Spo18219 (gene) | SpinachBase

Overview


Name	Spo18219
Type	gene
Organism	Spinacia oleracea (Spinach)
Description	Unknown protein
Location	chr4 : 121730397 .. 121737534 (-)

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGTATTTTCCAGAATTGGGCCCACTAATTCGGCATCCGGGAGAAGGAGGCTGTGGACATGGGTTCGGGCAGGGTTACACTATATGCCAACCCAGTTACAAGCCGAATCAGACGAGTTCCAATCAACCCGTGACGTGTGGGGGACCTGTGAGATGAATGATTGGAGAGCTTGTTTGTCTTGAGTCGGCTCAGAAGTGGATCATTGACTTAGTATCAACACTGCCAGTACGGACACTAACACTAGCGCGACCACCCTCATTTTGGGTGGTTTTATAGAGAGGGAATACTTTATTTGAAAACAAACATAGAGTATAACTAATCAAATTAAATGGGTGGGTTCCTGGGTTTCTTTTGAGGAAGAAGAAAACCCATTTAGTAGTCCAGATTGGAGGAGGGGAGGTGGGGATTTGGGTGGCGTTCCGATTCAGGTTCAAATTTGGTTCCGATTTTCGTGATTCGGGTTCAGCAAGGAACAAAGTTGGGCTTGCGTTTATGGCGTTCAATGATGATGTCTTCAGGGGTGGAGAAAGAGAAGAGGTGGACGGAGATGGAACAAGGTGGTGGGGCACGGTGGTGATATGGGTGGTAGGAGAAAGACCCATGGGAAGGAGAAATAAAGAAAAGAATAAGGAAAAAAAAGAAAATAAATAAATTAAATTAGCGTTAAAGTTAACAGAAAAGTTAACGGAATGGACGGAAAATGCTCATTAAGGGCATTTTGTGTATTTTTACAAAATCTTGGGGTATTTGGTGCGTTCTGGAAAGTTTAGGGGTATTTGGTGCATTTAGTTAACCTCAGAGGCATTTGAGGGCAGAGAGGCCAATATCTGATATGTATTTCAAGATACATATCACACCACTAAACGACAAAATAGGGATAAGACAAACATTAAAACATATGCCATTTTTAAAAAACAGATGCCATTTTGGAAAAATGGATGCCATTTTTCAAAACCGGGTGCCATTTTAAAAAAAAATTGATTTTGTTCTTTAGCGTTTGTCTTTAGCCTATTTTATCGTTTAGTTGGGTGATATGTATCTTGAAATACATATCAGATATTGATTTATACTTCCTCGAGACATTTTATGAAAAACCGATTTGAGATTTGAAAATTTTCACCATTTAAACACTTGAATTACTCAATTGCATAATTCCAAATAAAATTCAAGTTACCAAATACATACACGGATACACCATACATAAAATCAAATTTTATACACAATGTGAGTTGAATGAGTCATGTCTCGTTTAAATTAAAGGAAAGGTTGAGACTGATAAGATAAAAAATGAGATACTCCTTGATATAATTTCATTTTAAAGAAGTTGGAAAATAATTATTCAGGCAGGTTCGCACGTGATTATAGATTAATGTCAGTATGTCACAATAATCGATGTTTAACAAAACTTATGATCAATTTTGTGAACTCAAAGTTGTTTTACCCACCAACTAGAAAAATTCTTAAATATTTTGGCGTGGTCATTCCTTAATTTTTGGATCACAAATTTTCTCAAATCCACATTTAATATCCATACCCATATCCATTTAGATCGAACTTGGGTAACCCACAAAAAAATTGAATCGCACCTCCCCACTTTCACTGACTACACCCCCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCCTCCTGTTGCTCCGCCGTCTACTCAGCCTTCTCCGTCGACCGTCTTCAACAATTTCGCTGGCCTCCATTGCTCCCGCTGTCAATAATTCCGTTGAGATCCTTCCGCTGGCGGAGGTTTGCCCTCTCTCCAATCTTCGTTTCTCCCTAATTCTTAATTAAAGGTTTTCTAGGTTTTATAAATCTGAATGATGACAGTTTTTAGGTTAATTAATAGCAATTTTTAGGGTTTGAATTGTATGGAATTATTCAATTAGTGTAATTTTGGTGGGGGTATGTAGGGGTTTGGAGGTCGAGGATGAGTAATTTTGATGTAGAACATTTGATTGATGAGCTTTTCTGAAAAAAAAGTGCAGTCATTTGGAATTAGTATTAGATTCCCTATGAATTCAGCCTGAAGTTACTAGATGAATCAATAAATCCCTCTCCCAACAACTGATAGAAATTCATCCGCAAGAAAAGAATAAGACTTTCTCATTGGTTCCACATGAGAAACCTGTACAAATATAACCTACATGTCTGATATCTGTGAACCAAGGAGTTTCTTCATCATTTTTCTCGTTGTCGAGGTAAAAAGTTCCTCAAGCCTTCTGTTTTGTTGGGGTATGGGCAGAGCTGGGATGGGAAGTATTTCGGGATGGAGAGGCTAATGTTAAGATTTAAATGTTGTGAGGAGGAGAGAGATTTTCTTGCATAGACAACCTCTCGAGTCTAAGCTAGTTATTGTAACCTTGTAGGCTCTATACGTCTTGATGTACCCTGCTAGTGGCTCTTCTTTATATTTACATACTCTTGTTCTTTGGATAAAGGCTTTGTTGTAGATTATCTAGTTAACTACTTTGGTTAGTGCATACCTTCTTTGGTAAAGATGACATAAAAAGGCTCTCAATTGTACTTAATGGTGGTAAATATTGACGTTAATCTAAATGCTTCTTTCATAAAGGTGTGTGTTGATCTATACCCTCCTTGAGAAACACTCCTTATTTTGAATATGGTTGTGCCGTTCGGATAGCTTATCCTTGTGTTGGTAACTTGGTATGGTTGCATGCTTGTTTTAACTAGAAAACAGTGCGTGGCACGGGTGATGCCCCGGTTTTTATTTAGAATAATTAAAGTTCAAGATTTTACTTCAGCTCAATATTTGACCAAAATACACGTAGTCCATAAAAGTGAATTTTTTTATTAAATTCATCGACTACACCTTTACACTACGTCATTTTTTATGCCAAGTAATTTTTTAATTAGATCATCTTACAATTATTTTAACTTATTTTCTAATGGAACTACGTGCTTCATATTAATAAACACCAAATTAGATTATGAAGGGTATTTCTATCGGTCATGCTCATGAGATTTATGATATCATGTTTAATTCATGGTTTCCTTAGTGCTTTAATTGTTATTTTTATCCCAATATGGTCCATATGAAATAAAATGTAACATAAAGATTTAGTTGTTTTAGACTTCATGTTAACATGTATTTATAAATTAATGTGCATGGATAAACAACAATTAGTGGTTGGTTAAGATGGTAATGAGAGTTATTCTCCAAACTTGAGGTCTTGTGTTCGAATCTTATTGTATTGATTTTTGGTTATCAATAACATCACATAACCTTGGTGAGTGGATGACGTGGTTTAACACGAGAGTTCTACGTGGCACATAAACTTTCTCCGCAACGCCTTATAAATTATAATATATTAGTATAGATAGGATAATTGGTATCTTTCTAAATGTCCGTTGGAGTGAGGCAGGTACTCAGGTAGCAAGAGTTTTAGACATGCGTTTTGACTTTTGAGATGTACAATTGTAAACATGTCCTTCAGCCTTCACATTATTTCATCAAGGAGTGTGTGGTTTATGGTTGGTTTTATCATTTGCAATTTACCTTATTTTTTCACTCCTGACCATTCTTCATGTCATCTTGTCTGGAAGGTGAATCGTATGTTCTTATGTAGAGGTACAAGGTTAATTCCATCAATTATTTTAAGTATTAATTTCTAGAATACCAGTTAAACTGTGACGTAAACATTTTCGCATCTCCGTTACAGGGGTTTTCCTTTCGCTGCAGAAAATGAGTTTGACGATGTTAGATGTTTCACATGATGGTTATCAATGGTGTCTGAGATTACATTCTTGTTTGACTATGTTGGTGAATTAATGACTTGTTTTATTTGATTTCTTCTATTTTTTGCCTTGATGAGTGTGATGATAATTATTTTGTACAAAATATGGGGCTAGTATGAAAATAGTTTCTTTGCAGTTGTCGGGTAAGTCTGAAAAAGGCTCTCTGTAGTTCTTTGAGTAAGGAATTCTACATCTGACCTCGCCCCTAGGCGTGAGCCTTGGCATATTGATATGATGTTAGTTTATATAGGCACCTAGTTTTGAAGCCCGGTCGTTGCCCGGGTTGTACAATAATATTTTATGCATTGGAAACATGAGAAATATAACCCAGCTATTGAGCCTATGTTTTTTCTTCCTCGATATTCTATCATCTTAGGATAAATACGCTATCTTCAATAAAAGGGGCTCAAGGTCCTATCCCAATAAACTCTCCAACCTGTCTAAAGCCCAAATTGAAAACGTGAAGGAAATTAGGGAATAATTATCTTATAGTTTTTCTGAGGCATTAAACCTTTGTTCTTTTTTTAATATTATTCAAAGGAGAATTACACTTACATCCTGCAAACAGAAAGGCAGAGGGATTAAACCTTTGTTCTTTTTTAATATTATTCAAAGGAGAATTACACTTACATCCTGCAAACAGAAAGGCAGAGGGATTAAACATGTGACCTTAGTAAAGAATTTTGTTTTACCACTATGTCTAGAAAAGATAGATATGAAGTGTTGGCGATTCATCATTCTTTACAGATTCAGCTTCTCTGTTAGACTGTTAGTTCTTCTGTTGTAGGAATAACAATGTAGGGAGTATTATTGAAGTTTGTTGACATTTATATAAGTAGTTTTGATGAATTTTAAGTCATTTTCTTTTTGTGTAATCTGGCTTTGCATAGTCAATTAAAGTGATTAATAATGCAATGTGAGATTGTTTTGGTCGATTTATAGCTCTATAGGTCCTTGTTTTTCTATATTAGTAATTCTTGTACATTACCTATGACTACTGTCTCTAAGCTAAAATCACAACTCCCTTGCAGAATGACTCGTTATAGTCGCATAGTCACGTAAACAAAACTTGTATAAGATCCTACACTTTATACTTCATACATTGGAGAAACCTTTAATCTGGTGTTTGGGAAATCTTTTGTTCACACCAATGTCAGTCAGTTACAAAGTCTGAAGTAACTAATCTTGTTTCGGAGGGTGGAACTGCAAAAGGGTGTAGAATGTCTAATTTTCTTACGACAAGTCCTAGCATTAGTATGAGTTCGCTGACCGCTTAAGGGCAATCCATCTTGATGAAGAATTCCACGCGCTCTACTGAAATAGATTTCGCGGAAAACCAGCTATATACGTTCTTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGCCACAAGTCATCCCCGTATTTTGCCACATACGTGGGTTTGGTCCTCCAAGGCCTGTTAGAGCTCTCTTCAACCTGCTCATGGCTAGATCGATCGGTTTCGGGTCAAATAGGAAGAACTAGAAGATTCACCTCTGGAAAGCGCCTACACCTAATGGCTTATAGCTTTAGCGACTTCTCCAAAAACTTCGCTTTAGCGACTTCTCCTCCTTTTTACCATGTTGAGACAGTTAAATAGTAGTTGCGTGAATGACTCTTGGATCATTATGGTTTCATGCTGTTCTTTTTGTTTAGTTTGAACATTATTAATTTCTATTTCAGTAGTCTGATACTCTGATGCATAAAAGATTAAGAATCCTTATTAAGATAGAGAAGCACCTGTCCAAAAGATCATAATTCAAGTCACAATCACAACTCACAAGTACACAACATATCATAAGACCATAACACCATAACCAAAATCAGATCCATAAAATACATACAATAAGCTGAGATAATCCAATGATTAATTAACTTGACTTTTTCAAAAACTCTATGACCTTAGTATCATAAGCTGATCATGCCACTCTAAACCCTTCAAATCCGGATCCTTTAGCCAAGGCCTCAAACTCTTGTTCTGTCCTTTCTTTACCACTCGGGTTGTGAGCCAACATGATAGCATCCATGTGGAAGACGGTCCTTGCAGTGAGTGTAGTTGTTCACCAATGAGCTTAGATTTAGTGGAAGATGAGTATAAATGATTTTTTGATACTGAGAGAATATGACACATCTCCCTATGCTGAATTGAATAGGTGATGAAGTAATTGCATAACAAATGGAGATTTTTGTATATTATTTTAAGAAGAAAATTGAGTTTATTTAAATTGATAAATCAGTATTTTATTTTTCTCAAAACTATATCTATTTACTTTTTTATCTTAAATTATTATGAAGTGAATTTTATCTTTTTATCATAATTATCTATTTATTATTTTTTAAATAATTAATATTCGATTTTATGACTGGACTTTCCTACATGTACGCTCCCAATGCTCTTGAGAAAACTCCCCTTTATATATATATATTAGATTCTACAGGGTGAGTAGGAAAAGTAACTTTATATAGGCATTGGCATATTGATATGATGTGGCATGTGAAGACATGGGACTTGTTACAAATGCAGGGTGTTGCTAGAATACCTTTACCTTGCTTATAGACTCCCTAATTCCAAGCCCTTTGCCACCCCTTAAACTCACAATGGTTAACTTGCTTTTGCAAATTATATTGAAATATTTGCTTCACACTTAATAATCAATTGAAAGCATTAGTTCTTCCCTACACTATAACTCGTTATTAGTGCATTTAAAAAATAAATAGAATTTCCAAACACATTTCTTACTTTTTTCTGGTAAGATGGCATTTTACTTCCGGTTGATACCTGATTGTTTTGTGCTGGTTTTGTAGCAAATGCTGTATCATTATGTGTGTGCTTGTTGGAGGGGGGGNGGGGGGGGGGGGGGAGCGGAACTGAGGGAGCAGCGAGGGAGGATATGTGGCACAACTAGTTGTATACTCAATGCTTCTAAGATTAGAGAAGATAGGAAAAAAATGAGCAAAAAGATATTGTACAATCAGTTGAACAATAGAAATTGCCCGGGCCAAGTTATTCTATTGAATTATGAGTATAATATGAAATTGTACTTTGGTGAAATTCATTAGTTATTTCCTGGGCTTTTACTGGTTTCGGGCGTTGCGAGATTATTTTATTCTTGTTCTTTCTCCAGGTNTTTCCTGGGCTTTTACTGGTTTCGGGCGTTGCGAGATTATTTTATTCTTGTTCTTTCTCCAGGTGTAAGCACTATACTAGATAATTTAAGCTCTAGGGAAGAAAGGAAACAGAATCGTATTTCCTTGTGTATTTATAATAACATCTAGGGCCTTATATAGTTCTACATGTATTTTTCTTATCACTAGGCCGTATCAGTCTATTGGAATCATATTCGTTTTGAATTTTGTTCTGCAGATATTAG

mRNA sequence

ATGGTATTTTCCAGAATTGGGCCCACTAATTCGGCATCCGGGAGAAGGAGGCTGTGGACATGGGTTCGGGCAGGGTTACACTATATGCCAACCCAGTTACAAGCCGAATCAGACGAGTTCCAATCAACCCGTGACGTGTGGGGGACCTATCGAACTTGGGTAACCCACAAAAAAATTGAATCGCACCTCCCCACTTTCACTGACTACACCCCCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCCTCCTGTTGCTCCGCCGTCTACTCAGCCTTCTCCGTCGACCGTCTTCAACAATTTCGCTGGCCTCCATTGCTCCCGCTGTCAATAATTCCGTTGAGATCCTTCCGCTGGCGGAGATATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTATTTTCCAGAATTGGGCCCACTAATTCGGCATCCGGGAGAAGGAGGCTGTGGACATGGGTTCGGGCAGGGTTACACTATATGCCAACCCAGTTACAAGCCGAATCAGACGAGTTCCAATCAACCCGTGACGTGTGGGGGACCTATCGAACTTGGGTAACCCACAAAAAAATTGAATCGCACCTCCCCACTTTCACTGACTACACCCCCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCCTCCTGTTGCTCCGCCGTCTACTCAGCCTTCTCCGTCGACCGTCTTCAACAATTTCGCTGGCCTCCATTGCTCCCGCTGTCAATAATTCCGTTGAGATCCTTCCGCTGGCGGAGATATTAG

Protein sequence

MVFSRIGPTNSASGRRRLWTWVRAGLHYMPTQLQAESDEFQSTRDVWGTYRTWVTHKKIESHLPTFTDYTPSSLSLSSSCCSAVYSAFSVDRLQQFRWPPLLPLSIIPLRSFRWRRY

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo18219.1	Spo18219.1	mRNA

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spo18219.1 vs. NCBI nr
BLAST of Spo18219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
BLAST of Spo18219.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
BLAST of Spo18219.1 vs. TAIR (Arabidopsis)

BLAST of Spo18219.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo18219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo18219.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo18219.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0007033	vacuole organization
cellular_component	GO:0005576	extracellular region
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane
cellular_component	GO:0005886	plasma membrane
cellular_component	GO:0009506	plasmodesma

RNA-Seq Expression

Co-expression


Gene	r value	Expression
Spo04647	0.70	Barchart \| Table
Spo06473	0.66	Barchart \| Table
Spo14777	0.66	Barchart \| Table
Spo27064	0.65	Barchart \| Table