Spo24197 (gene)

Overview
NameSpo24197
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5 : 31800089 .. 31811334 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGCGAGGCCGCCTTACCAGTATCTCAAAATTGCAAGGTAAAACAAGAATTTTCTAGGCTACATTACCAAGTAGTTCATACTTTGTGGAATATACATTACCTAGCTCCCAGTCAGGACGCCTTGCTCCCAGTCAGGACGCCTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATTAAGACGCCTTGTCCAAACTCCTTGTCAGGACTTGCAAGATCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTTCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTATCCAAATTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAACTCCTTGTTAGGACTTGCAAGCTCCCCTCAAGACTTGTAAGTTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAATTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAATTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGATGCCTTTTCGAAACTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCTCATGACTTGCAAGCTCCCCATCAGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTACTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAATTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCAGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAACTCCTTGTGAGGACTTTCAAGCTCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAATTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCCAAATTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCAATAGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCTAAATTCCTTGTCAGGAATTGCAAGCTCCCCTCAAGAATTGCAAGCTCCCCATCGGGACTTACTCCCTCATGGACTTGCTCCCCATCGGGACTTGCTCCTCGTCAAGGCGCCTCATCAAGACGCCTTGTCAAAACTCCTTGTCAGGACTTGCAAGCTCCCCTCAAGACTTGCAAGCTCCCCATCAGGACTTTCTCCCTCATGGACTTGCTCCCCATCGGGACTTGCTCCCATCATGACTTAATAAAGATAGTCAATCAATATCGACGCCTTCTTATAGATGGCGTTAGAAAAGACTAATCGGTTGATGGCCTGAGGAGTGGCCTAGATTAGCGCCCCAAATTAGATTGATCACCTAAAACACTGGGGTTACCGTCCGCATATGGGCAACAAAATTCATTTCAAAAAACCAGCATATGACTGAAAAGGGATGAATACATAAAAAGTGCACAGAAGGCACAAAAATTCCTACATGCGCACACAGCGCGAAAACCAAAATGAAGAGTGCCAAAAAGCACCAATGTTAATACAAAGCGCCGGCGCCGCGAAAACCAACAGTCAAAGAAAAGGTTAAGGACAAGGAGCGATCAAACTACCTTCCTGGACGTCCTGCCCGACGGAGGAATTCACTTCTTCTTCCTCCACGTCTTCCTCCTCCTAATCAGGACTCGCAAGCTCCTATCATGACTTGCAAACTCCCATCATGACTCACGACTAGTCACATGTTAGAGCCCAAGTTTCTCTCTAAATGTGCCCCAAGTTGAGTCGCAACTGACAAAATGTTGCCTCCCGCCATAAGGTACTAGTTGAGTCGCTCATTAAATTTTCAAAGGCGACTTACCTTGTAAAAAAGATAAGACCCTCTTTGAGGGGCAAATGATGTGGCAAAAAATAATTGGACATCGTGTCCCAATGATAGCTTGACACATGTCCTCCATAAATGGCACGAAGGCCAACTTGTTTGACAGGCCCAGCCCTAAAAAGGCACCTTAAAGCCCTTTATTTCAAAAACGCACCAGATAAGGACACATGTCTTCATCTCTAAAGATCACCCAGTCATATTGCTAGGGTTTTTGGACACTTCCCAAAAACCCTAGCCCTATATATAGTCCAATTCCCAAGGTAAAAGGGTCATTGAATTCATTCCCACCAACCTAAACTATCTTTGCTCTACCTTCTCTCTACAAATTACTTCTCTCTCTAGCTTATACTTACTTAAGCATTGGAGGAAATATTCCTACGGGAATATTCTTGTTTTGCAGGTTGCCAGAAGTTTGTGCCAACTCATACTTGATACCTCCGAGGAACGCGTGACATGTCATCACCGTAAAACATCCCACAACAAGGAGCAATGGACTAACAACCACGAAGAATCAGACTGGAAATTATTTGTGTGGTTGACGGTGGTTGATCCCTAAACTTATCATGATGTGAGCGATGATTTGCGGCACGAGAGATTCAGCAGTGGAGATTGATTAAGAGGGGTAGATTTGAAGGAGTACCAAGAAATGAAGGGAACAAAAATATAAAATACAAGGTAAATTTGTTAAGGAGTCTCCCGTATGAGAGAGAAAATGAAGAGGCTACGGATGATTAAGTAAAACAAAATTACGATGAGTTAGGAAAAGAAGTTAGGGATTTCATATCATTTTAGGGTCAATAACTTAAGAGATTAAAGAAAAAAGGGGGGTTTTTAATTTTCTTTGTAAAACACGGGGAAACGGATGGCTAAGAACACCGTACTGTATTCTTTAAAGTAATATTTGTTTAATTTATTTTTCATTATGGTAAGAGAAATAAATGGATAGAGAACAATGATCTATGAACAACGTTTTATAGTCTATTTTTCGCACAACGGTGGTTTATGAAAGGCGTTTTCTATAGTTGGGGAAATCGGTTATCTCACTTAACCGTACTCTATCTTCTGTTTCTTATTCCAACTTTTGTAGTAGTGTTACATTGACAAAGTGCTAGCTAGGTTCAATATGATGGAAGCCAAGAGAGGCCATCTACCCATGACACATGGCACATATCTAAGCAAGACTCAGTGTCCCAAGACATCTGATGAGCATAGAAAGATGAGTGGAATTTCGTACGCTTCGGCTATTGTATCCATCATGTATGCTATGATTTGTACAAGGTCGGATGTTTCCTTCGCACTCAGTGCAACGAGCAGGTACCAGTCAGACCCAGGTGATGCCCATTGGACTGCTGCCAAGAATATCCTAAAGTACCTGAAAAGGACTAAGGATCAGTTTCTGGTCTATGGTGGTACATATGAGTTGATTGTTAAGGGCTATACGGACGCAAGATTTCAAACCGATAGAGATGATTTCAGATCACAGTCTGGTTTTGTGTTCTGCCTTAATGGCGGAGCAGTAAGCTGGAAAAGTGCTAAGCAAAGCACTATTGCGGATTCTACAACTGAAGCCGAGTACATTGCTGCCTCAGAAGCAGAAAAGGAAGCTGTTTGGATTCGAAAGTTCATCGAAGAACTTGGGGTTGTCCCCTCCATTAAAGGACCAATGGCTTTGTATTGCGACAATAGCGGATCCATTGCCCAGGCAAAGGAGCCTAGGAGCCACCAGAAGTCCAAGCACGTACTGCGGCAATTTCACATACTTAGAGAAATTGTTGAACGGAAAGAAATCGAGATTTGCAAGGTTGGAACTTACGACAACGTCGCGGATCCATTGACTATTCACAAGTAAAGCACAACGCACATCTAGCAACCGTGGGAATCAAGCATGTTGGAGAATGGCTTTGAATTTTTAAGTTTTGTCTTAGAATATCTGTTAGATTCGTGTTTAAAAAAATTGGTTTAACCATTTTATATTTATAAAATTTCTTATTTCATATTCATTTAATTTGGTTTAGTATTAAAAGAAAAGTTCATGTGATTCAAAGCATTCAAATGGGATGTCAAGATGGATTCTTCGACAAACAAACACCCATAAGTGAACTTGAACATTGAAGTCACAAAGGATCCCTAATCCATGTCATTGAAAGGTGGACGACCAATGACTAATGAAGATTAGATTGCAAGTAGATTTGTAGTTCAATTTCTTGAACTAGATTTACTAGATGTCATAATCTTTTGCATAGATACTTATTGGATCTTGTATCAGATTGACCATGAGAACACTTTAAGAGATTAAAGTCATGTCATAAGCAGTTCTCATTAATGGTGATTAGAACTATTCCTCAGAACATGAGTAATTATGATTTCTCGTTTGAGAATTAGTTTGCTCTGATGCTAGCAAAACGTCGCACCGTAAAAGGAGGCTATAAAAGCAGTTATTGGGCGTACTATGAATCAAAGTGAGTGTTCATAGATTGCAAGAATGGATTGTCCTCCTATCTTTGATAGGATATGGTGTTGTTGTGTAACAAGGCCTCTTGGAGAGTTAGATACTGTGAAAATTCATGGTCGTGCTCAGAATAGTTAAGGCTTAACCTTCTGTAAAATTTTAACAGTTGAACTCAGTAATCCGAGAAACACTTCTGGACCTAATAAGGATGGCTTGGATCTTACCTTATGTTCAGCAAGTAACACTAAG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mRNA sequence

ATGGTGCGAGGCCGCCTTACCAGTATCTCAAAATTGCAAGAGCTGTATCAACACTGCCGATTAATATTGAGGATGAGGCCCGAAAGCGATGCCGAGATTGAAGAAGCTTTGAAGGATGGTCGGTCTGTATACTGTTTAACAGTTCTCACATCTGATAGTGGCGAAGATGATATAAACATAGTTGGAGAGAACTTCATGATTGCTATCGCATTGTTTTTGATCATGAGAGGATGGTGTTCGGATGGAAGACACACGACTCTGCAATTGTTGGAATATAATACAGATAAAGGTCAAAGTGGAGCTAACGGTGGAAAAAAAGCGGGAAAACTCCCTCCAAAAGCCAAAGAGTACTTTACTTACCGTGGTCAAGATTTGTACATGCATGTGACATACTATGAGTCTATGAGTCTATACACATTACAGTATTACACGGCATACACCCCCTCTGTCCTCTACTTCCCCTTTTCGTTCCAAATAGCTAAAACAATACATATCCCAAAAAACCCAATTGACTTCCACATTCCTTCTCCATACATACCTTCAAAGTCCATCTCGTCTCCAACTTCTTTCCCGGCGTCCATGGCTGACGATTCTCTAAGGTCAACAACCACAAGGTTCACAACCATGGAGACAATGCCAGAGGTAGTTAATGAGCTAGAAACACCCACAAACACAAGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGCGAGGCCGCCTTACCAGTATCTCAAAATTGCAAGAGCTGTATCAACACTGCCGATTAATATTGAGGATGAGGCCCGAAAGCGATGCCGAGATTGAAGAAGCTTTGAAGGATGGTCGGTCTGTATACTGTTTAACAGTTCTCACATCTGATAGTGGCGAAGATGATATAAACATAGTTGGAGAGAACTTCATGATTGCTATCGCATTGTTTTTGATCATGAGAGGATGGTGTTCGGATGGAAGACACACGACTCTGCAATTGTTGGAATATAATACAGATAAAGGTCAAAGTGGAGCTAACGGTGGAAAAAAAGCGGGAAAACTCCCTCCAAAAGCCAAAGAGTACTTTACTTACCGTGGTCAAGATTTGTACATGCATGTGACATACTATGAGTCTATGAGTCTATACACATTACAGTATTACACGGCATACACCCCCTCTGTCCTCTACTTCCCCTTTTCGTTCCAAATAGCTAAAACAATACATATCCCAAAAAACCCAATTGACTTCCACATTCCTTCTCCATACATACCTTCAAAGTCCATCTCGTCTCCAACTTCTTTCCCGGCGTCCATGGCTGACGATTCTCTAAGGTCAACAACCACAAGGTTCACAACCATGGAGACAATGCCAGAGGTAGTTAATGAGCTAGAAACACCCACAAACACAAGCTAA

Protein sequence

MVRGRLTSISKLQELYQHCRLILRMRPESDAEIEEALKDGRSVYCLTVLTSDSGEDDINIVGENFMIAIALFLIMRGWCSDGRHTTLQLLEYNTDKGQSGANGGKKAGKLPPKAKEYFTYRGQDLYMHVTYYESMSLYTLQYYTAYTPSVLYFPFSFQIAKTIHIPKNPIDFHIPSPYIPSKSISSPTSFPASMADDSLRSTTTRFTTMETMPEVVNELETPTNTS
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo24197.1Spo24197.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo24197.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo24197.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo24197.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo24197.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated
biological_process GO:0006094 gluconeogenesis
biological_process GO:0044238 primary metabolic process
biological_process GO:0006448 regulation of translational elongation
cellular_component GO:0000124 SAGA complex
cellular_component GO:0005667 transcription factor complex
cellular_component GO:0044434 chloroplast part
cellular_component GO:0005840 ribosome
molecular_function GO:0003712 transcription coregulator activity
molecular_function GO:0004611 phosphoenolpyruvate carboxykinase activity
molecular_function GO:0017076 purine nucleotide binding
molecular_function GO:0003824 catalytic activity
molecular_function GO:0003746 translation elongation factor activity
RNA-Seq Expression