Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAATTGCAGGAGGGTTTTTCGATGAGTGATGAAACTCAAAACAGTAGCTTTTTCTTTCAGCTTAAATCGTGCTGTTTGGAGCTTCTTGACCTTCTGCATCAACCTAAGAAGCAATCATGTGCTCTTTCTCAATTGCTCGTCCTTCTTCGCTCTTCAACTTCCGAAGCCATTCAACCTTTGTTTGAGTATGAGCTCCCCTCTCATTTGGTTGCATTTTTATTGTTGTTGTAATTGCTAATCCAAACAGTTGCACTAGATAGCAGGTGAAGGGATGACAATTATATTTGTGGGCATGCCTCCGACCCCATCTTTTGTTTACTTTAATTCTAATTCTGTCCTCTATTTTGCTTTCAGCTATACCTTGTTTCCGTTGCTGCTTCTATTGGATGCAGCAGTGGATTGCCGATCTGTTCAGAAACGTAATTCTGAAGAAAAATCTGCAATTCTATTTGCGAAAAATAATGTGTCTGATGCTGTTTCAGAAGGCGTGCTTCAGTGTTTGGAAGAACTCTTAACTAAATGTTGTTTAGGTTCCGTGAATCAGGTTGTGTATCCTTTGTAACACTTCTATCCACACCACTGCACCCTTACTAATGTCTCAAGGTTTTATATATGTTTGTCGTTCCTGTGCCAGCTGCAAAAGCATTATCTTTTATGCATTCTAAGTGCAACTTTTATTATTAACTGCTTTTCTTTATATTGTTCTTTTCAGAAATAATTTTGAGCTGTAGTTTGTTCTTTATATTCTTAGTTTCTGGTTGTGTCTGTGTTGGGAGAAATATTTCCAGAGGGAAATCAAAAATTTTGATGAATTTCTTTCTTTGATGATTGGTTCTGATTTACACGTTTTAAGCTGTTAAATCAGCAAAGATAAATGGCAAACGTCATACAGATGAATAAGGAAAACTAAATGCTTCTTTGTTCAATTAGTTGAAAATTGTTTTAAAGTGCAATTGGCCGTTATAATTAAGATGTATTCCGTATCTTTTTAGGGGTTACATAAACCACTTCCAGCCGTATTTAATTAGGGGTTACATTTCTATTTTTGGTAAGTTCTCTACCCCACTCCTGAATTATTTAATATATATCTTTTTTTCCTATAGGGATCACTACTACAATAAACTCCATCTTCTTTGATTAAAACACTTATCCCACTATCTTTTTTTCTAATTGTTTATTACTTCCTCCCCCACTTGATTTAATATTAAATTACATTCAACCCTCATTTCTTAATACTTGTGTCGATCAACATGTAACACCTAAAAAAATACAGAGCGTGTACCTTCATCATAATGGCAAAAAAACACGAGGCAGTAATTTATAGACACCACTGTGGACAATTGAATTGAAGAGCTGCATACTCTTGATCTTCAAGCATACAATAATAGAATGGAATTCTCTTGAATTTTGAGAATTTTTTTTTTCATCCCCAAACGTGTCGAATTTCTATTATTTTGTCCTCTTTGTTTGATAACCAAACTGAAAAAAAAAAATCTAAATATAGTTTACTTGGGAAGTATGCTTCTTCCAACTTAATGCAGCCATAGTTGTCCATACGTTTTCATGATTGGAGTTTGAACATTGATGCTACATGTGACCTGAAGGTTTGAGTCTACTTTCTAGCAGATGACTGTTGTGCTGAAGACGTTAACTCATGGTGCCATGCTATCACCATCCGAGGCCGCAGAAGAGTTTCGAGGAGGAGTAGTCAAGTGCTTTAGGACATTGATTTCCAATATAATTCTGTGCTCCGACACATCTTGCTCCTGCAAAGAAAGTTTTAGTCGACCTCCCCTTCTAGATATTGAAGATTTAAAATGCTCAACTGTTGAACACTTGGAGCATCATTCATATCCGAAGGAATGCTTAATTGCATTTCTGCAGTCAGAATGTGCTTCCGCTGCTGTTGGACACTGGCTATCTATCCTGCTAAATGTACGTTGATGCCTTGTATCTGCATATTATTTAAAAAAGCTATTGTCTTGCTTATGCCTTTTCTCTTTGGTATATGAGTTTTTCTTATTGATTTGTTTGCACCAAGATTGCAGAGACCGAGAGCTCACGAGGTCTTAGGGGAAGTGCAAAAATTCGGATAGAAGCACTTTTGACCCTACGTGTGCTTGTAGCAAAGGTAAAAATGAAGTTATCTTGTTGCTTATTCCCAAAGTTGCTAGTCGAGCAAGTCGATTGTGAGTTGAGGGGTGCTCGACTCAACTCGAAAATAGCTACTTGCTCGTGCTCTAAGTTGATCTCATAACTAGAGAAGCTAAGTACTCGACTCACTTGAATCCATTTTTTTCCTTTAAGCCCGACTCTAGTTCATCAAGTGCTATGCTTAGTAATTGAGCTGAGTTCAGTAATGGACTCAATCCCACAGGGCTCATTGTAGAACTTAATGCAAGCCTATGAAGATGCCGAAGTTAAAAAAAAAAAAACTTGAGTTAGCTTGTGTTTATATTTTTATTTTTATAGTCGTTCTTTCCTAGTACTTCCAATTTTTTTTTCAAGGTGGGGTTTTGAACTTTATGCTACATTAAGAAGTCTGGTGTTTCTAAGAATTCTTTTCTTTTTCATAAACTTTTATTTAGTTTATGTATTTATTTGCATTTGTTAAGTGTGAAATTTCTCTTAAAAAATACCAAATTATTTTTAAAAATATAGTACTAAGTCACTACATATTTCATTCTCCCTCCGTCCCATATTTATAGTTCCGTTTGACTAAATACACGGGTCTTAAGAAAAGTGGAGTGTAGTACATATGAAAGTGTAATATAGTACATTGATAATTGTAGAAAGTGGAATATAGTACATGGAAAAGGGAAATGTAGTACATAGGGAAGTGGAATATAGCACATGAAATTTTTTTGTTGTGTTTTCAATGCATTTTTAATTAACTAGTTTTTAGCCCGTGCGATAAGGTTACATGTTTTTTTACATTGTGTTCCATACGGATTTGATATTTTAAAACCAAATTATTCAACACTTATTTGAAAGAGTAACAAAAATGTTGATGAAAAAGTTGAAGGTGATGAATAGAGCTAATGAACACAAAGAGTTTTTTAATTAAAATTTAAGAAAAGTCAATTAATATCTTTATTTCGAAAAAATAAAAATGAAGTAGAGTTAAAAAAAGATATAAGTGTTTGTGTTTTAAAATATTAGTATAGATATATTATATGGGAAAGTGGAGAATTTAATGGCAAAAAGTAGAAATAAGACTATAACTTTGGGAAACACGATGAGAAAAACAAGACTATAAATATGGGATGGAGAGAGTAATGAATAAAAATAACAGGAACTTAACTAGTTGAGTTAGAGCTTGCTCAATTTGACTCGTTAAGGTCCCGAGTCGACTTTTGACCGAGTTGCTCACGAGCTGCTAAACATAAGTACCATTCTTTTACCCAAAAAACTAGAATATAGTGGCGACTAGCCGACTAGTAAATCACCCGTGCGATGCACGATTATTGATCTAAATACTATTATTATAAAAGTGTTTAAAATAAATCTAATTTAATTAGGGAAAATCGTCTCTTTACATTAATAGATTAATCATCAATGTTTTATACTCTGTAGTATAATTCAGTAACTTTGAAAACAGACAATCTATATGATATCTTTTTTTAGTCAGCCAGCTCTTGGAAAAAATTGACTTCCACCTAAAATGTCCTCACTTTTGTATTTACTCTTTTAAATTTGATATTCTTAGTGAAATATATTTTGATTATTTTTGTTTTTTGAAAATTGAAGCACGTATGTCGTGCATTTAAATCTTGTGTCTAAATAACAACACTCGTGGTAGATACATGAATTTATGAAATGAGTTCTTAGGACTGTCAAATCGGGTCATTGGTCGGTTACAATTCAGGTATAATCGGGGTTTTGGTCTAATTGGATAATGTTTTGTTCAGGGTCATTATGTCCATGGGTATTGAATGTTAATTATTTTTTTTAGGGTCACTTCGGTTTTTCCCGGGTGTCGGTCGGTTGGGTCATTTTTAACAGCCATATTCTAAGCCTAATTTAAATGTTAGAGATATTGTACTTCTACTTTTAATAATTTTATTTTGAGGAATGATTGAAAACTTAATTTGTAGGAATTGGATTTCTGATCTACTATAGTTTCAATGCCACATAAAAGTCACAATATAGCATATCGATAATGTTAATTTTTTTCTTCGAGATTGTCATTGATCTACTGGAACTTACTTTTTTTTATGACCGATAACCGCTTTATGTTATGGAGAGTATATTTTCTTACTCAAATTCTGTATCATCCTTTTTAGTCGGTATAATTTTTATCCCTATCTTATCTCCGTCCATCATCAATTCATCGCCTATCCCCGTATCATTAAGGCAAATATTCAACCATCCTCATACTTAACTCCATTAAGCTCGTATTTAGCCAGTAGTCATGCATCCCCAAACAAACGATGCATGTATCATATCTCTTAGCTAGGTTTATTTATAGAATTAAGTAGATAGAGCTAATTGTATATGGTTGCATATGGTTGCATATTTATGTATAACTTCATATCCACCTGCTTGCTATAAAAATATATTTACGTATTTCTTCTTAATTTTCTCAATGGGAAGGTTTGTAGATTAATTTTACAGGAATATTCAGTAAAAATCAGTTTCACTGTTAAAACAAGTTTCAATAAAAAACAAAAATCAGTTTTTATTAGTGAAGAGAATAGGACATAAATGGTCATTCTCATTCTTGTAATGAAAATCTGAGTGATATTTGATACCTTCTCAATGATTCAATGAATGTCCATTCCCCTTTGGCAGGTTGGTACTCCAGATGCACTAGCTTTCTTTCTGCCTGGAGTTGTTAGTAAATTGGCTAGAGTTCTGAATGTCTCCAAATCTATGATTAGTGGGGCTGCTGGAAGTACAGAAGCAACTGATCATGCAATCAGAGGCTTGGCCGAATTTCTCATGACAGTCCTTCAGGATGACTCCGGTACACGTGACCCTCATGCGCT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MELQEGFSMSDETQNSSFFFQLKSCCLELLDLLHQPKKQSCALSQLLVLLRSSTSEAIQPLFDYTLFPLLLLLDAAVDCRSVQKRNSEEKSAILFAKNNVSDAVSEGVLQCLEELLTKCCLGSVNQMTVVLKTLTHGAMLSPSEAAEEFRGGVVKCFRTLISNIILCSDTSCSCKESFSRPPLLDIEDLKCSTVEHLEHHSYPKECLIAFLQSECASAAVGHWLSILLNIAETESSRGLRGSAKIRIEALLTLRVLVAKVGTPDALAFFLPGVVSKLARVLNVSKSMISGAAGSTEATDHAIRGLAEFLMTVLQDDSGTRDPHALVNSLPGFLSHENESPQSFMEELRHLHVKAEDRIPNPANESCVNAVIVIGELLEKQSPNISGGLGPLHVKRTRDWLEKTSVNVNSLLSNLFPHICVHPSKRIRRGLLSAVHGLLSKCSCILKESRLILLECLCYLVCDDSKDVSIPAQDFLGFLFSSNGKYVIEDDLAEIFNRLLEKLPKLVLGCEESLALASAQQLLAVIYYSGPQLVYNHLLCSPIKAAKLFDVFSLCLSEESVFAGSLGKLVVSRPSSTGYLHSLAELKVGSIKSVDQYPVINASTSDISNMRTLVQEIQYSEGQTYENYELPRMPPWFESVGSHKLYEALVGILRLVGLSLISVRSNEVPLSKVIEIPLDNLRKLVSEIRSKEYNRESWESWYTRTHSGQLLRQAGTAACILNEMLFGMSDQAINLFEKIFHKSGAKLEEKQKSYATSFGQPCQVQYHAADGSLWRTNGAENMKQHVIGCVGTILHEYIAPEIWDLPVIHETSLFLSGWKSESINKHFFHDVAALHQEMAFSQLVLIEGIGIFNMTLGEHFASSGFLCSSLYLLLENLMCSNSDVKHASDVVLRLISSTSGCSSVGHLVMLNSDYVIDSLCHQLRHLDLNPHVPDVLSAMLSCVGVTHKILPLLEEPMRSVSMELEILGRHQHPELTIHFLKAVVQIVKAAKHEAHLLPAQAESFLAYVNREASDVKKELGRDTICAGEPDNCAFFDDLDENMEQWESILLKLNDKKRYRRIVASIAISCLTAVTPLVASEKEPICLIALNIIEDGIATLEKVEEAFRLEKETKEGIEEVASLCSFYNLKDILDAADDGTDENRLLPAMNKIWPYLVVCVRNRIPVPVRRCAEVISNVVKICGGNFFSRRFHNDGSHIWKLLCSSPFKRKPNLSDEKGPILPYRSTSHTLEDPVSESSNLKTQIAVLHMIAELSQDKNSASALVLVFKKVSGIVVGIACSGVTGLWDASIDALSGLASIDPDLIWLLLADVYYSLKEGDMQPPNSIFPHLGEILPLPMSSKDYLYVQYGGQSYGFDLHFLSVENAFKKLYPEMFVILAQH Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo13329.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902175781|gb|KNA08663.1| (hypothetical protein SOVF_160610 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 2713.3 bits (7032), Expect = 0.000e+0 Identity = 1378/1378 (100.00%), Postives = 1378/1378 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902175782|gb|KNA08664.1| (hypothetical protein SOVF_160610 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 2684.8 bits (6958), Expect = 0.000e+0 Identity = 1370/1386 (98.85%), Postives = 1372/1386 (98.99%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731318932|ref|XP_010669990.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104887100 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 2031.9 bits (5263), Expect = 0.000e+0 Identity = 1052/1380 (76.23%), Postives = 1178/1380 (85.36%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870866379|gb|KMT17361.1| (hypothetical protein BVRB_2g038170 isoform B [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 2029.2 bits (5256), Expect = 0.000e+0 Identity = 1050/1378 (76.20%), Postives = 1177/1378 (85.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731434678|ref|XP_010645148.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100246156 isoform X2 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1503.8 bits (3892), Expect = 0.000e+0 Identity = 809/1386 (58.37%), Postives = 1021/1386 (73.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QPP7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_160610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2713.3 bits (7032), Expect = 0.000e+0 Identity = 1378/1378 (100.00%), Postives = 1378/1378 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QN33_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_160610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2684.8 bits (6958), Expect = 0.000e+0 Identity = 1370/1386 (98.85%), Postives = 1372/1386 (98.99%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8FNH3_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g038170 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2029.2 bits (5256), Expect = 0.000e+0 Identity = 1050/1378 (76.20%), Postives = 1177/1378 (85.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6H9X3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_19s0085g00130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1510.0 bits (3908), Expect = 0.000e+0 Identity = 811/1386 (58.51%), Postives = 1025/1386 (73.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061FHK9_THECC (ARM repeat superfamily protein isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_032895 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1458.7 bits (3775), Expect = 0.000e+0 Identity = 787/1367 (57.57%), Postives = 999/1367 (73.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TTI1_MOUSE (TELO2-interacting protein 1 homolog OS=Mus musculus GN=Tti1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 5.300e-17 Identity = 127/482 (26.35%), Postives = 205/482 (42.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TTI1_HUMAN (TELO2-interacting protein 1 homolog OS=Homo sapiens GN=TTI1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 6.500e-7 Identity = 39/122 (31.97%), Postives = 61/122 (50.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13329.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G79190.1 (ARM repeat superfamily protein) HSP 1 Score: 1287.7 bits (3331), Expect = 0.000e+0 Identity = 722/1380 (52.32%), Postives = 935/1380 (67.75%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo13329.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo13329.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo13329.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 2
BLAST of Spo13329.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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