Spo01949 (gene) | SpinachBase

Overview


Name	Spo01949
Type	gene
Organism	Spinacia oleracea (Spinach)
Description	Unknown protein
Location	SpoScf_03796 : 5350 .. 15382 (+)

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGTGGGAGGAAAAATATGCGAAGTTACTCCCAAACTCCATCATCGCTTCTCAAATCCGAAAGAAGACTCACATCAAAGACCCCAAGGTTTTACCCCTAATTGACCTAATCTTAAATTTATTTTTATATTATCTGGGTAATCTTTTAGAAACTTTCGTTATTTTGTGTGAGTAGGGTAAATTGTAATGTTTTTTATCGTCGATTCGTCGTGTTTCGAATACGTAGACATTGATTGTATTATTGTGTTGTAATGTTGGCGGTTTTAGCTCCTTTTTGGTGGTTATGTTTAGCATAAGAATTAAAATTGGCTCAATGCAAAACAATCATGTAAATGCTGAATTTCGATTTTAGATAAATCTTCGGTATTTATTACAGAATAAACATAAATGCTCGGTTTCTATTTCTTGGTTTGTATCTTGCTTTAGTTAAAAGTTTAATTTGAATTATGGTTATAATGTTAATTAACCATACCCCCCCTTGGTTTTAAAATACATGCACACATGTACACACACTTTGGAGAATTAATCTGAAGCTTGGTTTATATGCGAAGCTAGACTTATGATCCTGGTGGTGATGCGGGATGTGACTATATACAACAGAGGCAGCAACTTAAGTTGGCAGGCCAATCTCTTCACTTGGACTGGTAGTTACAGTAGATTTCTTGAATTTGCTGCTTTATAACCAGGGGTCTTTTTACAATGGAAGCCGGTATGACTTTTTCAACGTTAACGGAACTCTTCCGGAAGAGGTCGAGCCTTCATTTATCAACAAGGTCGAGCCCGGCCCATTGAACATGTATATGATAGGAAAATATCAAATTAGTTGTATATGATTACTTTGTACTCCATAATCCGTATATATGATGTTTCTCTAGGCTTTTTATCCTCTTTATTTTGTTTGTGCATGAGATAAAGTATTATATAATATCGTATTCTTGTTATTCAATTGACTTAGCTTATACATAGTACGGGTAGTATATACTTATTATTTTAAGATGTTTTTAAGTCAGATTACATGAACATGTTCTAATACAATTGTGTAAGTTGTTAATCTAAGGATTGGTGAACCTTCCCCTAACATTGCTTCCTTTCTCCTTGCAGATAAAACCTGTTAAAGTCCGGCAAGCTGTTGGCTTACTTCTGAAAAATAATCTTAGAACTGCGCGCTTTCAAAACTATGGCCCCAACTAATCAGCAATATATGAATCAGAGTTGTTTCCTTGTCTTGTATCACCTGATAGGCACATCCGTACAACTGTTGGGATCACAATTAGTGTTATTATGCAGCTTGTAGGAGTTATTGGTTGACCTGAGACGTTGCAGGCTCTCTTAACTCATTTAGACATACTGATCTTAGTCAGGTCAAAGTGGCTATGGTTGCTTTATCAAAGGTATGACTATCCACTGGTTGATATACAACAGTGAATCAAATACGAAATACTTTACTTTTCGCTCCTTTTTTCACCTATTACGATCAATAACGGATTTTGTTGGTGTTATATGTATTATCTGGTAGTTGATTTTTTTTGAAAATTAATTGATTATACTATATTTTTGGTAATGACTTCTGAATTTGGGTGTTTGGTTCTGATTTGTGAATCGATTTAGTAGTATTCAGTTGTCGATCATCTCCATCTTCTATTCTAGATATTCTCTCGAAGTGGTCGTTGCTAATTTTTCTTTTTGAATCTCTATCAATTAATTAATTCTATATATTTGGGTTTTTAGGGTATATTTCTAACTTTAATTGTGGGGTTTCAAATTTGGGAACTGTCGTTGTCAGTTTTAGTTTGGTTTTGGGGTGATCACTTTGAATTAATTTATGTGTGGGGTATTTTGGAGGAGTTGTGTTATTTTATTGGTTATTCATCCCAAGTTGGTAGAAGGGGTTGTGGTATAATGGTGGTTATGGGGATCCAAAGACTAAGGACTGTAGTGGAAGTTAGAAGGTGGCTGCGAATGAGCTGCCGAGTTTTGATCCTCCAATACCAATCTCTAATACATTGTAAATTTATCCCCCTTATATTGTTATCTTTTTTATTATTAGATTTAGAGTTTTTATAGTGTTGATTTGTTTACCTACCTTTTGATCTAATTACAAGTTATTTGAATTGAATATGTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTCTTTTGGAAAGGAAATCTCAACTCTAATTGGGAAACTTAATTAAGATTTACTTATTCTTAATACTTAATACTTAATGTTAGTTTGCTAGCTTGTGACATTTGGTGAGTATTTGATCTATTTTTGGATATAGTGATTGGAGGAAGTTCGAGTTGGACATGTCGGTTTTTAGTAGTGATTGGAGATTTGGAGGATATAGTGATTGAAAGATGTATGAAATCATGTCAGTTTTGAGTAATTCTTATGATTTTTGAAGATTGAGAAGGTATTATGGTGTTTTCATATATAAGTAAGAAGTACAATAACTGAGTATGGTTCCGCTTTTTCAACTAAGTGAAAGTAGTTCATATGGTCTTTGAAGATCGAGAAGGTATTATGGTGTTTTGGTGGGGAAGTAAGACGTACAATCACTGTTTATGCTGTTTATTTTTTGCATCGAAAAAAACTTATTATGGGTCTGCTTTTCAACGAAATGAATAAAATGGATACAACTTTACCAGTTATTATTCTGGAGGGTATTCATAATGTGAATTCATTTTCAGGTTTGAAGGATCTGTGATATTTTTCTTTTAAAAAAAATTCTTATTTATATATTTTTTTAAAATCTTAAATCTTATTTATATATGTATTTAAAATATTATTTATCAATTAGTCATTGGTGACAGATTTTACTCTGATTCTTTAAGGTATGGGGTAATTGGCACTCTGTCATGCATATGGAGACTTCACAGAACCATTATATTGGAGTGTAAATGACCTGGAATTTATTTGCATTGAAACAGGAAATCATTCACAATATTTAAAGAGGAAACGGGCTATCCCTGGTACAGCTTTGGCGGCGACACTTGCTTCCGCAACTATAGTTTCATATTCTATTCCCGATGTATGTTCACAAGGTGCCCGTTCTCACTGCATACAGAAGACCAAAGAGATGGGTACCTAGCAGGGAATGAAGAGAGTTGGTATATGTATGGTTTATTTAACTGGAGAGGTGTGTATTTAGTTATTTTATTATTCATAAATCAAATGTGCGCTATCTCTAGCTTCAGATTTCAACATTTGGATATACCCTTAGACCTTTGATGTGTAACCGATTTACTGAACATTATATTTGTGGAATGAGTTCACGTGCACATGTACATAATTACTGAACACGGTTGGTGATTAACACATTCTTAGCATTCTGGTGTTTGGTTTCGGCAGGTGAGCTGTAGGATTATTATATAGGTTATATTATAGAATCTTCCTAGAAGTTTTACTTGAGAAGTTGTCTACTATTGTATTATTCTGCTCTGCGCAGCTGCTAGCTTATTGTGGAAGGTACAATTGCATATTTGGTAACCTTTATCTCTCCAATTCTGTTACTGTATTATTCTGCTCTTCTGCTCAGCTGATATCTGTAGCTCGAGCCTTTGACATTAATTCAGCACTTCAGCATTGCATACGTCATTTCTCTCCTAAACAATGAAAGCATTAAGAGCCACACTGACAGGGCTTGGTTTCAACATGATGTTAGTTTCCTAGATCATGAATGGATGGCACCGGCAAGGGGGATGGGCCTTGAGACTTCCTATGAATTCATTCATAAAGGTATATTTCCTCTTTTGTAATTACAAATTTTTGTAAAGACGTAAAACGAAAGTGTAAAAACTTAATTGGGACGGAGGGAGTATTAAGTTTGAAATAACTAATTTTTTCATGTACACAAAGGAAAATGACCAGGTGTATGTTTATATGGTACATATAATCTTTGCCATTTTCATAATTGGAGGAAGGTACTGAAATGTTTAATAAATGTTGCAGAATCGTATTCATAATTGGAGGAAGACGACTCTAAGTTTGACTTGTATTCTATTTCTAGCTGCTGCATGCAATATGGTTTATACTTTATACGTAAGAGTCTTATCTGCATCTTTCCTTCCATCACCTTTTATTTCTGGGCCAAACCTTTCCTCTTGCAACATTATTCCCTTGGAAATAAAAAAAAGGTGGTGTTCATTATTAAGGCATTGTCCACTGCACATATGTCCACTTTAAAGATGATGTTCAGTCCTAGCTCTTAGGGACCAACTAATCTAACTAGAGTCTGCATTGATATAAGATATTACAAAATACCAGAAGTAACAAGTATGTGTTTTCCTTAAGAAGCGTACTGATTAATTCTTTAAACTTTATTATGCCAAGTGGGTTCATGGCTGAGTTCAGTTTCTTTTGTCACCAACTCTCTTGAGTCTCTTCTACTACAGCTCCCTGGTTCCAACAAAGAGAAGAAATAGCTTGCTTGGGGTCTACTTAACCAAGTCCGATATTATAGGTTTGCTTGAGAGAGATGATACTTGTGACAAGAAGTTGCATCTCAATAGAAAAGGAACGTTTTAGAAGCTTGTCTATTATATGAAAATACGATTTTATCATGACATTTCTCATTTATCATCTTCCTTGCACTATTCACAAAATTATAAGTGTCCGTCTTTTACCGAAATTTTTTACAAGATCATTTTTTATACCTTGGGGATCCAACAACTAGTTTTACAAAAAAAACATACAATGAGTTGAGAAATAAATAGTCATAAGTTCAAATATAAACTTTTAATTTGATCGACTTATGAATATATGACTTGAGTTACACATTATAATTAAACCGTATAAACTTTATAATTAGAAAGCTACACTTTTTAAACAGTTATACTTTATGATAAAATTGTTCTATTTTATATATAAGTAAAAAGTTATATCCTTTTTGTATGGGATCTTGTTTAAATCGACTCAATTTCATGAAAATACTACTTTTTCAACAAAAAAAAATATTTTTTATTTCACGAACATTATAAAAGTTGATAATCCTTCAATCTTAATATAATTAACTTTGAATTGAACACTTTCCTTTTTATTTTTAATTGACATATTTCTTTAGTTATGCTTTTAATGCATAACTTTAAATATTAATATCTTAAATTATCAATAACCAAAATTTATGAAACTAACTTCTTATTTAAAAACAAAATCGAGTTTTATTAGAATACCATGTTATTTGCAGCCTGCGTGATACTCGAAATAAAATTCCCAATACAATTAATAAATATTTGCATCCCCAAAAGAAAAAGGCACCAATTGCAAGGGGAACAACTCTAATTTTGTACATGGGTATTTTATATACAAATTTATGCACATTGCAACATCGATCAAGCTCATAATGAAAATGCGGCAATAAATATTCAAATAGAGGTATATATTGTACTGCCATTTTTGTCAACCAACTCTTAAGGTGAATGATTGATGAAGTGTATGTAGTTATTCATAAACTTATACCATCTCCGTTTTAAAATGATCTTTACACTTTCCGTTTTAGTCCGTTTCATAATGTTCTTTACACTTTGCTTTATTCTATTTTGCGCATGAAAATTTACTACCTTACCCTTCTTACCCCAAAATATTTACATTTTTCCACTCACTTTTTCTTACCTTATTAATTTTGTTTTCTTACATCCACCACCTTTTTACACATTTCTCTTACGTTATTTATATTTTATTATATTCAACCAACTTTTGTACTTTTGTCTTAATATTTGTGCAAACAGTAACCGTAACAATCTTTATGAAACAGAGGTAGTATATTTATTCAATATACCGTCCACGTAGATTTCAATTAATGAAGTTTGTTCTCTTGACATGTCAATACCATGTTAGTTTATAATGTTGCCAAGTATTAACTTAATACTCTTAACCAATTCAATAAAATACCAAGTGCTTTACCGTTAATTAAGCTTCCTACTTTCGAAAAAAATAACTTCAAAGTTAAAATCCTTTATGATTATGAACTTCGTAATTCACAAGAGCGTAAATACAAATATTTACAACTCTTTGTGTACGTGTTGAAAACTATAAATATCGTCTAGCTATAAAGTCTGAGTAATATGTCATGCTCATGGAACTTTATTTGACTTACGATCAAAATTCATTAATATTCACCTTAAAAATGTAAATAATATTTCCTTTGTTCTTTATTTAACACATAATTGAATTTTTACTTTTTTCAATGCACAAATTTGATCTTTAATATCTTTTAATTATAATTTTATTAATATATAAAACAATTACTATTTTAAAATTATACATTGTAAAGAATCTAATAAAATCATGTAGAAAATAATTTATGCAAAAATCATAATACATGGTCAAAAGATAATGTGAAAATAAGACAAACCCGAATTGTTGTAATAAATTAAGAACAATATTAGAAGTATCTTTAAATTGGGATAATAAGAGTAATAATTTAGCTCATAGAAATCTGTTATTACATATGTAACACTTGAATTTGCACGTAGTTATATGATTATTTATGGATAATACATAATAATGAATAAATTAATAAACAAATTGAGTAATAAAATATCAAGTTGACTGGCGCGTGCGTAGTACGCCACGGTTCAACTAGTTAATTAAAATTGAATTGAAAACCCCACCCATGTACTATATTCCACTTTTCCCATGTACTATATTCTCTTTCACATGTACTTCATTCCACTTTTCCATACAACTCAATCATCATTTGTACTTTATTCCACTTTTTCATGTACTATATTCCACTTTTCTTAAAATCTGTGTTTTTGGTCAAACAGGAAGATAATTATGGGACGGAGGGAGTAAGTTGCTAGTTTTGGATTTCTTTTACTCCTAGTGCATATGAATTTCCTACCATTTGTTCGGTACGCAGCATTCAATACAAAAACCAAGCAATGTCTTGGCGTAGTAGAAATGGTTTCACCTTCCAATCAAAAGGGTGAGGATTCAATTCCACTATGGGCACTTTGAGGGAGGGTTCCCCTTACCATTCCCCCACTCTCAAGGTATCTTATCTAGCCTGCAAATCCGGATAGGTTAACCCGTGCGGAGTTCCAACCTGGTAAATCATTTCATCTTACCTTCACAACAACAAAAAATAAAAGACATTCAATACCAAATTCGAAAGTTTTGTGCTAATGAGTATTGTCCATGACGTGAAACTAGATTTCCAATCATACGGAATACACCTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTACAAATTTACAATATCACTCAATAGCCGAGCACTTCTTAAGGCAATGGATCATAATGAAAATTTACCACCGTTGGCAATTTTGTATTGTTTTTTTTAATATAAGAAGAAAGATGCATGGTATTTGGGGTGGAAATGGGCATTTGTTCAAATTCACAAATAAATAAAACTGAGAAAAAGAGAAAACATGCTGAATTTTCGTCTAACACCCAACTACACTTTTTAGGCTTAGTTTGATCATAGGAAAAGCCGAAAAGTTTTGGTTCCATTATACCAACAATGAAAATAGTTAATGAAGCTTGAACGCAGTTTCGTCACCCCAAACTATGAGAAGATACAAAATTCATGGATATTCTATTTGAAACTCATTCTCTCATAAGGGGTTGCCGCCTTGCCGGTACCGTAACCAGATGGGCATAAAATCCAAGTGAAGAGAATACCCCTGGAGTTCCAATTACATCCACAAAATTTGAAAATTAAAAGAACAAAATGAGTTTGTGCTCCCAATTACCAACGCGCGGATGATGCAGCCATGCACGGGTGCGTACGTAGATCTACATGCACCTGCACCAAAACGCAAAACAAAAAAAAACAAAAAAATGTAACGCAAAAAATAAAAAAGAACGTATTAAACTAAACAGAAAGAACATAATAGAGTAAACGAAAAGAACATTAACCACAACCTGAAAAGAACACTAATGCTAAAAAACCAAAGAAAATGTACGAAAATGAAAAGAACATACTCACTCTCCTGATAAACTATAAAAATAACAACTATTTTTCAAAAAAAACATCATGTAAAAAATGCGACAGAAAAACAACAAAAAAGTCAAGTATCGATAATATTATAAAAAAAATAAAAAAGGTAAAATAGTTAAAAAGAACACAAAATAATTTAAAAAAGAACAATAACTTTTTTATAAAACACAAAAAACAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAACAACAAAAACTCAAAATTAAAATTAAAATTAAAAAAAAAAGACAACAAAGAAAGAAAAAAAAAACATGAAAAAGACAACATTTTCTTTTTCCTTATCAAACAAAAGAACAAAATGAAAGGGACGAAAAGAACAACGGATCTATATTCTTTTATTAGTTGTACTTGTTCTTTTCAAACTATATAGTGTTCTAACTAAAAAGACGAAAACGACGATATTTGGATGCACTTAAAACTAGAACAATATTTTCGTTAAAGGTATTTTTGTTCTTATCCTACGCATCAGATCTATGTTCTTTTATTAAGTGTTATTTTCCCTATTTAAACGATTTTATGTTCTAATTAAAAAGACGAACCGACGATTTCTTGATGCACTTAAAACTAAATCCATATATTTTTTAAATATTTTTGTTGTTTCGCCACGAATAAGACTATGTTCTTTTATAAGTGTTATTTGTTCTTTTCAAACCATTATATGTTCCCATTAAAATGAAACGACAAAATTTTGAAAAACTTTAGACCAGATCTATGGTATTTTTCATTTATTACTGTTCTTTTTCCTATGTTTTATTTTTTCTTATTAAGAAAAGAAGACGAGACTGCAATGAAGTTGTTGAACTTAAAATCAGATCTACAACTTTGCTATGTTCGTTTACAAGTGTAGTTTGTTCTTTTAATAAAGTGTGTTTTAATGGTTTTGGACTTAAAAACATAAATTAGTTCCTTTTAAAATCTTTTTTGTTCTTTTAATAAAAAAAAGTACAATAATTGTGTTACGAGTTAAAATAATATCTATGTTCTTTTAAAAGTTGTTTTCATACTAATAGTATAATTTATTTATTTATTTTAAATTCAAAATGTGTTTTAATTTTATAAAAATAATCATTAACAGTATCAAAAAAACTCTCTAAAAATTTAAAAGAACAATCTATGTTGATATAAAAGAACAAACTATGGTGATTTAAAATAACAAACTATGTTATGACATAGTAAAAGTAAAGTTATGAAAAGAACATTACAATTTGAAAAGAACATTAGAGGAAAGAACAAGGAAGCATACCTTAAACACTTGATTAACATTTACCAAGAGCATCAATATCCTTTAATAAATCTTCAAAACTGATCTCAATCCTCTGAAAATATCATGCTCTCATGTGATTCTCTTGCTTTGAAAACTAGCCAAATTGAACTAGTATTTTTCTTAATTCACTCATTTTCAACTAAGGAGAAACATTCATAAGGAATTTTAGAGAAAGGATAAAGAGAAAATGTAATTTTTATTCTTTCACTCACTATCTCACTCTTTCTCTCTCAAAAATCTCTCTTATGTTGAGAGAATATAAATCCTCTCCTCTTTCTCTCTCTAAAATGTATTTCTAAAATTCTAAAATGACTAAGGGTTATGATTCATAAATACAATATATATATATATATATATATATATATATATAGGGAAGAGATCATGTGAAAATACATCCTTATGTGAGTATACTAGTATATATGAGAATGAATCTAATCCGTAGGATTAGATTCAATCTAATGGCTAGGATTAATTTGAGCAAACCCATCCACCTTCCCCATTAAAAGCCACGTCTCTATCAATAAACCCCACCACTTTCTCTCTCTAAAACCTTTCCTCTTCTTTCTCTCTCCCGTTCAAGACTCCTGTTCTCCCTCCTCTCGCAAAAACCTCAGCGATTTTCTCTCTCCTCTCGCGAAAACCACCATCGCAGCTCCGATTTTCTCTCTCCGTTCAAGACTCTCTGTTCGCCGCCGGTGTATTGAAGATTTAAGGTAAATTCGAGTTCAATTGTTATACATTTCTTCTCTCCTTCTACAATTTTTTCAAATTTTAACCTAATTTTTTCAATTGAAGATGA

mRNA sequence

ATGGTGGGAGGAAAAATATGCGAAGTTACTCCCAAACTCCATCATCGCTTCTCAAATCCGAAAGAAGACTCACATCAAAGACCCCAAGATAAAACCTGTCAAAGTGGCTATGGTTGCTTTATCAAAGGAAATCATTCACAATATTTAAAGAGGAAACGGGCTATCCCTGGTACAGCTTTGGCGGCGACACTTGCTTCCGCAACTATAGTTTCATATTCTATTCCCGATCTCGAGCCTTTGACATTAATTCAGCACTTCAGCATTGCATACGTCATTTCTCTCCTAAACAATGAAAGCATTAAGAGCCACACTGACAGGGCTTGGTTTCAACATGATGTTAGTTTCCTAGATCATGAATGGATGGCACCGGCAAGGGGGATGGGCCTTGAGACTTCCTATGAATTCATTCATAAAGCTCCGATTTTCTCTCTCCGTTCAAGACTCTCTGTTCGCCGCCGGTGTATTGAAGATTTAAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGGGAGGAAAAATATGCGAAGTTACTCCCAAACTCCATCATCGCTTCTCAAATCCGAAAGAAGACTCACATCAAAGACCCCAAGATAAAACCTGTCAAAGTGGCTATGGTTGCTTTATCAAAGGAAATCATTCACAATATTTAAAGAGGAAACGGGCTATCCCTGGTACAGCTTTGGCGGCGACACTTGCTTCCGCAACTATAGTTTCATATTCTATTCCCGATCTCGAGCCTTTGACATTAATTCAGCACTTCAGCATTGCATACGTCATTTCTCTCCTAAACAATGAAAGCATTAAGAGCCACACTGACAGGGCTTGGTTTCAACATGATGTTAGTTTCCTAGATCATGAATGGATGGCACCGGCAAGGGGGATGGGCCTTGAGACTTCCTATGAATTCATTCATAAAGCTCCGATTTTCTCTCTCCGTTCAAGACTCTCTGTTCGCCGCCGGTGTATTGAAGATTTAAGATGA

Protein sequence

MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTCQSGYGCFIKGNHSQYLKRKRAIPGTALAATLASATIVSYSIPDLEPLTLIQHFSIAYVISLLNNESIKSHTDRAWFQHDVSFLDHEWMAPARGMGLETSYEFIHKAPIFSLRSRLSVRRRCIEDLR

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo01949.1	Spo01949.1	mRNA

Homology

[Close]

BLAST of Spo01949.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902188508|gb|KNA11175.1| (hypothetical protein SOVF_137720 isoform A [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 2.500e-11
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 1

		  
Query: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 34
          MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC
Sbjct: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 33

[Close]

BLAST of Spo01949.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QV95_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_137720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 1.700e-11
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 1

		  
Query: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 34
          MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC
Sbjct: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 33

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spo01949.1 vs. NCBI nr
BLAST of Spo01949.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
BLAST of Spo01949.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
BLAST of Spo01949.1 vs. TAIR (Arabidopsis)

BLAST of Spo01949.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 1

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|902188508\|gb\|KNA11175.1\|	2.5e-11	100.	hypothetical protein SOVF_1377...	[more]

BLAST of Spo01949.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 1

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0K9QV95_SPIOL	1.7e-11	100.	Uncharacterized protein OS=Spi...	[more]

BLAST of Spo01949.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo01949.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0031048	chromatin silencing by small RNA
biological_process	GO:0009560	embryo sac egg cell differentiation
biological_process	GO:0009630	gravitropism
biological_process	GO:0045132	meiotic chromosome segregation
biological_process	GO:0006312	mitotic recombination
biological_process	GO:0007062	sister chromatid cohesion
cellular_component	GO:0009507	chloroplast
cellular_component	GO:0005829	cytosol
molecular_function	GO:0005488	binding

RNA-Seq Expression

Co-expression


Gene	r value	Expression
Spo15089	0.73	Barchart \| Table
Spo18179	0.71	Barchart \| Table
Spo18637	0.70	Barchart \| Table
Spo14588	0.68	Barchart \| Table
Spo19807	0.68	Barchart \| Table
Spo23771	0.68	Barchart \| Table
Spo26100	0.67	Barchart \| Table
Spo02230	0.67	Barchart \| Table
Spo02254	0.67	Barchart \| Table
Spo04703	0.67	Barchart \| Table
Spo14637	0.66	Barchart \| Table
Spo12507	0.66	Barchart \| Table
Spo15842	0.66	Barchart \| Table
Spo10563	0.66	Barchart \| Table
Spo06358	0.66	Barchart \| Table
Spo02483	0.66	Barchart \| Table
Spo01751	0.66	Barchart \| Table
Spo25082	0.66	Barchart \| Table
Spo00137	0.66	Barchart \| Table
Spo20858	0.65	Barchart \| Table
Spo23611	0.65	Barchart \| Table
Spo25013	0.65	Barchart \| Table