Spo10014.1 (mRNA)

Overview
NameSpo10014.1
TypemRNA
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1 : 44406685 .. 44414219 (-)
Sequence length279
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTACTCGACTATGAATATTATCCTGGATATGTAATTTTAACATTCCGGCCGTGTTTCATGAACTATAGCACATCTATCAAATTTGAAGAAGCTTGTCATGCTCTGTAAATTTCCTTTTAACTGTTCTCTACGGTTGACTAGGAAATCTCTTTTTTGTTAATTACCTAACACCTAAAGTTCTAAACTTGTTAGATCCATAATTGATTTTGATTCACACTGAACACCAGATGTGCTGCTCAGTTTGCCGTCCCATATAAACTATCAAGTGTAAGGAGTTTCTCTTAGATACTTACTTCATATGCAACAATAAAATTACACTAGTATTTAGGCTCTGTTTGGCAACCACTTTCAGTCACCTTAAATGAGTAGGTGCTAATCATTTAAGTTGACTTAAATAATTAGGAGTGTTTGGCATGGAGCTGAAATAAGATTTAAGGTGGTAAAAATGACTGAAACTGAAACGTTATTCATAATAACGTCTGGGAATCAGTTAGCTGAAATTATTTGTGCTTCTATTTTCTCGGAAATCAACATACGGAAATTTGATTTTGTGATGTTTCGTAGGATTGTTGCCCAATTACCAGCGAGCTTGCAAATGTATCCTACCTAATTTTTGTACTCATTTCTTTGACTCTTATTAATTGTTATTTGTTTGGTCTATTTTTCAATTTTTATTTACATTTTTTGTTTTATTGTTGAAGGAAAAGTTTTAAGAAATGAGCATAACCCATGATATAATTGATGGTGAATTACAATGGAGTATTAATACTATAAAAAAGCCAGAGTTATAAGGGTTTTTTGATTTATTTTATGACTCGTAGATGGTAGATCGGTATAATATCAACTATCATTATAAAAAAAAATATAAACGGTGTACTTATTTATTTGTAATTATTGTTACAAAGAAAATAATTATGGATTTCAAAATATATCAAATATCAATTAAACTACTAAAATTTCAGGTACTTTAAAAACTAGTTCTACCAAACAGGCAATATAGATAGCTACCTTATCAGTTTCAGCACCTTATCAGTTTCAGGTACTATCTTATCAGTTTCAGTTACCTTATCAGTTTCAGCTGAATATCAGCTAGTGTTGCCAAACAGAGCCTTAATAATCCAAATCTCAAGGGAGCGTTGATGTTCCGGTTGAAGAAAATGCATCCTGACTTTTTCATATTGAACTAGCGCTTATCCCATTAGACTCATTTAAGGCATCTCTAATCTATACCATATTGTTTTATTCAACTTACAAATAGAGTCCAAAAATTGTAGACCTGATCAAAAGGCGGGGCGGGCCGGGTCGAGGGCATAAAAACTTGTCCATTATATCGGATCGGGTCAAACTTCGGGTCAAGACCCACCCGCTTCGGCGTTACAATATTTTTTTGTCTGGTTTATTAGGCTGTCAGATGCATGCTATTCTAGTGATAACTTTAACACATTTATAGAAAATACAGCTACAAAAACTGTATTGAAAATACTTATCGGTAGTTGTTACTCATGTACCGGTTTTTTTTTATATGGACTAGTTTTGAAATAAATACTAGCTTGGTGAAATAAACGGCCTCATTTTACAATCAATCGCTTCATAAATAGATTGACAGCTTAAACTCTTAACAAAAAACTTTAACATCATTTCTGTTTTTCGTTTTATGGTAAGGAGTTACTAATTTGAGCATTATTCTATCATTTAATGTTGTTATTATTAATTTGAGCAATATTAATGGAACTAACAAAACAGAAAATTAATCACCTTTCTAATCCTATACTAAGCCTCGTACCCCGGCCCCCATTTTCTTCTTTAATCCATATTTTTTTCATCGGTACGTTTTCACCATGGATATCAAGATTGAAAGTGAAGATATTGAAGAACAACAAACACAACCTCTTATAGAAAACGAACAACAACAACCTAGAAAACAACCGAAAACTCGAACCCAAAAGGCCATAAGAAAAACATTCAAAGGCACATCCCATTTATCAAGCCTCCTTCCCTCAGGTTCAGTCCTAATATTTGAGATGTTTTCACCCATTCTAACAAACCAGGGCCAATGTGTAACATTCCAAGCACAACTCATCACATTATGCCTCATAACATTCGTTAGTTTATCATGCATTCTCATGTGTTTCACAGATAGTATTAGAGACGAAAGAGGTAAAGTTCGATACGGGATTGCAACGTTTCGAGGGATATGGATTGTTGATGGTTCTGTAAAACTTAGCCCTGAAGAAGCTGCCAAGTATCGAATCGGGGTTATTGACTTCCTTCATGCGTTGATGGGGGTGTTGGTGTTTATGGCGGTTGCTTTTTTGGATCAAAACGTTGTTAAATGTTTGTTTCCATTGCCATCTCAAGAAACCAAGGAGAGACTTGTTATGTTTCCTATTGGAGTTGGTGTTGTTTGTGGTTTCTTGTTTATTTGTTTTCCTAGCAAACGTAATAGCGTTGTATCTCCTCTTTCTAAAACCTAATTACGTACTACAATTATTTTTTGGGTGTGAACGAGTACAAGTGAAGTTACAAATAGGAGATGGCACAGTAATCTATTGTATATTGGTCATCGGTACCAGTGGTGGAGCCAGGATTTTTTTTTCGGGGTGTTGGCAGTTGTGCTCCTAAGATTTTTAGTGTGTTGTGTCTGGTGATTTTCCACAACACACAATATATTACTAAAAAAAATGTATCGTCCCAAAATGAATTAATATTCATATTACAATCAAATACGTACAAAATTATAAGAATATTCTCTACGGGTTTCATATATGTGGTGAAAAGAACAACTTAATCTAAGGGAAATGGTAAATAAATTCAAAACTTTAAGAGACCAGTGATTTCTAAAGACTGGTCTCTTAGGTTTTTTTATTTTTAGTATAACCTAAGAGATCGGTTTTACAAAATAACTGGTCTCTTAGCTCTCATCTATATGTTCCCCCCTTCCCTGTGGGGGTTGCACCTACTTGGCTCCGCCACTGATATTCGGTACCATTAGGTTAAGACACCATTAGTAGCTAAATATTACGATTTGTTGTGGGTGTAATATTCATCTCCTTTTTTTGATGTTATTTGTTTTGAAAATAAAACATGCCTCTATTATGAAAACGAGATAGAATTTCTTTTGATAATGCATTACTTAAGCACTTGTCTATGACGGTGGGGTTTTAGAGATATAGAAATAAGCATCTAAAGAACTTGAAGTTGACTGGGACCTTTTACCGTTATCGTATTAGGTACCTCTCTTTGCATGTGCTAGTTCATCAATTTAGTGAAGAAAAAAAAAACTTTGTAGGCTTTAATTACCGTAACCGCACAACATGTAAAATTTATTAGTATGTATAATGAAAATTTTAACTTACTTTCTCAGTCTCATTTTAGTTGCTCTATTTGACTAGGATTTAACTTTAGAAAAGGCAATTAAAAAATACTTACTGGATTTAGGTTATTTTGTTATGTTGTCCTGGATTTAGGAACAATATAACTTTAGTTTGTACCCAAAAAGTCCCTTTTTTCTTACTTTGGAATAGATCAAGAGGGGCAAAATCACAAATCTCACGGCCATGGTCATCCTTGTATAGGCTTGCACTTCTAGCTTCAACAACTAACGCACTCAACTCCCCTTTTTCCAGGTTTGTTCCTTCGTTCTTCCCTCTTTCTAAGCTTTGATTATGAGAAATTAAATTTATTTTACCTTTTACTTTCCGCAATATTTCTTTCCTTCAGCTAATTTAAGATGATCCTAAATCTGTTCTCGTTATTTGGATTTTACCTATGATCTGTCCTTCATGATTCAACCTTTAGGGTTATTTGCCCTCTTCTTGCTGTGATTAATTTTTAGTTTGCCTAATTGTGATACTGGAATTGTAAAATAATGATTGGAATTTGTTGCCCTTTATTCCTCTCTACCGAGAGCTTTATGTGGTTAATTTGCATTTTGGACAATTCATCAGAAAACCAAAGAGTTGAATTAAGGAGAGTGAGTTACCTTTGTTTTGCTTTATAGCGTATATGGTATACTGGTCCTTTTATGGTTGGGGATGAAGGAGATGTTTGATTCCCTGAGCAAAGAGCCTAAGACATAGAATAGAGGAGTGCAATGGAATTTAAGTTCCGGATGCAATTATTAAATGGGATAGTTTTCGAGCTACATCGAACATTTCAGAGGAATTTTGTTTTGCAGAAATTGCTGGAAACCCTTAAACACTGTTTTTGTGATTGAATAGTATAATTGGGGTCAGTTATAACTTATATATCTTGTAGTGTTTTTGATGAAAATTTCCGTAACCCATTGGCAATCTTGAACGGCTGATCAGTAAAAAGGCTCTCCTATTGTCCATAATGGGATGATTGAGTTTTGGATGTCATTGATAAAATTTTGATGTGTGGATGTATGATTATTTTTGCTGATAAAGGCCAATCTTTTTGTCTAGCGGTGAAGCTCTCTTAGTATCCAAGGTAATTAAATCCCCCTCCATCGGAATTAGTTGTCACATTATTGAAGTAGATTACCTTGAATCTTGTCTCCGTCTCTGTATTTACCAATCCTTTAGTTTCTCGCCTCATTTTCACATGAGATAGATGTTTCAATTCTTTTCTTTCTTCTCAGGTACATCAAAATTCAATATAAATGTAAACACCTGCAGAAAATAGCAATCCCCTATAGTTGGTCGATCTCTTTAGGGAGTTTAAATGTGTTTCTGACTCCCGAGGGTTAACTTTGAAAACTAGAAAAGCATGATAACTTCAAGGTTGTCCTCGACCTCTTTCTTCGTAGCAATTCAGGACTTTTAGGTTTCATCCCATCACAATTCATATTGGGATTATTTTGCAGATTTCATGGTTTATCATTCAGGCATTAAGCTTTAGCCAGGCAACTAAAAAGGTTCATTGTCTGAAAAGTCTAAATTTCCTGCTTAATAAATTAGACTGTATATAGTCTGATGTATTTTCCCTCTAGTGGGTGGTTTTCGGAAAGGAGATTTCTATTGCACAAGCTATAATCTTTAGTAAGATGTTTGTGAATCTTGAAGTGTTGCCATGTTGCCTGAGCCCTGAGGTTTAAGTTGATTGGTCTGTGTTGAGTAGTTTACTGGTTGCCTATTTCAGTGAATCTCTCAATCTGGGTGATACGTATTTGTTGGATGCTATCTTACATTTTTAATGGCGTTTTTAGTCCATATGTTCACTTTTCAATGCAAACTAAAATGAAATACTCTCCGCTATCCACAGTTAAATAAAATGAATGGTTAAGCCTTATTTTTGCAGTTTTGTAGAAGAAAAAGAAACCAAAGGCAGCTAAAAATATTACATTGGACTGGATTAAGTGTTGCATTACATTGGACTGGATTAAGTGTTGCATTCAACATTGCCGATCTCGCTCATCTATGCTCATTTACCTTGGTTTCTTTGGTTTTTGGCTGACGAAAACACTGTCGTAATACTAATCCTGGTATGTGAAATTGCTTTCACTGAATAGAAACTGATTAAACACACCTATGAAACACCATGCCATGGACGAAGGCCTCTTTGGTGGTGTTAGGATAATGTTGTCTAATGAATGATGATGTTAGACACAACTATCAAGTGTATCCTATTTCACCAAGCAACTTGGCTCCCCTACTATCCAAAGTGGGATGATTGAGTTTTGGATGTCATTGATAAAGTTTTGATATGAGTGGATGTATAATTTAATGTTACTGATAGAGGCACGAAATGCCAATCTTTTTGTCTAGGTGTGAAGTTCTCTTACTATCCTAACTACTAAGTAATTAATACCCTCTCCATCGGAATTAGCTGTCACATTGTCCCAATCCCGCACGAGTCATGATCAAGGATATGACATGATTTTACAAAAGACTTGTCTACTTCCAGTCACTTAACTTAAGTAGTGACCCATTAGGAAATCCGACTGTGAGACCATAAGCCAATACAATATTTGGTAAAATAACAAACTTTTTCCTGACATCCAACAAAGTACTGATTACCGTTATACCATGACTACTAAATTCTGGATGGAGAGAGGAGCTTCAAGTGCTTTGGTCGAGAGAAGCAAAGCAGCTAATGCCCCTAACTAGTATTCCTGGAGGCATTTTTCAGATTGTGGAAGCAGACTACCTTGAATCTTGTCTCTGCCTCTGTATCTAACCAACCCTTTAGTTTCTAGCCTCATTGTCACATGAGATAGATGTTTCAATTCTTTTCTTTCTTCTCATTTTGGTACATCAAAATTCAGTGTAAAATATAAACATCTGCAGAAAATAGCAATCCCCTGTAGTTGGTCGATCTCTTTACGGAATTTAAATGTCTTTCTGATTCGAGAGGGTTAACTTTGAAAACTAGAAAAGCATGATAACTTCAAGGGTCTCCACCTCTTTCTTCGTTTCAATTCAGGATCTTTAGGTTTCATCCCATCACAGTTCACAGTGTGATTGTTTTGCAGATTTCATGTTTTTCTCATTAAGCTTTAGCCAGGCAAGGTCTATATTTATCTGAAATAAAAAGGTGCATTGTCTGAAAAGTTTACATTTCCTGCTTAATGAATTAGAATGTGTTATAGTCTGATGTCTTTGTTCCCTGTAGTGGGTGGTTTCCGGAAAGGGTATATCTGTTGCACAAGCTAAAACCTTAAGACGTTTGTGAATCTTGAAGTGTTGCCGTCTTGCATGAGGTTTAAGTTGATTGGTCTGTGTTGAGTAGTTTATTGGTTACCTATTCACTCAATATCTCAATCTGGGTTATACTTCGTACATATTTGTTGGATGCTATCTTACCTTTAGTAATGGTACTTTAGTCCATATGTTCACTTTTCCATGCAAGCTAAATTGATACTTTTCGCTATCCACAGTAAAATAAAATGAATGGTTAAGCCTTTTTGCAGTTTCATAGCAGAAAGAAAAAAGTCAAAAACCAAAGGCAGCTTAAAATATTGCATTGGACTGTTGCATTCAACATTGCCTATCTCGCTCATCTATGCTCATTTACCTTTGGTGTTTGGTTTTTGGATGAAGAAAACACTGTCATAAACTCGTAATACTAATCCTGGTATGATTTTTTTGTTTTTCACTGAATAGAAACTGATTACACACACCTATGAAACACCATGCCATTGATGAAGGCCTCTTTGGTGGTGTTAGGACAATGTTGTCATATGAATGATGATGTTAGACACAACTATCAAGTGTATCCTATTTCACCAAGCAACTTGGCTGACCTGATCATGTACTTTAACTTATGTGAATAATGGATAGCAGTGCAATCAAGTATGGGTGTTGGGGTTAGGATAGCACATTTTGAAAGTGTGTTGGACTCAGCTAAAATTTTATCCAGAAATTCAAGCATAGGGAGTATATTATCTTTGATGCTTTTCCTGTTTTAAAATTTCACAAGTATTAAACTGCCTTCTGAATTCCCTATATTACTTTTTTCCCAAATCTGGTTTCTGACGTTTATTTCTGCTCATTGACAGATTTGAACCAGGAATTGAAGTAATGTTATGGTTCTATGATCAGAGAGAATTGAATCACTTTTACAATTGA

mRNA sequence

ATGGTACTCGACTATGAATATTATCCTGGATATGTAATTTTAACATTCCGGCCGTGTTTCATGAACTATAGCACATCTATCAAATTTGAAGAAGCTTGTCATGCTCTATCAAGAGGGGCAAAATCACAAATCTCACGGCCATGGTCATCCTTGTATAGGCTTGCACTTCTAGCTTCAACAACTAACGCACTCAACTCCCCTTTTTCCAGATTTGAACCAGGAATTGAAGTAATGTTATGGTTCTATGATCAGAGAGAATTGAATCACTTTTACAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTACTCGACTATGAATATTATCCTGGATATGTAATTTTAACATTCCGGCCGTGTTTCATGAACTATAGCACATCTATCAAATTTGAAGAAGCTTGTCATGCTCTATCAAGAGGGGCAAAATCACAAATCTCACGGCCATGGTCATCCTTGTATAGGCTTGCACTTCTAGCTTCAACAACTAACGCACTCAACTCCCCTTTTTCCAGATTTGAACCAGGAATTGAAGTAATGTTATGGTTCTATGATCAGAGAGAATTGAATCACTTTTACAATTGA

Protein sequence

MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHALSRGAKSQISRPWSSLYRLALLASTTNALNSPFSRFEPGIEVMLWFYDQRELNHFYN
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spo10014Spo10014gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo10014.1Spo10014.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo10014.1.CDS.3Spo10014.1.CDS.3CDS
Spo10014.1.CDS.2Spo10014.1.CDS.2CDS
Spo10014.1.CDS.1Spo10014.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo10014.1.exon.3Spo10014.1.exon.3exon
Spo10014.1.exon.2Spo10014.1.exon.2exon
Spo10014.1.exon.1Spo10014.1.exon.1exon


Homology
[Close]
BLAST of Spo10014.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902235585|gb|KNA23993.1| (hypothetical protein SOVF_020110 [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 1.000e-12
Identity = 36/36 (100.00%), Postives = 36/36 (100.00%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1  MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHAL 37
          MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHAL
Sbjct: 1  MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHAL 36
[Close]
BLAST of Spo10014.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RX13_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_020110 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 7.000e-13
Identity = 36/36 (100.00%), Postives = 36/36 (100.00%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1  MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHAL 37
          MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHAL
Sbjct: 1  MVLDYEYYPGYVILTFRPCFMNYSTSIKFEEACHAL 36
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo10014.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|902235585|gb|KNA23993.1|1.0e-12100.hypothetical protein SOVF_0201... [more]
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BLAST of Spo10014.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0K9RX13_SPIOL7.0e-13100.Uncharacterized protein OS=Spi... [more]
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BLAST of Spo10014.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo10014.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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