Spo16260 (gene)

Overview
NameSpo16260
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_01493 : 22870 .. 35126 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAATCAGATCCTCAACTAGCATTAGAATTTTTTGGAAGTCCAGGTAAACGATGCCATAAGTAAAAAGATATGCTGGTCTGATTTTCTTTTTAATTCTGGATTTTAGTAAAATGATATACTTCTATAGTTCTATATGCTATGCTTAATGGTTGTCATCATAATTGTATTGCTTGTCCCTCAACTAGCATTTGATATTTTTTGGAATGCCAAGTAAGCCATGCCATGAGTAAAAAGATGCACTTGGAAATTTTTTGTGAGTTCTGGATTTTAGTGGTAATCATTATTGTATTTCTTGTCTTGCGGCAACTATTGATTCTCTTAATTATTTCATACGCCGTTTATGAAACGGTGTTCTTCTGGAACATGAACTTGGGCTAATCTTCGTCTGCTCATATATATATTTACCTAATTCCACTTATAGTTTGTTAATTCTGATACAAGCGTTGTAAGAATGCAGAAATTTTTTCGAATGCACATAAGTGCAGAAAGCAAGCTGAAAGTTCAATTTTGTAAGTTTTGTAAAGTATTCTTGAAGATATCAATCAATTTATATTGCATCCAAATGAATTCTGGTCTTATTCCTTCAAATAAAGTCCATCCAAAGTTGTTCTTTGTCTTTTGACAATTTTAGGATAGATAAGCAAGCTTTTTGGAAGTGTTAGAGCATGGATAAACTTGGGGCCTGCTGAGACACCACCAGCTTCTTTAACATAAAGGAGGCTTTTAGTAAGAACTTATGATGTTCGCAAAGAACAGGTTCAAAGAAGACATATTGGCATAGACGAGGGGAGATCTTTCCTCAGGGATAAAATAAAACTATAGACCTCAAATGATCCCTGTTACAAAGTCATGTATCAAGTTGATCTCTTCTTTTGAGTGAATGTGAAAAACAAGTCTAAATCTTTTGTTGAAACGGCCTTAGAATCTTAGTAAAAAGATAAGATGAATGATAATAAAGAAAATATATCCATTCTATTATTAATCTTGTGGTCTTTTAAATTAAAGATTCTGGTAATACTGATTCATTTTTCATGATACGTGCTTCCTTTGATGTTTTTATCCTTATTTGTTCTTCTTCGTGCTTGGCTTTTGCACCTTGTTGGATATTTAATTTTCCTGACCTAAATTTAAATTGGCGGAGTCACCCTAACACTGTGGCTCAGCTTATGGTTCAGGACTCAGGAGCTTATTGCCCTTTATTTTTCTGATCAAGAGCTTATAGACATGTTATTAATATCATATATACGGGTATACTTATGTTTTCCGCATTCTGACCCGGTAATTAAGAAAAACAAACGAGCTTACCCACTAAATTGTGAGAAAATAAAACTCTAGTTCTGAACTTTGAGGAAATACCTTTAAACACAGGATTGTAGAAAAAAAGTTTCAATAGAGTCAACAACCCTGTTATCTTTTTCAAATCTTTTATTACCATACCAGGGATATCTTCTTCCAAATCAGGTATGATTATTTTCCTTTAATGTGTGGGAACATTATGATTTTCTTGAACAACTAAATAATTTTTTGGATTAAATAAAATGGACCAACCCTAGTTCTTAGCCCTAGTAGGCTCTATATAAAGAGGCTCTGATCACTTGTTCTGCATTCATCAAGCTACAAACATTATTTTACATATCCTTATCTGGTTAGACGAGAGAGTAAAGTTTTCTGAGGAAATCAATTCTTTTTGAGATATCAAAATCGAAATCAAATCACCTTCAATTCCGACAATGAGGAAGAGAAAAAGAAAGATCTATAATGGGATTCGAACTGTTTCATTTCCATCAAGTCAGTAAATTACCTGATAAAGGTAACGTCATTGTCCAATACTATGATTTTTTTTAAAAAAAGTTTAACTTGATAATATCATTGTTTTTGTTGTGACTTTGATAGAATATATGATGAAATTGTTTGGTGTCTGATTTTATTTGTACCCATTTTGACAGGAGGGGATCTAAGGACTCCAGAAAACACAGTGACGGAGGCGGTGAAACTAACAGAGATCATCCACGTCTTCATATCTGGTTGTTGCCTTTCTGGATTTTCGAAGCTACCCTCCATGATCTTTGCTGAAACAAGAAATTGTCCATGCTCGATTGATCTTTTGCTTATTCATGAATTCATTCATGTATGCCATTGTTCATATAAGCATGTCTCGATACAGGTACAAGGCAAGAAGGCCAAGAACGGTTTTCTTCCATACCTGTTGAATGCTGGATTGACAATTTCTTCTGTTTCAACATCTTACAAGTTAAAAAAAAAATAATGTATTTCTTTTGTTACGGGTTTTTGTATTCTTTTCTTTCGAGATTACTGATCATTTAGGGATTGTGCTTGTAGCTTGTGAATTGTGACAAATGTTTTAGTTTATAGCTCCTGATTGTTTACACGGTGGTAGCGTTGATAATCGTTTTAGTCCACAGATTCTAGACAGTTAGTTGATGTGATTCGTCCATTTTTACATGACCTTGGTCTTGATTTTACATTTTACTTTGTTAGTGATATTCAAGTGTAATACGATGAGTTTATTTTTAACAATTATGGCGTTATGAATATGATGATACATGATGTGGTGGTAATATTGGAATGTTTGTGCTTGTATATTGTTATGGTACCTGAAATTCCTGTGGTGGTATATTAGATATTCTGCTGAATTTGCATATAACATTATAACTCAAGTAAGATGTACTGAAAGAGAATACAACACTTGAAATAGAATTTATGTAACTCGGTATCCGGAAGATAAGAGATTATAACACTTAGGATCATAGATTGATTATTAATACACAAGCCACAATCATGAATTCTTCTAGAAATGCTCAAAAAAATTCAATTCAGGTATCATTTGATGTTTAGACATATAACTAGTGTTTCTCCCGGGCGATGCCCCGGGTTACAACATTGAAAAGTATATGAAGTCGTTTGTATTTCTCTATGCATTGTTTACACAATTACACATGTTGGTATGTGAGTTTGACTCTTTTTTTTCCCTAATAACTATCGGGAAATCGTTTATTTTATTCGGAGTGGCGTATTGTACGTAGTAATAATTTTTTTAAGTAACAATATTCTTAATCCTTTTGGGGTTGTTAGTTGTCGTAAACTATATCTAATATCTAATTAATGTCTTGTATGTTATGATCCATGTATGTTAACACATTTGTTGATTAATGAATGATAAAACATGTTCTATTATATACGAAAAATATATGGACAAGTAAAGATGTAATAATTGTTCGAAACCATTTTTAGTAATAGTAACAAAATATTTTTTTTCTTGCAATTACTATGTTGTGAAAATTAACAAATAACATCGAACATCTGAAAATATATTATAAATACACACTAATACTATCCAACTTAAATATATTTAAGTATAGTGAAAAGGCATAACTAATACTTAGCTAAGTTGGTAAACTTTCTACTACAATTCTTGTTGGTCCATGTTCAAACCCTAACAAAAATATTTTGCGTATCTATATTAAAAATACACCTCCATGTCATTGTTGATGTGTCACCTTGTCATGTTTAGAGAATGTGACACATGGCGGCGTGACATGCTTTGCATTGGAGATTTAATAATAGTATAGATTAGGTCCCGTGCACGCACGGTAATTTTAAAATTATTAATTGACCATCTTTTTTAACTGAAATATTTATTCCTTAAATCTATTGCGTAATTAATAAATCTCGAACGTACTCATTTTATCATATAATATACAATTTCTGCTCTATTAAGTATTATATATTTTATATGTTTAATATGATTGTTTGACCAAATTAATATTTGATATGCTTAATATGAACAAAATAAGTAAGAATGTTTTCTATTATTGATATGACGATCTGACTAAATTAATATTACTAAAACTGTTTAATAATGTCATATTTAATAATCCTACAATATTGTCTATTTATAAACATTTATACAAAAGGAGAGAAAATAAAAATAGAATAAAGTAGATATATTTTTTTAGGAAAGGGTTTTTGGCGGGAAAAAATCGCACCAGGAATTGACACGTGTCATTCCTGGTGTCTCTTTTAGTATCTACTTTTAGTATATAGTAATAGATACTAAAAGAGAAGTTCCTCTCTCCTCATTTGTCCACATGTCGCTACCAGAATTAGGCTCTATTCGGTAAAATTAGCGGTTAGTGGGTAGCGGTTCGAGTAGCGGGTAGCGGTGAATGGTAGCGGGTAACGGTTAGCTGTCAAAGTAGCGGCTAACTGATATGGGTGTTCGGTAAAAGTAGCGGTTGATATTCTAAAATAAAATAAAAGGTAGCATATTGTTTTAAACTTCATTATGAATTTGTCAAAAGCTATCCGTTACCTTAAAAGCTTCTAATTTTAACGTTTGACAAAAGCTACCCAAACGCTACCTCTACCGCTAACCGCTACCTAAAACGCTACCTTGCCGTACGCTTACTAATTTTACAAGTAGCATCTTAACTAGGTCAAAACGCTACCCGCTACCGCAAACGCTACTGCCGAACACGCCCTTAATCTCACCTATTTTTTTTTCAATGTGATCGAATTGAATTAATAGTATTTAATTATATGATATATTTTCAGATTCTTATGTTGACACACGTATATTATCTTCTAAAATATTACCTAAGAGAAAGATTAGCGCTAGTACTCCCTCCGTCCCTTAACACTTGCACCGTTTTGACTGGACACGCTTGCCAATGCACAACTTTGACCACCAATATCTTTAACTACATATTATAAAAACTTATAAAAATATATATAAGATGAAGCCAACAATATATTATATACTAACATTTGTTAACATATTCTAGAAATAAAATAAGGTTAAAGTGAATTATGTGAATAGGGAGTATAAGCTAAGACTTCCACGTCATCTTTTTATTAATTTTATTTTATTTTCAATTAATCAGATTCTTGTTGAGATCCTTTCAATCTTATTTAATTTTTCCACTTCACCCCTCGTACTCATTCAAGACTCCTCAAACTTATGAAAACTAGTATTT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mRNA sequence

ATGGAATCAGATCCTCAACTAGCATTAGAATTTTTTGGAAGTCCAGGAGGGGATCTAAGGACTCCAGAAAACACAGTGACGGAGGCGGTGAAACTAACAGAGATCATCCACGTCTTCATATCTGGTTGTTGCCTTTCTGGATTTTCGAAGCTACCCTCCATGATCTTTGCTGAAACAAGAAATTGTCCATGCTCGATTGATCTTTTGCTTATTCATGAATTCATTCATTTTATAGCTCCTGATTGTTTACACGGTGGTAGCGTTGATAATCGTTTTAGTCCACAGATTCTAGACAGAGGCGCCGACGAAAAAACAAAGCTAGGTTTGAAGGATATTTACATAGAACAACCCTTCATCTCTCCGATTCCTCAACATTCAGCAACCCTAAATCCTTATTTCATTCTTCGCACTCTTGCAAGTGATTGTTGGTGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAATCAGATCCTCAACTAGCATTAGAATTTTTTGGAAGTCCAGGAGGGGATCTAAGGACTCCAGAAAACACAGTGACGGAGGCGGTGAAACTAACAGAGATCATCCACGTCTTCATATCTGGTTGTTGCCTTTCTGGATTTTCGAAGCTACCCTCCATGATCTTTGCTGAAACAAGAAATTGTCCATGCTCGATTGATCTTTTGCTTATTCATGAATTCATTCATTTTATAGCTCCTGATTGTTTACACGGTGGTAGCGTTGATAATCGTTTTAGTCCACAGATTCTAGACAGAGGCGCCGACGAAAAAACAAAGCTAGGTTTGAAGGATATTTACATAGAACAACCCTTCATCTCTCCGATTCCTCAACATTCAGCAACCCTAAATCCTTATTTCATTCTTCGCACTCTTGCAAGTGATTGTTGGTGCTGA

Protein sequence

MESDPQLALEFFGSPGGDLRTPENTVTEAVKLTEIIHVFISGCCLSGFSKLPSMIFAETRNCPCSIDLLLIHEFIHFIAPDCLHGGSVDNRFSPQILDRGADEKTKLGLKDIYIEQPFISPIPQHSATLNPYFILRTLASDCWC
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo16260.1Spo16260.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo16260.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo16260.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo16260.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo16260.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006886 intracellular protein transport
biological_process GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process
biological_process GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi
biological_process GO:0015031 protein transport
biological_process GO:0006486 protein glycosylation
biological_process GO:0016126 sterol biosynthetic process
biological_process GO:0019745 pentacyclic triterpenoid biosynthetic process
biological_process GO:0009751 response to salicylic acid
biological_process GO:0015791 polyol transport
biological_process GO:0015695 organic cation transport
biological_process GO:0046836 glycolipid transport
biological_process GO:0009816 defense response to bacterium, incompatible interaction
biological_process GO:0008219 cell death
biological_process GO:0072488 ammonium transmembrane transport
biological_process GO:0015844 monoamine transport
biological_process GO:0031047 gene silencing by RNA
biological_process GO:0043248 proteasome assembly
biological_process GO:0008284 positive regulation of cell proliferation
biological_process GO:0006623 protein targeting to vacuole
biological_process GO:0051788 response to misfolded protein
biological_process GO:0009610 response to symbiotic fungus
biological_process GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
biological_process GO:0016192 vesicle-mediated transport
biological_process GO:0061025 membrane fusion
biological_process GO:0008152 metabolic process
biological_process GO:0016197 endosomal transport
cellular_component GO:0005794 Golgi apparatus
cellular_component GO:0031902 late endosome membrane
cellular_component GO:0009506 plasmodesma
cellular_component GO:0005886 plasma membrane
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005829 cytosol
cellular_component GO:0009507 chloroplast
cellular_component GO:0005737 cytoplasm
cellular_component GO:0005783 endoplasmic reticulum
cellular_component GO:0030904 retromer complex
molecular_function GO:0005525 GTP binding
molecular_function GO:0010175 sphingosine transmembrane transporter activity
molecular_function GO:0017089 glycolipid transporter activity
molecular_function GO:0008289 lipid binding
molecular_function GO:0046872 metal ion binding
molecular_function GO:0051861 glycolipid binding
molecular_function GO:0005515 protein binding
molecular_function GO:0003924 GTPase activity
molecular_function GO:0036459 thiol-dependent ubiquitinyl hydrolase activity
molecular_function GO:0008234 cysteine-type peptidase activity
RNA-Seq Expression