAGATAGATATGACGTAATGCTTGCATTTCAAAAGATATTAACGTCTTGTATACTTATTCCATTGTCCGCGAAATAGTATTATTCTGTATCTCAGTCGATGATGATCAATGGCCAGTTAATAGACTTAAACTTTTGTGTTACTTGAAAAGAATCTATCTATCTTCTTCCACAGTAAGATATTGGTGATCTTTTTAAATGAAACTGGTGAAAGTATTGAATCTTATTTAATAATTTTATATTTTTTTGCATGAAGAATCAATCAGTGCTAATCCGACTCAAGCTGAAAAGGAGGAGGTTGATTCTTGTTCAATATATGTTGGCAATGTGAGGCAATTTCTATCTTCTTGGTATCCTTATTTCTCTTGATATTGATATTCTTTAACTTATAAAATGTCAGTGTGGAAATGTGCAAGCTTTGATTAGATTTACAATTAACGTGTGTGAATTTTGTAGTTGAGTGTTAATTTAGATCTCTTTCTCTCATTGTACAATAATGCATTAATGGATGGATTGCGTTTCATCTCTCTAAATTATCTAGGTAACCTGAGCTATGCAGATACTGCAGAGTCGCTGCTGGGATTATAACGTCATTGCTTTCAAGCATTAGTAGAACCTTGTTTAAATTCTCTCCATATGCAAACGACAGTTCACATCATTATTTTGTTACATCTGAAAATTTGTCAAATATTCTAGAATAGGAATAGATTAAGATTATAGTTGGATTTTCCATGCTTTCATTTTAATGGAGTGGTGAGACAGGATGAGGAAAATGATGGTGGACTCTTTATCACAAGTCATTGGGACAATGTGACAGAAATTCCTTGCAGGGAGTTTATAAAACTTGTATCGATGTGTTTCGAATCACGACTAAGTATAGGGATGTTAACCGGTATATTGCATCAAGTTCTTGTAAACTAAAGAAAGGTTATGTTTTGTAACTTCAACTCTCTCTAGTGTTTTTGTGGCTACAATTTCATGTAGGAAATGCCAGTGGAAAGATTTGCTTGTCTTTGATTAGTTTAGTGTACCCCGTGACCTTTTATTGTTCAGTTTGGCATGAATGTTGCTCAGAAGCACTTAAAGAACTCTTCAAAATTTTGGTTTGGTGTATGTTTACCTTTGTTTGAAGAATTTGATTAACAATTTGGAAGGGGAGAATGGCTTAACTCAGTATTTGGAGTAAGACCTTGAGGGCATGAGAGCGTATCAGGCGAGACTAGAGGGATTTATAGAGGCCCAACAAATACCTTACATGTAACCCCTTGTGATTGTCTTACACGAAGGTGGTTGGCGTGTATTAAGCTGCTATTACTTAGTTGTGTAGGTAATATCTGCTTTTGATTGACGGTTTGGGAGGGGATATGCAAGCCTCTTAGTTAATTACCTATGGGGAGGAACAAATGTTGGTTTGGCACTGGCCATTCCAATGGTAAGCTTTCTGTAGATATTGGGTTCTCAATTTTATTAGCGTAAGTAGTTAATTTGACAAGGAAATTGCTCTACATTTCAGGTAGCTAGGATATATCTTCCCTTTATGATGTACTCTGCGTACGCAAGGAAGAATTAGCAGCAGAAGATATGCTCCAAGTGCAGAGCCATATGTCCAATTTGTCTCTGGTTCTTTGGCACATCGTTAGCTTGTATGGTTGTAGCACATGTTATCCAATTGAACTTGCTCACGCTCGAATGCAGGTGCTTATCCTTTCATGTTTTTGTAGATTACTGATGTACAATTTTTTCTACCGCGTTGTGTGAATTATTGTAACTATAATCTGTTGGCACTCAATTTTGAATCTGCCTTTTTATTTGATTGTAGGCATTCAAGGATACTGGAAAGGAGCTCCCTGGTGTATTCTAGACCCAAATTAGGACTTTCGAATGCTAAAAATACAACCACTTTTCAAGGCAAGTGTAAGTTCATCTTGGCTTTCATGTAACCATTGTGGTCTCGTATTACATCTCTATTATCCTTCTTGAAATTTCATACTACTGCAACTAAACCTCAAAACCTCTTTGCTTTACAAATACACGAATACATGTTTAGTAACCTCCACCAGTTCCGGAATGCGTTAAGGAAAGAGCACCCTAAAGGGAAGTAAATGCCTACACCATTAGCATTTAGTTGAAATGAAGACAATGAGTTAGCATAAGGCCACCTTTGAACTTACTTTCGAATATATTTGTTTTGCCTCATTTCTTGTATTTTATTTAATTTATTTATTATGTACTTGCAGGGAAGCTGAAATAAAACAATGAATGAGAAGAGCAAGACCAGGGTGAATGTTCAAAGTTTGTAAGTATAGAGATAGTGCTAACTGATTTATGCTTAATATAAATAAAAAAAAGGAAAAAACTCCATTTTTGGTGTAGTTACAAAAATAGACATTTGTACTCAAGAGATGATTTTTGCTCTAGGTCAATGATGCCTCTAATTTGATTTAGGAGCCCTATCTGTGGAGTTGGATAGTTTTGCAAACTACTTTCATTTGTATGCTATAGAGTATAGAGAACTATTCATGTAGCTCGGGACGTCCAAGAGTGTTAAATTGTTAATCAACTTTGTCTTGGGGTTATATCCTGTCATATATGGTGATATAGTTTACACCCATAAATAAGAAATTCAAGTGAGGAAGAGACACGAGGTGATAAAATTCAAATACTACTTCCGTCATGGAATACTCAAAACGCTTTTCTTATAAGGTCGTTCTGGATTACTTGCAACGTTTCTAGAAATGAAAACTTTTATTAATATTATATCAATTTCTCACTTATTCAAAGATTCACCTATATCTCTACTCCCTACAAAAAATAATATTAAAAAATTCCACTATCTCCACCCATATCCTTTTAAAAGTTTGATACACATCTCACTACCTATATTAAAAAATACTCCACTACCATCTAATTAAATAATAGGTCAATTATAATGCATTAAATTCTATGTCGGTCAAATCGTTTTGAGTATTCTGAGATGGAAGGAGTATTTTTTAATATGAAGTTAATAAAAAACTTGGTGCGGGTCATTTTTACTTTAGCTACTTGATATTATTGTGTATGCATTAATATGAAACTTGCGCTTATATATGAAAATAATACCAATAATTAACTTATTTTCTATTGTATCAATAAACAACCATCTCTTAACTTGTTCACAATCTCCAAATAATTTGCTCCGAATTCTAACTAAGTTTTGCTATCTTGGTGTGCGTCGTCCAACAACTAGTATTGTAAGAAGTTGAAAACAACATTTCTGTAATGCTGCAGTAAAACGACTACCAACTATTGTAAGTTTGAGGCTCAAATTGGAAAGTAATAGTTTTTCGTATAGATATGTAGATTATGTTTGAACTTGTTAATATTGTTGACCCAACCCCTACACCTAAGATAACTACTAATACACGGTAGAACTTGAACTTAGAAGATCTGAGCAAAGCATACATGAAAGCATGACTGTTTCGGGTAAAGAAGCTCAACCTAAAGGATGAACTTGAAGATGAACATCAAGGGCATACTAGAGCTGGCAAAAGCTGACTCAACCCGCCGACCCAACTCGAACACAACCCAATAATAAAGGGTTGGGTCAAGATTTTTAACCCGCTTAATTAAATGGGTTGACCCAACCCAACTCGTCTAATTAAATGAGATGCGTCAGATTGAAATTTTCAGTCTGAAAGCAACCCGTCTAACGCATATACCTATTTGGGTCAGGTCAATCCACTCAATCCGTATAAATATTTTCTTTTAATCTTTTTAGCTTTTACAAANAACCCGCTTAATTAAATGGGTTGACCCAACCCAACTCGTCTAATTAAATGAGATGCGTCAGATTGAAATTTTCAGTCTGAAAGCAACCCGTCTAACGCATATACCTATTTGGGTCAGGTCAATCCGCTCAACCCGTATAAATATTTTCTTTAAATCTTTTAGCTTTTACAAATTAAAATATGAAAACGCTTAAACTAACAACTAGCATCCTTCCCTACCTAATCTTCTTTCAATATCTATTTTCTCTAACTCATCTCAAAGATTATCAACCTAGATTTGTTCTCTATATATTCTTTTTATCAACAAACAAAGCATTGGATCTTGGTTAATAGGTAATTGAAGTTGAAGCAATACGAGAAGAAGTAAATAATGAG

mRNA sequence

ATGCCATCTATTGTGCAGGGAAGTCAAACTGAGCGAGTATACAGAGGATTGTTTGAAGAATTAGTCATAGTCAAATACGGTGATATGTTGAAGAGCATCTGTTTGGAGGTCTATGGTATTGTTGAAAGCATTAATACTACACCCTTTAAAAAGCAAGGAATGGTGTTTTACTATTCATCAAATAGTGAAGTGACGGATCCACCCTCACATTCCTTCACGTTTTCATTTTGTCGTTATTCTTACAGACAGTGTAATCACCTCTTTGCCCTCATTCCCAGATTTCCCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCTCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCCCCTACTGATCCGCTGCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTTCCTCCCCTTCCGTTTGCGAACGCTACCTCTCATCTCTCCTCCGCCCCCTTAACTTTTCTCTCTCCTTTTCAATAACCTCGGATCATCAGCAAAACGTCGCCGACCACCTGGATCTCTCGCTTGTGAGAAGGAAATTGATTTCATCAAGGATCTTGTTGCTGTTTTATGGAAATAAATTGGTGATTTTAGAGAAGTGGCTATTAATCCACTGGGTTGCATTTCAGTGCCGATTATGGGTTCATCCTTCAGAATCAATCAGTGCTAATCCGACTCAAGCTGAAAAGGAGGAGGTTGATTCTTGTTCAATATATGTTGGCAATGTAGCTAGGATATATCTTCCCTTTATGATGTACTCTGCGTACGCAAGGAAGAATTAGCAGCAGAAGATATGCTCCAAGTGCAGAGCCATATGTCCAATTTGTCTCTGGTTCTTTGGCACATCGTTAGCTTGTATGGTTGTAGCACATGTTATCCAATTGAACTTGCTCACGCTCGAATGCAGGCATTCAAGGATACTGGAAAGGAGCTCCCTGGTGTATTCTAGACCCAAATTAGGACTTTCGAATGCTAAAAATACAACCACTTTTCAAGGCAAGTTAACCTCCACCAGTTCCGGAATGCGTTAAGGAAAGAGCACCCTAAAGGGAAGTAAATGCCTACACCATTAGCATTTAGTTGAAATGAAGACAATGAGTTAGCATAAGGCCACCTTTGAACTTACTTTCGAATATATTTGTTTTGCCTCATTTCTTGTATTTTATTTAATTTATTTATTATGTACTTGCAGGGAAGCTGAAATAAAACAATGAATGAGAAGAGCAAGACCAGGGTGAATGTTCAAAGTTTGTAATTGAAGTTGAAGCAATACGAGAAGAAGTAAATAATGAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCATCTATTGTGCAGGGAAGTCAAACTGAGCGAGTATACAGAGGATTGTTTGAAGAATTAGTCATAGTCAAATACGGTGATATGTTGAAGAGCATCTGTTTGGAGGTCTATGGTATTGTTGAAAGCATTAATACTACACCCTTTAAAAAGCAAGGAATGGTGTTTTACTATTCATCAAATAGTGAAGTGACGGATCCACCCTCACATTCCTTCACGTTTTCATTTTGTCGTTATTCTTACAGACAGTGTAATCACCTCTTTGCCCTCATTCCCAGATTTCCCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCTCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCCCCTACTGATCCGCTGCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTTCCTCCCCTTCCGTTTGCGAACGCTACCTCTCATCTCTCCTCCGCCCCCTTAACTTTTCTCTCTCCTTTTCAATAACCTCGGATCATCAGCAAAACGTCGCCGACCACCTGGATCTCTCGCTTGTGAGAAGGAAATTGATTTCATCAAGGATCTTGTTGCTGTTTTATGGAAATAAATTGGTGATTTTAGAGAAGTGGCTATTAATCCACTGGGTTGCATTTCAGTGCCGATTATGGGTTCATCCTTCAGAATCAATCAGTGCTAATCCGACTCAAGCTGAAAAGGAGGAGGTTGATTCTTGTTCAATATATGTTGGCAATGTAGCTAGGATATATCTTCCCTTTATGATGTACTCTGCGTACGCAAGGAAGAATTAG

Protein sequence

MPSIVQGSQTERVYRGLFEELVIVKYGDMLKSICLEVYGIVESINTTPFKKQGMVFYYSSNSEVTDPPSHSFTFSFCRYSYRQCNHLFALIPRFPQVPSSFSSLQVPSSFSSPLLIRCLFAFSEISSPSVCERYLSSLLRPLNFSLSFSITSDHQQNVADHLDLSLVRRKLISSRILLLFYGNKLVILEKWLLIHWVAFQCRLWVHPSESISANPTQAEKEEVDSCSIYVGNVARIYLPFMMYSAYARKN
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spo21936Spo21936gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo21936.1Spo21936.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo21936.1.CDS.7Spo21936.1.CDS.7CDS
Spo21936.1.CDS.6Spo21936.1.CDS.6CDS
Spo21936.1.CDS.5Spo21936.1.CDS.5CDS
Spo21936.1.CDS.4Spo21936.1.CDS.4CDS
Spo21936.1.CDS.3Spo21936.1.CDS.3CDS
Spo21936.1.CDS.2Spo21936.1.CDS.2CDS
Spo21936.1.CDS.1Spo21936.1.CDS.1CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo21936.1.utr3p.4Spo21936.1.utr3p.4three_prime_UTR
Spo21936.1.utr3p.3Spo21936.1.utr3p.3three_prime_UTR
Spo21936.1.utr3p.2Spo21936.1.utr3p.2three_prime_UTR
Spo21936.1.utr3p.1Spo21936.1.utr3p.1three_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo21936.1.exon.10Spo21936.1.exon.10exon
Spo21936.1.exon.9Spo21936.1.exon.9exon
Spo21936.1.exon.8Spo21936.1.exon.8exon
Spo21936.1.exon.7Spo21936.1.exon.7exon
Spo21936.1.exon.6Spo21936.1.exon.6exon
Spo21936.1.exon.5Spo21936.1.exon.5exon
Spo21936.1.exon.4Spo21936.1.exon.4exon
Spo21936.1.exon.3Spo21936.1.exon.3exon
Spo21936.1.exon.2Spo21936.1.exon.2exon
Spo21936.1.exon.1Spo21936.1.exon.1exon


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo21936.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo21936.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo21936.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo21936.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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