Spo26533 (gene)

Overview
NameSpo26533
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_01347 : 104644 .. 116273 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCGGCGAAGGAATGCGGCAAAGGTCTGCGATTTAATGTCGGCGATGATTAGAGGCCGCGGTTGTGAGGGTGGAGGCAGCTAGGCGGCTGTTAAATAGGCGGATGGACGGTGTTGGTTATGGAGGTGGTTGACGTGAACACGGGATTGAATTTGGTGGTTGTGAAGGCGGTGGTTGATTGAAAGAGAAGAAAGAGAGGTGGAGCAGCGGTGTGGGTATGGGAGAGGAGAGAGAAAATGAGTTCTTGTTGGAGGACAAATGAGACGTGAGTTTTTGGATTTCAAATCCCCTCTTTTCCCATGTTATTTTAAACTAGATTTTAACCCGTGCGATGGACGGATTCTATTAAATTTTTATGTTTAAATAAAAATCCTATGTATATACCATTTTTGTATATTAGATTAGATTAGTTTTTTATTTTTCATTGGATTTCATTTTAGATTTTTTTTATTATGAAAGTGTTTGTTTTTGGATGAAATTGTATATGCGTAATATTAAAAAATAATTAATAAAAAAATCTACGTGAAAGTTAATAATTTCTTTACGTGACACTCGTTTTTTTTAATTCAAAATTAATTTTGAAATCTTATTTTTCATTGGCCGAAACCATTAGAATTTTCTATGTGGCGCTCTAATATTGGATTAATATTTGATTTTAAATTGAATTTTATTTAATTTATTTTAGATTATTGTTTGATTTTGGATGAATTTTATTTAGATTTATTTTTTAATTATTAGAGTGTTTGATTTTAGACGGAGTTGTATATATATTAGTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATATCTACGTGACACCTAATTAATTATCTACGTGGAAATCGATTATTTTTTAATTATTAGAGTGTTTTATTTTCGATGGAGTTGTATATATTAGTAATTAATTAATTAATTAAAATATCTACGTGGCACCTAATTAATTATCTACGTGTCACTTGATTTTTAAATTCAAAAATAAATTAGAAATATTATTTTCCATTGGCCGAAACCATTAGTAATCCTAGGTGGCGGCGTGGCGCTCTAATATTTCAGCAAATATTCGTCCATTGGCCGAAGCCATTAGATTTTTCTACGTGGCGCTCTAACATTGGATTAATGTTTGATTTTAAATTGAATTTTATTTATTTTATTTTAGATTATTGTTTGATTTTGGATGAATTTTATTTTAGATTTATTTTTTAATTATTAGAGTGTTTGATTTTAGATGGAGTTGTATATATTAGTAATTAATTAATTAATTAAAATATCTATGTGGCACCTAATTAATTATCTACGCGACAATCGATTATTTTTTAATTATTAGAGTGTTTGATTTTCGATGGAGTTGTATATATTAATAATTAATTAATTAAAATATCTACGTGGCACCTAATTATTATCTACGTGGCACTTGGTTTTTTTAATTCAAAAATAAATTAGAAATCTTATTTTTCATTGGCCGAAACCATTAGTAATCTTAGGTGACGCTCTAATCTTTCAGCAAATATGCCTCCTTTATATATGTATATTAGATTCCAGCAGTAAGGTTTAAGTGTTAAAAGGTTTGGAATTGGGCCAAATCCAATTTCAAATCCTTTGCATTCCCAAACAATAGATTTGGCCCGATTCCGGGATTTCAAATGAAATCTTCTTAACCAAACAGGCCATAAAGTTATTTGGTTGAACTTCATCATGTGTTAAGTTCTAAATAACGAAGTATATACAAGTTACAAAGAAAGTACATCGAACCCCTTACTACCACGTTACGTGTACATGTGTAGGGTGGTAGTTCTTCCGTGGTCTATCAGAAGACACCCGAACACATCAAATTGTGATCACAATCAACTAATCAAGCATATAACATTGATTCCCATGTCATTCTTTAGCTAAGTCTATAGCAGTTGATTTAACAACAGATGGTCTTAAAAGACTAGGACTTTAGACTTCAGTCTGTAAGTTCTTCAGTAAATAAGTAATGAGTCAGTGTATCATTCAGGTCTCTCTCGGAACTTAGTATCCTTCCATGAAATTACCAAACTTAGCCTTAAAAGAAAACAAAAGAGAGAGTGTGAGCAGAAAAATGTCACTCCAAAGTCTAGAGACGATGCATCATGAAGTTACATGCACAACCAAAAATGTTATATTATGTAGTGTCTCAGAAATTAATAAACAAATGGTACCGTGCAAACATATGTACGGACTATATATATTTTACATAAGGCAGCATATAGATAGCCAGAGATTAGCTACGCTGCAGGAAACTCTTCCTCAAGTCTCATGAGTGATGTACGCTCTTGGTGGAATCTAACATCTACGAATTTGCTGTTCAAGGATACTGGTGCATTATCAGAATGACCGTTGCCAATCAGTTATGCTTGAACAGAAAAGAATAAAAAAGTTAAAGACTTAAGAAAAAAAATTAAAAAAAATTCTAGTGTATTTACTATAAATAGGTTCAATATTTTAATTGCAGTAGATGGGTTAATCTTCCATGGGATCGGTCTCTATTTCTTGAGCCAGTTCCCTTGTCAGGCTATCTGCGCGTTCATCTTGTCCTCCTGCAAAGGAATAAACCTTAAAGGCGAACTGAAAAGCCCTCCAAAGCATTTTAGCACACACATTTTTCTGCCCTCCTGCTTTGGACCATGCTTGATCATTTGTTTGTGCCTTCGCATCTCTCCTTTCCTGCAATACAAGAAAAAAATAATATTGTTTTATGACACTCAAACTCTTCAATTTACTTAAAAGAGGAAACATGTAGAAAACTAGGAAAGAAATTGGTTGGTTTGGTGTAACTACCTTTAGTGCCAATTCCATGCAGCTTGATGAGACATCTACTATTGCTTCCTTAATCTTGACAAGAATTTGAAAGTCGAAGTGGATGTTGTGGCTTAGAAATTTCTTTGCTTCTTCATCTTTAGTTCGTTCCAAACCTTCTAATTCTCCTTTAATCTGTATGAAATCGAAGTTTTTTGTTATATTGAAGTCATGCTGATATATAGTTGCCAAAATGCTACTTTAATATCCATGTTAGAGCCTTATCTGTGATCTATGCATGTTTCTAATGTTCATTTACCTTGTTGAAGTATTTTTCGACTTTGTCAAGAAGTGGGATCAAAGGACACTCCAATTTCCAGTTATGTAATTCAGATAATATTCCATCAAGCTTTTTATACAACGCTGCTGCCATCCTCAAGGCTTCTAATTTTTTAACTGGAAAACCTTCAAACCTTGCGAAAACCTGGCTCTCATCTGTGAGGACTTCAAGCTTGGATTCTACTTGCTGATGGAACTTGATCAGTTCATTCATGTCCTTGGTCTGAAATGAGGTCAGGATACCTTGCATCTCTTTAATTGCTTTTCCGTGCTTTTCTACATCTTCTTCAATTTGCATAAAGTATGCTGATCTGAAAATTCAGTATAGCAGCACTTAAAGTAGTATTCTTCTATAGTACATTGTTAATTAGTACTATTACACAATTCAAATGTAGAATGTAAAAATCATTTATATTTTCAGCTTACCTTTTGGTCATTTCTGCAAGTGCATCAGCCATGCTTTGTCCTCCACCACCACCACCATTACCCCCGCCTCCCTTTTTCCCCTGTGATGATTTTCCTGTTAAAGATGAACCTTCCACCTTTCCCTTGAGCAACCGATATAAGTTCCCCATGTGAGAGGACCTTTTTAATTTTGTGGTGCTCTTTGCACGTAGGGACCTTGCACCTGGAGGAGGAGGTGGTGGCCCACCTCCTTTACCAGGCATGGGTGGTGGTGGTGCTGGTGTGCCACCCTTTGAGCCAAATGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTCGTGCAGCTCCCCCAGGAGGTGGCGGAGGAGGAGGGGCCTTTGAACCAGGGGGTGGAGGTGGTGGTGGAGCTCCCCCGCCAGGTAGTGGTGGAGGAGGAGGGGCCCTTAAACTAGGTGGTGGAGCTCCTGCATTGAATGGGGGTGGAGGTGGTGGTGGAGGAGTTGTAACTACAGAAGAGGATGACGTTGGTGCACCAGGAGGTGGTGGAGGTGGTGGCGGAGGTGCTGTGACTGCAGAACAGGGTGGAATTGGTGCACCAGGAGGGGGTGGAGGAGGTGGAGGTCTCGTGATGTAAGGCAGGGGTGGAGGGGGCGGAGCACTGGAAACAGATAGAGGAGGAGGAGGTGGTGGGGGAGGCCCAAGATTTAATGGTGGGTTACTTGGTGGCGGAGGGGGTGCAGTTGATTGTGGTGGTTGTGGGGGTTGTGGTGGTGGCGAATGCAGGAGCTTGATTGGTGGGAATGATGACATGGCAATTGGTGATGATGGGGAAGATGGTGGTGGAGTAATTGTTTCTTCTGATCGATGTTGAGCTAGTGGAGGTAGTATTAGTTTTAGCTTCTCTTGATCAGTGGGCCCCAACTTTGATTTTAAGCATGGTAATTGAATTTTCTCTTTGTCTTCCATGTCTATGACCATGGGAGTTGGCCCATGTTCTGTACCTTCAACCTTTACCTCATTCTTTCCATTTTCCGTTTGGATGGCAGTTGGCCCCTCGCCGATTTTCTGGTTCTGATTCTGCAAATTATTCTGAAGGATCATCTGGAAAGAAAGGCGCTTCCAATCCATTGCGGTCAATTTCTCTACAGCTTGAACCCTGAGGTCCCACAGACGCGGGGGAGAATAGCTTCCACACTCTCCATATCTTGGGGACTCAGGTAGGACTGAAGTTGGGGTTTGTGGTGAAGCACAAGTTGATGCACTTACATCAAATGATCTCCTGTCAAAAGATATGGACCTTGAACTTAAGCTTGGGCTTGAGCACGAGCTATACTCCCTCTTTGGTTCATCCTCGTCCATCAAGTCAAACCTCTCTTTCGCTGTCCTGTTAATGCAGTCCAATATTGCCACCACTATCTTAGCTGCAAGACATGAACAAGTATCCTATTTTAGGAAAAGAAATTTCTGCAGCATTGGAGCATAGTTGAAATAAACCTAAACATACCGAGTTTT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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGTCGGCGAAGGAATGCGGCAAAGCTTACCTTTTGGTCATTTCTGCAAGTGCATCAGCCATGCTTTGTCCTCCACCACCACCACCATTACCCCCGCCTCCCTTTTTCCCCTGTGATGATTTTCCTGTTAAAGATGAACCTTCCACCTTTCCCTTGAGCAACCGATATAAGTTCCCCATGGACCTTGCACCTGGAGGAGGAGGTGGTGGCCCACCTCCTTTACCAGGCATGGGTGGTGGTGGTGCTGGTGTGCCACCCTTTGAGCCAAATGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTCGTGCAGCTCCCCCAGGAGGTGGCGGAGGAGGAGGGGCCTTTGAACCAGGGGGTGGAGGTGGTGGTGGAGCTCCCCCGCCAGGTAGTGGTGGAGGAGGAGGGGCCCTTAAACTAGGTGGTGGAGCTCCTGCATTGAATGGGGGTGGAGGTGGTGGTGGAGGAGTTGTAACTACAGAAGAGGATGACGTTGGTGCACCAGGAGGTGGTGGAGGTGGTGGCGGAGGTGCTGTGACTGCAGAACAGGGTGGAATTGGTGCACCAGGAGGGGGTGGAGGAGGTGGAGGTCTCGTGATGGGTGGAGGGGGCGGAGCACTGGAAACAGATAGAGGAGGAGGAGGTGGTGGGGGAGGCCCAAGATTTAATGGTGGGTTACTTGGTGGCGGAGGGGGTGCAGTTGATTGTGGTGGTTGTGGGGGTTGTGGTGGTGGCGAATGCAGGAGCTTGATTGGTGGGAATGATGACATGGCAATTGGTGATGATGGGGAAGATGGTGGTGGATTGGCCCCTCGCCGATTTTCTGGTTCTGATTCTGCAAATTATTCTGAAGGATCATCTGGAAAGAAAGGCGCTTCCAATCCATTGCGGACTGAAGTTGGGGTTTGTGGTGAAGCACAAGTTGATGCACTTACATCAAATGATCTCCTGTCAAAAGATATGGACCTTGAACTTAAGCTTGGGCTTGAGCACGAGCTATACTCCCTCTTTGGTTCATCCTCGTCCATCAAGTCAAACCTCTCTTTCGCTGTCCTGTTAATGCAGTCCAATATTGCCACCACTATCTTAGCTGCAAGACATGAACAAGGTACATTCGATGAAGGTCCTCTCCTGTCAAAATCAACAGCTACAGGGAAGAAGAAAATGATATTTCTGACCAACAATAGCAGAAGAATGCAGAAATATTCAAACAAGAAAAGCCGCCAATATACCTGTAATTTGACCGCTTTTCGACGAAACAACGAAGGAATGCAAGAAGTAGCTCCAGCCATTAAAAAGCATGCAGGGCATTTGTACTCAGATTTTGCAAGGAAAGAAAGGAGACGTTGTCGGTGTCGTGGTCGGGGTGGGGGTCGGGGTGGGGGTGGGGAGAAGGGTGGTGGCTCTCCACAAAAGAGAGAAAAGGGAGATTTTTCTTTTAAGAAGAGACCGAAAACACTAGAAGCGAACTTTGCCCAATTCCAAACAGTGATGAACATCTATTTTGTTCATCACAGGCTGATTCAATTCCCCCATCCACTGCCAACATCCAACACAAGCCACCATCTACAGCGGACTTCCACCTCTACCTTCACCGCCTCTGGTGGGGCTACACCCCATCTCATCATCGATAATATCTGA

Protein sequence

MSAKECGKAYLLVISASASAMLCPPPPPPLPPPPFFPCDDFPVKDEPSTFPLSNRYKFPMDLAPGGGGGGPPPLPGMGGGGAGVPPFEPNGGGGGGGRAAPPGGGGGGGAFEPGGGGGGGAPPPGSGGGGGALKLGGGAPALNGGGGGGGGVVTTEEDDVGAPGGGGGGGGGAVTAEQGGIGAPGGGGGGGGLVMGGGGGALETDRGGGGGGGGPRFNGGLLGGGGGAVDCGGCGGCGGGECRSLIGGNDDMAIGDDGEDGGGLAPRRFSGSDSANYSEGSSGKKGASNPLRTEVGVCGEAQVDALTSNDLLSKDMDLELKLGLEHELYSLFGSSSSIKSNLSFAVLLMQSNIATTILAARHEQGTFDEGPLLSKSTATGKKKMIFLTNNSRRMQKYSNKKSRQYTCNLTAFRRNNEGMQEVAPAIKKHAGHLYSDFARKERRRCRCRGRGGGRGGGGEKGGGSPQKREKGDFSFKKRPKTLEANFAQFQTVMNIYFVHHRLIQFPHPLPTSNTSHHLQRTSTSTFTASGGATPHLIIDNI
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo26533.1Spo26533.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo26533.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo26533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo26533.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo26533.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0055114 oxidation-reduction process
biological_process GO:0006979 response to oxidative stress
cellular_component GO:0005576 extracellular region
molecular_function GO:0020037 heme binding
molecular_function GO:0046872 metal ion binding
molecular_function GO:0004601 peroxidase activity
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo053300.70Barchart | Table
Spo026670.66Barchart | Table