Spo04395.1 (mRNA)

Overview
NameSpo04395.1
TypemRNA
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 2815902 .. 2820587 (+)
Sequence length399
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGATTCAATTAACAGAAATGACACCAAATTGCAACAATGATTCAATTCTACTGCCTATCTTCAACTGTTTGCGGCACTTTTATGACGCATTAAGAAAGTGTCGGCGAATTTAGGGGGAATTGGGAGCTGTGAAGGGGGAATTTGTATGGGGAATGCTGCAATTATCTTGAAGTTGAACTTCTTCTTCTTCCTTTTTGTGGATTTAAAAAAAGGGAAAAAGGAAATGGAAGGAGAAGTGACAGAGAGGGTTTTTTTCGAAATTATCTGGGTTTTGTTTTTGTTAATGATGGAACCTCAATGACGAAAATGACCTTCTATTTTGACAGAGAGTATTATTTTTAAATGACCATTTTATTTTTTCTTTATCTGTTAGAATCTACGATAACGAGACATTCAATTTGAAATTGGAATCTTAGCGATGTGTTATAAGACGAATAATAATACTCGTAAGTTCGTTTTTGGTTATGTTCTAATCAACATAGTAGTAAGTAATTAATCGTATTACTTAGCTGATCTCGTTTGCGATGTGTTATTGGATGAATTATAATTATATGTTCGATTTAAGTTATGTTCTAATCCATCGAGTATTAATTTATTGATGATCCCGTTTGTGATATGTTATTGATGATGATACTTGTACATTCGATTTAGGTTATGTTATGATCAATCGGGTATTAAATATTCGTATTTCTTATATGATTTCGTTTGCGAATATCGGACAAATGATACTTGTATGTGTAATTTAGGTAATGTTCCAATCAATCGGGTATTAAATTAATCGTATTAATTAGTTGATCTCGTTTGCGATGTGTTGTTAAACGAATGATACTTGTTCGTTCGATTAAGGTTATGTCCTATCAATCATGTATTAAATTAATTGTATTCCTTAGATGATCATATTTTGTTGAAACTTACTTTTTTTGCACTTATCTTATTTATTCGTTTTTTCCCCTTATAATGTCAATTAAACATAATCTTAAGCCTTGGGATCCGTTCGATATCGTCTTTTGTTTTCACTTTTTTGTTTTTTAAAAAACTAAAACCAAAATATGAAAACCACAAACAATAGCTTCCAGATTTTTATGGCCAGTTTTCAAAATTAACATGATTACCATAAATGAAATTATCTTTTAGTTCATGATTCAATATAAATCATATGACTTATAAAACAAAACAAAAAAACAAAAATTGAAAATTGGCAGTAACACCGAATGAGCACATATATCTTTTTTTCTTAATGTATTTATGATCATTAATATAATTATAAATTATATTAATATAACCATCATCATAATCCGTTCATTACTAATACTACCTCGATTTCAAAATAATTGCGAACAATTTTATTTTATGGTTGGCAATTCATGGAAATTAGTAAGGTGTATGATGATTTGGGGTGGTGGGGATGAGATTAGAGGAATTGGTCGAATTAGTACAATTATGAAGGAAGTGGGGCCGACCCAAGTCCAACCAAGTCCGTGCAGATTACTTTAGCCCACTAATTAAACGACTGTCATTATCTTTTGTCACATGTTGTTTATGACTACACCTATCATCAAACATCTAATTATGCTCACATATTAACTTTCAAAACTTATATTTGCATTGTGAGTAAAATAGAGGTTTTGTGTTTAAATTTCTCTTTCTCATTAGTAGCTTGTAAAAAAAAAATATAATCGGTATAACAACATTGACATTGTGATATGCAAACAACAAACAATCGCATATTTTCTCCTTTAGAAGTGAATCAAGTGATGTGCTTACTTAGAAACGGTCGAATTAGCCAAAATAAATGTTTTATTAGACACGCATGCATGGAGAGATATGTAGTACGGAGTAATTAGTTTGTACTCTATATCTCCTAAATTCCTTATCTATACAATATGTGAACTCATAACGTGTACGTATTTCGCATGTTATTATAAGTTTTTAATACTTTCCCCTTTATAACAAATTTGAAGTCTTGATTAGTTAATTACCTCAAATGTGTTATGTTGTGGATTGAGAAAGATAAATGAGGTGTTTGGTTGAGAGAACCTTAGGGAATCAAAGAGTTTTGGCCAGAAACTTAGATGAGTCATTTAACATTAATCCAAATCTCCAAATATTTAATAAATCAAAACCTCTTATCGATGTTTAATTGAGAGAGAATCGGTAGAGAGCTTTGAGTTAAAAAAATCTACTTTTGAAATACGGAGTACGGAGTAGCTTTTAAAAAAATCTTTACAATGGTCGGGTTTTAATTACGGTTTTTTTTAGGGACCTGCAGTATTTAAGGCCAGAAAATGACTTTAATATCCTGAATCTGGTCGTATTTTTTTTTTAAAAATCCACAAATTCTAATTTTATTCAAACTCAAAAGAATATGAAGATCATCATGCTCCTATCGACTACATTTGCATATATAACGTATACATACACTGATGCATGCGTATTTTATGCGAAATTGACGTATCAACTCATGCATACAATCATACACAATCAATCATAATATTACACGTCCTATATTCATATATATATATCAAAATATTCCATAACATGCGATTCAATACAATACGTAACTAGTCGTAGATGAGTTTTCGATCTGAATTTTCTTTGAAATCTTCTAAATAGTTTTCTAATTGGGGTATTACTTTAATGTGTCTCTTAAAATAAAATGTAATATTAACTAGGTCATAAAATGAGACACCTCCAAATATGGCATCAGAGCGAAAGCATGCGCATTGCGGATTTTTTTTTTATGTTATAGCCATGCCTTTACTATTCTTCTACCTTCATCCTCGCTGACTCCTACAAACACACACTTGCAAGTCTGCTATCACAACATTTGTAACCATACAATATATATAATCACACACCAAATCAGTGGGTGACATACACAATCCATGATCACACATCTTATATCCACGTGTTATTAAACATTTCGCAACATGCATCGTAGTACAATACGTAAATAATAATATATAGATAACTTTTAAAATATTCTTGGATACATTCAAGATAGTTTCCTAATTGTGATATAACCCTCATATATGTTTTTTAGAGTCCGGCATAAATTTTTTGAATGCAAAATGTCTTATTTCATGAAACATTGTAACTAGGTAAAAAATCTGACACTTCCGAACATGATATCATATCAAAAATATCCTCATGTGAAATGACTCTTACTCTCTAGTCATGCACTAATCCATTTTCTACCTTCTTCTTCTTCTTCATACACAATCACAAATCCCCGTGGACTTCTACAAATTTGCATCAACTGTTTCGCTGCCAGTGTCCTCCATAATAATCGTTACCATACACATCGCACTAATCCATTTTCTACCTTCTTCTTGTTTATACACAATCACAAATCCTCGTGGACTCCTATAAATTTGCACCAGCTGATTCCCTGCCAGTATCCTCCATAATAACCGTTACCATACACATCACACAAATCCATTTTCTACCTTCTTCTACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATACACAATCACAAATCCTCGTGGACTTCTACAAATTTGCATAAGCTGATTCGCTGTCAGTATGACAATATCCTCCATAATAACCATTACCATACACATCGCCTGTAAATCTGGCGCACCAAATCAACGAATGACATACACAATCCATCTTCAAGATTCGCCACACATGATCACATCATATATCCATACGTATTGGTTATTATTACTCAAGCCGCTCTTCCGAGCACGACTGCAAGATCGAATATCGAAACAGATCAACAACAAGATACTCAACATACACTCATGCACCCAAAATGTAGGATTCGTCACACGTTATCACATCATATATCCATATGGATTGTGTATGTCCATCGTTAGAATTCGTCACACATTATCACATCATATATCCATATGTTCTACACACCGCTTTTAAGATCGAATATCGAAACAGATCAACAACAAGATACACAACATACACTCATGTACTCAAAATATAGGGTAAAGGGCACAAGTGCTATGAAGGTACCAAAAAGCCCATATTGTGACCCGTTATACACAATATGGGCTCAACAAATCCAAAGTCGGTTTATTGACCTTCTTCGAATCTACAAACACTATAACGAGTCGTCATCTTCCCCCTTTCGCTTGGTCTCCAAGACACCTCTTTCTAATTTCCATTTTAAAATTAAAATAAAAAATTAAATTAATTATTCTGGTTTCCCCCCCTTATAAAGTCGGTCACCCCCATTTCTCAGGATTAAAGCTTTCCCCAGGTTTCAATTTCTCTCTCCTAGAGAACCCCGTGAACTTCTCCTACCCAAGTCTAGAGCGAGAAAGAGAGGAGAGAGAGAGGGAACAAATTCGATTGTTGAACTTTCCTAATTCTCATCTATCAGAGGTTAGTATTCTTTTTGTTCTTGCTCATTTCTGCAATTTTGGATGTTTATGATTTCTTACTTGGTTGAACTTTTTCTGGGTAGTTTGTAATTTTTGATTTTCTTGGTGATTTTATGGTATTGCTATATCGGGAAATAATGCTAGGGTTGCGAATTAAATAGGAAATGTTACGAAAAAGATGAATTATTCTTGTTAATTTTGTTTTTTTTGGGTGTGTTAATGTGGGGTTTGTTCATTTTTTGTACTGATATGTTTGAATTTCTGGGTTGTTATTGATTAAATGTATGGAATTATTTCAGGGGTGTAAGAAGAAACTTAAAACCTAA

mRNA sequence

ATGGTGATTCAATTAACAGAAATGACACCAAATTGCAACAATGATTCAATTCTACTGCCTATCTTCAACTGGGGAATTGGGAGCTGTGAAGGGGGAATTTGTATGGGGAATGCTGCAATTATCTTGAAGTTGAACTTCTTCTTCTTCCTTTTTGTGGATTTAAAAAAAGGGAAAAAGGAAATGGAAGGAGAAGTGACAGAGAGGGGTAAAGGGCACAAGTGCTATGAAGGATTAAAGCTTTCCCCAGGTTTCAATTTCTCTCTCCTAGAGAACCCCGTGAACTTCTCCTACCCAAGTCTAGAGCGAGAAAGAGAGGAGAGAGAGAGGGAACAAATTCGATTGTTGAACTTTCCTAATTCTCATCTATCAGAGGGGTGTAAGAAGAAACTTAAAACCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGATTCAATTAACAGAAATGACACCAAATTGCAACAATGATTCAATTCTACTGCCTATCTTCAACTGGGGAATTGGGAGCTGTGAAGGGGGAATTTGTATGGGGAATGCTGCAATTATCTTGAAGTTGAACTTCTTCTTCTTCCTTTTTGTGGATTTAAAAAAAGGGAAAAAGGAAATGGAAGGAGAAGTGACAGAGAGGGGTAAAGGGCACAAGTGCTATGAAGGATTAAAGCTTTCCCCAGGTTTCAATTTCTCTCTCCTAGAGAACCCCGTGAACTTCTCCTACCCAAGTCTAGAGCGAGAAAGAGAGGAGAGAGAGAGGGAACAAATTCGATTGTTGAACTTTCCTAATTCTCATCTATCAGAGGGGTGTAAGAAGAAACTTAAAACCTAA

Protein sequence

MVIQLTEMTPNCNNDSILLPIFNWGIGSCEGGICMGNAAIILKLNFFFFLFVDLKKGKKEMEGEVTERGKGHKCYEGLKLSPGFNFSLLENPVNFSYPSLEREREEREREQIRLLNFPNSHLSEGCKKKLKT
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spo04395Spo04395gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo04395.1Spo04395.1-proteinpolypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo04395.1.exon.1Spo04395.1.exon.1exon
Spo04395.1.exon.2Spo04395.1.exon.2exon
Spo04395.1.exon.3Spo04395.1.exon.3exon
Spo04395.1.exon.4Spo04395.1.exon.4exon
Spo04395.1.exon.5Spo04395.1.exon.5exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo04395.1.CDS.1Spo04395.1.CDS.1CDS
Spo04395.1.CDS.2Spo04395.1.CDS.2CDS
Spo04395.1.CDS.3Spo04395.1.CDS.3CDS
Spo04395.1.CDS.4Spo04395.1.CDS.4CDS
Spo04395.1.CDS.5Spo04395.1.CDS.5CDS


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04395.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04395.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04395.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04395.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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