Spo09684.1 (mRNA)

Overview
NameSpo09684.1
TypemRNA
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 85040368 .. 85062597 (+)
Sequence length231
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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CAAAGGCTTGTACCAAAGTTGACCCGAGTGGGGCAAACTTTCGGTCTCGGATCCATCTTACAGGGTTTCTTCGGGCGGGAGCCTCTTCTACAGCATGGACTTCTTGGGCTTGGGGTGTGTTTCCCCGATTATAGGTGTTGGTCTTATATGTGGGTTTGCTCTGTATGGTTTTGGCGAGGTCGTCCTCCATCTTTATTCCCACATCATAAACTCTTTTGAAAGTGTCGAGTCCCAGGTACCTAAGGTGTTGTCTGTAAGCCGTGTCCAGGTTGTCAATGAATTTTTGGACCAATTTTGTTTCGGGAGGCCTATTGATTAGCTGGGCCGCCTGGTCCCTCCATCTAGCAAGTAGTAGGTTGTGAAACCCTCATTTTTCTTTTGGAAGAGAACTTCCAGCTCGCGCATGGTGACTTGGAAATCCATGTTCGACGAGTATTGCTTGATGAAGACATTGACAAAATCTTCCCAAGTGGGGAAGGGCTTAGGGTCCTGGTGATAGTACCATTTGAGCGGCACAGGTTCCAAGGACAAAGGAAAGGCAGGTAAGTACATGGACTTGTCCACGCCTTTCAAGTTCATGGTATTCACAAAGCTCAGTAGATGATCACGGGGGTTGTCCGTGGCCTTGAACTTTGGCAAGTCAGATGAACTGAACTTTTCTGGTAATTTGCCAGGAAAAGGTTCAGGATCGAGGGAGAAGTATTTGCTCCCCATGGTTTGCTGTAGGACCATTTTTTCAATCCTCTTCTCGTTTTCGAGGTCATTTTTGGCTTGCGCAGCCGCTAAAGCTTCATTTTCCATTTTCAGTTGGCCCATAAGTTGGGTCATTTGGACCATCTGGTCTCGCAAATCTTCAATGGACATGTTTGAAGGTGCGAATCGAGGTTGGGGAAGCGGAGATCCTTGAAATGAGGGACGACGGACGGAGCTTGGAGTTACTAAACTTGGTGTTGGCGATGTATCTTCGAGACGCACTAACCGTTGATTCCCTGATCGGCACCAAGTGGGAGGACCAGTCCTAGGCATAAGATAAGCTAAAGTTTTAGGTTCCCAAAGTTTCAAGCATTACTTAGTCTAGACTTCGACTCTCTAAATTGGTTTTTCACTTTTTCTTTTGTCGGTACACTTTTTGGGTTTTTTTTTTTGGTCATTCTTTGGATTTTCTAAACACTTGACCGTGTGACATTCATAGTTATTAGCATGTTTGGTTTTGGTGCCGAGCATTGCCGTCGTAGGAGGCCCAACAACGACACAAAGAGTTATTAATTTTTTTACGAGCCGCTTTTTGAAATCGAGTGCTTTTCTTACGCCCTCGTAGCAATTCTCTTGATGAACATTTTTTGCGCTACGTATTTTCCTTTCGCTCGGGCACCGAGGCTGCTGCGCCTGACCAGAAGGCCAAGCAGCAACTTCAGCGCCCAGCTAGGGGCGTGAGAAATTCTGGCGCCCAGCCAGGGGTGCTGAAAATTCGTCCCTGGCTGGTTCTCGTTTTCTGTCTTCTGTTTATGCGACTTCGACTTGCGTGCTTGCCTAATAACGTCCTTTACGCGTAACAGCGTTTGTGGGATTCGTTACCGGCCATCCCGAGCGTCGCTTATTTCGTGGCGATCATTCGGGTTTGCGGAACACATGTTTCGGTATAACTCTTTGGCCAATTAGTCTATGAATGTTTGGGCAATTTTTAAGGTCGTTGGTTTTCTAGGATAGTTTGTCACACACAATCACATATTTCGCTACACAAAACTACATTACAAACATGGATTTGAAAATTAAATATGCCACGTAGTTTATGATAGGATTCTATGGGTAGTTTATTTGCGCCTGGCTTGGTATCGCTTCTATCGTAGATCCAACACATGCCCCGGTCGAGGTAGTGTCTTCAACGGACGAATTTCGCTCAAGAGGCCAACCCGCAAGTGCAAGCCAAGGGGGCATGTAGGCGAGAGGGACCTAATGGGCGAGCGATTGGGTTCGGGATAGTTGTACTACCTGCACAAGTACCGAGTGGGAAACATGCGCGGCGTATGCACCCCCCTATTGGCGAAAAAAGGTATCCTTAGTCCCAACTCCCGAGGGAGCCGAGATTCGTTATGATGTTCTGCCCGTTCACATTAATATGCTGATTTTTCAGGTCGTCCCAACTTGATGGGGAAATAAACGCGAGGTAGGATCGTTTCACCCTTCGGCTATTTTGATTACCTACAAGCACGAGTATTTCCTTCACTATCGTCAGTGGAGTCGCCACTGTGAGGGGGTCGAAAAAGCGCGAGGCTAATGCGTGACCTCGTCCCTCGTGGGTGTGACGATTCTTTTTATTCAATCAAGTGTAATTGGATTTCCTGTGAGTATACACCCAATTGACTAGTAATATAGGAGTCGCCATTCAGTTTTTAACGACAATGAGAAAAACTGACAAAACCCGGTTATCGTGACATAAAGGGAGTGCAATTATGTTTGACCACGACGGCCGTAGGTTCCCTTGTGATCCCTGGTGTGGGGATCTCTCAATATACACCCGCAAGGTAGAGATTGAGGGTTCGGGGGACTGTAACTACCGAGAGGAGTACTTCGCTCGTCGATAACTCCAGAGGCAGGATATCCTTACTAGCTTAGCATAAATAATTGAAGGGACATGCGTTAACTATTAAACTAATCTGAGTTGATTTTAGCAATATGCAACATATAATACTAATTCGATCATGATTATCTGATTTAAGTAGCATTAAGGGACCTAGCATGATAATCCGATTTCCCAAAAATATTATATTTGTTAGGCGTGATAGAACAATCAGATTAGGTTAGTTTAACAGTTCATAAAAAGGGCGAGGAAAGCAGTTAAATCATCGAAAAGGGACACATTACGACGCACCCTTGAGAGGTGCGTCACGGTTCTCAGAAAACTAACCACTTTGACTTTGCTATTTCTCCTTTTTATTTAACAAATCTCAATTATGGGACAGGATACGTTCTGTTCGATTTATGGATCGATTGCGACAGAACGCGTGAACAGTTTCGCAGCGAGAGGCTTAGGCTAAGGGTTGGAGTCAATACTCAGAATATAATTGTGTGTTGTTGTTGTCCTTTCACGTCGAATTTAGGGGGCTATTTATAGGGAAGAGTTCGTGGAAAGATAGAATTGCAGAGTTCTAATCCACAAAGAATTAGAAAAAAACACGTACCCAGGTACTTTCAGCGCCCAGGCCTGGGCGCCGAAGATTTCGGCGCCCAGAGCCTGGCGTTGAAAATAGGGTCTGGGCTGTTTTCTTTAGTCAGATTCGGATTCCTGAAATCTGTAGAGTTTGAGATTAATTCGAGTCTTTTAGCGCGTATCAATTTTGTGACGGAATGCATCCGGGCCCGTTACGAACTCTAGGCTCGTTAGGATTTCAATTAATACGTAACTCTTATTTCCGAATCATATTAGGAATAGGATTCTAGCAGTTTTCTATCTCATTTAGGATTTATGTCGGAATGCAACACCTAATTCTGACAGGTTTCTATCTTTTATGATTTGCCACTTTTAGAAGCTACCTTTTACGGTAGTTACTATTTTTAGCAGGTTTCCATAAATAGCAGGTTTCGGGTGAAATGAAATGGGGAATCGAGATTCGTTTATTTTATAGGAGATGCGTTGTCAAGTGGAGATTTACGTTTTCATCATCGAACCTTTCCCTTGCGGGAACGGGGACAAAAGTAGGCGTCTACACTTTTCTTTCTTTCTTTTCTTGGTTTGTGTTTTTCATTTTAGTCTTGCCTTGATTAGATTTGCTAGATTTTGTTTTTGGTAAGTTTTTAGAATTAGATTAGTTGCTCATTCTTCCCTAGTTGAGTTTAGTTTGCTAGAGACTAGGAAACGCTTAGCTTGGGGGAGTTTGATGAGCGGCATTTATGTCTCTCTAGGCCTAAGATTTTATAGAATTTTATTATGCTTGGGTTGTCTTGCCAGTGCCAGGCTTCATGTCTTTCCTCTCCTGTCACTATTATTGAAATCTTGGGTTGTCTTGCCAGTGGTCATTTTGAGCTGGGAGATTTTTCCATACATGATATGTCCTTTATTGTTTGGCATGAATCTTGTGTATTGCGTGGGTGTTTCTTGAAGGACGGCGAGTGATGAGCGGCATTTATGTCGCTCTAGGCCTAGGATTTTATAGAATTTTATTATGCTTTTTGATAGTTTTGTATAGTTTTGTTGCATTTTTATCCCCTTATTCCATCTATGAACTTTTCAGTTAAAAATGTTGAAAATGATGGAAATGCTTGAGAATTGCTCGAATAAAGCCCGTGCGATCGCACAGAATTTCTGTGTGTTCGCACGGGTCAGCAGAGTTGCCTCCAAAGTCAAGCAGGCTCGTGTGCTCGTGCCCCAGGAGTGTGTGTTCGCACGAATTCAGAAAATCGATGCAGGAACTATGTGGGAATTCGTGCGATCGCACAGAAGAAGAGCCAGCTCGCACGGATTTTTGGTGGGCTCGCACTGAATTTCCGTGCGAGCACATGAAGATTTCTGGGAATTTGGCTAAGTCAGTCCTGTGCGATCGCACGGCTTGCGGGCACGATCGCACGGATCGAAGAAAAGAATTCGTAGCTGAGCTCGCTCGCACTGAACCACAGCCCGCTCGCACTGATGCGATCACATCTGGGTATGCCCGTTCGCACGGCTGCGCGGGATTCCCTTTTCGAGTTTAAACTTCTCATTTTTAGGGGTTAATATAAATAGATTTTTCATCATTTTTATTAAAAAGTTAATTTCAGAAATAGATTTTAGAAAGTTTTAGAGGTTTTGTTCTTCAAGCTAGTGTTCTAGAGAGAGAAACTCATTGATTTCAAGCTTCAATTCTGTAATTCCTTCAACTCTTCTCTTTTTCTTGCAATTTAATTCTTTGTTTCTTAATTCTTGCTCTTGCTTTGTTGTTGATTGTTCTTCAATTCCTTAATTTCTTGAATTCTTGATTTCATTGATTGAAGTTACTTTGATTCTCAATTCTCTAGTTGTTGATTTCAGTTTGCAATTGAATTCTTAATTCTCTTCTCCTACTCCTTCAATTTCATGCTTGCTAGCTTAGAATTAATGGAATGCTTAACTTCTAGAATAATTAGTGAGTAGAATTAGGTTAGGGAAAGGGGAGAATGTAGGGGCTTAATTAGGGGAAATTGTTGATTGATTGTTGGTTGATTCATGTGATTTAATATGATTTGATGATAGGACATCCATGCTAGTTGAGTGGCAGTTGCAAATGCTATTCGGTTAGATTCACGTGGAACCATAGGATAGGTTTGGCGAGAGATTGTGGGCCTATCTTGTGTGATCAAATAGTGGTGCCTATTATATGCTAGTTAGTTTAATCTAGGATTAGGCAAAAGCTCTTCCGTGGGTTAGACGCTTAGCGTTCCCTATCCGAGAGGTGGCGGATTCGTCATTAGATGCTATTTGCCTATTCATCATTTCGTTGCATGATCATCATTGCTAGATAGTTGAATTCATTTCCCCCGATTTCCCTAGCCTATCTCCGACTCCCTAACGTTTCCCTTTCTTGATTCAATTCCGCATAATTGTTAGTTTTAGTTTCTTAAAGTGATAATTCAAAACCAAATTCTTGTTCGAACTAGATTGACATATAAACTTGATAACCACCGTTTCTTTGGGACGATCCCTTTACTTACCGCTAGCCGGTTAGTTGAGTGGTTTTATAAATTTTGTTTGATTTGGTTGTTTTCTATCAACGACGGAAAATACACCTATCAACGAGCCTAAGCTACATTGATGGTATCTTGTTGTGTTATAAATTTCTCTAGTCAAGTAATCATGTTGACATAATAAGAGCTGATGCAGTCATGCATAAAACTAGTTGTAGTATCTATGTCTTGATTATCAGAAATTGGATGAAAGGAGTTTCAAAGAAACATTAGGATAGTAGGATGCATTTTTTTTCTTTCTCATTATTTTCTTTTGAACTTAAATGGATATAAAGAGAACAAGTGAAGCCTTCTTGGTCTTAAAGGAGGGATATGTAATCTTATTGAGAAATTTTCTTGCTTGGTGAAAATACTTATTATGATGCTAGCATGGCGTATTCATGAAGCTGGATCTAATGGAAATTCCAGCTGATATTCCTACTTCCTCTGACACAGGCATGTCATTATCCAACTGATATTCCAGCTGTACTTGAAGTACAGCTGATTTTTCCTACTTCCTCTAACACAGGCATGTCATTATCCACTAAGGCCTCAGTTCGTTGATAAGAGTAGACTGTCCTAGATCCTTATAGAAAGGTTGCCAAATGAATTGGCCATTGGCTTGTCGTAGGGTTGTCTTACACTACCAGAGGCTATATTGTTTCTGAAATTCTGCTTATCAAAAGAATATGATGATAGTAAATCAAAATGGATCCCTCACGTTGCATGAATCTCTCATGTTCTTGTTTGTCGTGGCACAATAGAAAATCAAGGAACGGAGAACTTTTCACTATACTATCTAATCAGCCAATCAATTTAGATAAGTTTATATTCTCTTTTAAATTTTAACTTTTTTGCTGCATGAATCCCTCATGGTCTTGAATCTCAGTGTTTAGCTGATTTTTTGGGTCTTGAATTTCAGGCTCGTGTTATTTAGATCTTCTTGACAATGTTGTAGCTTATTATTTCAATAACAGGAAGAGTCTAGTGATGATTTCTTACCCTGCTCTCCTTAGACCTTATTTTAATGCATTTAGCACTTAGCACTTAGCACATAGCCTCATTTTCCGTGCTTTCCCAAGTAGGGGTGTGGTAAGAATCAACCTGATTTTCTGTGCTTTCTGATATTGTATTCGACTGAAAAGAAAGCCAAACAAAATAGGGTAGCAGAAATTTGTATTAGCTTGAATTAGGAAATCAGACTAATACAATGGATATGGAGTTATGGACTATTGAATATATAACTGGATACAGCAAGGTATGAATGTATTTGTTTAGTTCAGTTGTCCAGTTCAGTTTTCATTAGTTCAGTTGTTCTGATTTGTCAATTTGTTCAGTTCAGTTGTTTTCAATAGTTAAGTGACGTTCAGTTGTTCATTTGTTCAGTTCAGTTTGTTTTGATTTGTTCATTTGTTCAGTTCAGTTGTTCATTTATTCAGTTCAGTTGTTTTCATTGGTTTAGTCCGTTCAGTTGTTCTGATTAGTTCAGTTGTTCTGTTGCCTTGCTTGCTGATATTTTGTTTTTTTGTGACTTGTCTTGCAGTTGCTATATGGTAA

mRNA sequence

ATGGTTATTGCTTTTTATAACAAGAACCAAGGGAGGCCACTCCCGGAGTCTGTGGCCCTTATGGAAATCATTGCAGTGGAATATGTTACTGATTTGTTCATTTCCATGTCTGATGTTCTCACCAACTATACACTGCACTTAGGTTCACAAGGCCCAAGATGTGGGTTCAAAGAGGGGGAGGCTATTGACAGAAGATTTTTTGTTCATAATCTGCAAGTTGCTATATGGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTTATTGCTTTTTATAACAAGAACCAAGGGAGGCCACTCCCGGAGTCTGTGGCCCTTATGGAAATCATTGCAGTGGAATATGTTACTGATTTGTTCATTTCCATGTCTGATGTTCTCACCAACTATACACTGCACTTAGGTTCACAAGGCCCAAGATGTGGGTTCAAAGAGGGGGAGGCTATTGACAGAAGATTTTTTGTTCATAATCTGCAAGTTGCTATATGGTAA

Protein sequence

MVIAFYNKNQGRPLPESVALMEIIAVEYVTDLFISMSDVLTNYTLHLGSQGPRCGFKEGEAIDRRFFVHNLQVAIW
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spo09684Spo09684gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo09684.1Spo09684.1-proteinpolypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo09684.1.exon.1Spo09684.1.exon.1exon
Spo09684.1.exon.2Spo09684.1.exon.2exon
Spo09684.1.exon.3Spo09684.1.exon.3exon
Spo09684.1.exon.4Spo09684.1.exon.4exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo09684.1.CDS.1Spo09684.1.CDS.1CDS
Spo09684.1.CDS.2Spo09684.1.CDS.2CDS
Spo09684.1.CDS.3Spo09684.1.CDS.3CDS
Spo09684.1.CDS.4Spo09684.1.CDS.4CDS


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo09684.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo09684.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo09684.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo09684.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR009072Histone-foldGENE3D1.10.20.10coord: 12..33
score: 2.

GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0046982 protein heterodimerization activity