Spo26051.1 (mRNA) | SpinachBase

Overview


Name	Spo26051.1
Type	mRNA
Organism	Spinacia oleracea (Spinach)
Description	Syntaxin-81 protein
Location	SpoScf_01117 : 38862 .. 71390 (+)
Sequence length	1689

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS

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mRNA sequence

TCCGCCTCCCCTCTACAACTCTCTCTCTCTCTCATATTCTTCTTTTCCGATCCCCATTGTTGAAACTCCTACACTTCTATGTCTCTCATTCAACATCGAGCTTGCCCTTCAAAGTCTCCTCTCACCAAACCATCCCAATTTGTCAATTTTCTTTGAAAATTCAAGCTATGCGAATATGGCATTAAGCAAAACTCTAGGTTCCAGCGGCGCGGCGAAGTGTTAAATTCATCCAATAACACTAACAATAACAAGAATTACTGATCAGAAAACACCCAAGGCGTCGTTCAGGGAGCTGTCTCTCTTCTCTACTCGCTCTCTCTTTAGCGCTGCTCCATTTTCTGATTTCCGCAGCATCACCTGGTGTATTATCCGAAAATGGCCAAAATTATGGATAGAACTGAGGATTTCAAGGAGGCTGTTCGCCGTGAAGCTGTTTCTTTGGAGTATAATGAGTCTAAAGTGGCTGCTATAATGGCATCATTTATCATTCACAAGCCTCGTGAAAGGACTCCTTTCATGAAATCTTCTTTGAAAACACTTGAGAGCATTGGAGAATTGGGACAGTATTTGATGAAACATAAGCGCGATTATGTTGATATGCATCGGACAACCGAACATGAGAGAGATAGCATTGAGCAAGAAGTCAGCAACAAGAAATTAAAGCAGAATAAATATCAATGGGTTTTGTCGTGTTTCGAGTGGGTATGTTATGCTTTCGGAGGTGTTGTTGGGGTTTCAAACGGTCATGGTAGGTTTTTGGAGGTTGAGCTTGCGTTTCCGGTAGATGGGCTGGCGTTGCTAGCGGCTGGGGATCGGTTGCTGATTACTAATTTGGTGGTCATTGTTTGCCTCCTCGACTTCAAGAATGAAAATTTGAGCAGAACCGAAGTTACTTCTTTCGTTAAATTGTGTCAAAAGCAGATAGAGGTTCTAAAAGCTAGTATAAGTGACGAAGAAGCAAATTCGAAGGGCTGGCTTGGTATGAGGACAGATGGTTCTAATGCTGATACAATTGCACATAAACATGGAGTGTGGTGGCGGCGCAATGTCGGCGGTAATTTATGTGGTGGTGGTTGGTCGTTGGTGGTTGGTCGTTGTGATTTAGTTTTGATATTGAGCGAAAAGCTTCATACAGTTACATCAGAATTTGATCGACTAAGAGCTGTACGGTTCCAAGATGCTTTGAATAGAACAATGCCCAGAAGAAAACGTAGCCGTATCTCCGACCAAACTGCAATAGATAATTTGAAATCAAAGCTTCCAGAGGTTAAGGAACATGATGAAGTAGAACCCAGTCCCCAAAGAGTCCAAGAACAGCTTTTGGATGATGATACTCGTGCACTTCAGGTGGAGCTGAGTAATCTCCTTGATGCTGCTCAAGAAACTGAAACTAAAATGGTGGAGATGTCTGCACTGAATCACCTCTTGGCTACACATGTTCTCCAGCAAGTCCAACAGATTGAATACTTGTACGATCAGGCAGTTGAAGCAACCAAAAATGTGGAGCTTGGCAACAAAGAGCTGACGCAGGCCATACAGCGAAATAGCAGTAGCAGAATATTTAATAGGTTTCAACAATCAACAGCTGCAAGCTTATTAGTCATCACTAAAGAAGATGGTCCTTGTTTATTTTTCCATGAAACTGGGGTTCCAAGATTTGGAGAACATCCATACGACACCCGGGCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCAAAATTATGGATAGAACTGAGGATTTCAAGGAGGCTGTTCGCCGTGAAGCTGTTTCTTTGGAGTATAATGAGTCTAAAGTGGCTGCTATAATGGCATCATTTATCATTCACAAGCCTCGTGAAAGGACTCCTTTCATGAAATCTTCTTTGAAAACACTTGAGAGCATTGGAGAATTGGGACAGTATTTGATGAAACATAAGCGCGATTATGTTGATATGCATCGGACAACCGAACATGAGAGAGATAGCATTGAGCAAGAAGTCAGCAACAAGAAATTAAAGCAGAATAAATATCAATGGGTTTTGTCGTGTTTCGAGTGGGTATGTTATGCTTTCGGAGGTGTTGTTGGGGTTTCAAACGGTCATGGTAGGTTTTTGGAGGTTGAGCTTGCGTTTCCGGTAGATGGGCTGGCGTTGCTAGCGGCTGGGGATCGGTTGCTGATTACTAATTTGGTGGTCATTGTTTGCCTCCTCGACTTCAAGAATGAAAATTTGAGCAGAACCGAAGTTACTTCTTTCGTTAAATTGTGTCAAAAGCAGATAGAGGTTCTAAAAGCTAGTATAAGTGACGAAGAAGCAAATTCGAAGGGCTGGCTTGGTATGAGGACAGATGGTTCTAATGCTGATACAATTGCACATAAACATGGAGTGTGGTGGCGGCGCAATGTCGGCGGTAATTTATGTGGTGGTGGTTGGTCGTTGGTGGTTGGTCGTTGTGATTTAGTTTTGATATTGAGCGAAAAGCTTCATACAGTTACATCAGAATTTGATCGACTAAGAGCTGTACGGTTCCAAGATGCTTTGAATAGAACAATGCCCAGAAGAAAACGTAGCCGTATCTCCGACCAAACTGCAATAGATAATTTGAAATCAAAGCTTCCAGAGGTTAAGGAACATGATGAAGTAGAACCCAGTCCCCAAAGAGTCCAAGAACAGCTTTTGGATGATGATACTCGTGCACTTCAGGTGGAGCTGAGTAATCTCCTTGATGCTGCTCAAGAAACTGAAACTAAAATGGTGGAGATGTCTGCACTGAATCACCTCTTGGCTACACATGTTCTCCAGCAAGTCCAACAGATTGAATACTTGTACGATCAGGCAGTTGAAGCAACCAAAAATGTGGAGCTTGGCAACAAAGAGCTGACGCAGGCCATACAGCGAAATAGCAGTAGCAGAATATTTAATAGGTTTCAACAATCAACAGCTGCAAGCTTATTAGTCATCACTAAAGAAGATGGTCCTTGTTTATTTTTCCATGAAACTGGGGTTCCAAGATTTGGAGAACATCCATACGACACCCGGGCTTAA

Protein sequence

MAKIMDRTEDFKEAVRREAVSLEYNESKVAAIMASFIIHKPRERTPFMKSSLKTLESIGELGQYLMKHKRDYVDMHRTTEHERDSIEQEVSNKKLKQNKYQWVLSCFEWVCYAFGGVVGVSNGHGRFLEVELAFPVDGLALLAAGDRLLITNLVVIVCLLDFKNENLSRTEVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLCGGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNLKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIFNRFQQSTAASLLVITKEDGPCLFFHETGVPRFGEHPYDTRA

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
Spo26051	Spo26051	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo26051.1	Spo26051.1-protein	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo26051.1.exon.1	Spo26051.1.exon.1	exon
Spo26051.1.exon.2	Spo26051.1.exon.2	exon
Spo26051.1.exon.3	Spo26051.1.exon.3	exon
Spo26051.1.exon.4	Spo26051.1.exon.4	exon
Spo26051.1.exon.5	Spo26051.1.exon.5	exon
Spo26051.1.exon.6	Spo26051.1.exon.6	exon
Spo26051.1.exon.7	Spo26051.1.exon.7	exon
Spo26051.1.exon.8	Spo26051.1.exon.8	exon
Spo26051.1.exon.9	Spo26051.1.exon.9	exon
Spo26051.1.exon.10	Spo26051.1.exon.10	exon
Spo26051.1.exon.11	Spo26051.1.exon.11	exon
Spo26051.1.exon.12	Spo26051.1.exon.12	exon
Spo26051.1.exon.13	Spo26051.1.exon.13	exon
Spo26051.1.exon.14	Spo26051.1.exon.14	exon

The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo26051.1.utr5p.1	Spo26051.1.utr5p.1	five_prime_UTR
Spo26051.1.utr5p.2	Spo26051.1.utr5p.2	five_prime_UTR

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo26051.1.CDS.1	Spo26051.1.CDS.1	CDS
Spo26051.1.CDS.2	Spo26051.1.CDS.2	CDS
Spo26051.1.CDS.3	Spo26051.1.CDS.3	CDS
Spo26051.1.CDS.4	Spo26051.1.CDS.4	CDS
Spo26051.1.CDS.5	Spo26051.1.CDS.5	CDS
Spo26051.1.CDS.6	Spo26051.1.CDS.6	CDS
Spo26051.1.CDS.7	Spo26051.1.CDS.7	CDS
Spo26051.1.CDS.8	Spo26051.1.CDS.8	CDS
Spo26051.1.CDS.9	Spo26051.1.CDS.9	CDS
Spo26051.1.CDS.10	Spo26051.1.CDS.10	CDS
Spo26051.1.CDS.11	Spo26051.1.CDS.11	CDS
Spo26051.1.CDS.12	Spo26051.1.CDS.12	CDS
Spo26051.1.CDS.13	Spo26051.1.CDS.13	CDS

Homology

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902100028|gb|KNA03499.1| (hypothetical protein SOVF_208630, partial [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 1.000e-94
Identity = 198/227 (87.22%), Postives = 199/227 (87.67%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSK WLG RTDGSNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKSWLGTRTDGSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQ AIDN
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQNAIDN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIFN 398
           LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNV LGNKELTQAIQRNSSSRIFN
Sbjct: 269 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVVLGNKELTQAIQRNSSSRIFN 291

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902133806|gb|KNA04369.1| (hypothetical protein SOVF_200390, partial [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 312.8 bits (800), Expect = 9.700e-82
Identity = 173/197 (87.82%), Postives = 173/197 (87.82%), Query Frame = 1


		  
Query: 172 VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLCG 231
           VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV            
Sbjct: 1   VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV------------ 60

Query: 232 GGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 291
                       VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL
Sbjct: 61  ------------VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 120

Query: 292 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 351
           KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL
Sbjct: 121 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 173

Query: 352 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 369
           ATHVLQQVQQIEYLYDQ
Sbjct: 181 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 173

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731315198|ref|XP_010690321.1| (PREDICTED: syntaxin-81 [Beta vulgaris subsp. vulgaris])

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 2.200e-78
Identity = 170/226 (75.22%), Postives = 186/226 (82.30%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQI+VLKASI+DEEANSKGWLG+R   SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIDVLKASINDEEANSKGWLGIRM-ASNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRA+RFQD LNR  PRRKR+RI + +A D+
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAIRFQDVLNRATPRRKRNRIPESSATDH 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSK  E KE DEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQ+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKHLENKEPDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE+LY+QAVEAT+NVELGNKEL+QAIQRNS SR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEHLYEQAVEATQNVELGNKELSQAIQRNSGSRTF 289

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|596013895|ref|XP_007218719.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa009021mg [Prunus persica])

HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 6.100e-68
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 176/226 (77.88%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI+D+EANSKGWLG+RTD SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVSAFIKACQEQIDVLKNSINDDEANSKGWLGIRTDYSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VTS+FD+LRA+RFQD +NR  PRRK  RI++    D 
Sbjct: 149 -------------VLILSERLHSVTSQFDKLRAIRFQDTINRATPRRKLKRIANSEPADA 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E +E++P P  VQ+QLLDD+TRALQVEL+NLLDA Q+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 SNSNNLELREPNELQPEPLTVQQQLLDDETRALQVELTNLLDAVQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE LYDQAVEATKNVELGNKE+++AIQRN+SSR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEQLYDQAVEATKNVELGNKEISKAIQRNNSSRTF 290

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645254028|ref|XP_008232848.1| (PREDICTED: syntaxin-81 isoform X2 [Prunus mume])

HSP 1 Score: 266.5 bits (680), Expect = 8.000e-68
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 175/226 (77.43%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI+D+EANSKGWLG+RTD SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 57  EVSAFIKACQEQIDVLKNSINDDEANSKGWLGIRTDYSNADTIAHKHGV----------- 116

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VTS+FD+LRA+RFQD +NR  PRRK  RI++    D 
Sbjct: 117 -------------VLILSERLHSVTSQFDKLRAIRFQDTINRATPRRKLKRIANSEPADA 176

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E +E++P P  VQ+QLLDD+TRALQVEL+NLLDA Q+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 177 SNSNNLELREPNELQPEPLTVQQQLLDDETRALQVELTNLLDAVQQTETKMVEMSALNHL 236

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE LYDQAVEATKNVELGNKE+++AIQRNS SR F
Sbjct: 237 MSTHVLQQAQQIEQLYDQAVEATKNVELGNKEISKAIQRNSGSRTF 258

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9Q8C4_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_208630 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 7.000e-95
Identity = 198/227 (87.22%), Postives = 199/227 (87.67%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSK WLG RTDGSNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKSWLGTRTDGSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQ AIDN
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQNAIDN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIFN 398
           LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNV LGNKELTQAIQRNSSSRIFN
Sbjct: 269 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVVLGNKELTQAIQRNSSSRIFN 291

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QAS4_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_200390 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 312.8 bits (800), Expect = 6.700e-82
Identity = 173/197 (87.82%), Postives = 173/197 (87.82%), Query Frame = 1


		  
Query: 172 VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLCG 231
           VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV            
Sbjct: 1   VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV------------ 60

Query: 232 GGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 291
                       VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL
Sbjct: 61  ------------VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 120

Query: 292 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 351
           KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL
Sbjct: 121 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 173

Query: 352 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 369
           ATHVLQQVQQIEYLYDQ
Sbjct: 181 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 173

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8D279_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g024510 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 1.600e-78
Identity = 170/226 (75.22%), Postives = 186/226 (82.30%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQI+VLKASI+DEEANSKGWLG+R   SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIDVLKASINDEEANSKGWLGIRM-ASNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRA+RFQD LNR  PRRKR+RI + +A D+
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAIRFQDVLNRATPRRKRNRIPESSATDH 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSK  E KE DEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQ+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKHLENKEPDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE+LY+QAVEAT+NVELGNKEL+QAIQRNS SR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEHLYEQAVEATQNVELGNKELSQAIQRNSGSRTF 289

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5XEH6_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa009021mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 4.200e-68
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 176/226 (77.88%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI+D+EANSKGWLG+RTD SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVSAFIKACQEQIDVLKNSINDDEANSKGWLGIRTDYSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VTS+FD+LRA+RFQD +NR  PRRK  RI++    D 
Sbjct: 149 -------------VLILSERLHSVTSQFDKLRAIRFQDTINRATPRRKLKRIANSEPADA 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E +E++P P  VQ+QLLDD+TRALQVEL+NLLDA Q+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 SNSNNLELREPNELQPEPLTVQQQLLDDETRALQVELTNLLDAVQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE LYDQAVEATKNVELGNKE+++AIQRN+SSR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEQLYDQAVEATKNVELGNKEISKAIQRNNSSRTF 290

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A072UC59_MEDTR (Syntaxin-81 protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_6g084580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 8.000e-67
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 176/226 (77.88%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI++EE NSKGWLG+ T  +NADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVSAFIKTCQEQIDVLKNSINNEEENSKGWLGITTAKANADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VT++FD+LRA+RFQDA+NR +PRRK +RI+ + + + 
Sbjct: 149 -------------VLILSERLHSVTAQFDQLRAIRFQDAINRAIPRRKLNRITKKDSTET 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E DE+   P RVQ+QLLDD+TRALQVELS+LLD  QETETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 SNSGDVELREPDELRSEPIRVQQQLLDDETRALQVELSSLLDTVQETETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           +ATHVLQQ QQIE+LYDQAVEATKNVELGNKEL+QAIQRNSSSR F
Sbjct: 269 MATHVLQQAQQIEHLYDQAVEATKNVELGNKELSQAIQRNSSSRTF 290

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYP81_ARATH (Syntaxin-81 OS=Arabidopsis thaliana GN=SYP81 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 2.400e-64
Identity = 140/227 (61.67%), Postives = 168/227 (74.01%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV +F+K C++QI++L  SI +EEANSKGWLG+  D  NAD+IAHKHGV           
Sbjct: 89  EVAAFIKACKEQIDILINSIRNEEANSKGWLGLPADNFNADSIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VT++FD+LRA RFQD +NR MPRRK  R+  +    N
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTAQFDQLRATRFQDIINRAMPRRKPKRVIKEATPIN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRV-QEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNH 350
                 E  E DE++  P+R+ Q+QLLDD+T+ALQVELSNLLD A++TETKMVEMSALNH
Sbjct: 209 TTLGNSESIEPDEIQAQPRRLQQQQLLDDETQALQVELSNLLDGARQTETKMVEMSALNH 268

Query: 351 LLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           L+ATHVLQQ QQIE+LYDQAVEATKNVELGNKEL+QAIQRNSSSR F
Sbjct: 269 LMATHVLQQAQQIEFLYDQAVEATKNVELGNKELSQAIQRNSSSRTF 291

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: STX18_DANRE (Syntaxin-18 OS=Danio rerio GN=stx18 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.100e-6
Identity = 39/141 (27.66%), Postives = 75/141 (53.19%), Query Frame = 1


		  
Query: 259 DRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNLKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDD 318
           D+ R  R +     T  R+     +D+   D       E +  D++ P     + Q+ + 
Sbjct: 161 DKKRLSRLEPEQINTEKRQSDGEENDKPVSDGNVDLWEENRVEDDLSPE----EIQMFEQ 220

Query: 319 DTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVEL 378
           + + L  E+++LLD  ++ E K+VE+S L  + +  VLQQ  +I+ ++   V AT+NV+ 
Sbjct: 221 ENQRLVGEMNSLLDEVRQIEGKVVEISRLQEIFSEKVLQQETEIDSIHQLVVGATENVKE 280

Query: 379 GNKELTQAIQRNSSSRIFNRF 400
           GN+++ +AI+ N+  R++  F
Sbjct: 281 GNEDIREAIKNNAGFRVWILF 297

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G51740.1 (syntaxin of plants 81)

HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 1.300e-65
Identity = 140/227 (61.67%), Postives = 168/227 (74.01%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV +F+K C++QI++L  SI +EEANSKGWLG+  D  NAD+IAHKHGV           
Sbjct: 89  EVAAFIKACKEQIDILINSIRNEEANSKGWLGLPADNFNADSIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VT++FD+LRA RFQD +NR MPRRK  R+  +    N
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTAQFDQLRATRFQDIINRAMPRRKPKRVIKEATPIN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRV-QEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNH 350
                 E  E DE++  P+R+ Q+QLLDD+T+ALQVELSNLLD A++TETKMVEMSALNH
Sbjct: 209 TTLGNSESIEPDEIQAQPRRLQQQQLLDDETQALQVELSNLLDGARQTETKMVEMSALNH 268

Query: 351 LLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           L+ATHVLQQ QQIE+LYDQAVEATKNVELGNKEL+QAIQRNSSSR F
Sbjct: 269 LMATHVLQQAQQIEFLYDQAVEATKNVELGNKELSQAIQRNSSSRTF 291

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
BLAST of Spo26051.1 vs. TAIR (Arabidopsis)

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 5


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|902100028\|gb\|KNA03499.1\|	1.0e-94	87.2	hypothetical protein SOVF_2086...	[more]
gi\|902133806\|gb\|KNA04369.1\|	9.7e-82	87.8	hypothetical protein SOVF_2003...	[more]
gi\|731315198\|ref\|XP_010690321.1\|	2.2e-78	75.2	PREDICTED: syntaxin-81 [Beta v...	[more]
gi\|596013895\|ref\|XP_007218719.1\|	6.1e-68	64.1	hypothetical protein PRUPE_ppa...	[more]
gi\|645254028\|ref\|XP_008232848.1\|	8.0e-68	64.1	PREDICTED: syntaxin-81 isoform...	[more]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 5


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0K9Q8C4_SPIOL	7.0e-95	87.2	Uncharacterized protein (Fragm...	[more]
A0A0K9QAS4_SPIOL	6.7e-82	87.8	Uncharacterized protein (Fragm...	[more]
A0A0J8D279_BETVU	1.6e-78	75.2	Uncharacterized protein OS=Bet...	[more]
M5XEH6_PRUPE	4.2e-68	64.1	Uncharacterized protein OS=Pru...	[more]
A0A072UC59_MEDTR	8.0e-67	64.1	Syntaxin-81 protein OS=Medicag...	[more]

BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 2


Match Name	E-value	Identity	Description
SYP81_ARATH	2.4e-64	61.6	Syntaxin-81 OS=Arabidopsis tha...	[more]
STX18_DANRE	5.1e-6	27.6	Syntaxin-18 OS=Danio rerio GN=...	[more]

BLAST of Spo26051.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G51740.1	1.3e-65	61.6	syntaxin of plants 81	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR019529	SNARE-complex protein Syntaxin-18, N-terminal	PFAM	PF10496	Syntaxin-18_N	coord: 5..86 score: 9.9
None	No IPR available	PANTHER	PTHR15959	SYNTAXIN-18	coord: 244..396 score: 1.3E-62coord: 2..78 score: 1.3E-62coord: 152..219 score: 1.3

GO Annotation

GO Assignments

This mRNA is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0016192	vesicle-mediated transport
cellular_component	GO:0016020	membrane