Spo05106 (gene)

Overview
NameSpo05106
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_00605 : 221596 .. 228763 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGAACCAACCTCGGCGATTGCCTTTCTATTTTCTCTAGTTTTTCACGAGTGTTTGAGGGATTGCAAAAACTTGAGGTATGAGGTATATGTCTATATTTATAGGGAAGGCATACAACAGGGTTATCAATTTGAGTAGTTAGATATTCTACGGAGATAAAGATGAGATTTCACGGTTAAGCTCTAGAATGATAGTCTTAGATAAATTATTTAGAGTTGGTTTGTTGAGAGTTTATCCTCCCTTGAATTTAGCTTGATACGAAAATAAGTTGCAAATGATAAGGATGCTTCAAAATCATATTTAATTCTATTTTTATTTTTATTATTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAATAAACACGTGAGGTTTGTCAAGGAGTAAGTTGTGATACGGTGAGGATTATCCAAATTGTGATAGGACTTTATTTTTTTTGTAAAGGAGATGTGAGACCATAGACTACGGAGTTGACCTCTTTTTTATAAAAAAAAAACTAATATTATTTATATAAGGTTATAAATGTTAGTAAAACATGGGGTATTACAATTTTGATGTAATTTTTCAATTATTTCTAGTATTTCTAGTTTAGAACTTTAAGTTAGCATATTGAATGAAGTTCAAGACGATGCCAAGCTAACAAGGTGAAGAAGAATGGATGCTTCAAGACAAAGTTTTGGGCCATACTAGTTAGCATATATTGTGAATGAATGTATATTATGCATGAATGTTGTTTGTATGCTTGATTAGAATTAGTTCACTAAATAATCGAACCAACATAGAAACAACTAGGTCCAAAGTAATATTGAGGTTTAAAATTGCCTTCCAAATGAAGCACTTACAAAAATCTAAGGATCTAACGTAGTAGGTTTCAGCCAAAGCGATATGCTATTTTAGTTGACTTAGATGGTAAGGTATCCCAAAGGAACATGTTGATTGTGGTTTTAACTCAAACAACAATGGCATATGTTGTGGCAATGGGATAAATTTATTAACCAAGAGTAATTTGGAGATTACTACCAATAGGTTTTGCTTACCTAGAATCTCAAAAGACTTAAGACATGTCAAAGCTGCTTAAGGATTTATGACTTTTAGGGTCTTGGAAACGTTTCATTCATTTTGGACCATGTTTTGCATTTGCATGAATGAAATGTTTAATAGCTTTAATGATTGCATGTTAGAATTTATTTAAAAGTTATTAAGGATTATGAATGGTTATTTATTGCAAATTCTTTTCAAATGTAGTAATTAAATGGCCGCAAACAATAACAACTCGTTCAACCTACGTTCAATTCTCGACAAAGAGAAGTTGAACGGCAACAATTTCCTTGACTGGCAAAGGAAGTTGCAAATAGTTCTAATGCATGCGGAAAAAGAATATGTCCTTGAGGAAGAGTTACCAGAGGCCGCCGGGCCGGAGGTAACTCAAGCTGCCCTTAACCGTTTGATCCAGGACAACATGGATATCAAATGTGTGATGCTTGCATCCATGAATCCTGAACTTCAGAAAACGTTCATTAACTCGGAATCACTACAACGTAAACGAGCAAATGCAAGGGTTTATTGCAACGGTTAAAGCTAATGCAACAGGCAAGTGCAACGGTTAAAGCTATTGCAACGATCTAATGCAACGATTTAGATTATTGCAACAGGTAGTGCAACGGTTATATTTATCGGAACGGTCTTTTGCAACCGGTACCCGCACACCGTTGCAATAGCCCCTCAAATGCAACTATTGTTTTAGCTATTGCAACGGTATCACTACACCTGGAAAAGATATTTAAATTGACGAACAAATTGAGACTCATAGGAATTAAGAGTCCTCTTTCCAGAACCCTCTTTTCTGAATTCTTTCTCAGGCCCCAAACCCTCCCTTCCCCTTTTACCTAGTCCTCACTCCCATAGTTCAATTTCCAGCAGTCTCCACCACATCGCGTCCTCGTCTTCTGCTGTTCATTTTCTCTCATACAAGTTTGTTCCTTTTCTCTTCCCTCTTTAATTTGGTCGGTGTTAATTTTTAGTTTCCTAATATAATCTTCTATTCTCTCTCCTCAATCCATGTTCTCAAAGAATCACAGATTTACATGTCAATTGGTTTCATCGAGAGATTGAGACGGTATTCGTGGTATTTCTTATGATTTAAGTTTAATCGCAGGCATTGTAATTTCTTTTACCTTGCAGACGTAGATTGTAAGTTTATTTACTTTGCCATTAATTTGCAAAATCCATAATTTTTAGTTTCTTCATTTTTTGTCCTTATTCTTCTTCGCAGATCTGTTGTTTATCTTTAGTGATTTTGATTCAATATTTGGCATGATTGATTTCTTATTTTATTTGGGTAATTTATGGGTTCTTTTTATACTTTTGTTTTTACTTGATTAAAGAATCGGAAGGTAGCTCACGCTCTGTCTAACAATAGGTAATGCAATTTATTCTTTATTTTTTGTTGATGCTCATTCATCTCTATTCGAGTTTAATTCAGACTTGCGTATTTAGGGTTTATCTTTGAATTTGGGTAAATTGGTGGTTAAAGAGGATTTGAATAATTACACTTAATCGTGAAGTTTTGGTAAATTGATATTTGGTTCCTCCGATGAGAACAATTTTTCATCCGATTGAGTGATAACATGTAAATACACACGCATGACTACTCTTAAAGTAAAAACTAAGAAGTGTAATTTATTTGGATATTACTCCGTAATTGTTATTGCTTTTGAAAGTGCATGATTTCATGTTTGGAAATTAACTAGAGGGAACAATTAAATCATGTTATCTGTTAGTGGTGATAGTTTTGACCTCTGTTATGTCCTGGTTAGTGTGTCCCTAATATAGTACCTATCTTAATTTTTAGCTTGATTCAAGTCTTGCTTGTTAGCAACTGATTGCGCTTTATGCGATTGTGTTCAGCAAGTGATAGTGCTTGGGTATTTGATTAAGTTGCTTGCTTTGTTGGAGAATCAGATTAGTTTAAAGTGCGCGCAATAGCTGTGTTGGTATTCTGATCCTTAAGGACTAGCATAGGCCATCATTTGGAGTTTAAAGTGTCTATTTATCAAACTTACATTACAATCACATCTAAACCTTAAGCTAAAGTAATTAATGATAATTTTGTTTAATATTATTAGGATTAGCGTTTTAATTCCGTACATTATAATCTCATCCAATTTTTATGGCTAAGACAACATAACCATGTTTTCTTTCATATGAAATATAGGAAAAGGGCGTTGGTTCTTTACCTTGATTATTAATAAGAATGTTTTTCTCTTCGACTTAGTTGCATTGTTATATTACATGTAGTACTGCTATATGGATAATGGAACAATGAGCTAGCTTACCATGTACATAAATAATATTGTTGCTCTACTAGTCGTCGATTATCAATTCACGTGTAGTGTTAAATAAAACATTTTTTGTTGAAACCTGAGGATCATGAGAATCAAGTCCAATATGTCCTAGTTGTATAATAAACAAAAACTCAGTTTAATAAGTCCTATGTAATTGGTCTAGTTGTTTTTAGGCTCTGTTTGTGAGTCTGGGCAGTTTGTTCAGTTTTGTCATGAGGGTTGCCCCTTGGTCACTTCTGATTAGGTAAGAAGTGTTTACTTGTTGCAACTTGAAGCTAACTTGAAGCTACTATACTTTCACTATCTCATTCTTGTGGTTGTGTTTAATACCTGGTATTCACTATGATACATGAGTTGTTGAGTTGACTTCCCAAAACCTTGGAGGGTTCCCGCTCAAAATTAGTAGATTTAGTTGGTTAAGAAATTTATATAACTCTATATAACCTTGGAGGCTTCCGGAATGGTGTAACCGTACCTAACTTTTTGAAGTGAGAGTGGAGTACTTTTCATAGCATTTTTGAGAAATAATGGACTGTTATCAGGTCACTGCAAAGCTAGGAAAGTGGACTATTTATATTCTTAGTTGTATCTGGAGTTATAGTTGCTACTGGTTATGTATTGATGAAGGCAAGTGTGTTTTTACAAGGTTAAAGTTGATACTAATTGGTTCTTGTAAGTTAAAACACTTTTTGCTTGCTTCTTTTGACCTTTTGATAACAAAAATGCTTTTGGGGGCTGGAGGACCCTAGTAATAGGAGCAGATACAAACTAACACTACTCAGGGCCGGTGTAACCCCTGTGCAAGCTGGTCTACTGCACAGGGCCACCAATTGATAGGGGCCCCAAAAAAATCAACCTGTTTCTGATTCTTAGTATAACTTAAAATCGATCAGTTAATGGTGATGAAAAAACTCTCTCTCTTCCCAATATTTCTCGGTTTCCATGGCAATCAAACTAAACGCATTCGTATTGATTTATCAATTTCCAAAAAGCTTCAACTCTCTAAACCTAGCAATGTTTCTTGGCATAATACATGTAGTAGCAATCAAACAGGTGGGCTAGGTTTTAGAGATGTTGTTCTTTGGAACACTGCAAGCATGGGTAAATATGTGTGGGCTTTAGCTACCAAACAAGATAATGTTTGGGTTAGATGGGTGACTTCTGTGTATTTAAAGAATGGGGAATGGTGGGGATACCAGCCAGGCAATAGTGCAAGCTGGTATTGGAAGAAAATTTGTGAAGTGAAAGAAGTACTGAAGCAAGTCTATTCTGAGAATGAGTTTAGTAATATGCCTCACTACTCTATGAAACAGGTGTATGAGAAGTTAGCAGTTGATAAGACTAAGGTTCACTGGGACAAATTAGTGTGGAATAGGCTCAATACTCCTAAACATAGATTCATTGCTTGGCTTGCTATTCAGGCTAGACTGCAGACTACAGCTAAGCTTGCAAAAATAGCGATTAGTGCTTCTGCTACTTGCCTGATTTGTGGTCAGGGGGATGAGATTCATGATCACTTATTCTTCTGGTGTATTATAGTAACATGTGTCTGAAAGAAATGAAGAAGTGGTTGGGTTTTCAGTGTGGAAACAAATTGCAGCATATTTTCAGAAGCATCAGTCACAGTAGAAGGTCCAAGTTCAGAAAACAGGTTGTTTTTGCAACTGT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mRNA sequence

ATGGGAACCAACCTCGGCGATTGCCTTTCTATTTTCTCTAGTTTTTCACGAGTGTTTGAGGGATTGCAAAAACTTGAGTTTCCTAATATAATCTTCTATTCTCTCTCCTCAATCCATGTTCTCAAAGAATCACAGATTTACATGTCAATTGGTTTCATCGAGAGATTGAGACGGATCAACAACCAAATTGATTGGACAAAAAGGAATTGAATTACTTTATTGGGATTAAAATTGTTTGGTGGTGGGCCTCAAAAACAAGTGTTAAACACTTAGAATTATTTAGCTTCTTCCATAAATATGTTATACAGATTATTTTAGTTTTGATGCAAATATTACTTATACAATTAAGTATTACTCAAGTTCGAAGTACTTCATTTTGTAAATTGTCAATAACAATTGCGCGATAATGTACATATTTTTGGATAATATTAGAAACATTGAAAATTTTATCACCCTTCATTTGTATTTATCTTTTGGCC

Coding sequence (CDS)

ATGGGAACCAACCTCGGCGATTGCCTTTCTATTTTCTCTAGTTTTTCACGAGTGTTTGAGGGATTGCAAAAACTTGAGTTTCCTAATATAATCTTCTATTCTCTCTCCTCAATCCATGTTCTCAAAGAATCACAGATTTACATGTCAATTGGTTTCATCGAGAGATTGAGACGGATCAACAACCAAATTGATTGGACAAAAAGGAATTGA

Protein sequence

MGTNLGDCLSIFSSFSRVFEGLQKLEFPNIIFYSLSSIHVLKESQIYMSIGFIERLRRINNQIDWTKRN
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo05106.1Spo05106.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo05106.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo05106.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo05106.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo05106.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0048657 anther wall tapetum cell differentiation
biological_process GO:0000271 polysaccharide biosynthetic process
biological_process GO:0007169 transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
biological_process GO:0010103 stomatal complex morphogenesis
biological_process GO:0009069 serine family amino acid metabolic process
biological_process GO:0048767 root hair elongation
biological_process GO:0010224 response to UV-B
biological_process GO:0043481 anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light
biological_process GO:1900140 regulation of seedling development
biological_process GO:0010817 regulation of hormone levels
biological_process GO:0009911 positive regulation of flower development
biological_process GO:0002237 response to molecule of bacterial origin
biological_process GO:0010584 pollen exine formation
biological_process GO:0060548 negative regulation of cell death
biological_process GO:0009825 multidimensional cell growth
biological_process GO:0048366 leaf development
biological_process GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus
biological_process GO:0042742 defense response to bacterium
biological_process GO:0071555 cell wall organization
biological_process GO:0009932 cell tip growth
biological_process GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway
biological_process GO:0018108 peptidyl-tyrosine phosphorylation
cellular_component GO:0032991 protein-containing complex
cellular_component GO:0010008 endosome membrane
cellular_component GO:0005886 plasma membrane
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
molecular_function GO:0005524 ATP binding
molecular_function GO:0046982 protein heterodimerization activity
molecular_function GO:0042803 protein homodimerization activity
molecular_function GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity
molecular_function GO:0005496 steroid binding
molecular_function GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
RNA-Seq Expression